MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bdellovibrio bacteriovorus HD100

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005363	GGCTTA	2	12	15407	15418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005363	AAAAGC	2	12	27564	27575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005363	CAATTG	2	12	47735	47746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_005363	TTTTTG	2	12	58755	58766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005363	TGAAGG	2	12	85912	85923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005363	TAAACT	2	12	182854	182865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005363	CTTTTT	2	12	212795	212806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_005363	ATAATC	2	12	245644	245655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005363	TACACC	2	12	337952	337963	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005363	AACCAA	2	12	386926	386937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005363	TGGGGA	2	12	431285	431296	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005363	CCTAGC	2	12	463464	463475	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005363	CTTTTT	2	12	499612	499623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_005363	AGAAAA	2	12	505198	505209	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005363	AAGCTC	2	12	561907	561918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005363	GGTGTA	2	12	563858	563869	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005363	TTTTTG	2	12	624547	624558	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005363	ACGATC	2	12	629011	629022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005363	TCCTTA	2	12	665248	665259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005363	ATCTAA	2	12	736591	736602	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_005363	TGCCCT	2	12	747061	747072	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005363	GGGAAA	2	12	790375	790386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005363	AAGAAA	2	12	819345	819356	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005363	ACACTG	2	12	820294	820305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005363	GAAAAA	2	12	924789	924800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005363	ATGGGA	2	12	1049179	1049190	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005363	TTGTCT	2	12	1055438	1055449	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_005363	TTGAAA	2	12	1074342	1074353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005363	TTTCGA	2	12	1089440	1089451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005363	TTTTTC	2	12	1101360	1101371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005363	GAAAAA	2	12	1132591	1132602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005363	GAAAAA	2	12	1158686	1158697	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005363	CTTTTT	2	12	1180417	1180428	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_005363	AAGATC	2	12	1192013	1192024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005363	TTGTTT	2	12	1228536	1228547	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005363	TAAAAA	2	12	1380716	1380727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005363	GATCAC	2	12	1538329	1538340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005363	ACACTG	2	12	1688358	1688369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005363	TTCAAC	2	12	1693907	1693918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005363	ATTTCA	2	12	1694007	1694018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005363	ATTTCT	2	12	1694019	1694030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005363	CAAAAA	2	12	1729905	1729916	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_005363	CTTTTT	2	12	1729942	1729953	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_005363	AAAAAC	2	12	1751596	1751607	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005363	TTTAGA	2	12	1763154	1763165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005363	TTCTTA	2	12	1765434	1765445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005363	GCTTTT	2	12	1826566	1826577	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_005363	AGACAC	2	12	1951230	1951241	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005363	ACCTAT	2	12	2038340	2038351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005363	AACATA	2	12	2061091	2061102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005363	GAAAAA	2	12	2074921	2074932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005363	AAAAGC	2	12	2077594	2077605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_005363	GTATTT	2	12	2138702	2138713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005363	AACCCC	2	12	2159838	2159849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_005363	AGCAAT	2	12	2178069	2178080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_005363	CGATTT	2	12	2230444	2230455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_005363	GCCAAA	2	12	2235225	2235236	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005363	GGTCAT	2	12	2250779	2250790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_005363	TGCCCG	2	12	2269440	2269451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005363	CAAAAA	2	12	2271963	2271974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_005363	TCATTT	2	12	2356979	2356990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_005363	ACTTCA	2	12	2383962	2383973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005363	TGAAGC	2	12	2392834	2392845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005363	TGCAAA	2	12	2422935	2422946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005363	CTTTTG	2	12	2429980	2429991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_005363	AATTTT	2	12	2624119	2624130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005363	GTTTGA	2	12	2686097	2686108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005363	AATCTT	2	12	2737774	2737785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005363	TTTTCC	2	12	2843102	2843113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005363	CAAAAA	2	12	2886447	2886458	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_005363	CCGGCA	2	12	3050726	3050737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005363	AAATTT	2	12	3125726	3125737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005363	TGGACT	2	12	3181712	3181723	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_005363	GTTATA	2	12	3249828	3249839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005363	TCACAA	2	12	3265605	3265616	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005363	AATCTC	2	12	3290646	3290657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005363	CATGGT	2	12	3306093	3306104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_005363	TAGTTT	2	12	3416654	3416665	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005363	GAGGCT	2	12	3425993	3426004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_005363	CAGTTT	2	12	3457282	3457293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_005363	TTGAAA	2	12	3589671	3589682	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005363	TGACAT	2	12	3734846	3734857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_005363	TATAAA	2	12	3780390	3780401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.