MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus ATCC 10987 plasmid pBc10987

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005707	CAATC	2	10	784	793	40 %	20 %	0 %	40 %	44004340
2	NC_005707	AAATA	2	10	964	973	80 %	20 %	0 %	0 %	44004340
3	NC_005707	ATTTG	2	10	1097	1106	20 %	60 %	20 %	0 %	44004340
4	NC_005707	ATATT	2	10	2746	2755	40 %	60 %	0 %	0 %	44004340
5	NC_005707	ATTTT	2	10	3190	3199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005707	ATATT	2	10	3380	3389	40 %	60 %	0 %	0 %	44004342
7	NC_005707	ATATT	2	10	5116	5125	40 %	60 %	0 %	0 %	44004344
8	NC_005707	TAATA	2	10	6206	6215	60 %	40 %	0 %	0 %	44004346
9	NC_005707	AAATT	2	10	6865	6874	60 %	40 %	0 %	0 %	44004347
10	NC_005707	AAAAG	2	10	7357	7366	80 %	0 %	20 %	0 %	44004347
11	NC_005707	TCAAT	2	10	8982	8991	40 %	40 %	0 %	20 %	44004349
12	NC_005707	TAACA	2	10	9076	9085	60 %	20 %	0 %	20 %	44004349
13	NC_005707	AAATA	2	10	9714	9723	80 %	20 %	0 %	0 %	44004349
14	NC_005707	AACAA	4	20	10188	10207	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_005707	TTTAT	2	10	10651	10660	20 %	80 %	0 %	0 %	44004350
16	NC_005707	ATTTC	2	10	11203	11212	20 %	60 %	0 %	20 %	44004350
17	NC_005707	ATCCA	2	10	13050	13059	40 %	20 %	0 %	40 %	44004352
18	NC_005707	CTTTA	2	10	14163	14172	20 %	60 %	0 %	20 %	44004353
19	NC_005707	ACTTC	2	10	14925	14934	20 %	40 %	0 %	40 %	44004354
20	NC_005707	TATGG	2	10	14942	14951	20 %	40 %	40 %	0 %	44004354
21	NC_005707	AAATT	2	10	15332	15341	60 %	40 %	0 %	0 %	44004354
22	NC_005707	ATTTT	2	10	16384	16393	20 %	80 %	0 %	0 %	44004355
23	NC_005707	TTCAC	2	10	22419	22428	20 %	40 %	0 %	40 %	44004363
24	NC_005707	TTAAT	2	10	25459	25468	40 %	60 %	0 %	0 %	44004363
25	NC_005707	ATCGC	2	10	27985	27994	20 %	20 %	20 %	40 %	44004364
26	NC_005707	TAAAT	2	10	28688	28697	60 %	40 %	0 %	0 %	44004365
27	NC_005707	ATTTC	2	10	30238	30247	20 %	60 %	0 %	20 %	44004368
28	NC_005707	TACCA	2	10	30272	30281	40 %	20 %	0 %	40 %	44004368
29	NC_005707	GCATC	2	10	32001	32010	20 %	20 %	20 %	40 %	44004372
30	NC_005707	TTTTG	2	10	32323	32332	0 %	80 %	20 %	0 %	44004372
31	NC_005707	GGAAT	2	10	32694	32703	40 %	20 %	40 %	0 %	44004372
32	NC_005707	TTCAT	2	10	32753	32762	20 %	60 %	0 %	20 %	44004372
33	NC_005707	TGTTT	2	10	32962	32971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005707	CATTT	2	10	32988	32997	20 %	60 %	0 %	20 %	44004373
35	NC_005707	CCATA	2	10	37428	37437	40 %	20 %	0 %	40 %	44004376
36	NC_005707	AATAA	2	10	37903	37912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005707	CACAA	2	10	38752	38761	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_005707	GTCTT	2	10	39619	39628	0 %	60 %	20 %	20 %	44004381
39	NC_005707	AAGTG	2	10	41140	41149	40 %	20 %	40 %	0 %	44004383
40	NC_005707	CTTCA	2	10	42295	42304	20 %	40 %	0 %	40 %	44004383
41	NC_005707	TTTTC	2	10	42305	42314	0 %	80 %	0 %	20 %	44004383
42	NC_005707	CATTT	2	10	42463	42472	20 %	60 %	0 %	20 %	44004383
43	NC_005707	TCTGT	2	10	42670	42679	0 %	60 %	20 %	20 %	44004384
44	NC_005707	TTACT	2	10	44225	44234	20 %	60 %	0 %	20 %	44004385
