MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus ATCC 10987 plasmid pBc10987

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005707	ATACGA	2	12	1676	1687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	44004340
2	NC_005707	CAATTA	2	12	5288	5299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004344
3	NC_005707	AGTTGG	2	12	5660	5671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	44004345
4	NC_005707	AAAAAC	2	12	7170	7181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	44004347
5	NC_005707	TATCTA	2	12	11829	11840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	44004351
6	NC_005707	TCTAAT	2	12	18430	18441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	44004358
7	NC_005707	TGTTTT	2	12	19775	19786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	44004361
8	NC_005707	TCTCCA	2	12	20875	20886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	44004362
9	NC_005707	CTTTTT	2	12	21711	21722	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	44004362
10	NC_005707	TTTGAT	2	12	22669	22680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	44004363
11	NC_005707	TTGCGT	2	12	23489	23500	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	44004363
12	NC_005707	GACTAA	2	12	25988	25999	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	44004363
13	NC_005707	TTTTCA	2	12	28445	28456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	44004365
14	NC_005707	TTTGAA	2	12	30282	30293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	44004368
15	NC_005707	ATTAGG	2	12	33121	33132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	44004373
16	NC_005707	ACAATC	2	12	40320	40331	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	44004382
17	NC_005707	CTTCCG	2	12	41436	41447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	44004383
18	NC_005707	CCTTTC	2	12	41718	41729	0 %	50 %	0 %	50 %	44004383
19	NC_005707	ATTTCT	2	12	41873	41884	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	44004383
20	NC_005707	TACAAA	2	12	42533	42544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	44004384
21	NC_005707	ATCTGT	2	12	43217	43228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	44004384
22	NC_005707	AATAAC	2	12	45145	45156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	44004389
23	NC_005707	TCCCTG	2	12	47600	47611	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	44004391
24	NC_005707	CTCTCC	2	12	47922	47933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	44004391
25	NC_005707	CTGGAT	2	12	53864	53875	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	44004398
26	NC_005707	GCATCT	2	12	56216	56227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	44004399
27	NC_005707	ACCAAA	2	12	56284	56295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	44004399
28	NC_005707	TGCTCC	2	12	56422	56433	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	44004399
29	NC_005707	TGCTGT	2	12	56461	56472	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	44004399
30	NC_005707	CGAAAT	2	12	57651	57662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	44004402
31	NC_005707	TTTGTT	2	12	61029	61040	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	44004404
32	NC_005707	TATCAA	2	12	64046	64057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004406
33	NC_005707	GTCCTA	2	12	77945	77956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	44004415
34	NC_005707	TTTCAC	2	12	87910	87921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	44004430
35	NC_005707	ATCAAT	2	12	89050	89061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004432
36	NC_005707	TAAAGT	2	12	98487	98498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	44004446
37	NC_005707	GTTGGC	2	12	105621	105632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	44004453
38	NC_005707	AGAAAA	2	12	106569	106580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	44004454
39	NC_005707	CAAGAG	2	12	108622	108633	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	44004456
40	NC_005707	CTAGAG	2	12	114985	114996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	44004462
41	NC_005707	AAAGGA	2	12	116706	116717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	44004463
42	NC_005707	AATTGA	2	12	118277	118288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	44004465
43	NC_005707	AATGAA	2	12	118296	118307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	44004465
44	NC_005707	TGGTTC	2	12	120287	120298	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	44004468
45	NC_005707	CCGTTT	2	12	120703	120714	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	44004469
46	NC_005707	TAATAT	2	12	123908	123919	50 %	50 %	0 %	0 %	44004477
47	NC_005707	TTCTTT	2	12	134136	134147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	44004490
48	NC_005707	ATCTTT	2	12	134676	134687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	44004491
49	NC_005707	CTGTAC	2	12	136339	136350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	44004493
50	NC_005707	TAAAGT	2	12	136720	136731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	44004494
51	NC_005707	TTACAA	2	12	137240	137251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004495
52	NC_005707	TCAGCT	2	12	143131	143142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	44004503
53	NC_005707	TGCTCT	2	12	151465	151476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	44004512
54	NC_005707	TAGCAT	2	12	154307	154318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	44004515
55	NC_005707	CTCTAA	2	12	155414	155425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	44004516
56	NC_005707	TCTAAA	2	12	163254	163265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004524
57	NC_005707	CATAAT	2	12	167340	167351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	44004530
58	NC_005707	TGTATA	2	12	169684	169695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	44004535
59	NC_005707	CTTTTA	2	12	170853	170864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	44004536
60	NC_005707	GAGCAG	2	12	176898	176909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	44004543
61	NC_005707	TCCTGC	2	12	181843	181854	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	44004549
62	NC_005707	TTTTAC	2	12	182833	182844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	44004550
63	NC_005707	TTTTTC	2	12	183031	183042	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	44004550
64	NC_005707	GGTCTA	2	12	186345	186356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	44004552
65	NC_005707	ATATGA	2	12	189021	189032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	44004557
66	NC_005707	TTCCCA	2	12	191520	191531	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	44004560
67	NC_005707	GAAATT	2	12	191912	191923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	44004560
68	NC_005707	AATCTT	2	12	193968	193979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	44004563
69	NC_005707	TCATCT	2	12	195582	195593	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	44004564
70	NC_005707	TGCAAA	2	12	199694	199705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	44004569

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.