MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 1088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	TGGAA	2	10	10784	10793	40 %	20 %	40 %	0 %	45357565
2	NC_005791	CTGTT	2	10	13044	13053	0 %	60 %	20 %	20 %	45357567
3	NC_005791	ATTTT	2	10	13684	13693	20 %	80 %	0 %	0 %	45357568
4	NC_005791	ATATG	2	10	14799	14808	40 %	40 %	20 %	0 %	45357568
5	NC_005791	AAAAT	2	10	15083	15092	80 %	20 %	0 %	0 %	45357568
6	NC_005791	CATAA	2	10	15170	15179	60 %	20 %	0 %	20 %	45357568
7	NC_005791	AAAAC	2	10	16105	16114	80 %	0 %	0 %	20 %	45357569
8	NC_005791	TAAAA	6	30	17571	17600	80 %	20 %	0 %	0 %	45357570
9	NC_005791	TCAAT	2	10	18732	18741	40 %	40 %	0 %	20 %	45357571
10	NC_005791	TTTTA	2	10	19252	19261	20 %	80 %	0 %	0 %	45357571
11	NC_005791	CAATT	2	10	21952	21961	40 %	40 %	0 %	20 %	45357574
12	NC_005791	ATTCA	2	10	25168	25177	40 %	40 %	0 %	20 %	45357577
13	NC_005791	CTTTT	2	10	26316	26325	0 %	80 %	0 %	20 %	45357579
14	NC_005791	CAGAA	2	10	27912	27921	60 %	0 %	20 %	20 %	45357581
15	NC_005791	AAAAC	2	10	28521	28530	80 %	0 %	0 %	20 %	45357581
16	NC_005791	CTAAA	2	10	28786	28795	60 %	20 %	0 %	20 %	45357582
17	NC_005791	AGTGG	2	10	29208	29217	20 %	20 %	60 %	0 %	45357583
18	NC_005791	TATCC	2	10	29394	29403	20 %	40 %	0 %	40 %	45357583
19	NC_005791	AATTT	2	10	30418	30427	40 %	60 %	0 %	0 %	45357585
20	NC_005791	ATTTA	2	10	35845	35854	40 %	60 %	0 %	0 %	45357589
21	NC_005791	ACCGT	2	10	36097	36106	20 %	20 %	20 %	40 %	45357589
22	NC_005791	TTATA	2	10	44223	44232	40 %	60 %	0 %	0 %	45357591
23	NC_005791	TAAAT	2	10	44511	44520	60 %	40 %	0 %	0 %	45357591
24	NC_005791	TAAAT	2	10	44705	44714	60 %	40 %	0 %	0 %	45357591
25	NC_005791	ACTAA	2	10	44814	44823	60 %	20 %	0 %	20 %	45357592
26	NC_005791	TTTTA	2	10	44948	44957	20 %	80 %	0 %	0 %	45357592
27	NC_005791	GTTCA	2	10	47251	47260	20 %	40 %	20 %	20 %	45357593
28	NC_005791	ATGCA	2	10	51767	51776	40 %	20 %	20 %	20 %	45357597
29	NC_005791	AAATT	2	10	54184	54193	60 %	40 %	0 %	0 %	45357599
30	NC_005791	TTTTC	2	10	56923	56932	0 %	80 %	0 %	20 %	45357602
31	NC_005791	AATCA	2	10	57492	57501	60 %	20 %	0 %	20 %	45357603
32	NC_005791	TTTCT	2	10	58943	58952	0 %	80 %	0 %	20 %	45357604
33	NC_005791	GACAG	2	10	59490	59499	40 %	0 %	40 %	20 %	45357604
34	NC_005791	TTTAA	2	10	62801	62810	40 %	60 %	0 %	0 %	45357607
35	NC_005791	TAATT	2	10	62907	62916	40 %	60 %	0 %	0 %	45357607
36	NC_005791	GTACA	2	10	66006	66015	40 %	20 %	20 %	20 %	45357612
37	NC_005791	AAGAA	2	10	67095	67104	80 %	0 %	20 %	0 %	45357614
38	NC_005791	TATTT	2	10	70094	70103	20 %	80 %	0 %	0 %	45357619
39	NC_005791	AATTA	2	10	72766	72775	60 %	40 %	0 %	0 %	45357621
40	NC_005791	TATTG	2	10	75231	75240	20 %	60 %	20 %	0 %	45357625
41	NC_005791	TTAAA	2	10	77086	77095	60 %	40 %	0 %	0 %	45357627
42	NC_005791	GGTCA	2	10	77260	77269	20 %	20 %	40 %	20 %	45357628
43	NC_005791	GAACA	2	10	79128	79137	60 %	0 %	20 %	20 %	45357630
44	NC_005791	ATTCC	2	10	79851	79860	20 %	40 %	0 %	40 %	45357631
45	NC_005791	GTGCC	2	10	80799	80808	0 %	20 %	40 %	40 %	45357632
46	NC_005791	ACTAT	2	10	85140	85149	40 %	40 %	0 %	20 %	45357636
