MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	45478503
2	NC_005813	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	45478504
3	NC_005813	G	6	6	2937	2942	0 %	0 %	100 %	0 %	45478507
4	NC_005813	A	6	6	3262	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	45478508
5	NC_005813	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	45478510
6	NC_005813	T	7	7	6961	6967	0 %	100 %	0 %	0 %	45478513
7	NC_005813	G	8	8	8601	8608	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
8	NC_005813	G	6	6	8661	8666	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
9	NC_005813	A	6	6	10055	10060	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
10	NC_005813	A	7	7	10337	10343	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
11	NC_005813	A	6	6	10482	10487	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
12	NC_005813	A	8	8	10542	10549	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
13	NC_005813	A	6	6	13368	13373	100 %	0 %	0 %	0 %	45478518
14	NC_005813	T	7	7	15034	15040	0 %	100 %	0 %	0 %	45478521
15	NC_005813	C	6	6	16127	16132	0 %	0 %	0 %	100 %	45478522
16	NC_005813	C	7	7	18398	18404	0 %	0 %	0 %	100 %	45478526
17	NC_005813	T	6	6	19961	19966	0 %	100 %	0 %	0 %	45478530
18	NC_005813	C	6	6	20257	20262	0 %	0 %	0 %	100 %	45478531
19	NC_005813	T	6	6	20523	20528	0 %	100 %	0 %	0 %	45478531
20	NC_005813	T	6	6	20770	20775	0 %	100 %	0 %	0 %	45478531
21	NC_005813	A	6	6	20894	20899	100 %	0 %	0 %	0 %	45478531
22	NC_005813	A	6	6	21041	21046	100 %	0 %	0 %	0 %	45478531
23	NC_005813	T	6	6	22592	22597	0 %	100 %	0 %	0 %	45478532
24	NC_005813	A	6	6	23101	23106	100 %	0 %	0 %	0 %	45478532
25	NC_005813	T	6	6	23526	23531	0 %	100 %	0 %	0 %	45478533
26	NC_005813	A	6	6	24513	24518	100 %	0 %	0 %	0 %	45478535
27	NC_005813	A	6	6	24525	24530	100 %	0 %	0 %	0 %	45478535
28	NC_005813	G	7	7	25224	25230	0 %	0 %	100 %	0 %	45478536
29	NC_005813	T	7	7	26559	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	45478537
30	NC_005813	A	7	7	26670	26676	100 %	0 %	0 %	0 %	45478537
31	NC_005813	A	7	7	28272	28278	100 %	0 %	0 %	0 %	45478540
32	NC_005813	G	7	7	28473	28479	0 %	0 %	100 %	0 %	45478540
33	NC_005813	T	6	6	30278	30283	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
34	NC_005813	T	6	6	30730	30735	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
35	NC_005813	T	6	6	31192	31197	0 %	100 %	0 %	0 %	45478543
36	NC_005813	C	9	9	32168	32176	0 %	0 %	0 %	100 %	45478544
37	NC_005813	C	6	6	32336	32341	0 %	0 %	0 %	100 %	45478544
38	NC_005813	T	7	7	33727	33733	0 %	100 %	0 %	0 %	45478545
39	NC_005813	C	6	6	34401	34406	0 %	0 %	0 %	100 %	45478548
40	NC_005813	C	8	8	35182	35189	0 %	0 %	0 %	100 %	45478550
41	NC_005813	A	6	6	36924	36929	100 %	0 %	0 %	0 %	45478550
42	NC_005813	A	7	7	38650	38656	100 %	0 %	0 %	0 %	45478553
43	NC_005813	A	6	6	38816	38821	100 %	0 %	0 %	0 %	45478553
44	NC_005813	C	6	6	39500	39505	0 %	0 %	0 %	100 %	45478555
45	NC_005813	A	7	7	40741	40747	100 %	0 %	0 %	0 %	45478556
46	NC_005813	T	6	6	42722	42727	0 %	100 %	0 %	0 %	45478558
47	NC_005813	T	6	6	43326	43331	0 %	100 %	0 %	0 %	45478559
48	NC_005813	A	6	6	43789	43794	100 %	0 %	0 %	0 %	45478559
49	NC_005813	T	6	6	44030	44035	0 %	100 %	0 %	0 %	45478559
50	NC_005813	T	6	6	44713	44718	0 %	100 %	0 %	0 %	45478560
51	NC_005813	T	6	6	45762	45767	0 %	100 %	0 %	0 %	45478561
52	NC_005813	T	6	6	46373	46378	0 %	100 %	0 %	0 %	45478562
53	NC_005813	T	7	7	47379	47385	0 %	100 %	0 %	0 %	45478564
54	NC_005813	A	6	6	48983	48988	100 %	0 %	0 %	0 %	45478565
55	NC_005813	A	7	7	49054	49060	100 %	0 %	0 %	0 %	45478565
56	NC_005813	A	7	7	54401	54407	100 %	0 %	0 %	0 %	45478569
57	NC_005813	T	6	6	56008	56013	0 %	100 %	0 %	0 %	45478571
58	NC_005813	A	6	6	56381	56386	100 %	0 %	0 %	0 %	45478573
59	NC_005813	G	6	6	57576	57581	0 %	0 %	100 %	0 %	45478575
60	NC_005813	T	6	6	61889	61894	0 %	100 %	0 %	0 %	45478581
61	NC_005813	A	6	6	62563	62568	100 %	0 %	0 %	0 %	45478582
62	NC_005813	T	7	7	63249	63255	0 %	100 %	0 %	0 %	45478584
63	NC_005813	A	6	6	63799	63804	100 %	0 %	0 %	0 %	45478584
64	NC_005813	A	6	6	64505	64510	100 %	0 %	0 %	0 %	45478585
65	NC_005813	C	6	6	65568	65573	0 %	0 %	0 %	100 %	45478585

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.