MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 1544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	AAAAT	2	10	689	698	80 %	20 %	0 %	0 %	42560561
2	NC_005364	GAATT	2	10	1987	1996	40 %	40 %	20 %	0 %	42560562
3	NC_005364	TAATT	2	10	2315	2324	40 %	60 %	0 %	0 %	42560562
4	NC_005364	GATTT	2	10	2419	2428	20 %	60 %	20 %	0 %	42560562
5	NC_005364	AATAG	2	10	3177	3186	60 %	20 %	20 %	0 %	42560563
6	NC_005364	CAAAA	2	10	3377	3386	80 %	0 %	0 %	20 %	42560564
7	NC_005364	CAAAA	2	10	3974	3983	80 %	0 %	0 %	20 %	42560564
8	NC_005364	ATAAA	2	10	4385	4394	80 %	20 %	0 %	0 %	42560565
9	NC_005364	CTAAA	2	10	4406	4415	60 %	20 %	0 %	20 %	42560565
10	NC_005364	GTATT	2	10	5308	5317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005364	ATTAT	2	10	5550	5559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005364	AGTTT	2	10	5877	5886	20 %	60 %	20 %	0 %	42560566
13	NC_005364	ATAAA	2	10	6307	6316	80 %	20 %	0 %	0 %	42560566
14	NC_005364	GATTA	2	10	9941	9950	40 %	40 %	20 %	0 %	42560567
15	NC_005364	TGATT	2	10	10762	10771	20 %	60 %	20 %	0 %	42560568
16	NC_005364	TAAAT	2	10	11134	11143	60 %	40 %	0 %	0 %	42560569
17	NC_005364	AATTT	2	10	11423	11432	40 %	60 %	0 %	0 %	42560569
18	NC_005364	GTAAA	2	10	12578	12587	60 %	20 %	20 %	0 %	42560569
19	NC_005364	TTTAA	2	10	12917	12926	40 %	60 %	0 %	0 %	42560569
20	NC_005364	TAGTT	2	10	13549	13558	20 %	60 %	20 %	0 %	42560569
21	NC_005364	CATAC	2	10	14159	14168	40 %	20 %	0 %	40 %	42560570
22	NC_005364	CATAT	2	10	14201	14210	40 %	40 %	0 %	20 %	42560570
23	NC_005364	ATTTC	2	10	14511	14520	20 %	60 %	0 %	20 %	42560570
24	NC_005364	CTAAT	2	10	14560	14569	40 %	40 %	0 %	20 %	42560570
25	NC_005364	TAATA	2	10	14903	14912	60 %	40 %	0 %	0 %	42560570
26	NC_005364	AAATA	2	10	15056	15065	80 %	20 %	0 %	0 %	42560570
27	NC_005364	TTTTG	2	10	16553	16562	0 %	80 %	20 %	0 %	42560571
28	NC_005364	TATCA	2	10	17195	17204	40 %	40 %	0 %	20 %	42560572
29	NC_005364	ATTTA	2	10	18350	18359	40 %	60 %	0 %	0 %	42560572
30	NC_005364	ATTTT	2	10	21118	21127	20 %	80 %	0 %	0 %	42560574
31	NC_005364	TCCAT	2	10	21878	21887	20 %	40 %	0 %	40 %	42560574
32	NC_005364	TCAAT	2	10	22077	22086	40 %	40 %	0 %	20 %	42560574
33	NC_005364	TGTTA	2	10	22375	22384	20 %	60 %	20 %	0 %	42560575
34	NC_005364	TGAAT	2	10	22526	22535	40 %	40 %	20 %	0 %	42560575
35	NC_005364	TTCTA	2	10	23400	23409	20 %	60 %	0 %	20 %	42560576
36	NC_005364	ATTTA	2	10	23538	23547	40 %	60 %	0 %	0 %	42560576
37	NC_005364	ATATT	2	10	23854	23863	40 %	60 %	0 %	0 %	42560577
38	NC_005364	TAAGT	2	10	24058	24067	40 %	40 %	20 %	0 %	42560577
39	NC_005364	TAAGT	2	10	25224	25233	40 %	40 %	20 %	0 %	42560578
40	NC_005364	TGAAT	2	10	25818	25827	40 %	40 %	20 %	0 %	42560579
41	NC_005364	ACATT	2	10	25871	25880	40 %	40 %	0 %	20 %	42560579
42	NC_005364	TTGAT	2	10	27010	27019	20 %	60 %	20 %	0 %	42560581
43	NC_005364	TTGGT	2	10	27790	27799	0 %	60 %	40 %	0 %	42560581
44	NC_005364	ATCAA	2	10	28006	28015	60 %	20 %	0 %	20 %	42560581
45	NC_005364	TATAT	2	10	28324	28333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005364	TGTTT	2	10	28472	28481	0 %	80 %	20 %	0 %	42560582
47	NC_005364	AAATA	2	10	32749	32758	80 %	20 %	0 %	0 %	42560590
48	NC_005364	AAAAC	2	10	32966	32975	80 %	0 %	0 %	20 %	42560590