47	NC_005791	GAAAA	2	10	87390	87399	80 %	0 %	20 %	0 %	45357638
48	NC_005791	AATAA	2	10	88237	88246	80 %	20 %	0 %	0 %	45357640
49	NC_005791	ATAAA	2	10	88574	88583	80 %	20 %	0 %	0 %	45357640
50	NC_005791	TTTTA	2	10	89323	89332	20 %	80 %	0 %	0 %	45357641
51	NC_005791	AATTA	2	10	91444	91453	60 %	40 %	0 %	0 %	45357643
52	NC_005791	TTTAA	2	10	91596	91605	40 %	60 %	0 %	0 %	45357643
53	NC_005791	CTGTT	2	10	94659	94668	0 %	60 %	20 %	20 %	45357646
54	NC_005791	TCTTT	2	10	95565	95574	0 %	80 %	0 %	20 %	45357647
55	NC_005791	CTATT	2	10	96131	96140	20 %	60 %	0 %	20 %	45357648
56	NC_005791	CATTG	2	10	96326	96335	20 %	40 %	20 %	20 %	45357648
57	NC_005791	TGAAG	2	10	97334	97343	40 %	20 %	40 %	0 %	45357649
58	NC_005791	AATAA	2	10	105362	105371	80 %	20 %	0 %	0 %	45357658
59	NC_005791	GAAAT	2	10	105684	105693	60 %	20 %	20 %	0 %	45357658
60	NC_005791	TTCAC	2	10	107393	107402	20 %	40 %	0 %	40 %	45357660
61	NC_005791	TTTAT	2	10	108380	108389	20 %	80 %	0 %	0 %	45357662
62	NC_005791	AATTT	2	10	112714	112723	40 %	60 %	0 %	0 %	45357666
63	NC_005791	ATTTT	2	10	115831	115840	20 %	80 %	0 %	0 %	45357670
64	NC_005791	CAGTG	2	10	115925	115934	20 %	20 %	40 %	20 %	45357670
65	NC_005791	TGGAT	2	10	120361	120370	20 %	40 %	40 %	0 %	45357674
66	NC_005791	TTGTT	2	10	120619	120628	0 %	80 %	20 %	0 %	45357675
67	NC_005791	AATTC	2	10	120960	120969	40 %	40 %	0 %	20 %	45357675
68	NC_005791	AAAAT	2	10	122337	122346	80 %	20 %	0 %	0 %	45357676
69	NC_005791	TTATT	2	10	122670	122679	20 %	80 %	0 %	0 %	45357677
70	NC_005791	GTATT	2	10	123078	123087	20 %	60 %	20 %	0 %	45357677
71	NC_005791	ACACT	2	10	123532	123541	40 %	20 %	0 %	40 %	45357678
72	NC_005791	CTTAA	2	10	125181	125190	40 %	40 %	0 %	20 %	45357679
73	NC_005791	TATTT	2	10	127160	127169	20 %	80 %	0 %	0 %	45357682
74	NC_005791	ATTTT	2	10	127922	127931	20 %	80 %	0 %	0 %	45357684
75	NC_005791	TCCAA	2	10	128099	128108	40 %	20 %	0 %	40 %	45357685
76	NC_005791	ACAGA	2	10	133345	133354	60 %	0 %	20 %	20 %	45357689
77	NC_005791	AGCAA	2	10	134486	134495	60 %	0 %	20 %	20 %	45357690
78	NC_005791	TCATA	2	10	134686	134695	40 %	40 %	0 %	20 %	45357690
79	NC_005791	GTTTT	2	10	135072	135081	0 %	80 %	20 %	0 %	45357691
80	NC_005791	GAAAA	2	10	137139	137148	80 %	0 %	20 %	0 %	45357693
81	NC_005791	CTTTT	2	10	137655	137664	0 %	80 %	0 %	20 %	45357694
82	NC_005791	TAAAA	2	10	139081	139090	80 %	20 %	0 %	0 %	45357695
83	NC_005791	AAAAT	2	10	143906	143915	80 %	20 %	0 %	0 %	45357700
84	NC_005791	GTTTT	2	10	143931	143940	0 %	80 %	20 %	0 %	45357700
85	NC_005791	TTGAT	2	10	145687	145696	20 %	60 %	20 %	0 %	45357701
86	NC_005791	TTCAC	2	10	147292	147301	20 %	40 %	0 %	40 %	45357702
87	NC_005791	ATTTT	2	10	150626	150635	20 %	80 %	0 %	0 %	45357704
88	NC_005791	CCTGA	2	10	150961	150970	20 %	20 %	20 %	40 %	45357704
89	NC_005791	ATAAC	2	10	155461	155470	60 %	20 %	0 %	20 %	45357709
90	NC_005791	AAAAG	2	10	155696	155705	80 %	0 %	20 %	0 %	45357709
91	NC_005791	ACTGG	2	10	158152	158161	20 %	20 %	40 %	20 %	45357711
92	NC_005791	AAATG	2	10	158854	158863	60 %	20 %	20 %	0 %	45357711
