MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	AACAGC	2	12	921	932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42560561
2	NC_005364	TTTAAA	2	12	2084	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	42560562
3	NC_005364	AACTAA	2	12	2632	2643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560562
4	NC_005364	ATTTAA	2	12	3339	3350	50 %	50 %	0 %	0 %	42560564
5	NC_005364	AGAAAA	2	12	5227	5238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560565
6	NC_005364	CTTTAT	2	12	5977	5988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560566
7	NC_005364	GTTGAA	2	12	5991	6002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560566
8	NC_005364	AAACTA	2	12	6610	6621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560566
9	NC_005364	TGATGG	2	12	7904	7915	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	42560567
10	NC_005364	TGAAGA	2	12	9050	9061	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42560567
11	NC_005364	TCCTAA	2	12	10721	10732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560568
12	NC_005364	GTTCTT	2	12	11265	11276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560569
13	NC_005364	CTTGTT	2	12	11691	11702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560569
14	NC_005364	CATTAA	2	12	12204	12215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560569
15	NC_005364	CTTTTT	2	12	13843	13854	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560570
16	NC_005364	ATACCA	2	12	14961	14972	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560570
17	NC_005364	TTTTCT	2	12	17301	17312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560572
18	NC_005364	TCTAAT	2	12	19015	19026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560573
19	NC_005364	TTTACT	2	12	19483	19494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560573
20	NC_005364	AAAATA	2	12	19529	19540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42560573
21	NC_005364	TCTTTA	2	12	22883	22894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560575
22	NC_005364	TTTTAG	2	12	23346	23357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560576
23	NC_005364	CAATAT	2	12	24506	24517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560577
24	NC_005364	ACCAGG	2	12	27382	27393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42560581
25	NC_005364	TTTGAA	2	12	27447	27458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560581
26	NC_005364	ACTATT	2	12	28679	28690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560582
27	NC_005364	AGTTGT	2	12	29651	29662	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560584
28	NC_005364	AAAACC	2	12	31655	31666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560588
29	NC_005364	TTAACT	2	12	32678	32689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560590
30	NC_005364	AAAACA	2	12	33038	33049	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560590
31	NC_005364	TCCAGA	2	12	33103	33114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42560590
32	NC_005364	GTTTTT	2	12	33327	33338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42560590
33	NC_005364	TAGTTT	2	12	33438	33449	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560590
34	NC_005364	TTTCAT	2	12	34833	34844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560592
35	NC_005364	TAGTTT	2	12	35301	35312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560592
36	NC_005364	CAATTC	2	12	35373	35384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560592
37	NC_005364	TTTCAT	2	12	36615	36626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560592
38	NC_005364	GATTTT	2	12	38451	38462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560593
39	NC_005364	TCAAAT	2	12	39141	39152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560593
40	NC_005364	CAGCAA	2	12	39730	39741	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42560593
41	NC_005364	GAAAAA	2	12	42436	42447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560593
42	NC_005364	GTTGAT	2	12	42909	42920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560593
43	NC_005364	ATATTT	2	12	43039	43050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560593
44	NC_005364	AGCTGG	2	12	44566	44577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	42560594
45	NC_005364	GGATAT	2	12	47903	47914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560598
46	NC_005364	TCTTGT	2	12	49656	49667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560599
47	NC_005364	TTTTTC	2	12	49673	49684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560599
48	NC_005364	TAAAAT	2	12	51140	51151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560599
49	NC_005364	CAAAAC	2	12	51492	51503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560599
50	NC_005364	TGTAAT	2	12	53415	53426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560602
51	NC_005364	TATTAA	2	12	53773	53784	50 %	50 %	0 %	0 %	42560602
52	NC_005364	TTAATC	2	12	54825	54836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560604
53	NC_005364	TGATTT	2	12	59035	59046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560608
54	NC_005364	TTTTTC	2	12	61459	61470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560611
55	NC_005364	TGTTAT	2	12	61716	61727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560611
56	NC_005364	AAAATC	2	12	63888	63899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560612
57	NC_005364	TGATTT	2	12	64279	64290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
58	NC_005364	ATTTTG	2	12	64299	64310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
59	NC_005364	ATTGTT	2	12	64323	64334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
60	NC_005364	TCTTTA	2	12	67663	67674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560615
61	NC_005364	TTTTAG	2	12	68126	68137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560616
62	NC_005364	TTTAAT	2	12	69064	69075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560619
63	NC_005364	GGATAT	2	12	69717	69728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560620
64	NC_005364	TCACAA	2	12	72403	72414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560622
65	NC_005364	ATTAAA	2	12	72477	72488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560622
66	NC_005364	GATATT	2	12	73183	73194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560623
67	NC_005364	GTTAAA	2	12	73534	73545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560624
68	NC_005364	ATTGCT	2	12	73651	73662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42560624
69	NC_005364	ATTCTT	2	12	75586	75597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560625
70	NC_005364	CTAGAA	2	12	77943	77954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42560628
71	NC_005364	TTAAAT	2	12	78571	78582	50 %	50 %	0 %	0 %	42560629
72	NC_005364	ATATCC	2	12	81568	81579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560630
73	NC_005364	ACATCT	2	12	82445	82456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560631
74	NC_005364	GGATAT	2	12	88881	88892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560633
75	NC_005364	ATTTAA	2	12	91711	91722	50 %	50 %	0 %	0 %	42560634
76	NC_005364	ATTAAT	2	12	92286	92297	50 %	50 %	0 %	0 %	42560634
