MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
2	NC_005813	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	45478503
3	NC_005813	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
4	NC_005813	GT	3	6	2266	2271	0 %	50 %	50 %	0 %	45478505
5	NC_005813	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	45478505
6	NC_005813	AC	3	6	2517	2522	50 %	0 %	0 %	50 %	45478506
7	NC_005813	AC	3	6	2674	2679	50 %	0 %	0 %	50 %	45478507
8	NC_005813	AG	3	6	3380	3385	50 %	0 %	50 %	0 %	45478508
9	NC_005813	CA	3	6	3746	3751	50 %	0 %	0 %	50 %	45478510
10	NC_005813	CG	3	6	3890	3895	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
11	NC_005813	GC	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
12	NC_005813	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
13	NC_005813	TG	3	6	6832	6837	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
14	NC_005813	GC	3	6	6939	6944	0 %	0 %	50 %	50 %	45478513
15	NC_005813	TC	3	6	7053	7058	0 %	50 %	0 %	50 %	45478513
16	NC_005813	TC	3	6	7375	7380	0 %	50 %	0 %	50 %	45478514
17	NC_005813	AC	3	6	7451	7456	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
18	NC_005813	AC	3	6	7874	7879	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
19	NC_005813	AC	3	6	8860	8865	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
20	NC_005813	GC	3	6	8892	8897	0 %	0 %	50 %	50 %	45478514
21	NC_005813	AG	3	6	9332	9337	50 %	0 %	50 %	0 %	45478514
22	NC_005813	AT	3	6	9910	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	45478515
23	NC_005813	GA	4	8	10353	10360	50 %	0 %	50 %	0 %	45478515
24	NC_005813	AG	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	45478518
25	NC_005813	AG	3	6	12491	12496	50 %	0 %	50 %	0 %	45478518
26	NC_005813	CA	3	6	12846	12851	50 %	0 %	0 %	50 %	45478518
27	NC_005813	GC	4	8	12923	12930	0 %	0 %	50 %	50 %	45478518
28	NC_005813	AG	3	6	15077	15082	50 %	0 %	50 %	0 %	45478521
29	NC_005813	GC	3	6	16979	16984	0 %	0 %	50 %	50 %	45478523
30	NC_005813	CT	3	6	17236	17241	0 %	50 %	0 %	50 %	45478524
31	NC_005813	GT	3	6	18540	18545	0 %	50 %	50 %	0 %	45478526
32	NC_005813	TC	3	6	19911	19916	0 %	50 %	0 %	50 %	45478530
33	NC_005813	CG	3	6	21067	21072	0 %	0 %	50 %	50 %	45478531
34	NC_005813	AC	3	6	21331	21336	50 %	0 %	0 %	50 %	45478532
35	NC_005813	GA	3	6	24297	24302	50 %	0 %	50 %	0 %	45478535
36	NC_005813	AT	3	6	24681	24686	50 %	50 %	0 %	0 %	45478535
37	NC_005813	AG	3	6	25007	25012	50 %	0 %	50 %	0 %	45478536
38	NC_005813	TG	3	6	25159	25164	0 %	50 %	50 %	0 %	45478536
39	NC_005813	AT	3	6	26291	26296	50 %	50 %	0 %	0 %	45478537
40	NC_005813	GC	3	6	26869	26874	0 %	0 %	50 %	50 %	45478537
41	NC_005813	AG	3	6	27276	27281	50 %	0 %	50 %	0 %	45478538
42	NC_005813	TG	3	6	28787	28792	0 %	50 %	50 %	0 %	45478541