49	NC_005364	TAATT	2	10	33605	33614	40 %	60 %	0 %	0 %	42560591
50	NC_005364	TTTGA	2	10	34013	34022	20 %	60 %	20 %	0 %	42560591
51	NC_005364	TCTTT	2	10	34292	34301	0 %	80 %	0 %	20 %	42560591
52	NC_005364	GTTTT	2	10	34979	34988	0 %	80 %	20 %	0 %	42560592
53	NC_005364	TGGTT	2	10	35505	35514	0 %	60 %	40 %	0 %	42560592
54	NC_005364	TATCT	2	10	35887	35896	20 %	60 %	0 %	20 %	42560592
55	NC_005364	AAAAT	2	10	36638	36647	80 %	20 %	0 %	0 %	42560592
56	NC_005364	ATTAT	3	15	37899	37913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005364	TTTAA	2	10	38295	38304	40 %	60 %	0 %	0 %	42560593
58	NC_005364	ACAAA	2	10	38753	38762	80 %	0 %	0 %	20 %	42560593
59	NC_005364	ATCAA	2	10	40751	40760	60 %	20 %	0 %	20 %	42560593
60	NC_005364	AATTT	2	10	41151	41160	40 %	60 %	0 %	0 %	42560593
61	NC_005364	TAAGT	2	10	41351	41360	40 %	40 %	20 %	0 %	42560593
62	NC_005364	TAGTT	2	10	42182	42191	20 %	60 %	20 %	0 %	42560593
63	NC_005364	TATTT	2	10	42318	42327	20 %	80 %	0 %	0 %	42560593
64	NC_005364	TACAA	2	10	42780	42789	60 %	20 %	0 %	20 %	42560593
65	NC_005364	TTATG	2	10	43000	43009	20 %	60 %	20 %	0 %	42560593
66	NC_005364	TTTTA	2	10	43547	43556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005364	TTTAG	2	10	44135	44144	20 %	60 %	20 %	0 %	42560594
68	NC_005364	TAAAA	2	10	45935	45944	80 %	20 %	0 %	0 %	42560595
69	NC_005364	CTTAT	2	10	46803	46812	20 %	60 %	0 %	20 %	42560596
70	NC_005364	AAAGA	2	10	47524	47533	80 %	0 %	20 %	0 %	42560597
71	NC_005364	TTTCA	2	10	49210	49219	20 %	60 %	0 %	20 %	42560598
72	NC_005364	ACATT	2	10	49454	49463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_005364	AGAAA	2	10	50831	50840	80 %	0 %	20 %	0 %	42560599
74	NC_005364	ATTTT	2	10	52620	52629	20 %	80 %	0 %	0 %	42560602
75	NC_005364	TAGTA	2	10	54111	54120	40 %	40 %	20 %	0 %	42560603
76	NC_005364	ATATT	2	10	54848	54857	40 %	60 %	0 %	0 %	42560604
77	NC_005364	AATGT	2	10	57001	57010	40 %	40 %	20 %	0 %	42560607
78	NC_005364	TTGTT	2	10	57200	57209	0 %	80 %	20 %	0 %	42560607
79	NC_005364	GATTT	2	10	57789	57798	20 %	60 %	20 %	0 %	42560608
80	NC_005364	ATTTT	2	10	57893	57902	20 %	80 %	0 %	0 %	42560608
81	NC_005364	TTTGT	2	10	58172	58181	0 %	80 %	20 %	0 %	42560608
82	NC_005364	TAAAA	2	10	58830	58839	80 %	20 %	0 %	0 %	42560608
83	NC_005364	TTGTT	2	10	58890	58899	0 %	80 %	20 %	0 %	42560608
84	NC_005364	AATTA	2	10	59451	59460	60 %	40 %	0 %	0 %	42560609
85	NC_005364	ATTAT	2	10	59923	59932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005364	TTCTT	2	10	60857	60866	0 %	80 %	0 %	20 %	42560610
87	NC_005364	GTAAA	2	10	62501	62510	60 %	20 %	20 %	0 %	42560612
88	NC_005364	TTTTA	2	10	63783	63792	20 %	80 %	0 %	0 %	42560612
89	NC_005364	GTTAA	2	10	64762	64771	40 %	40 %	20 %	0 %	42560613
90	NC_005364	TATTT	2	10	65367	65376	20 %	80 %	0 %	0 %	42560614
91	NC_005364	ATTTT	2	10	66516	66525	20 %	80 %	0 %	0 %	42560614
92	NC_005364	AATTA	2	10	66753	66762	60 %	40 %	0 %	0 %	42560614
93	NC_005364	TGTTA	2	10	67155	67164	20 %	60 %	20 %	0 %	42560615
94	NC_005364	TGAAT	2	10	67306	67315	40 %	40 %	20 %	0 %	42560615
95	NC_005364	TTTCA	2	10	71024	71033	20 %	60 %	0 %	20 %	42560620
