MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A chromosome

Total Repeats: 3303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005773	TTCGT	2	10	3087	3096	0 %	60 %	20 %	20 %	71736050
2	NC_005773	TTCCG	2	10	4901	4910	0 %	40 %	20 %	40 %	71735115
3	NC_005773	GGTCT	2	10	5978	5987	0 %	40 %	40 %	20 %	71735115
4	NC_005773	AACGT	2	10	6015	6024	40 %	20 %	20 %	20 %	71735115
5	NC_005773	GCGCG	2	10	15784	15793	0 %	0 %	60 %	40 %	71736576
6	NC_005773	CCAGA	2	10	16792	16801	40 %	0 %	20 %	40 %	71735874
7	NC_005773	CCCAG	2	10	16947	16956	20 %	0 %	20 %	60 %	71735874
8	NC_005773	GCGCC	2	10	19284	19293	0 %	0 %	40 %	60 %	71734940
9	NC_005773	GCGCC	2	10	19422	19431	0 %	0 %	40 %	60 %	71734940
10	NC_005773	TGCCG	2	10	22949	22958	0 %	20 %	40 %	40 %	71736653
11	NC_005773	TGCCT	2	10	23717	23726	0 %	40 %	20 %	40 %	71736653
12	NC_005773	ACCTG	2	10	24141	24150	20 %	20 %	20 %	40 %	71736653
13	NC_005773	GCCCT	2	10	25683	25692	0 %	20 %	20 %	60 %	71737239
14	NC_005773	CCTGA	2	10	27343	27352	20 %	20 %	20 %	40 %	71736102
15	NC_005773	GCGTG	2	10	28447	28456	0 %	20 %	60 %	20 %	71736684
16	NC_005773	CGGTG	2	10	29501	29510	0 %	20 %	60 %	20 %	71735048
17	NC_005773	CGAAA	2	10	34182	34191	60 %	0 %	20 %	20 %	71734030
18	NC_005773	CTCGA	2	10	35160	35169	20 %	20 %	20 %	40 %	71737365
19	NC_005773	GGCGC	2	10	36468	36477	0 %	0 %	60 %	40 %	71734150
20	NC_005773	TCCGC	2	10	39391	39400	0 %	20 %	20 %	60 %	71736555
21	NC_005773	GCGTA	2	10	41145	41154	20 %	20 %	40 %	20 %	71733716
22	NC_005773	GCAAG	2	10	42167	42176	40 %	0 %	40 %	20 %	71734425
23	NC_005773	TGACG	2	10	46296	46305	20 %	20 %	40 %	20 %	71736455
24	NC_005773	TGTGG	2	10	49911	49920	0 %	40 %	60 %	0 %	71734879
25	NC_005773	GCCGT	2	10	57101	57110	0 %	20 %	40 %	40 %	71735998
26	NC_005773	ACGCC	2	10	58174	58183	20 %	0 %	20 %	60 %	71735157
27	NC_005773	TGGCG	2	10	59407	59416	0 %	20 %	60 %	20 %	71734037
28	NC_005773	GTAAG	2	10	60978	60987	40 %	20 %	40 %	0 %	71734037
29	NC_005773	ACTCC	2	10	64272	64281	20 %	20 %	0 %	60 %	71734634
30	NC_005773	GGCGC	2	10	65469	65478	0 %	0 %	60 %	40 %	71733208
31	NC_005773	CACTG	2	10	69736	69745	20 %	20 %	20 %	40 %	71736034
32	NC_005773	CCACG	2	10	71373	71382	20 %	0 %	20 %	60 %	71737743
33	NC_005773	GCGCT	2	10	71843	71852	0 %	20 %	40 %	40 %	71737743
34	NC_005773	TCAGT	2	10	72486	72495	20 %	40 %	20 %	20 %	71737743
35	NC_005773	ACCCT	2	10	73594	73603	20 %	20 %	0 %	60 %	71737534
36	NC_005773	TGCGC	2	10	74944	74953	0 %	20 %	40 %	40 %	71734140
37	NC_005773	TCGCG	2	10	76244	76253	0 %	20 %	40 %	40 %	71736888
38	NC_005773	GGCCA	2	10	77770	77779	20 %	0 %	40 %	40 %	71736199
39	NC_005773	TGCCG	2	10	78433	78442	0 %	20 %	40 %	40 %	71736199
40	NC_005773	TGGTC	2	10	80453	80462	0 %	40 %	40 %	20 %	71735782
41	NC_005773	TCACT	2	10	81056	81065	20 %	40 %	0 %	40 %	71735782
42	NC_005773	CCAGA	2	10	82249	82258	40 %	0 %	20 %	40 %	71737842
43	NC_005773	GGGGT	2	10	82481	82490	0 %	20 %	80 %	0 %	71737842
44	NC_005773	GCCGC	2	10	83010	83019	0 %	0 %	40 %	60 %	71737842
45	NC_005773	GCGCA	2	10	85968	85977	20 %	0 %	40 %	40 %	71736508
