MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 4208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005791	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005791	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005791	CAAC	2	8	5573	5580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005791	GGCT	2	8	5842	5849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005791	TCCT	2	8	8741	8748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005791	TGCA	2	8	10901	10908	25 %	25 %	25 %	25 %	45357565
8	NC_005791	AATT	2	8	11311	11318	50 %	50 %	0 %	0 %	45357565
9	NC_005791	AATT	2	8	11520	11527	50 %	50 %	0 %	0 %	45357566
10	NC_005791	TAGA	2	8	12758	12765	50 %	25 %	25 %	0 %	45357567
11	NC_005791	AATC	2	8	12871	12878	50 %	25 %	0 %	25 %	45357567
12	NC_005791	ATTT	2	8	12977	12984	25 %	75 %	0 %	0 %	45357567
13	NC_005791	AATT	2	8	13307	13314	50 %	50 %	0 %	0 %	45357567
14	NC_005791	AATT	2	8	13910	13917	50 %	50 %	0 %	0 %	45357568
15	NC_005791	AATA	2	8	14825	14832	75 %	25 %	0 %	0 %	45357568
16	NC_005791	TTAA	2	8	15241	15248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005791	TAAA	2	8	15252	15259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005791	TGGA	2	8	15344	15351	25 %	25 %	50 %	0 %	45357569
19	NC_005791	TAAT	2	8	15514	15521	50 %	50 %	0 %	0 %	45357569
20	NC_005791	GAAG	2	8	15663	15670	50 %	0 %	50 %	0 %	45357569
21	NC_005791	AATT	2	8	15850	15857	50 %	50 %	0 %	0 %	45357569
22	NC_005791	TTCA	2	8	16015	16022	25 %	50 %	0 %	25 %	45357569
23	NC_005791	AAAT	2	8	16745	16752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005791	AATA	2	8	17390	17397	75 %	25 %	0 %	0 %	45357570
25	NC_005791	CTGA	2	8	17481	17488	25 %	25 %	25 %	25 %	45357570
26	NC_005791	ATTT	2	8	17605	17612	25 %	75 %	0 %	0 %	45357571
27	NC_005791	TCTG	2	8	17717	17724	0 %	50 %	25 %	25 %	45357571
28	NC_005791	GTAT	2	8	17819	17826	25 %	50 %	25 %	0 %	45357571
29	NC_005791	TTTA	2	8	18355	18362	25 %	75 %	0 %	0 %	45357571
30	NC_005791	CTTT	2	8	18717	18724	0 %	75 %	0 %	25 %	45357571
31	NC_005791	TAAA	2	8	19263	19270	75 %	25 %	0 %	0 %	45357571
32	NC_005791	CATG	2	8	19808	19815	25 %	25 %	25 %	25 %	45357572
33	NC_005791	TACT	2	8	19858	19865	25 %	50 %	0 %	25 %	45357572
34	NC_005791	TTAA	2	8	20397	20404	50 %	50 %	0 %	0 %	45357572
35	NC_005791	ATTT	2	8	20423	20430	25 %	75 %	0 %	0 %	45357572
36	NC_005791	TCAA	2	8	20433	20440	50 %	25 %	0 %	25 %	45357572
37	NC_005791	TATT	2	8	20975	20982	25 %	75 %	0 %	0 %	45357574
38	NC_005791	CTTG	2	8	21107	21114	0 %	50 %	25 %	25 %	45357574
39	NC_005791	AGGA	2	8	21420	21427	50 %	0 %	50 %	0 %	45357574
40	NC_005791	ATTT	2	8	21751	21758	25 %	75 %	0 %	0 %	45357574
41	NC_005791	ATTA	2	8	21772	21779	50 %	50 %	0 %	0 %	45357574
42	NC_005791	ACAA	2	8	22129	22136	75 %	0 %	0 %	25 %	45357575
43	NC_005791	TAGT	2	8	22571	22578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005791	CTTT	2	8	22956	22963	0 %	75 %	0 %	25 %	45357576
45	NC_005791	AGCA	2	8	23074	23081	50 %	0 %	25 %	25 %	45357576
46	NC_005791	ATAC	2	8	23155	23162	50 %	25 %	0 %	25 %	45357576
47	NC_005791	ATGG	2	8	23277	23284	25 %	25 %	50 %	0 %	45357576
48	NC_005791	GAAA	2	8	23669	23676	75 %	0 %	25 %	0 %	45357576
49	NC_005791	CTTT	2	8	24108	24115	0 %	75 %	0 %	25 %	45357577