45	NC_005707	ACATT	2	10	44518	44527	40 %	40 %	0 %	20 %	44004386
46	NC_005707	CTTTC	2	10	47553	47562	0 %	60 %	0 %	40 %	44004391
47	NC_005707	TTTTC	2	10	48970	48979	0 %	80 %	0 %	20 %	44004392
48	NC_005707	TTTCC	2	10	52595	52604	0 %	60 %	0 %	40 %	44004398
49	NC_005707	TCATT	2	10	52721	52730	20 %	60 %	0 %	20 %	44004398
50	NC_005707	TTTTC	2	10	53366	53375	0 %	80 %	0 %	20 %	44004398
51	NC_005707	ACCTT	2	10	53387	53396	20 %	40 %	0 %	40 %	44004398
52	NC_005707	ATTTT	2	10	53485	53494	20 %	80 %	0 %	0 %	44004398
53	NC_005707	GTTTC	2	10	55575	55584	0 %	60 %	20 %	20 %	44004399
54	NC_005707	GTTTC	2	10	55671	55680	0 %	60 %	20 %	20 %	44004399
55	NC_005707	GTTTC	2	10	55767	55776	0 %	60 %	20 %	20 %	44004399
56	NC_005707	CTTTT	2	10	57678	57687	0 %	80 %	0 %	20 %	44004402
57	NC_005707	AAAAT	2	10	58014	58023	80 %	20 %	0 %	0 %	44004402
58	NC_005707	CATCA	2	10	59030	59039	40 %	20 %	0 %	40 %	44004402
59	NC_005707	AATTC	2	10	59584	59593	40 %	40 %	0 %	20 %	44004403
60	NC_005707	ATTTA	2	10	60339	60348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005707	ATTTT	2	10	62275	62284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005707	AATAA	2	10	64097	64106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005707	TTTTG	2	10	64605	64614	0 %	80 %	20 %	0 %	44004407
64	NC_005707	TGAAC	2	10	65255	65264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_005707	ATCAA	2	10	66733	66742	60 %	20 %	0 %	20 %	44004409
66	NC_005707	AATCA	2	10	69085	69094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_005707	TTCTT	2	10	69757	69766	0 %	80 %	0 %	20 %	44004412
68	NC_005707	TTTAC	2	10	71347	71356	20 %	60 %	0 %	20 %	44004412
69	NC_005707	TCGTA	2	10	71589	71598	20 %	40 %	20 %	20 %	44004412
70	NC_005707	ACTTC	2	10	72727	72736	20 %	40 %	0 %	40 %	44004412
71	NC_005707	TTAAA	2	10	73103	73112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005707	AAAAT	2	10	73160	73169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005707	TTCCA	2	10	75793	75802	20 %	40 %	0 %	40 %	44004414
74	NC_005707	GCTTC	2	10	76382	76391	0 %	40 %	20 %	40 %	44004414
75	NC_005707	ATCTA	2	10	77098	77107	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_005707	ATTTT	2	10	78237	78246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005707	TTTTG	2	10	78370	78379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005707	TTACT	2	10	80091	80100	20 %	60 %	0 %	20 %	44004417
79	NC_005707	AAGCA	2	10	80569	80578	60 %	0 %	20 %	20 %	44004417
80	NC_005707	GAATG	2	10	82351	82360	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005707	CTTAT	2	10	82575	82584	20 %	60 %	0 %	20 %	44004422
82	NC_005707	AAAAG	2	10	86042	86051	80 %	0 %	20 %	0 %	44004428
83	NC_005707	CGAAG	2	10	87273	87282	40 %	0 %	40 %	20 %	44004429
84	NC_005707	TTTTC	2	10	92609	92618	0 %	80 %	0 %	20 %	44004437
85	NC_005707	GAAGG	2	10	95178	95187	40 %	0 %	60 %	0 %	44004441
86	NC_005707	ATTAT	2	10	96747	96756	40 %	60 %	0 %	0 %	44004443
87	NC_005707	GAAAT	2	10	97885	97894	60 %	20 %	20 %	0 %	44004445
