MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
2	NC_005813	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	45478503
3	NC_005813	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
4	NC_005813	GT	3	6	2266	2271	0 %	50 %	50 %	0 %	45478505
5	NC_005813	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	45478505
6	NC_005813	AC	3	6	2517	2522	50 %	0 %	0 %	50 %	45478506
7	NC_005813	AC	3	6	2674	2679	50 %	0 %	0 %	50 %	45478507
8	NC_005813	AG	3	6	3380	3385	50 %	0 %	50 %	0 %	45478508
9	NC_005813	CA	3	6	3746	3751	50 %	0 %	0 %	50 %	45478510
10	NC_005813	CG	3	6	3890	3895	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
11	NC_005813	GC	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
12	NC_005813	GC	3	6	5105	5110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005813	AC	3	6	6411	6416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005813	AT	3	6	6682	6687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005813	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
16	NC_005813	TG	3	6	6832	6837	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
17	NC_005813	GC	3	6	6939	6944	0 %	0 %	50 %	50 %	45478513
18	NC_005813	TC	3	6	7053	7058	0 %	50 %	0 %	50 %	45478513
19	NC_005813	TC	3	6	7375	7380	0 %	50 %	0 %	50 %	45478514
20	NC_005813	AC	3	6	7451	7456	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
21	NC_005813	AC	3	6	7874	7879	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
22	NC_005813	AC	3	6	8860	8865	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
23	NC_005813	GC	3	6	8892	8897	0 %	0 %	50 %	50 %	45478514
24	NC_005813	AG	3	6	9332	9337	50 %	0 %	50 %	0 %	45478514
25	NC_005813	AT	3	6	9428	9433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005813	TA	4	8	9512	9519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005813	AT	3	6	9910	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	45478515
28	NC_005813	GA	4	8	10353	10360	50 %	0 %	50 %	0 %	45478515
29	NC_005813	TA	3	6	12179	12184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005813	AG	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	45478518
31	NC_005813	AG	3	6	12491	12496	50 %	0 %	50 %	0 %	45478518
32	NC_005813	CA	3	6	12846	12851	50 %	0 %	0 %	50 %	45478518
33	NC_005813	GC	4	8	12923	12930	0 %	0 %	50 %	50 %	45478518
34	NC_005813	GT	3	6	14241	14246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005813	AG	3	6	15077	15082	50 %	0 %	50 %	0 %	45478521
36	NC_005813	TA	3	6	15311	15316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005813	TC	3	6	15654	15659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005813	AT	4	8	15830	15837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005813	AT	3	6	16396	16401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005813	GC	3	6	16979	16984	0 %	0 %	50 %	50 %	45478523
41	NC_005813	CT	3	6	17236	17241	0 %	50 %	0 %	50 %	45478524
42	NC_005813	GT	3	6	18540	18545	0 %	50 %	50 %	0 %	45478526
43	NC_005813	TC	3	6	19911	19916	0 %	50 %	0 %	50 %	45478530
44	NC_005813	CG	3	6	21067	21072	0 %	0 %	50 %	50 %	45478531
45	NC_005813	AC	3	6	21331	21336	50 %	0 %	0 %	50 %	45478532
46	NC_005813	TA	4	8	23561	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005813	GA	3	6	24297	24302	50 %	0 %	50 %	0 %	45478535
48	NC_005813	AT	3	6	24681	24686	50 %	50 %	0 %	0 %	45478535
49	NC_005813	TA	3	6	24797	24802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005813	AG	3	6	25007	25012	50 %	0 %	50 %	0 %	45478536
51	NC_005813	TG	3	6	25159	25164	0 %	50 %	50 %	0 %	45478536
52	NC_005813	CA	3	6	25303	25308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005813	TA	3	6	25650	25655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005813	AT	3	6	25673	25678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005813	AT	3	6	26291	26296	50 %	50 %	0 %	0 %	45478537
56	NC_005813	GC	3	6	26869	26874	0 %	0 %	50 %	50 %	45478537
57	NC_005813	AG	3	6	27276	27281	50 %	0 %	50 %	0 %	45478538
58	NC_005813	TG	3	6	28787	28792	0 %	50 %	50 %	0 %	45478541
59	NC_005813	CG	3	6	29884	29889	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
60	NC_005813	CG	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
61	NC_005813	CT	3	6	30530	30535	0 %	50 %	0 %	50 %	45478542
62	NC_005813	AG	3	6	31759	31764	50 %	0 %	50 %	0 %	45478544
63	NC_005813	GC	3	6	34827	34832	0 %	0 %	50 %	50 %	45478549
