MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005791	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005791	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005791	CAAC	2	8	5573	5580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005791	GGCT	2	8	5842	5849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005791	TCCT	2	8	8741	8748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005791	TTAA	2	8	15241	15248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005791	TAAA	2	8	15252	15259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005791	AAAT	2	8	16745	16752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005791	TAGT	2	8	22571	22578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005791	ATAG	2	8	29454	29461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005791	TACT	2	8	31667	31674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_005791	AATA	2	8	32907	32914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005791	TTGT	2	8	36753	36760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005791	GCCT	2	8	36836	36843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005791	ATTC	2	8	36984	36991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005791	TGGG	2	8	37014	37021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005791	CAAC	2	8	37583	37590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005791	GGCT	2	8	37852	37859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005791	TCCT	2	8	40832	40839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005791	GATA	2	8	48827	48834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005791	TAAT	2	8	49075	49082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005791	ATTT	2	8	49938	49945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005791	ATTA	2	8	49961	49968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005791	ATTA	2	8	50104	50111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005791	TAAT	2	8	50141	50148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005791	ATTT	2	8	50188	50195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005791	TATT	2	8	50267	50274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005791	TTAA	2	8	50317	50324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005791	ATTA	2	8	50339	50346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005791	ATTT	2	8	50374	50381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005791	ATTA	2	8	54954	54961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005791	AATT	2	8	60197	60204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005791	ATTT	2	8	61528	61535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005791	TAAG	2	8	70055	70062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005791	TAAT	2	8	72435	72442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005791	TATT	2	8	72515	72522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005791	AAAG	2	8	75110	75117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005791	CTTT	2	8	76360	76367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005791	TATT	2	8	76418	76425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005791	TTCC	2	8	76522	76529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005791	ACCA	2	8	76537	76544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005791	TAAG	2	8	78868	78875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005791	ATTT	2	8	80614	80621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005791	AACT	2	8	82285	82292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005791	TAAT	2	8	82427	82434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005791	GAAT	2	8	82454	82461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005791	AATT	2	8	82609	82616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005791	TTAA	2	8	83750	83757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005791	TTTA	2	8	83827	83834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005791	ATTT	2	8	84912	84919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005791	ATTT	2	8	86198	86205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005791	ATCT	2	8	89623	89630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_005791	ATCA	2	8	89678	89685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_005791	AATA	2	8	90388	90395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005791	ACTT	2	8	95084	95091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_005791	AAAT	2	8	95098	95105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005791	AAAT	2	8	95326	95333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005791	AAAT	2	8	97679	97686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005791	ATTA	2	8	111704	111711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005791	AATT	2	8	111768	111775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005791	ATTC	2	8	114431	114438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_005791	CTAA	2	8	116323	116330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005791	CAAT	3	12	128946	128957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_005791	ATTT	2	8	129008	129015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005791	TACA	2	8	134863	134870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005791	AATA	2	8	134890	134897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005791	TAAT	2	8	140970	140977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005791	GAAA	2	8	141347	141354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005791	TCAA	2	8	141588	141595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_005791	ATTG	2	8	157813	157820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005791	AAAT	2	8	158000	158007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005791	ATAA	2	8	165107	165114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005791	CATA	2	8	166854	166861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005791	ACTA	2	8	172033	172040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005791	TAAA	2	8	190575	190582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005791	AAAC	2	8	191811	191818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_005791	TAAA	2	8	191920	191927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005791	ATTT	2	8	192269	192276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005791	TATT	2	8	193693	193700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005791	TTAA	2	8	196528	196535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005791	TAAA	2	8	196575	196582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005791	TTTC	2	8	197726	197733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005791	GATT	2	8	199675	199682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005791	CTTT	2	8	202248	202255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_005791	TATT	2	8	202265	202272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005791	TTAA	2	8	202440	202447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005791	TAAA	2	8	202479	202486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005791	ATTT	2	8	203381	203388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005791	TTAA	2	8	203955	203962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005791	TTTA	2	8	209852	209859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005791	TTAA	2	8	209907	209914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005791	TATT	2	8	209955	209962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005791	TAAT	2	8	212210	212217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005791	ATTA	2	8	212236	212243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005791	GTAT	2	8	212271	212278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005791	TTTA	2	8	212410	212417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005791	TTTA	2	8	218220	218227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005791	AAAT	2	8	230531	230538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005791	TAAG	2	8	236751	236758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005791	AATA	2	8	239492	239499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005791	AGGA	2	8	241471	241478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005791	ATTT	2	8	250171	250178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005791	AAAT	2	8	251126	251133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005791	TTAT	2	8	252191	252198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005791	TAAA	2	8	252215	252222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005791	TTTA	2	8	263079	263086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005791	ATTT	2	8	263419	263426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005791	ATTA	2	8	263669	263676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005791	ACTT	2	8	274277	274284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005791	TTTA	2	8	274394	274401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005791	AAAT	2	8	278295	278302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005791	ATCA	2	8	279537	279544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_005791	ATAA	2	8	279565	279572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005791	ATAA	2	8	284019	284026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005791	ATTA	2	8	291068	291075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005791	TATT	2	8	291616	291623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005791	TAAC	2	8	294144	294151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_005791	TTAA	2	8	294199	294206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005791	ATTA	2	8	297309	297316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005791	ATTA	2	8	298747	298754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005791	TATT	2	8	299205	299212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005791	AGTT	2	8	299231	299238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005791	TTAA	2	8	302453	302460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005791	ATGG	2	8	308784	308791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005791	TTAT	2	8	312789	312796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005791	TAAA	2	8	315901	315908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005791	TATT	2	8	322233	322240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005791	GGGA	2	8	324513	324520	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005791	TAAA	2	8	330492	330499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005791	TAAA	2	8	332774	332781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005791	ATTT	2	8	334758	334765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005791	AATT	2	8	335686	335693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005791	TTAA	2	8	337598	337605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005791	TACT	2	8	339151	339158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005791	TAAA	2	8	339214	339221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005791	AGTT	2	8	343612	343619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005791	TTTA	2	8	343674	343681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005791	TTTA	2	8	345733	345740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005791	AAAT	2	8	356623	356630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005791	ATTT	2	8	356686	356693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005791	ATAA	2	8	364756	364763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005791	TACT	2	8	371131	371138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005791	ATTA	2	8	379543	379550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005791	ACTT	2	8	381367	381374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_005791	ATTT	2	8	381477	381484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005791	ATTT	2	8	381639	381646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005791	CAAT	2	8	383831	383838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_005791	TAAA	2	8	384302	384309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005791	TCTT	2	8	384320	384327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_005791	TCTT	2	8	384345	384352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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