88	NC_005707	ATTAA	2	10	99067	99076	60 %	40 %	0 %	0 %	44004447
89	NC_005707	AACGG	2	10	101716	101725	40 %	0 %	40 %	20 %	44004449
90	NC_005707	TGGCT	2	10	102262	102271	0 %	40 %	40 %	20 %	44004449
91	NC_005707	TAATT	2	10	103483	103492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005707	ATATA	2	10	103518	103527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005707	CAACT	2	10	104677	104686	40 %	20 %	0 %	40 %	44004453
94	NC_005707	TAGTC	2	10	105013	105022	20 %	40 %	20 %	20 %	44004453
95	NC_005707	ACAAG	2	10	105737	105746	60 %	0 %	20 %	20 %	44004453
96	NC_005707	ATTGG	2	10	106305	106314	20 %	40 %	40 %	0 %	44004454
97	NC_005707	AGAAA	2	10	107096	107105	80 %	0 %	20 %	0 %	44004454
98	NC_005707	GAACG	2	10	109714	109723	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_005707	GAAAA	2	10	111965	111974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005707	AGGAA	2	10	113160	113169	60 %	0 %	40 %	0 %	44004460
101	NC_005707	AATGG	2	10	115295	115304	40 %	20 %	40 %	0 %	44004463
102	NC_005707	AATGC	2	10	116259	116268	40 %	20 %	20 %	20 %	44004463
103	NC_005707	CGTAT	2	10	116477	116486	20 %	40 %	20 %	20 %	44004463
104	NC_005707	ACAGA	2	10	117244	117253	60 %	0 %	20 %	20 %	44004464
105	NC_005707	ATCAA	2	10	118414	118423	60 %	20 %	0 %	20 %	44004465
106	NC_005707	TTGTA	2	10	119344	119353	20 %	60 %	20 %	0 %	44004467
107	NC_005707	TTCTT	2	10	119727	119736	0 %	80 %	0 %	20 %	44004467
108	NC_005707	TATCA	2	10	120384	120393	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_005707	ATTTT	2	10	120785	120794	20 %	80 %	0 %	0 %	44004469
110	NC_005707	TAAAG	2	10	123282	123291	60 %	20 %	20 %	0 %	44004475
111	NC_005707	TGTAA	2	10	123407	123416	40 %	40 %	20 %	0 %	44004476
112	NC_005707	TTTAA	2	10	124072	124081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005707	TTTTA	2	10	124709	124718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005707	AATGA	2	10	126598	126607	60 %	20 %	20 %	0 %	44004479
115	NC_005707	CGATT	2	10	127202	127211	20 %	40 %	20 %	20 %	44004479
116	NC_005707	AGAGT	2	10	127286	127295	40 %	20 %	40 %	0 %	44004479
117	NC_005707	ATATG	2	10	127578	127587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005707	ACGGT	2	10	127991	128000	20 %	20 %	40 %	20 %	44004480
119	NC_005707	AGAAA	2	10	128753	128762	80 %	0 %	20 %	0 %	44004482
120	NC_005707	ATGGA	2	10	129046	129055	40 %	20 %	40 %	0 %	44004483
121	NC_005707	TACAA	2	10	129291	129300	60 %	20 %	0 %	20 %	44004483
122	NC_005707	TAAAA	2	10	129527	129536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005707	TGTAA	2	10	129685	129694	40 %	40 %	20 %	0 %	44004484
124	NC_005707	AAAAT	2	10	129889	129898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005707	TTATT	2	10	129923	129932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005707	TTTTA	2	10	130030	130039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005707	TGAAG	2	10	130498	130507	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005707	AATTA	2	10	131220	131229	60 %	40 %	0 %	0 %	44004487