64	NC_005813	TC	3	6	35514	35519	0 %	50 %	0 %	50 %	45478550
65	NC_005813	CG	3	6	35603	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	45478550
66	NC_005813	AT	3	6	35706	35711	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
67	NC_005813	AT	3	6	36349	36354	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
68	NC_005813	TC	3	6	36549	36554	0 %	50 %	0 %	50 %	45478550
69	NC_005813	AT	3	6	36829	36834	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
70	NC_005813	TC	3	6	37486	37491	0 %	50 %	0 %	50 %	45478551
71	NC_005813	TG	3	6	37768	37773	0 %	50 %	50 %	0 %	45478552
72	NC_005813	CT	3	6	39118	39123	0 %	50 %	0 %	50 %	45478554
73	NC_005813	AG	3	6	41218	41223	50 %	0 %	50 %	0 %	45478556
74	NC_005813	TA	3	6	41640	41645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005813	TA	3	6	43209	43214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005813	AT	3	6	43216	43221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005813	AG	3	6	43572	43577	50 %	0 %	50 %	0 %	45478559
78	NC_005813	GA	3	6	44274	44279	50 %	0 %	50 %	0 %	45478559
79	NC_005813	TA	3	6	45160	45165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005813	AT	3	6	45259	45264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005813	TA	4	8	46446	46453	50 %	50 %	0 %	0 %	45478562
82	NC_005813	TA	3	6	46664	46669	50 %	50 %	0 %	0 %	45478562
83	NC_005813	GA	3	6	47369	47374	50 %	0 %	50 %	0 %	45478564
84	NC_005813	CT	3	6	47812	47817	0 %	50 %	0 %	50 %	45478564
85	NC_005813	AT	3	6	48174	48179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005813	AT	3	6	48429	48434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005813	CT	3	6	49027	49032	0 %	50 %	0 %	50 %	45478565
88	NC_005813	CA	3	6	50266	50271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005813	GT	3	6	51162	51167	0 %	50 %	50 %	0 %	45478567
90	NC_005813	AT	3	6	51175	51180	50 %	50 %	0 %	0 %	45478567
91	NC_005813	GT	3	6	51290	51295	0 %	50 %	50 %	0 %	45478567
92	NC_005813	TA	3	6	52128	52133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005813	TA	3	6	52326	52331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005813	TC	4	8	54145	54152	0 %	50 %	0 %	50 %	45478569
95	NC_005813	GA	3	6	54374	54379	50 %	0 %	50 %	0 %	45478569
96	NC_005813	GT	3	6	55401	55406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005813	AC	3	6	55487	55492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005813	AT	3	6	55718	55723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005813	AT	3	6	55882	55887	50 %	50 %	0 %	0 %	45478571
100	NC_005813	TA	3	6	56238	56243	50 %	50 %	0 %	0 %	45478572
101	NC_005813	TA	3	6	56245	56250	50 %	50 %	0 %	0 %	45478572
102	NC_005813	GA	3	6	56345	56350	50 %	0 %	50 %	0 %	45478573
103	NC_005813	TA	3	6	57194	57199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005813	AT	3	6	57541	57546	50 %	50 %	0 %	0 %	45478575
105	NC_005813	TA	3	6	57634	57639	50 %	50 %	0 %	0 %	45478575
106	NC_005813	GC	3	6	58069	58074	0 %	0 %	50 %	50 %	45478576
107	NC_005813	AG	3	6	58538	58543	50 %	0 %	50 %	0 %	45478577
108	NC_005813	AC	3	6	59011	59016	50 %	0 %	0 %	50 %	45478578
109	NC_005813	GA	3	6	60426	60431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005813	TC	3	6	61671	61676	0 %	50 %	0 %	50 %	45478580
111	NC_005813	GT	3	6	62586	62591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005813	TA	3	6	62955	62960	50 %	50 %	0 %	0 %	45478583
113	NC_005813	TC	3	6	63359	63364	0 %	50 %	0 %	50 %	45478584
114	NC_005813	CG	3	6	63728	63733	0 %	0 %	50 %	50 %	45478584
115	NC_005813	AC	3	6	63817	63822	50 %	0 %	0 %	50 %	45478584
116	NC_005813	GT	3	6	63839	63844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005813	GA	3	6	65895	65900	50 %	0 %	50 %	0 %	45478585
118	NC_005813	CA	3	6	66373	66378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_005813	TA	3	6	66732	66737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005813	GT	3	6	66865	66870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005813	AT	3	6	67020	67025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005813	AT	3	6	67142	67147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005813	GA	3	6	67857	67862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005813	TC	3	6	68682	68687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_005813	CG	3	6	69236	69241	0 %	0 %	50 %	50 %	45478586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.