50	NC_005791	CATT	2	8	24473	24480	25 %	50 %	0 %	25 %	45357577
51	NC_005791	ATTC	2	8	25665	25672	25 %	50 %	0 %	25 %	45357578
52	NC_005791	TTAT	2	8	26021	26028	25 %	75 %	0 %	0 %	45357578
53	NC_005791	TAAT	2	8	26105	26112	50 %	50 %	0 %	0 %	45357579
54	NC_005791	CTTT	2	8	27242	27249	0 %	75 %	0 %	25 %	45357580
55	NC_005791	AAAT	2	8	27470	27477	75 %	25 %	0 %	0 %	45357580
56	NC_005791	TAAA	2	8	28549	28556	75 %	25 %	0 %	0 %	45357581
57	NC_005791	ATTT	2	8	28691	28698	25 %	75 %	0 %	0 %	45357582
58	NC_005791	TGTT	2	8	29183	29190	0 %	75 %	25 %	0 %	45357583
59	NC_005791	ATAA	2	8	29223	29230	75 %	25 %	0 %	0 %	45357583
60	NC_005791	ATAG	2	8	29454	29461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005791	ATTT	2	8	29988	29995	25 %	75 %	0 %	0 %	45357584
62	NC_005791	TATT	2	8	31075	31082	25 %	75 %	0 %	0 %	45357586
63	NC_005791	TACT	2	8	31667	31674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005791	GGTT	2	8	31851	31858	0 %	50 %	50 %	0 %	45357587
65	NC_005791	AAGG	2	8	31957	31964	50 %	0 %	50 %	0 %	45357587
66	NC_005791	ATTT	2	8	31970	31977	25 %	75 %	0 %	0 %	45357587
67	NC_005791	TTTA	2	8	32058	32065	25 %	75 %	0 %	0 %	45357587
68	NC_005791	GCAG	2	8	32435	32442	25 %	0 %	50 %	25 %	45357587
69	NC_005791	AATA	2	8	32907	32914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005791	CTTT	2	8	33068	33075	0 %	75 %	0 %	25 %	45357588
71	NC_005791	AATC	2	8	33433	33440	50 %	25 %	0 %	25 %	45357589
72	NC_005791	TTCC	2	8	33798	33805	0 %	50 %	0 %	50 %	45357589
73	NC_005791	CATC	2	8	33912	33919	25 %	25 %	0 %	50 %	45357589
74	NC_005791	ATCT	2	8	34164	34171	25 %	50 %	0 %	25 %	45357589
75	NC_005791	TATC	2	8	34917	34924	25 %	50 %	0 %	25 %	45357589
76	NC_005791	GTTT	2	8	35932	35939	0 %	75 %	25 %	0 %	45357589
77	NC_005791	ATCT	2	8	36132	36139	25 %	50 %	0 %	25 %	45357589
78	NC_005791	AAAT	2	8	36224	36231	75 %	25 %	0 %	0 %	45357589
79	NC_005791	TTGT	2	8	36753	36760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005791	GCCT	2	8	36836	36843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005791	ATTC	2	8	36984	36991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005791	TGGG	2	8	37014	37021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005791	CAAC	2	8	37583	37590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005791	GGCT	2	8	37852	37859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_005791	TCCT	2	8	40832	40839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005791	AAAT	2	8	43073	43080	75 %	25 %	0 %	0 %	45357590
87	NC_005791	ATTT	2	8	43622	43629	25 %	75 %	0 %	0 %	45357591
88	NC_005791	TTTC	2	8	44023	44030	0 %	75 %	0 %	25 %	45357591
89	NC_005791	CATT	2	8	44383	44390	25 %	50 %	0 %	25 %	45357591
90	NC_005791	AAAT	2	8	44800	44807	75 %	25 %	0 %	0 %	45357592
91	NC_005791	GCAA	2	8	45051	45058	50 %	0 %	25 %	25 %	45357592
92	NC_005791	CGTC	2	8	45379	45386	0 %	25 %	25 %	50 %	45357592
93	NC_005791	ATTG	2	8	45974	45981	25 %	50 %	25 %	0 %	45357593
94	NC_005791	AATT	2	8	46358	46365	50 %	50 %	0 %	0 %	45357593
95	NC_005791	GATC	2	8	47022	47029	25 %	25 %	25 %	25 %	45357593
96	NC_005791	TTGA	2	8	47136	47143	25 %	50 %	25 %	0 %	45357593
97	NC_005791	TTTA	2	8	47230	47237	25 %	75 %	0 %	0 %	45357593
98	NC_005791	TAAT	2	8	47782	47789	50 %	50 %	0 %	0 %	45357594