129	NC_005707	GTTTA	2	10	132636	132645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005707	CAATT	2	10	133929	133938	40 %	40 %	0 %	20 %	44004490
131	NC_005707	CTTGA	2	10	134423	134432	20 %	40 %	20 %	20 %	44004491
132	NC_005707	CTAAA	2	10	136079	136088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_005707	TTTTA	2	10	136975	136984	20 %	80 %	0 %	0 %	44004495
134	NC_005707	TGAAG	2	10	137785	137794	40 %	20 %	40 %	0 %	44004495
135	NC_005707	GTTTG	2	10	138127	138136	0 %	60 %	40 %	0 %	44004495
136	NC_005707	ACGTA	2	10	138270	138279	40 %	20 %	20 %	20 %	44004495
137	NC_005707	ATACT	2	10	142008	142017	40 %	40 %	0 %	20 %	44004501
138	NC_005707	GTAAC	2	10	142194	142203	40 %	20 %	20 %	20 %	44004502
139	NC_005707	CTTCT	2	10	144039	144048	0 %	60 %	0 %	40 %	44004504
140	NC_005707	ATTTA	2	10	144668	144677	40 %	60 %	0 %	0 %	44004505
141	NC_005707	TTTCA	2	10	144806	144815	20 %	60 %	0 %	20 %	44004505
142	NC_005707	TAAAT	2	10	147382	147391	60 %	40 %	0 %	0 %	44004507
143	NC_005707	ACAAA	2	10	147825	147834	80 %	0 %	0 %	20 %	44004507
144	NC_005707	GGTTT	2	10	150801	150810	0 %	60 %	40 %	0 %	44004511
145	NC_005707	GGGAT	2	10	152363	152372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005707	GTTTT	2	10	152630	152639	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005707	CAAAA	2	10	152740	152749	80 %	0 %	0 %	20 %	44004514
148	NC_005707	TTTAA	2	10	153517	153526	40 %	60 %	0 %	0 %	44004515
149	NC_005707	TTTGA	2	10	153588	153597	20 %	60 %	20 %	0 %	44004515
150	NC_005707	ATTAA	2	10	154412	154421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005707	TTCAT	2	10	156021	156030	20 %	60 %	0 %	20 %	44004517
152	NC_005707	ATTGC	2	10	156534	156543	20 %	40 %	20 %	20 %	44004517
153	NC_005707	TTTAA	2	10	157999	158008	40 %	60 %	0 %	0 %	44004518
154	NC_005707	TTTAG	2	10	158244	158253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005707	ATTTA	2	10	159021	159030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005707	ATTTT	2	10	161240	161249	20 %	80 %	0 %	0 %	44004521
157	NC_005707	TCTGC	2	10	162811	162820	0 %	40 %	20 %	40 %	44004523
158	NC_005707	TCCCT	2	10	165654	165663	0 %	40 %	0 %	60 %	44004527
159	NC_005707	ATTTT	2	10	165863	165872	20 %	80 %	0 %	0 %	44004528
160	NC_005707	TTTTA	2	10	168156	168165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005707	TGCTG	2	10	168550	168559	0 %	40 %	40 %	20 %	44004533
162	NC_005707	CTTTA	2	10	168982	168991	20 %	60 %	0 %	20 %	44004534
163	NC_005707	TACAG	2	10	169736	169745	40 %	20 %	20 %	20 %	44004535
164	NC_005707	TCTTT	2	10	170722	170731	0 %	80 %	0 %	20 %	44004536
165	NC_005707	AAACC	2	10	171245	171254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_005707	GGTTT	2	10	171281	171290	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_005707	AAATA	2	10	171649	171658	80 %	20 %	0 %	0 %	44004538
168	NC_005707	TTAAA	2	10	174248	174257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_005707	CTTCT	2	10	176725	176734	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_005707	TCCTT	2	10	177387	177396	0 %	60 %	0 %	40 %	44004544