77	NC_005364	ATGTTA	2	12	92311	92322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560634
78	NC_005364	TGGTAA	2	12	92478	92489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560635
79	NC_005364	TTTGAG	2	12	94010	94021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560636
80	NC_005364	AGCTAA	2	12	94149	94160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42560636
81	NC_005364	CAAAAA	2	12	94190	94201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560636
82	NC_005364	TGAAAA	2	12	95394	95405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560636
83	NC_005364	ATCAAT	2	12	98469	98480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560639
84	NC_005364	GTTTTT	2	12	99298	99309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42560639
85	NC_005364	AGTTAA	2	12	101082	101093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560641
86	NC_005364	CTTTTT	2	12	106729	106740	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560648
87	NC_005364	CAATAT	2	12	106899	106910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560648
88	NC_005364	TTTTGA	2	12	110454	110465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560650
89	NC_005364	AGAGGA	2	12	112869	112880	50 %	0 %	50 %	0 %	42560652
90	NC_005364	TTTTAG	2	12	114306	114317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560654
91	NC_005364	CTAATA	2	12	114458	114469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560654
92	NC_005364	GTTAAA	2	12	114929	114940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560655
93	NC_005364	GGATAT	2	12	115399	115410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560656
94	NC_005364	ATATCC	2	12	119201	119212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560657
95	NC_005364	TTTTAT	2	12	120074	120085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560659
96	NC_005364	ATATTT	2	12	121686	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560661
97	NC_005364	ATTTTT	2	12	122321	122332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560662
98	NC_005364	GTTGAT	2	12	122747	122758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560662
99	NC_005364	CATAAC	2	12	123187	123198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560664
100	NC_005364	ATTAGT	2	12	123758	123769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560664
101	NC_005364	ATTTTT	2	12	125100	125111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560666
102	NC_005364	AACATC	2	12	125475	125486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560666
103	NC_005364	TAAAAA	2	12	127370	127381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42560667
104	NC_005364	AAAAGA	2	12	135346	135357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560673
105	NC_005364	ATATTG	2	12	135864	135875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560673
106	NC_005364	ACAAAA	2	12	136388	136399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560674
107	NC_005364	TAATAT	2	12	136661	136672	50 %	50 %	0 %	0 %	42560674
108	NC_005364	TTGGAA	2	12	137521	137532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560674
109	NC_005364	TTTTAA	2	12	140523	140534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560677
110	NC_005364	AAAAGT	2	12	140818	140829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560677
111	NC_005364	AACTTT	2	12	141130	141141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560677
112	NC_005364	AAGTGA	2	12	146023	146034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42560680
113	NC_005364	GAATGT	2	12	147543	147554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560681
114	NC_005364	AAAAAC	2	12	152057	152068	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560684
115	NC_005364	TAGGAT	2	12	152689	152700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560684
116	NC_005364	AGATAA	2	12	153038	153049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560684
117	NC_005364	TTTATT	2	12	153132	153143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560684
118	NC_005364	TGCTAT	2	12	153332	153343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42560684
119	NC_005364	AGACAT	2	12	158431	158442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42560688
120	NC_005364	ATATAG	2	12	159182	159193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560689
121	NC_005364	TATTAA	2	12	159885	159896	50 %	50 %	0 %	0 %	42560690
122	NC_005364	AAAATG	2	12	159974	159985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560690
123	NC_005364	TCTTTA	2	12	161621	161632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560691
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241	NC_005364	GAAAAA	2	12	328774	328785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560835
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476	NC_005364	TAATTT	2	12	622388	622399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561082
477	NC_005364	ACCTAA	2	12	622566	622577	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42561082
478	NC_005364	CCAATT	2	12	622828	622839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561082
479	NC_005364	ATCAAT	2	12	623608	623619	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42561083
480	NC_005364	CTTTAT	2	12	624819	624830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42561083
481	NC_005364	TAGATA	2	12	624925	624936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42561083
482	NC_005364	AAAGAA	2	12	625332	625343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42561083
483	NC_005364	ATAATT	3	18	626103	626120	50 %	50 %	0 %	0 %	42561083
484	NC_005364	ATATCC	2	12	627830	627841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561084
485	NC_005364	TAATTT	2	12	628174	628185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561085
486	NC_005364	ATCAAT	2	12	628590	628601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42561085
487	NC_005364	ATTTTT	2	12	629717	629728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42561087
488	NC_005364	TTTTTA	2	12	632917	632928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42561091
489	NC_005364	TACTAA	2	12	634524	634535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42561091
490	NC_005364	CATTAA	2	12	634857	634868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42561092
491	NC_005364	ATAGTT	2	12	635980	635991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42561094
492	NC_005364	TGTATT	2	12	635992	636003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42561094
493	NC_005364	TAGCTA	2	12	637415	637426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42561097
494	NC_005364	AAGTGA	2	12	643982	643993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42561101
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496	NC_005364	CTTTAT	2	12	646178	646189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42561103
497	NC_005364	AAATGC	2	12	647042	647053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42561104
498	NC_005364	TCTTGT	2	12	647190	647201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42561104
499	NC_005364	AACTAA	2	12	648671	648682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42561105
500	NC_005364	CCAGCT	2	12	649464	649475	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	42561105

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