MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005791	TTTC	2	8	1624584	1624591	0 %	75 %	0 %	25 %	45359245
3502	NC_005791	ATAA	2	8	1624932	1624939	75 %	25 %	0 %	0 %	45359245
3503	NC_005791	AATC	2	8	1625496	1625503	50 %	25 %	0 %	25 %	45359245
3504	NC_005791	ATAC	2	8	1625924	1625931	50 %	25 %	0 %	25 %	45359246
3505	NC_005791	ATTA	2	8	1627087	1627094	50 %	50 %	0 %	0 %	45359247
3506	NC_005791	AATT	2	8	1628003	1628010	50 %	50 %	0 %	0 %	45359249
3507	NC_005791	TTTA	2	8	1628591	1628598	25 %	75 %	0 %	0 %	45359249
3508	NC_005791	GGAA	2	8	1628627	1628634	50 %	0 %	50 %	0 %	45359249
3509	NC_005791	TTGA	2	8	1628809	1628816	25 %	50 %	25 %	0 %	45359249
3510	NC_005791	AAAT	2	8	1629897	1629904	75 %	25 %	0 %	0 %	45359251
3511	NC_005791	TTCA	2	8	1630297	1630304	25 %	50 %	0 %	25 %	45359252
3512	NC_005791	GATG	2	8	1630327	1630334	25 %	25 %	50 %	0 %	45359252
3513	NC_005791	ACAA	2	8	1630420	1630427	75 %	0 %	0 %	25 %	45359252
3514	NC_005791	ATCC	2	8	1631122	1631129	25 %	25 %	0 %	50 %	45359253
3515	NC_005791	ATAC	2	8	1631573	1631580	50 %	25 %	0 %	25 %	45359254
3516	NC_005791	TGTC	2	8	1632128	1632135	0 %	50 %	25 %	25 %	45359254
3517	NC_005791	TGCA	2	8	1632570	1632577	25 %	25 %	25 %	25 %	45359254
3518	NC_005791	ACAT	2	8	1632828	1632835	50 %	25 %	0 %	25 %	45359255
3519	NC_005791	AACT	2	8	1633722	1633729	50 %	25 %	0 %	25 %	45359255
3520	NC_005791	GGTA	2	8	1634177	1634184	25 %	25 %	50 %	0 %	45359257
3521	NC_005791	GTTT	2	8	1634643	1634650	0 %	75 %	25 %	0 %	45359257
3522	NC_005791	TTGA	2	8	1634932	1634939	25 %	50 %	25 %	0 %	45359257
3523	NC_005791	CATG	2	8	1635655	1635662	25 %	25 %	25 %	25 %	45359258
3524	NC_005791	CAAT	2	8	1638078	1638085	50 %	25 %	0 %	25 %	45359260
3525	NC_005791	TAAT	2	8	1638319	1638326	50 %	50 %	0 %	0 %	45359260
3526	NC_005791	TCCT	2	8	1638421	1638428	0 %	50 %	0 %	50 %	45359260
3527	NC_005791	GTTA	2	8	1640761	1640768	25 %	50 %	25 %	0 %	45359263
3528	NC_005791	TTTA	2	8	1641758	1641765	25 %	75 %	0 %	0 %	45359263
3529	NC_005791	ATTC	2	8	1642117	1642124	25 %	50 %	0 %	25 %	45359263
3530	NC_005791	GATA	2	8	1642887	1642894	50 %	25 %	25 %	0 %	45359264
3531	NC_005791	TTAT	2	8	1642954	1642961	25 %	75 %	0 %	0 %	45359264
3532	NC_005791	CAAA	2	8	1643350	1643357	75 %	0 %	0 %	25 %	45359265
3533	NC_005791	AATC	2	8	1643456	1643463	50 %	25 %	0 %	25 %	45359265
3534	NC_005791	AGAT	2	8	1644404	1644411	50 %	25 %	25 %	0 %	45359266
3535	NC_005791	TAAA	2	8	1644437	1644444	75 %	25 %	0 %	0 %	45359266
3536	NC_005791	TTAA	2	8	1645097	1645104	50 %	50 %	0 %	0 %	45359266
3537	NC_005791	TAAT	2	8	1645975	1645982	50 %	50 %	0 %	0 %	45359268
3538	NC_005791	ATCA	2	8	1646223	1646230	50 %	25 %	0 %	25 %	45359268
3539	NC_005791	ATCT	2	8	1646971	1646978	25 %	50 %	0 %	25 %	45359270
3540	NC_005791	ATCC	2	8	1647056	1647063	25 %	25 %	0 %	50 %	45359270
3541	NC_005791	TTCC	3	12	1647090	1647101	0 %	50 %	0 %	50 %	45359270
3542	NC_005791	CAGT	2	8	1647442	1647449	25 %	25 %	25 %	25 %	45359271
3543	NC_005791	ATTT	2	8	1648006	1648013	25 %	75 %	0 %	0 %	45359273
3544	NC_005791	ATTT	2	8	1648138	1648145	25 %	75 %	0 %	0 %	45359273
3545	NC_005791	CTTT	2	8	1648149	1648156	0 %	75 %	0 %	25 %	45359273
3546	NC_005791	ATTT	2	8	1648647	1648654	25 %	75 %	0 %	0 %	45359274
3547	NC_005791	TTGA	2	8	1648727	1648734	25 %	50 %	25 %	0 %	45359274
3548	NC_005791	ATTT	2	8	1648842	1648849	25 %	75 %	0 %	0 %	45359274
3549	NC_005791	TTGT	2	8	1650634	1650641	0 %	75 %	25 %	0 %	45359276
3550	NC_005791	ATCA	2	8	1651676	1651683	50 %	25 %	0 %	25 %	45359277
3551	NC_005791	GATC	2	8	1651750	1651757	25 %	25 %	25 %	25 %	45359278
3552	NC_005791	TTTA	2	8	1651840	1651847	25 %	75 %	0 %	0 %	45359278
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3556	NC_005791	ATTT	2	8	1654213	1654220	25 %	75 %	0 %	0 %	45359280
3557	NC_005791	TCAA	2	8	1654464	1654471	50 %	25 %	0 %	25 %	45359281
3558	NC_005791	GATT	2	8	1654937	1654944	25 %	50 %	25 %	0 %	45359282
3559	NC_005791	GAAT	2	8	1655192	1655199	50 %	25 %	25 %	0 %	45359282
3560	NC_005791	TATT	2	8	1655352	1655359	25 %	75 %	0 %	0 %	45359282
3561	NC_005791	CATT	2	8	1656126	1656133	25 %	50 %	0 %	25 %	45359282
3562	NC_005791	ATTT	2	8	1656282	1656289	25 %	75 %	0 %	0 %	45359282
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3564	NC_005791	ATTG	2	8	1656376	1656383	25 %	50 %	25 %	0 %	45359282
3565	NC_005791	AGTC	2	8	1656972	1656979	25 %	25 %	25 %	25 %	45359282
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3570	NC_005791	AAAT	2	8	1659127	1659134	75 %	25 %	0 %	0 %	45359283
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3572	NC_005791	ATTG	2	8	1659983	1659990	25 %	50 %	25 %	0 %	45359284
3573	NC_005791	TGGA	2	8	1660094	1660101	25 %	25 %	50 %	0 %	45359284
3574	NC_005791	ATTC	2	8	1660529	1660536	25 %	50 %	0 %	25 %	45359285
3575	NC_005791	AATA	2	8	1660613	1660620	75 %	25 %	0 %	0 %	45359285

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.