MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	TAGAAA	3	18	1509	1526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005364	TAGTAA	2	12	1527	1538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005364	ATTTTT	2	12	2742	2753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005364	TTAAAT	2	12	16909	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005364	AAATTT	2	12	43623	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005364	GATATT	2	12	74744	74755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005364	ATATCC	2	12	81977	81988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005364	ATATCT	2	12	88556	88567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005364	ATATCT	2	12	90570	90581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005364	ATAAAA	2	12	127222	127233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005364	ATGGTG	2	12	134090	134101	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005364	TAAAGT	2	12	134862	134873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005364	ATATCC	2	12	144690	144701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005364	CAGATC	2	12	147393	147404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005364	CTAAAA	2	12	149777	149788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_005364	AGATAA	2	12	150238	150249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005364	ATATCC	2	12	165062	165073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005364	AGATAA	2	12	166051	166062	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005364	ATATTT	2	12	169719	169730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005364	ATTTTA	2	12	178713	178724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005364	AAAATT	2	12	186419	186430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005364	TATTTG	2	12	187092	187103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005364	GATTAT	2	12	187155	187166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005364	TTTAAT	2	12	191963	191974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005364	AAAATT	2	12	198995	199006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005364	TTTTAA	2	12	210496	210507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005364	TGACTT	2	12	230401	230412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_005364	TAAATC	2	12	231969	231980	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005364	ATCTAA	2	12	233472	233483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005364	TAAAAC	2	12	240881	240892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005364	TTTTAG	2	12	245337	245348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005364	TTCATC	2	12	263298	263309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005364	TCTTTA	2	12	265864	265875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_005364	CTAATA	2	12	266702	266713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005364	CAAAAT	2	12	267813	267824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_005364	AGAACA	2	12	267831	267842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_005364	CTAAAA	2	12	280240	280251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_005364	ATATTA	2	12	281815	281826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005364	TTAATT	2	12	282310	282321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005364	ATTTTC	2	12	288303	288314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005364	AAGCTT	2	12	316924	316935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005364	ATTTTT	2	12	322901	322912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005364	AAAGAA	2	12	326117	326128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005364	AATTAA	2	12	336728	336739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005364	CTTTTT	2	12	351696	351707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_005364	ATTTTT	2	12	359132	359143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005364	AAATTA	2	12	359229	359240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005364	GGATAT	2	12	363794	363805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005364	TTTTAT	2	12	366062	366073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005364	ATTATC	2	12	366304	366315	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005364	TTGTTT	2	12	373113	373124	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005364	CTAAAA	2	12	387392	387403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_005364	ATATCC	2	12	389101	389112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005364	AGATAA	2	12	389742	389753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005364	ATTTTG	2	12	390588	390599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005364	TTTAGT	2	12	395188	395199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005364	CAAAAA	2	12	395235	395246	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005364	ATATGT	2	12	395343	395354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005364	TACAAA	2	12	416669	416680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_005364	TGGTAA	2	12	417376	417387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005364	GATAAA	2	12	417564	417575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005364	TCTTTA	2	12	419147	419158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005364	TTTTAG	2	12	419611	419622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005364	AAATTT	2	12	419930	419941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005364	CAAATA	2	12	429616	429627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_005364	GGATAT	2	12	431860	431871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005364	ATATCC	2	12	434550	434561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005364	TAAAGA	2	12	434822	434833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005364	TCAAAA	2	12	435120	435131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_005364	ATATAA	2	12	435577	435588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005364	GTCAAG	2	12	440094	440105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_005364	CAAATT	2	12	441191	441202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_005364	TAAAGC	2	12	441225	441236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_005364	TAAAAA	2	12	441480	441491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005364	ATTACA	2	12	441705	441716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_005364	TTTTAA	2	12	443221	443232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005364	AAGTTA	2	12	444155	444166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005364	TATAAA	2	12	444234	444245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005364	AAATTT	2	12	445467	445478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005364	TAAAAA	2	12	450809	450820	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005364	AATTCA	2	12	457397	457408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_005364	GGATAT	2	12	458246	458257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005364	ATATCC	2	12	468053	468064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005364	CTAAAA	2	12	468444	468455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_005364	GGATAT	2	12	469056	469067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005364	AGATAA	2	12	470785	470796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005364	ACTTAA	2	12	487171	487182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_005364	TCTTTT	2	12	487927	487938	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_005364	ATTTTA	2	12	522741	522752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005364	TTTAAT	2	12	578813	578824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005364	AATCCA	2	12	586296	586307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005364	ACTCCA	2	12	586317	586328	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_005364	ATTTAA	2	12	595579	595590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005364	TCTTTA	2	12	599472	599483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005364	TTTTAG	2	12	599935	599946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005364	ACTAGT	2	12	609697	609708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_005364	TTTGAT	2	12	611163	611174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005364	TTATTT	2	12	638031	638042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005364	TCTTTA	2	12	639302	639313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_005364	TTTTAG	2	12	639765	639776	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005364	GGATAT	2	12	640185	640196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005364	TTTCTT	2	12	647669	647680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_005364	TATTTT	2	12	659887	659898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005364	TAAAAA	2	12	674864	674875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005364	TCAACT	2	12	690384	690395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005364	AAAAAC	2	12	692577	692588	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_005364	AAATTG	2	12	723369	723380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005364	TTTATA	2	12	723435	723446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005364	TCAAAT	2	12	725373	725384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_005364	ATATCC	2	12	729963	729974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005364	ATAAAA	2	12	735377	735388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005364	AATTAG	2	12	744677	744688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005364	CTTTTT	2	12	744974	744985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_005364	ATTAAT	2	12	755594	755605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005364	CCAATT	2	12	756387	756398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_005364	GGATAT	2	12	760952	760963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005364	CTAAAT	2	12	765071	765082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_005364	TCTTTA	2	12	771391	771402	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_005364	AGAAAT	2	12	792449	792460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005364	TTTGAA	2	12	795755	795766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005364	AATCAA	2	12	796002	796013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_005364	TTGTTT	2	12	796297	796308	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005364	AATACA	2	12	799374	799385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_005364	TAAGTG	2	12	801676	801687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005364	ACCAAT	2	12	805139	805150	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_005364	ATATCC	2	12	828295	828306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005364	TTTTAA	2	12	849487	849498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005364	TTTTTA	2	12	850453	850464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005364	TTGCTA	2	12	877930	877941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_005364	CTAAAA	2	12	888584	888595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.