171	NC_005707	ATACC	2	10	178141	178150	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_005707	CTAAA	2	10	178818	178827	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_005707	ACTAA	2	10	179249	179258	60 %	20 %	0 %	20 %	44004546
174	NC_005707	AAAAT	2	10	179619	179628	80 %	20 %	0 %	0 %	44004546
175	NC_005707	AATTC	2	10	179723	179732	40 %	40 %	0 %	20 %	44004547
176	NC_005707	GTTTG	2	10	181174	181183	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_005707	GTCTT	2	10	181534	181543	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_005707	TTTTA	2	10	181545	181554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_005707	CATTT	2	10	182911	182920	20 %	60 %	0 %	20 %	44004550
180	NC_005707	CATTC	2	10	183424	183433	20 %	40 %	0 %	40 %	44004550
181	NC_005707	ATTTT	2	10	185114	185123	20 %	80 %	0 %	0 %	44004552
182	NC_005707	AAAGT	2	10	186449	186458	60 %	20 %	20 %	0 %	44004552
183	NC_005707	TATTC	2	10	186577	186586	20 %	60 %	0 %	20 %	44004553
184	NC_005707	TAATT	2	10	187021	187030	40 %	60 %	0 %	0 %	44004554
185	NC_005707	ACAAA	2	10	187608	187617	80 %	0 %	0 %	20 %	44004556
186	NC_005707	ATGCT	2	10	188203	188212	20 %	40 %	20 %	20 %	44004556
187	NC_005707	TTTAG	2	10	188548	188557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_005707	TTTTC	2	10	188827	188836	0 %	80 %	0 %	20 %	44004557
189	NC_005707	TTCTC	4	20	190024	190043	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
190	NC_005707	AAAAG	2	10	190614	190623	80 %	0 %	20 %	0 %	44004559
191	NC_005707	AGTAT	2	10	191629	191638	40 %	40 %	20 %	0 %	44004560
192	NC_005707	TCCAA	2	10	193571	193580	40 %	20 %	0 %	40 %	44004562
193	NC_005707	AAGGA	2	10	195151	195160	60 %	0 %	40 %	0 %	44004564
194	NC_005707	TAGAA	2	10	196254	196263	60 %	20 %	20 %	0 %	44004564
195	NC_005707	TAGAT	2	10	196825	196834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_005707	CAATA	2	10	197913	197922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_005707	ATTCT	2	10	198008	198017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_005707	CATTT	2	10	199012	199021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_005707	GTATA	2	10	200818	200827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
200	NC_005707	ACTTA	2	10	200973	200982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
201	NC_005707	TTCTT	2	10	201691	201700	0 %	80 %	0 %	20 %	44004573
202	NC_005707	AAATT	2	10	202430	202439	60 %	40 %	0 %	0 %	44004574
203	NC_005707	GAAAA	2	10	202547	202556	80 %	0 %	20 %	0 %	44004574
204	NC_005707	ATGAA	2	10	202579	202588	60 %	20 %	20 %	0 %	44004574
205	NC_005707	ACCAT	2	10	203533	203542	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
206	NC_005707	ATTAT	2	10	203929	203938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_005707	GATGC	2	10	204516	204525	20 %	20 %	40 %	20 %	44004576
208	NC_005707	TTTCA	2	10	205650	205659	20 %	60 %	0 %	20 %	44004577
209	NC_005707	CATAT	2	10	206548	206557	40 %	40 %	0 %	20 %	44004578
210	NC_005707	TATGT	2	10	207371	207380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.