MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
2	NC_005813	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
3	NC_005813	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478503
4	NC_005813	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
5	NC_005813	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478503
6	NC_005813	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478503
7	NC_005813	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
8	NC_005813	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
9	NC_005813	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478503
10	NC_005813	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
11	NC_005813	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
12	NC_005813	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
13	NC_005813	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478504
14	NC_005813	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
15	NC_005813	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
16	NC_005813	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
17	NC_005813	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478504
18	NC_005813	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
19	NC_005813	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478504
20	NC_005813	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
21	NC_005813	GCC	2	6	1963	1968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478505
22	NC_005813	AGC	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
23	NC_005813	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
24	NC_005813	CTG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478505
25	NC_005813	GTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
26	NC_005813	TGG	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
27	NC_005813	TCC	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
28	NC_005813	CCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
29	NC_005813	CAG	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478506
30	NC_005813	CAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478506
31	NC_005813	TTA	2	6	2666	2671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478507
32	NC_005813	TGG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
33	NC_005813	AGC	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478507
34	NC_005813	GGT	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
35	NC_005813	TCG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478507
36	NC_005813	AAC	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478508
37	NC_005813	ACC	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478509
38	NC_005813	CGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
39	NC_005813	GCC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
40	NC_005813	TAC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478510
41	NC_005813	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478510
42	NC_005813	AAC	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478510
43	NC_005813	GCC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478512
44	NC_005813	CAA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478512
45	NC_005813	ACC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478513
46	NC_005813	TTA	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478513
47	NC_005813	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478513
48	NC_005813	GAA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478513
49	NC_005813	CAG	2	6	7132	7137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
50	NC_005813	CAG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
51	NC_005813	GGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
52	NC_005813	AGC	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
53	NC_005813	AGG	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
54	NC_005813	GTT	2	6	7865	7870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
55	NC_005813	GTA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
56	NC_005813	GTT	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
57	NC_005813	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478514
58	NC_005813	TCA	2	6	8354	8359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
59	NC_005813	CGA	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
60	NC_005813	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478514
61	NC_005813	GCA	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
62	NC_005813	TGG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478514
63	NC_005813	ATC	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
64	NC_005813	GCA	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
65	NC_005813	CAG	4	12	9037	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
66	NC_005813	GAT	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
67	NC_005813	GGC	2	6	9198	9203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478514
68	NC_005813	AGG	2	6	9224	9229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
69	NC_005813	TGA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
70	NC_005813	ACT	2	6	9279	9284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
71	NC_005813	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
72	NC_005813	ATT	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478515
73	NC_005813	TGG	2	6	10276	10281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478515
74	NC_005813	ATA	2	6	10384	10389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478515
75	NC_005813	TGT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478515
76	NC_005813	TGA	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478516
77	NC_005813	GAA	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478516
78	NC_005813	GCC	2	6	11342	11347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478516
79	NC_005813	CAT	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478516
80	NC_005813	GTT	2	6	11881	11886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478517
81	NC_005813	CTG	2	6	11933	11938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478517
82	NC_005813	GCT	2	6	12031	12036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478517
83	NC_005813	GCA	2	6	12394	12399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478518
84	NC_005813	TGC	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478518
85	NC_005813	TGT	2	6	12541	12546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478518
86	NC_005813	AAG	2	6	12555	12560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
87	NC_005813	AAT	2	6	12602	12607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478518
88	NC_005813	AAG	2	6	12616	12621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
89	NC_005813	ATC	2	6	12739	12744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478518
90	NC_005813	CAG	2	6	12937	12942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478518
91	NC_005813	CAC	2	6	12949	12954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478518
92	NC_005813	GCG	2	6	13008	13013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478518
93	NC_005813	ATT	2	6	13245	13250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478518
94	NC_005813	CAG	2	6	13470	13475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478518
95	NC_005813	AGA	2	6	13633	13638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
96	NC_005813	TAT	2	6	13672	13677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478518
97	NC_005813	ATT	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478518
98	NC_005813	ACC	2	6	14270	14275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478519
99	NC_005813	TTC	2	6	14352	14357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478519
100	NC_005813	TCT	2	6	14377	14382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478519
101	NC_005813	TGC	2	6	14463	14468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478519
102	NC_005813	AAT	2	6	14622	14627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478520
103	NC_005813	CAG	2	6	14676	14681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478520
104	NC_005813	CAA	2	6	14887	14892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478520
105	NC_005813	AAT	2	6	14920	14925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478520
106	NC_005813	GCA	2	6	14926	14931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478520
107	NC_005813	TCA	2	6	14989	14994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478520
108	NC_005813	TCG	2	6	15100	15105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478521
109	NC_005813	CCA	2	6	15155	15160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478521
110	NC_005813	GTA	2	6	15178	15183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478521
111	NC_005813	CCG	2	6	15197	15202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478521
112	NC_005813	CTT	2	6	15243	15248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478521
113	NC_005813	TTC	2	6	15287	15292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478521
114	NC_005813	GCC	2	6	15852	15857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478522
115	NC_005813	GGC	2	6	15872	15877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478522
116	NC_005813	AAT	2	6	15885	15890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478522