46	NC_005773	CGGGC	2	10	92559	92568	0 %	0 %	60 %	40 %	71735385
47	NC_005773	TGGCA	2	10	93052	93061	20 %	20 %	40 %	20 %	71735385
48	NC_005773	ACGCA	2	10	98221	98230	40 %	0 %	20 %	40 %	71735135
49	NC_005773	TCATT	2	10	99565	99574	20 %	60 %	0 %	20 %	71733454
50	NC_005773	TGGGC	2	10	101255	101264	0 %	20 %	60 %	20 %	71733348
51	NC_005773	CGCCC	2	10	101743	101752	0 %	0 %	20 %	80 %	71733348
52	NC_005773	CAGCA	2	10	103658	103667	40 %	0 %	20 %	40 %	71738163
53	NC_005773	TCAGG	2	10	104377	104386	20 %	20 %	40 %	20 %	71738163
54	NC_005773	CCAGC	2	10	109787	109796	20 %	0 %	20 %	60 %	71733707
55	NC_005773	AAAAG	2	10	113382	113391	80 %	0 %	20 %	0 %	71734808
56	NC_005773	CCTCG	2	10	113769	113778	0 %	20 %	20 %	60 %	71734414
57	NC_005773	CCACG	2	10	117501	117510	20 %	0 %	20 %	60 %	71733859
58	NC_005773	CGCTG	2	10	121237	121246	0 %	20 %	40 %	40 %	71735552
59	NC_005773	ACCCT	2	10	122889	122898	20 %	20 %	0 %	60 %	71735008
60	NC_005773	GCGAG	2	10	127489	127498	20 %	0 %	60 %	20 %	71736766
61	NC_005773	GCTTT	2	10	134548	134557	0 %	60 %	20 %	20 %	71733687
62	NC_005773	GACCT	2	10	136318	136327	20 %	20 %	20 %	40 %	71733302
63	NC_005773	ACGGG	2	10	138944	138953	20 %	0 %	60 %	20 %	71733734
64	NC_005773	GCCAG	2	10	139520	139529	20 %	0 %	40 %	40 %	71733734
65	NC_005773	CAGGG	2	10	142796	142805	20 %	0 %	60 %	20 %	71738017
66	NC_005773	GTCCT	2	10	143670	143679	0 %	40 %	20 %	40 %	71736066
67	NC_005773	CTGCG	2	10	145111	145120	0 %	20 %	40 %	40 %	71736620
68	NC_005773	TCGCT	2	10	146136	146145	0 %	40 %	20 %	40 %	71736620
69	NC_005773	GAGGC	2	10	146576	146585	20 %	0 %	60 %	20 %	71736620
70	NC_005773	GGTCA	2	10	146767	146776	20 %	20 %	40 %	20 %	71736620
71	NC_005773	GAATT	2	10	150147	150156	40 %	40 %	20 %	0 %	71733359
72	NC_005773	CCACG	2	10	150316	150325	20 %	0 %	20 %	60 %	71733359
73	NC_005773	CGATG	2	10	151077	151086	20 %	20 %	40 %	20 %	71736516
74	NC_005773	CAGGG	2	10	152961	152970	20 %	0 %	60 %	20 %	71736516
75	NC_005773	TCGTT	2	10	153470	153479	0 %	60 %	20 %	20 %	71736516
76	NC_005773	ATGCG	2	10	154176	154185	20 %	20 %	40 %	20 %	71737889
77	NC_005773	TCGGC	2	10	155388	155397	0 %	20 %	40 %	40 %	71735418
78	NC_005773	ATCGA	2	10	158138	158147	40 %	20 %	20 %	20 %	71734334
79	NC_005773	TCAGG	2	10	161404	161413	20 %	20 %	40 %	20 %	71737586
80	NC_005773	CCGAG	2	10	164246	164255	20 %	0 %	40 %	40 %	71733264
81	NC_005773	GCAAT	2	10	164412	164421	40 %	20 %	20 %	20 %	71733264
82	NC_005773	CAGGG	2	10	166034	166043	20 %	0 %	60 %	20 %	71733934
83	NC_005773	TCAGG	2	10	167325	167334	20 %	20 %	40 %	20 %	71734476
84	NC_005773	GGTGT	2	10	170466	170475	0 %	40 %	60 %	0 %	71737268
85	NC_005773	CGGGT	2	10	174044	174053	0 %	20 %	60 %	20 %	71736857
86	NC_005773	GGGCG	2	10	174737	174746	0 %	0 %	80 %	20 %	71736857
87	NC_005773	CGGCC	2	10	184028	184037	0 %	0 %	40 %	60 %	71733790
88	NC_005773	AGGGC	2	10	185776	185785	20 %	0 %	60 %	20 %	71734817
89	NC_005773	CAGGT	2	10	199750	199759	20 %	20 %	40 %	20 %	71737260
90	NC_005773	TGGCG	2	10	201237	201246	0 %	20 %	60 %	20 %	71737260
91	NC_005773	GCGCC	2	10	201885	201894	0 %	0 %	40 %	60 %	71737260
