MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	CCTACG	2	12	2515	2526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005791	AAGGCC	2	12	3438	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005791	CCTACG	2	12	7556	7567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005791	AAGGCC	2	12	8479	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005791	CCTACG	2	12	39566	39577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005791	AAGGCC	2	12	40570	40581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005791	TTGATT	2	12	48936	48947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005791	AATTTA	2	12	60267	60278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005791	TTAAAT	2	12	60300	60311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005791	TAAATA	2	12	134796	134807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005791	TATTAG	2	12	141461	141472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005791	AATTTA	2	12	155390	155401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005791	AAAATT	2	12	169103	169114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005791	ATTTAA	2	12	170521	170532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005791	ATTTAA	2	12	186103	186114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005791	TAAAAA	2	12	192009	192020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005791	TAAAAA	3	18	193229	193246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005791	GTATAG	2	12	197580	197591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005791	TTTTAA	2	12	209462	209473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005791	TTTGAT	2	12	212319	212330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005791	ATAAAT	2	12	227273	227284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005791	ATAATT	2	12	255728	255739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005791	AAAATT	2	12	284036	284047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005791	ATTTGA	2	12	305082	305093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005791	ATAAAA	6	36	308887	308922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005791	TTTTTA	2	12	312755	312766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005791	AAAAAT	2	12	344899	344910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005791	CTTTTT	2	12	366950	366961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005791	CTTTTT	2	12	383562	383573	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005791	CCTATA	2	12	385566	385577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005791	ATTTTA	2	12	392891	392902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005791	ATTTTG	2	12	418543	418554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005791	TAAATT	2	12	426549	426560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005791	TATAAA	2	12	430529	430540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005791	TTTAAA	2	12	433163	433174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005791	TTTAAT	2	12	440218	440229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005791	TATAAT	2	12	441900	441911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005791	TAAGTT	2	12	449112	449123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005791	TAATTT	2	12	449452	449463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005791	GATTAT	2	12	463488	463499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005791	AATTTT	2	12	507614	507625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005791	TTAATG	2	12	543329	543340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005791	TAATTT	2	12	563122	563133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005791	TTTAAT	2	12	568340	568351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005791	TAAAAA	2	12	585606	585617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005791	TAAAAT	2	12	591688	591699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005791	TCTAAA	2	12	611338	611349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_005791	ATTAAT	2	12	637980	637991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005791	CAAAAT	2	12	650251	650262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_005791	TTTATT	2	12	651121	651132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005791	TTTGAA	2	12	657032	657043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005791	TAAAAA	2	12	682125	682136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005791	ATGCAT	2	12	686416	686427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_005791	AAAAAT	2	12	689836	689847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005791	ATAAAA	2	12	694388	694399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005791	ATTTTT	2	12	699978	699989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005791	AATTTT	2	12	713943	713954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005791	CCAAAA	2	12	714717	714728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005791	TAATTA	2	12	742296	742307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005791	TAATTT	2	12	761447	761458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005791	AATTTT	2	12	775701	775712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005791	TTCCCA	2	12	777497	777508	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005791	TAAACA	2	12	786724	786735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005791	TGTATT	2	12	821632	821643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005791	AAATTT	2	12	823094	823105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005791	TTAAAA	2	12	854441	854452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005791	CCAAAA	2	12	871950	871961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005791	TTTATC	2	12	879181	879192	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005791	TTAAAA	2	12	884226	884237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005791	TAAATA	2	12	898069	898080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005791	TATTAA	2	12	908353	908364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005791	ATTATA	2	12	923258	923269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005791	TTTTAA	2	12	940175	940186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005791	TAAAAA	2	12	961519	961530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005791	TAAAAA	2	12	982360	982371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005791	AATAAA	2	12	1023368	1023379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005791	ATCTAA	2	12	1023408	1023419	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_005791	ATTCTT	2	12	1030457	1030468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_005791	AAAATT	2	12	1043683	1043694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005791	TAAAAA	2	12	1060328	1060339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005791	AAATTA	2	12	1085838	1085849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005791	AAATTA	6	36	1091858	1091893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005791	TAAAAT	2	12	1103184	1103195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005791	ATTTTT	2	12	1122256	1122267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005791	AAATAC	2	12	1134707	1134718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_005791	CTAATT	2	12	1137692	1137703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005791	TTTAAA	2	12	1171272	1171283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005791	TATAAA	2	12	1174149	1174160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005791	AAAATT	2	12	1174217	1174228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005791	AAAATT	2	12	1180501	1180512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005791	ATTAAA	2	12	1211866	1211877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005791	AATTTT	2	12	1213493	1213504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005791	TTATTT	2	12	1214489	1214500	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005791	ATTTTT	2	12	1235914	1235925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005791	ATAATT	2	12	1260562	1260573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005791	TTTAAA	2	12	1270677	1270688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005791	TTATAA	2	12	1285861	1285872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005791	ATTTTG	2	12	1288549	1288560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005791	TAGGTT	2	12	1291038	1291049	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005791	TAAAAA	2	12	1292642	1292653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005791	ATTTTT	2	12	1293453	1293464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005791	AAAATA	2	12	1328933	1328944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005791	ATATTA	2	12	1338973	1338984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005791	TAATTA	2	12	1346729	1346740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005791	TTTTAA	2	12	1358842	1358853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005791	TTAAAA	2	12	1377603	1377614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005791	AATAAA	2	12	1471684	1471695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005791	AGAATT	2	12	1472936	1472947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005791	TAAAAA	2	12	1474525	1474536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005791	TCTACC	2	12	1497731	1497742	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_005791	TAAATT	2	12	1506841	1506852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005791	TAAATT	2	12	1520462	1520473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005791	AAAATT	2	12	1565925	1565936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005791	AATTAA	2	12	1577190	1577201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005791	TTATTT	2	12	1588748	1588759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005791	GCAGGG	2	12	1601003	1601014	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.