43	NC_005813	CG	3	6	29884	29889	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
44	NC_005813	CG	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
45	NC_005813	CT	3	6	30530	30535	0 %	50 %	0 %	50 %	45478542
46	NC_005813	AG	3	6	31759	31764	50 %	0 %	50 %	0 %	45478544
47	NC_005813	GC	3	6	34827	34832	0 %	0 %	50 %	50 %	45478549
48	NC_005813	TC	3	6	35514	35519	0 %	50 %	0 %	50 %	45478550
49	NC_005813	CG	3	6	35603	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	45478550
50	NC_005813	AT	3	6	35706	35711	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
51	NC_005813	AT	3	6	36349	36354	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
52	NC_005813	TC	3	6	36549	36554	0 %	50 %	0 %	50 %	45478550
53	NC_005813	AT	3	6	36829	36834	50 %	50 %	0 %	0 %	45478550
54	NC_005813	TC	3	6	37486	37491	0 %	50 %	0 %	50 %	45478551
55	NC_005813	TG	3	6	37768	37773	0 %	50 %	50 %	0 %	45478552
56	NC_005813	CT	3	6	39118	39123	0 %	50 %	0 %	50 %	45478554
57	NC_005813	AG	3	6	41218	41223	50 %	0 %	50 %	0 %	45478556
58	NC_005813	AG	3	6	43572	43577	50 %	0 %	50 %	0 %	45478559
59	NC_005813	GA	3	6	44274	44279	50 %	0 %	50 %	0 %	45478559
60	NC_005813	TA	4	8	46446	46453	50 %	50 %	0 %	0 %	45478562
61	NC_005813	TA	3	6	46664	46669	50 %	50 %	0 %	0 %	45478562
62	NC_005813	GA	3	6	47369	47374	50 %	0 %	50 %	0 %	45478564
63	NC_005813	CT	3	6	47812	47817	0 %	50 %	0 %	50 %	45478564
64	NC_005813	CT	3	6	49027	49032	0 %	50 %	0 %	50 %	45478565
65	NC_005813	GT	3	6	51162	51167	0 %	50 %	50 %	0 %	45478567
66	NC_005813	AT	3	6	51175	51180	50 %	50 %	0 %	0 %	45478567
67	NC_005813	GT	3	6	51290	51295	0 %	50 %	50 %	0 %	45478567
68	NC_005813	TC	4	8	54145	54152	0 %	50 %	0 %	50 %	45478569
69	NC_005813	GA	3	6	54374	54379	50 %	0 %	50 %	0 %	45478569
70	NC_005813	AT	3	6	55882	55887	50 %	50 %	0 %	0 %	45478571
71	NC_005813	TA	3	6	56238	56243	50 %	50 %	0 %	0 %	45478572
72	NC_005813	TA	3	6	56245	56250	50 %	50 %	0 %	0 %	45478572
73	NC_005813	GA	3	6	56345	56350	50 %	0 %	50 %	0 %	45478573
74	NC_005813	AT	3	6	57541	57546	50 %	50 %	0 %	0 %	45478575
75	NC_005813	TA	3	6	57634	57639	50 %	50 %	0 %	0 %	45478575
76	NC_005813	GC	3	6	58069	58074	0 %	0 %	50 %	50 %	45478576
77	NC_005813	AG	3	6	58538	58543	50 %	0 %	50 %	0 %	45478577
78	NC_005813	AC	3	6	59011	59016	50 %	0 %	0 %	50 %	45478578
79	NC_005813	TC	3	6	61671	61676	0 %	50 %	0 %	50 %	45478580
80	NC_005813	TA	3	6	62955	62960	50 %	50 %	0 %	0 %	45478583
81	NC_005813	TC	3	6	63359	63364	0 %	50 %	0 %	50 %	45478584
82	NC_005813	CG	3	6	63728	63733	0 %	0 %	50 %	50 %	45478584
83	NC_005813	AC	3	6	63817	63822	50 %	0 %	0 %	50 %	45478584
84	NC_005813	GA	3	6	65895	65900	50 %	0 %	50 %	0 %	45478585
85	NC_005813	CG	3	6	69236	69241	0 %	0 %	50 %	50 %	45478586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.