92	NC_005773	GCGTT	2	10	202162	202171	0 %	40 %	40 %	20 %	71737260
93	NC_005773	CAGCG	2	10	203638	203647	20 %	0 %	40 %	40 %	71737260
94	NC_005773	AATTA	2	10	205277	205286	60 %	40 %	0 %	0 %	123979206
95	NC_005773	TCGCG	2	10	207970	207979	0 %	20 %	40 %	40 %	71733711
96	NC_005773	CGGCG	2	10	212037	212046	0 %	0 %	60 %	40 %	71734072
97	NC_005773	GTTGC	2	10	212150	212159	0 %	40 %	40 %	20 %	71734072
98	NC_005773	GCTAG	2	10	214285	214294	20 %	20 %	40 %	20 %	71733329
99	NC_005773	ACGAT	2	10	215696	215705	40 %	20 %	20 %	20 %	71733329
100	NC_005773	TGCGC	2	10	218150	218159	0 %	20 %	40 %	40 %	71735347
101	NC_005773	ACGTT	2	10	222250	222259	20 %	40 %	20 %	20 %	71737666
102	NC_005773	CGACC	2	10	222974	222983	20 %	0 %	20 %	60 %	71734273
103	NC_005773	AGCGC	2	10	225650	225659	20 %	0 %	40 %	40 %	71736980
104	NC_005773	CGCGT	2	10	226994	227003	0 %	20 %	40 %	40 %	71733507
105	NC_005773	GGTCC	2	10	228842	228851	0 %	20 %	40 %	40 %	71733507
106	NC_005773	TTTCT	2	10	228979	228988	0 %	80 %	0 %	20 %	71733507
107	NC_005773	GGCAA	2	10	229469	229478	40 %	0 %	40 %	20 %	71733396
108	NC_005773	TACCG	2	10	231467	231476	20 %	20 %	20 %	40 %	71735760
109	NC_005773	CGATG	2	10	231806	231815	20 %	20 %	40 %	20 %	71735760
110	NC_005773	GCAAG	2	10	239749	239758	40 %	0 %	40 %	20 %	71737993
111	NC_005773	TCAGC	2	10	242883	242892	20 %	20 %	20 %	40 %	71736995
112	NC_005773	CCACG	2	10	244636	244645	20 %	0 %	20 %	60 %	71737974
113	NC_005773	GCTCA	2	10	248096	248105	20 %	20 %	20 %	40 %	71734935
114	NC_005773	CGGCT	2	10	249861	249870	0 %	20 %	40 %	40 %	71735786
115	NC_005773	CGCGC	2	10	254482	254491	0 %	0 %	40 %	60 %	71735222
116	NC_005773	TCGGC	2	10	255838	255847	0 %	20 %	40 %	40 %	71736437
117	NC_005773	TGGCT	2	10	256338	256347	0 %	40 %	40 %	20 %	71736437
118	NC_005773	CGAGC	2	10	257885	257894	20 %	0 %	40 %	40 %	71737156
119	NC_005773	ACGGC	2	10	260339	260348	20 %	0 %	40 %	40 %	71734259
120	NC_005773	ATGAC	2	10	262144	262153	40 %	20 %	20 %	20 %	71735668
121	NC_005773	TGAAC	2	10	262986	262995	40 %	20 %	20 %	20 %	71736924
122	NC_005773	CGCAG	2	10	263905	263914	20 %	0 %	40 %	40 %	71737818
123	NC_005773	GCTGC	2	10	264980	264989	0 %	20 %	40 %	40 %	71737117
124	NC_005773	CAGCC	2	10	267064	267073	20 %	0 %	20 %	60 %	71734241
125	NC_005773	TCACC	2	10	268390	268399	20 %	20 %	0 %	60 %	71735687
126	NC_005773	ACCTG	2	10	268784	268793	20 %	20 %	20 %	40 %	71735687
127	NC_005773	CGCAC	2	10	268871	268880	20 %	0 %	20 %	60 %	71735687
128	NC_005773	CGCTG	2	10	269417	269426	0 %	20 %	40 %	40 %	71734840
129	NC_005773	GCGCT	2	10	270178	270187	0 %	20 %	40 %	40 %	71734840
130	NC_005773	GAAGC	2	10	274797	274806	40 %	0 %	40 %	20 %	71735852
131	NC_005773	GTTGC	2	10	275713	275722	0 %	40 %	40 %	20 %	71737194
132	NC_005773	CAGCG	2	10	277490	277499	20 %	0 %	40 %	40 %	71733600
133	NC_005773	GCCAG	2	10	277858	277867	20 %	0 %	40 %	40 %	71733600
134	NC_005773	GACCA	2	10	278799	278808	40 %	0 %	20 %	40 %	71735263
135	NC_005773	ACCGT	2	10	278955	278964	20 %	20 %	20 %	40 %	71735263
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