117	NC_005813	GTT	2	6	15910	15915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478522
118	NC_005813	TAA	2	6	15986	15991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478522
119	NC_005813	GAC	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478522
120	NC_005813	CGG	2	6	16063	16068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478522
121	NC_005813	TGA	2	6	16077	16082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478522
122	NC_005813	GAC	2	6	16114	16119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478522
123	NC_005813	TTG	2	6	16151	16156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478522
124	NC_005813	TTA	2	6	16159	16164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478522
125	NC_005813	AAT	2	6	16495	16500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478523
126	NC_005813	TGT	2	6	16766	16771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478523
127	NC_005813	TTG	2	6	16876	16881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478523
128	NC_005813	GTT	2	6	16952	16957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478523
129	NC_005813	TAT	2	6	17023	17028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478523
130	NC_005813	TGC	2	6	17193	17198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478524
131	NC_005813	AGC	2	6	17290	17295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478524
132	NC_005813	AAT	2	6	17307	17312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478524
133	NC_005813	AAT	2	6	17344	17349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478524
134	NC_005813	TGT	2	6	17350	17355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478524
135	NC_005813	AGC	2	6	17514	17519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478524
136	NC_005813	ATG	2	6	17576	17581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478524
137	NC_005813	CAT	2	6	17649	17654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478524
138	NC_005813	CTT	2	6	17657	17662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478524
139	NC_005813	ACA	2	6	17722	17727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478525
140	NC_005813	TAT	2	6	17869	17874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478525
141	NC_005813	CTG	2	6	17920	17925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478525
142	NC_005813	TGC	2	6	17951	17956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478525
143	NC_005813	CTT	2	6	17963	17968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478525
144	NC_005813	CTC	2	6	18203	18208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478525
145	NC_005813	CTT	2	6	18262	18267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478525
146	NC_005813	TTC	2	6	18458	18463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478526
147	NC_005813	CCT	2	6	18589	18594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478526
148	NC_005813	GAG	2	6	18596	18601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478526
149	NC_005813	TCT	2	6	18624	18629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478526
150	NC_005813	ATT	2	6	18651	18656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478526
151	NC_005813	GTT	2	6	18663	18668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478526
152	NC_005813	TCC	2	6	18687	18692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478526
153	NC_005813	CTG	2	6	18935	18940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478527
154	NC_005813	ACA	2	6	18978	18983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478527
155	NC_005813	AGG	2	6	19061	19066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478527
156	NC_005813	ATA	2	6	19076	19081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478527
157	NC_005813	TGC	2	6	19083	19088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478527
158	NC_005813	TTG	2	6	19402	19407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478528
159	NC_005813	TCA	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478528
160	NC_005813	CTT	2	6	19470	19475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478528
161	NC_005813	CTT	2	6	19512	19517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478528
162	NC_005813	TTA	2	6	19671	19676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478529
163	NC_005813	TGT	2	6	19683	19688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478529
164	NC_005813	TGC	2	6	19730	19735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478529
165	NC_005813	CTG	2	6	19768	19773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478529
166	NC_005813	CTT	2	6	19775	19780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478529
167	NC_005813	AAT	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478530
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169	NC_005813	CAT	2	6	19952	19957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478530
170	NC_005813	CTC	2	6	20033	20038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478530
171	NC_005813	TGA	2	6	20174	20179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478531
172	NC_005813	TGT	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478531
173	NC_005813	TCA	2	6	20345	20350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478531
174	NC_005813	AGC	2	6	20486	20491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478531
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176	NC_005813	TTC	2	6	20650	20655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478531
177	NC_005813	TGC	2	6	20658	20663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478531
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187	NC_005813	CTT	2	6	21144	21149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478531
188	NC_005813	GAT	2	6	21415	21420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478532
189	NC_005813	CTT	2	6	21449	21454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478532
190	NC_005813	TAA	2	6	21489	21494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478532
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198	NC_005813	GCA	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478532
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213	NC_005813	CAT	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478532
214	NC_005813	TAA	2	6	22980	22985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478532
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225	NC_005813	TAT	2	6	23810	23815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478534
226	NC_005813	GCG	2	6	23825	23830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478534
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233	NC_005813	ACG	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478535
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238	NC_005813	TGA	2	6	25258	25263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478536
239	NC_005813	TAT	2	6	25856	25861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478537
240	NC_005813	TGT	2	6	25874	25879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478537
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242	NC_005813	CTT	3	9	26016	26024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478537
243	NC_005813	GTG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478537
244	NC_005813	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
245	NC_005813	TGA	2	6	26149	26154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
246	NC_005813	TGA	2	6	26195	26200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
247	NC_005813	GAC	2	6	26205	26210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
248	NC_005813	AAC	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478537
249	NC_005813	CAC	2	6	26586	26591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
250	NC_005813	GCC	2	6	26639	26644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478537
251	NC_005813	TAG	2	6	26777	26782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
252	NC_005813	CGA	2	6	26814	26819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
253	NC_005813	TTC	2	6	26885	26890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478537
254	NC_005813	TCA	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478538
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256	NC_005813	AAG	2	6	27074	27079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478538
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261	NC_005813	TTA	2	6	27308	27313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478538
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281	NC_005813	GAT	2	6	28590	28595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478540
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382	NC_005813	GCT	2	6	36113	36118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478550
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498	NC_005813	TAA	2	6	45986	45991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478561
499	NC_005813	CGG	2	6	46010	46015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478561
500	NC_005813	TGC	2	6	46019	46024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478561

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