93	NC_005791	GAAAA	2	10	159177	159186	80 %	0 %	20 %	0 %	45357711
94	NC_005791	TTTTC	2	10	164105	164114	0 %	80 %	0 %	20 %	45357716
95	NC_005791	TTGAT	2	10	164866	164875	20 %	60 %	20 %	0 %	45357716
96	NC_005791	AAAAC	2	10	168967	168976	80 %	0 %	0 %	20 %	45357722
97	NC_005791	TAATT	2	10	169140	169149	40 %	60 %	0 %	0 %	45357723
98	NC_005791	TTTCT	2	10	170406	170415	0 %	80 %	0 %	20 %	45357723
99	NC_005791	AAATC	2	10	171108	171117	60 %	20 %	0 %	20 %	45357724
100	NC_005791	CAAGT	2	10	171212	171221	40 %	20 %	20 %	20 %	45357724
101	NC_005791	ATTAA	2	10	173146	173155	60 %	40 %	0 %	0 %	45357727
102	NC_005791	GCTTC	2	10	174128	174137	0 %	40 %	20 %	40 %	45357728
103	NC_005791	TCCCG	2	10	175898	175907	0 %	20 %	20 %	60 %	45357730
104	NC_005791	AAAAT	2	10	176328	176337	80 %	20 %	0 %	0 %	45357730
105	NC_005791	CACTG	2	10	176617	176626	20 %	20 %	20 %	40 %	45357730
106	NC_005791	GGAAT	2	10	181798	181807	40 %	20 %	40 %	0 %	45357737
107	NC_005791	TGGAT	2	10	183038	183047	20 %	40 %	40 %	0 %	45357737
108	NC_005791	CGGTT	2	10	185585	185594	0 %	40 %	40 %	20 %	45357739
109	NC_005791	TAAAT	2	10	187984	187993	60 %	40 %	0 %	0 %	45357742
110	NC_005791	AACAC	2	10	193905	193914	60 %	0 %	0 %	40 %	45357748
111	NC_005791	CTTTT	2	10	196114	196123	0 %	80 %	0 %	20 %	45357750
112	NC_005791	ATTTT	2	10	201996	202005	20 %	80 %	0 %	0 %	45357756
113	NC_005791	TAATT	2	10	204685	204694	40 %	60 %	0 %	0 %	45357759
114	NC_005791	ATTTT	2	10	205365	205374	20 %	80 %	0 %	0 %	45357760
115	NC_005791	GGATA	2	10	208548	208557	40 %	20 %	40 %	0 %	45357764
116	NC_005791	ATAAA	2	10	208730	208739	80 %	20 %	0 %	0 %	45357764
117	NC_005791	TATTT	2	10	209004	209013	20 %	80 %	0 %	0 %	45357764
118	NC_005791	TTAAA	2	10	209240	209249	60 %	40 %	0 %	0 %	45357764
119	NC_005791	TGGAA	2	10	210639	210648	40 %	20 %	40 %	0 %	45357765
120	NC_005791	TTTAA	2	10	211121	211130	40 %	60 %	0 %	0 %	45357765
121	NC_005791	TTTAA	2	10	214088	214097	40 %	60 %	0 %	0 %	45357770
122	NC_005791	AAATA	2	10	215535	215544	80 %	20 %	0 %	0 %	45357771
123	NC_005791	AAAAT	2	10	215740	215749	80 %	20 %	0 %	0 %	45357771
124	NC_005791	ATTTA	2	10	216456	216465	40 %	60 %	0 %	0 %	45357771
125	NC_005791	GAATT	2	10	216645	216654	40 %	40 %	20 %	0 %	45357772
126	NC_005791	ATTAA	2	10	220210	220219	60 %	40 %	0 %	0 %	45357775
127	NC_005791	AAACC	2	10	221678	221687	60 %	0 %	0 %	40 %	45357777
128	NC_005791	AAAAC	2	10	225191	225200	80 %	0 %	0 %	20 %	45357781
129	NC_005791	GATAT	2	10	227027	227036	40 %	40 %	20 %	0 %	45357782
130	NC_005791	TGATA	2	10	228284	228293	40 %	40 %	20 %	0 %	45357783
131	NC_005791	CGAAA	2	10	229115	229124	60 %	0 %	20 %	20 %	45357784
132	NC_005791	AATCA	2	10	229828	229837	60 %	20 %	0 %	20 %	45357784
133	NC_005791	TGAAA	2	10	230497	230506	60 %	20 %	20 %	0 %	45357784
134	NC_005791	AAAAG	2	10	230779	230788	80 %	0 %	20 %	0 %	45357785
135	NC_005791	AGTGG	2	10	231044	231053	20 %	20 %	60 %	0 %	45357786
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137	NC_005791	CATTG	2	10	235272	235281	20 %	40 %	20 %	20 %	45357790
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