96	NC_005364	ACATT	2	10	71268	71277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_005364	CTATT	2	10	72166	72175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_005364	AATTA	2	10	72930	72939	60 %	40 %	0 %	0 %	42560623
99	NC_005364	ATAAA	2	10	73246	73255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005364	CAAAA	2	10	74876	74885	80 %	0 %	0 %	20 %	42560625
101	NC_005364	TTAGG	2	10	74898	74907	20 %	40 %	40 %	0 %	42560625
102	NC_005364	CAAGT	2	10	74976	74985	40 %	20 %	20 %	20 %	42560625
103	NC_005364	TATAA	2	10	75705	75714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005364	AAAAC	2	10	76130	76139	80 %	0 %	0 %	20 %	42560626
105	NC_005364	GATTA	2	10	76567	76576	40 %	40 %	20 %	0 %	42560626
106	NC_005364	AACAA	2	10	76770	76779	80 %	0 %	0 %	20 %	42560626
107	NC_005364	AAATT	2	10	76863	76872	60 %	40 %	0 %	0 %	42560626
108	NC_005364	TAAAA	2	10	77004	77013	80 %	20 %	0 %	0 %	42560626
109	NC_005364	TAGTT	2	10	77530	77539	20 %	60 %	20 %	0 %	42560628
110	NC_005364	ATTAG	2	10	77852	77861	40 %	40 %	20 %	0 %	42560628
111	NC_005364	AAAAG	2	10	78331	78340	80 %	0 %	20 %	0 %	42560628
112	NC_005364	AACAA	2	10	78473	78482	80 %	0 %	0 %	20 %	42560629
113	NC_005364	TAATG	2	10	80014	80023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005364	AATGA	2	10	80257	80266	60 %	20 %	20 %	0 %	42560630
115	NC_005364	CATTT	2	10	83468	83477	20 %	60 %	0 %	20 %	42560632
116	NC_005364	TTCAA	2	10	84773	84782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_005364	TTTCA	2	10	90188	90197	20 %	60 %	0 %	20 %	42560633
118	NC_005364	ACATT	2	10	90432	90441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005364	TAAAC	2	10	91778	91787	60 %	20 %	0 %	20 %	42560634
120	NC_005364	TTTGT	2	10	91972	91981	0 %	80 %	20 %	0 %	42560634
121	NC_005364	AATTT	2	10	93334	93343	40 %	60 %	0 %	0 %	42560636
122	NC_005364	TTTAG	2	10	93397	93406	20 %	60 %	20 %	0 %	42560636
123	NC_005364	TAAAG	2	10	93840	93849	60 %	20 %	20 %	0 %	42560636
124	NC_005364	GAATA	2	10	94548	94557	60 %	20 %	20 %	0 %	42560636
125	NC_005364	AGTTT	2	10	94714	94723	20 %	60 %	20 %	0 %	42560636
126	NC_005364	TAATT	2	10	95613	95622	40 %	60 %	0 %	0 %	42560636
127	NC_005364	TAAAT	2	10	97534	97543	60 %	40 %	0 %	0 %	42560638
128	NC_005364	AGTGT	2	10	97613	97622	20 %	40 %	40 %	0 %	42560638
129	NC_005364	GGAAT	2	10	98342	98351	40 %	20 %	40 %	0 %	42560639
130	NC_005364	ATTTT	2	10	100011	100020	20 %	80 %	0 %	0 %	42560640
131	NC_005364	ATTTT	2	10	100648	100657	20 %	80 %	0 %	0 %	42560641
132	NC_005364	AATTA	2	10	101427	101436	60 %	40 %	0 %	0 %	42560641
133	NC_005364	TAATT	2	10	103132	103141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005364	TTGTT	2	10	103357	103366	0 %	80 %	20 %	0 %	42560644
135	NC_005364	ATCAA	2	10	103755	103764	60 %	20 %	0 %	20 %	42560644
136	NC_005364	TTAAA	2	10	104969	104978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005364	TATTT	2	10	105002	105011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005364	TATAT	2	10	105249	105258	40 %	60 %	0 %	0 %	42560646
139	NC_005364	TATAA	2	10	106350	106359	60 %	40 %	0 %	0 %	42560647
140	NC_005364	AAAGA	2	10	108719	108728	80 %	0 %	20 %	0 %	42560648
141	NC_005364	AAACC	2	10	110273	110282	60 %	0 %	0 %	40 %	42560650
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