MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
2	NC_005813	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
3	NC_005813	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478503
4	NC_005813	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
5	NC_005813	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478503
6	NC_005813	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478503
7	NC_005813	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
8	NC_005813	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
9	NC_005813	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478503
10	NC_005813	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
11	NC_005813	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
12	NC_005813	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
13	NC_005813	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478504
14	NC_005813	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
15	NC_005813	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
16	NC_005813	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
17	NC_005813	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478504
18	NC_005813	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
19	NC_005813	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478504
20	NC_005813	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
21	NC_005813	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005813	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005813	GCC	2	6	1963	1968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478505
24	NC_005813	AGC	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
25	NC_005813	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
26	NC_005813	CTG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478505
27	NC_005813	GTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
28	NC_005813	TGG	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
29	NC_005813	TCC	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
30	NC_005813	CCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
31	NC_005813	CAG	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478506
32	NC_005813	CAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478506
33	NC_005813	TTA	2	6	2666	2671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478507
34	NC_005813	TGG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
35	NC_005813	AGC	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478507
36	NC_005813	GGT	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
37	NC_005813	TCG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478507
38	NC_005813	TGT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005813	AAC	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478508
40	NC_005813	ACC	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478509
41	NC_005813	CGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
42	NC_005813	GCC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
43	NC_005813	TAC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478510
44	NC_005813	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478510
45	NC_005813	AAC	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478510
46	NC_005813	CGT	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005813	GGA	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005813	CCT	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_005813	TCT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005813	TCG	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005813	CTT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005813	TCG	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005813	CCT	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_005813	TTA	2	6	5041	5046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005813	ACA	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005813	GCC	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_005813	GAG	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005813	GAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005813	GCA	2	6	5728	5733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005813	ACT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005813	TTA	2	6	5812	5817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005813	CAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005813	ACC	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_005813	GCC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478512
65	NC_005813	CAA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478512
66	NC_005813	GCT	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005813	GGA	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005813	CAT	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005813	TTA	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005813	TGG	2	6	6431	6436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005813	CTT	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005813	GTG	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005813	CTC	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005813	ACC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478513
75	NC_005813	TTA	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478513
76	NC_005813	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478513
77	NC_005813	GAA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478513
78	NC_005813	CAG	2	6	7132	7137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
79	NC_005813	CAG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
80	NC_005813	GGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
81	NC_005813	AGC	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
82	NC_005813	AGG	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
83	NC_005813	GTT	2	6	7865	7870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
84	NC_005813	GTA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
85	NC_005813	GTT	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
86	NC_005813	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478514
87	NC_005813	TCA	2	6	8354	8359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
88	NC_005813	CGA	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
89	NC_005813	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478514
90	NC_005813	GCA	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
91	NC_005813	TGG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478514
92	NC_005813	ATC	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
93	NC_005813	GCA	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
94	NC_005813	CAG	4	12	9037	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
95	NC_005813	GAT	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
96	NC_005813	GGC	2	6	9198	9203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478514
97	NC_005813	AGG	2	6	9224	9229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
98	NC_005813	TGA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
99	NC_005813	ACT	2	6	9279	9284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
100	NC_005813	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
101	NC_005813	AAT	2	6	9468	9473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005813	TTA	2	6	9481	9486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005813	CAA	2	6	9546	9551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_005813	TGC	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_005813	ATT	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478515
106	NC_005813	TGG	2	6	10276	10281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478515
107	NC_005813	ATA	2	6	10384	10389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478515
108	NC_005813	TGT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478515
109	NC_005813	GAA	2	6	10758	10763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005813	GCT	2	6	10823	10828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005813	GGT	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005813	CTT	2	6	10874	10879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005813	TTA	2	6	10966	10971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005813	ATT	2	6	10975	10980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005813	GTA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005813	TAG	2	6	11035	11040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005813	CAC	2	6	11100	11105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_005813	CAG	2	6	11184	11189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005813	TGA	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478516
120	NC_005813	GAA	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478516
121	NC_005813	GCC	2	6	11342	11347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478516