99	NC_005791	ATTT	2	8	48004	48011	25 %	75 %	0 %	0 %	45357594
100	NC_005791	GATA	2	8	48827	48834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005791	TAAT	2	8	49075	49082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005791	ATTA	2	8	49387	49394	50 %	50 %	0 %	0 %	45357595
103	NC_005791	AAAT	2	8	49519	49526	75 %	25 %	0 %	0 %	45357595
104	NC_005791	TTCT	2	8	49732	49739	0 %	75 %	0 %	25 %	45357595
105	NC_005791	ATTT	2	8	49938	49945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005791	ATTA	2	8	49961	49968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005791	ATTA	2	8	50104	50111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005791	TAAT	2	8	50141	50148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005791	ATTT	2	8	50188	50195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005791	TATT	2	8	50267	50274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005791	TTAA	2	8	50317	50324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005791	ATTA	2	8	50339	50346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005791	ATTT	2	8	50374	50381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005791	AAAC	2	8	51044	51051	75 %	0 %	0 %	25 %	45357596
115	NC_005791	AAAG	2	8	51663	51670	75 %	0 %	25 %	0 %	45357596
116	NC_005791	TGGT	2	8	52215	52222	0 %	50 %	50 %	0 %	45357597
117	NC_005791	TAAA	2	8	52620	52627	75 %	25 %	0 %	0 %	45357597
118	NC_005791	CAAT	2	8	52867	52874	50 %	25 %	0 %	25 %	45357598
119	NC_005791	ATAA	2	8	53343	53350	75 %	25 %	0 %	0 %	45357598
120	NC_005791	TTTA	2	8	54914	54921	25 %	75 %	0 %	0 %	45357600
121	NC_005791	AAAT	2	8	54923	54930	75 %	25 %	0 %	0 %	45357600
122	NC_005791	ATTA	2	8	54954	54961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005791	CATA	2	8	55035	55042	50 %	25 %	0 %	25 %	45357601
124	NC_005791	CCTG	2	8	55400	55407	0 %	25 %	25 %	50 %	45357601
125	NC_005791	TTTC	2	8	55465	55472	0 %	75 %	0 %	25 %	45357601
126	NC_005791	CATA	2	8	55637	55644	50 %	25 %	0 %	25 %	45357601
127	NC_005791	ACCC	2	8	56244	56251	25 %	0 %	0 %	75 %	45357602
128	NC_005791	TACT	2	8	56724	56731	25 %	50 %	0 %	25 %	45357602
129	NC_005791	TTTC	2	8	56798	56805	0 %	75 %	0 %	25 %	45357602
130	NC_005791	CTTT	2	8	57056	57063	0 %	75 %	0 %	25 %	45357603
131	NC_005791	CATC	2	8	57388	57395	25 %	25 %	0 %	50 %	45357603
132	NC_005791	ATTA	2	8	57771	57778	50 %	50 %	0 %	0 %	45357603
133	NC_005791	TTCA	2	8	58440	58447	25 %	50 %	0 %	25 %	45357603
134	NC_005791	AAAT	2	8	58919	58926	75 %	25 %	0 %	0 %	45357604
135	NC_005791	TGCA	2	8	59009	59016	25 %	25 %	25 %	25 %	45357604
136	NC_005791	TTTC	2	8	59176	59183	0 %	75 %	0 %	25 %	45357604
137	NC_005791	AAAT	2	8	59403	59410	75 %	25 %	0 %	0 %	45357604
138	NC_005791	TCTT	2	8	59573	59580	0 %	75 %	0 %	25 %	45357604
139	NC_005791	TTCA	2	8	59688	59695	25 %	50 %	0 %	25 %	45357605
140	NC_005791	AATT	2	8	60197	60204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005791	AATT	2	8	60528	60535	50 %	50 %	0 %	0 %	45357606
142	NC_005791	ATTA	2	8	60787	60794	50 %	50 %	0 %	0 %	45357606
143	NC_005791	TGAT	2	8	60867	60874	25 %	50 %	25 %	0 %	45357606
144	NC_005791	ATTT	2	8	61528	61535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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