122	NC_005813	CAT	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478516
123	NC_005813	GCC	2	6	11789	11794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_005813	GTT	2	6	11881	11886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478517
125	NC_005813	CTG	2	6	11933	11938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478517
126	NC_005813	GCT	2	6	12031	12036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478517
127	NC_005813	ATT	2	6	12085	12090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005813	TAA	2	6	12220	12225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005813	TAT	2	6	12260	12265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005813	ATA	2	6	12270	12275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005813	AGG	2	6	12336	12341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005813	GCA	2	6	12394	12399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478518
133	NC_005813	TGC	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478518
134	NC_005813	TGT	2	6	12541	12546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478518
135	NC_005813	AAG	2	6	12555	12560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
136	NC_005813	AAT	2	6	12602	12607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478518
137	NC_005813	AAG	2	6	12616	12621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
138	NC_005813	ATC	2	6	12739	12744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478518
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141	NC_005813	GCG	2	6	13008	13013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478518
142	NC_005813	ATT	2	6	13245	13250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478518
143	NC_005813	CAG	2	6	13470	13475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478518
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148	NC_005813	AAT	2	6	13873	13878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_005813	AAT	2	6	21747	21752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478532
262	NC_005813	GCA	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478532
263	NC_005813	CTT	2	6	21959	21964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478532
264	NC_005813	AAC	2	6	22047	22052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478532
265	NC_005813	GTT	2	6	22168	22173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478532
266	NC_005813	ACC	2	6	22180	22185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478532
267	NC_005813	TGA	2	6	22186	22191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478532
268	NC_005813	TTG	2	6	22192	22197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478532
269	NC_005813	TAT	2	6	22356	22361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478532
270	NC_005813	TTG	2	6	22449	22454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478532
271	NC_005813	AGC	2	6	22503	22508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478532
272	NC_005813	TCA	2	6	22516	22521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478532
273	NC_005813	TGT	2	6	22615	22620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478532
274	NC_005813	GAG	2	6	22661	22666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478532
275	NC_005813	CAT	2	6	22835	22840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478532
276	NC_005813	TAC	2	6	22941	22946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478532
277	NC_005813	CAT	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478532
278	NC_005813	TAA	2	6	22980	22985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478532
279	NC_005813	GTT	2	6	23203	23208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478533
280	NC_005813	CTT	2	6	23218	23223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478533
281	NC_005813	ATC	2	6	23285	23290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478533
282	NC_005813	TTG	2	6	23333	23338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478533
283	NC_005813	CAA	2	6	23491	23496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478533
284	NC_005813	TTC	2	6	23503	23508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478533
285	NC_005813	ATT	2	6	23544	23549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478533
286	NC_005813	ACC	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_005813	GAT	2	6	23700	23705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_005813	TAA	2	6	23772	23777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478534
289	NC_005813	ATT	2	6	23796	23801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478534
290	NC_005813	ACA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478534
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292	NC_005813	GCG	2	6	23825	23830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478534
293	NC_005813	CAA	2	6	24064	24069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478535
294	NC_005813	AAG	2	6	24086	24091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478535
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297	NC_005813	TTC	2	6	24263	24268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478535
298	NC_005813	ATA	2	6	24424	24429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478535
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303	NC_005813	TTA	2	6	24826	24831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_005813	TAA	2	6	24876	24881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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310	NC_005813	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_005813	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
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360	NC_005813	GAT	2	6	28590	28595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478540
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373	NC_005813	GGT	2	6	29999	30004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478542
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387	NC_005813	TTA	3	9	30794	30802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478542
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389	NC_005813	GTG	2	6	30893	30898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478542
390	NC_005813	CTT	2	6	30938	30943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478543
391	NC_005813	TGT	2	6	30964	30969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478543
392	NC_005813	TCG	2	6	30993	30998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478543
393	NC_005813	GCA	2	6	31040	31045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478543
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396	NC_005813	GTG	2	6	31186	31191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478543
397	NC_005813	CTC	2	6	31218	31223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478543
398	NC_005813	TGA	2	6	31270	31275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478543
399	NC_005813	GGC	2	6	31361	31366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478543
400	NC_005813	CTT	2	6	31534	31539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478544
401	NC_005813	TCA	2	6	31606	31611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478544
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412	NC_005813	TGT	2	6	32524	32529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478544
413	NC_005813	TAA	2	6	32585	32590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478544
414	NC_005813	GGC	2	6	32632	32637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478544
415	NC_005813	ATG	2	6	32660	32665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478544
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417	NC_005813	AGT	2	6	32880	32885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_005813	GAC	2	6	32889	32894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478545
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422	NC_005813	GAG	2	6	33136	33141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478545
423	NC_005813	AGA	2	6	33273	33278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478545
424	NC_005813	ATT	2	6	33582	33587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478545
425	NC_005813	CAA	2	6	33622	33627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478545
426	NC_005813	TTA	2	6	33659	33664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478545
427	NC_005813	GAG	2	6	33935	33940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478546
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462	NC_005813	TGG	2	6	36022	36027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478550
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499	NC_005813	ATC	2	6	38390	38395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478553
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