MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bdellovibrio bacteriovorus HD100

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005363	AGTAA	2	10	21692	21701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005363	CTTTT	2	10	31234	31243	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005363	CTGCC	2	10	94454	94463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_005363	CCCTT	2	10	96390	96399	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_005363	ATTCA	2	10	96461	96470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_005363	GTTTT	2	10	121838	121847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005363	GAGCT	2	10	183001	183010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_005363	ATTTT	2	10	183193	183202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005363	TGGGT	2	10	183325	183334	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005363	AAAAG	2	10	210124	210133	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005363	GAAGG	2	10	225355	225364	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005363	CCTCG	2	10	251365	251374	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_005363	CAATT	2	10	267345	267354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_005363	AAGAA	2	10	267368	267377	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005363	GTAAG	2	10	384686	384695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005363	GGAGT	2	10	385785	385794	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005363	TTTCT	2	10	393613	393622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005363	AACGA	2	10	405325	405334	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005363	TTAAA	2	10	407421	407430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005363	AGGGG	2	10	418671	418680	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005363	AGTCA	2	10	418689	418698	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_005363	CTTTG	2	10	427766	427775	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_005363	ATGCA	2	10	463399	463408	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_005363	AGAAA	2	10	477353	477362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005363	TGATT	2	10	482932	482941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005363	CTGCG	2	10	553070	553079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_005363	TTGCT	2	10	565308	565317	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_005363	AAAAG	2	10	582981	582990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005363	GCAAC	2	10	590923	590932	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_005363	GAAGC	2	10	612164	612173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005363	CTGAA	2	10	626184	626193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005363	CATCA	2	10	628950	628959	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_005363	AAGGA	2	10	654567	654576	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005363	AAGGT	2	10	693844	693853	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005363	CTGCG	2	10	703684	703693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_005363	GACCG	2	10	742557	742566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_005363	ATCGA	2	10	749691	749700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_005363	AAGGC	2	10	749734	749743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005363	CTTGT	2	10	762164	762173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_005363	GGAAT	2	10	773663	773672	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005363	CTTAA	2	10	816288	816297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_005363	TCGTG	2	10	820618	820627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_005363	TACTG	2	10	821314	821323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_005363	CTAGT	2	10	822565	822574	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_005363	AAAAG	2	10	824803	824812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005363	TTTCC	2	10	856453	856462	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_005363	ATTGA	2	10	881727	881736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005363	CATGC	2	10	887021	887030	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_005363	TCAAA	2	10	889406	889415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005363	TGGGC	2	10	892386	892395	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_005363	ATTGA	2	10	892792	892801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005363	AAAGG	2	10	894582	894591	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005363	TGATT	2	10	896142	896151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005363	GTTTT	2	10	901636	901645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005363	GATAA	2	10	925789	925798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005363	GCTTG	2	10	950530	950539	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005363	CAAGC	2	10	964579	964588	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_005363	AGGTT	2	10	976337	976346	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005363	GAATG	2	10	982677	982686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005363	GACCT	2	10	991684	991693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_005363	CTGCG	2	10	996661	996670	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_005363	CCCGG	2	10	999097	999106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_005363	TGTTA	2	10	1004009	1004018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005363	CAGGA	2	10	1011105	1011114	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_005363	GCGAC	2	10	1013763	1013772	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_005363	AAAAG	2	10	1015312	1015321	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005363	TAAAA	2	10	1018510	1018519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005363	GAATA	2	10	1036125	1036134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005363	GGGTG	2	10	1041684	1041693	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005363	TTCTG	2	10	1042388	1042397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005363	CTTCA	2	10	1074081	1074090	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_005363	AGGCA	2	10	1087389	1087398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_005363	TTAAA	2	10	1088853	1088862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005363	TCTGC	2	10	1089557	1089566	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_005363	TGGAA	2	10	1090055	1090064	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005363	GATAA	2	10	1101494	1101503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005363	TCTTA	2	10	1114810	1114819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_005363	AAATC	2	10	1141153	1141162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_005363	GGGCA	2	10	1148893	1148902	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005363	TTTGT	2	10	1158724	1158733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005363	GTTTT	2	10	1172772	1172781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005363	TTGAA	2	10	1174862	1174871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005363	AATTA	2	10	1180383	1180392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005363	CAGCT	2	10	1186557	1186566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_005363	AGGGC	2	10	1194650	1194659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_005363	TGGGG	2	10	1199847	1199856	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005363	CTGCG	2	10	1204772	1204781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_005363	GAAGA	2	10	1216546	1216555	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005363	TAAAA	2	10	1217085	1217094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005363	ATAAA	2	10	1224576	1224585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005363	AGTTA	2	10	1226970	1226979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005363	GTGCT	2	10	1267331	1267340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_005363	GGAAA	2	10	1289962	1289971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005363	GCCAT	2	10	1314170	1314179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_005363	GTCAG	2	10	1319792	1319801	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_005363	CGAAG	2	10	1339011	1339020	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_005363	GAAAA	2	10	1357889	1357898	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005363	AAGTG	2	10	1380914	1380923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005363	CTGGA	2	10	1447268	1447277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_005363	TGAAT	2	10	1457300	1457309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005363	CCGCA	2	10	1465639	1465648	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_005363	GCTCA	2	10	1469629	1469638	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_005363	TTATT	2	10	1469803	1469812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005363	TTAAT	2	10	1511834	1511843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005363	GCCCG	2	10	1545389	1545398	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_005363	GTTTT	2	10	1546207	1546216	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005363	GTTTT	2	10	1550399	1550408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005363	GCGTT	2	10	1594398	1594407	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_005363	TGGGG	2	10	1613954	1613963	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005363	TCGTT	2	10	1619655	1619664	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_005363	GAAAA	2	10	1619781	1619790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005363	ACAAA	2	10	1638968	1638977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_005363	TCTTT	2	10	1675939	1675948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_005363	AATAG	2	10	1686805	1686814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005363	TCGTG	2	10	1688682	1688691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_005363	TACTG	2	10	1689378	1689387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_005363	CTAGT	2	10	1690629	1690638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_005363	GAGTC	2	10	1693189	1693198	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005363	CAAAA	2	10	1693844	1693853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_005363	TGTTT	2	10	1720106	1720115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005363	GTAAA	2	10	1731699	1731708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005363	GGATG	2	10	1741832	1741841	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005363	ACGAA	2	10	1771868	1771877	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_005363	TAAAG	2	10	1776477	1776486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005363	TTTAA	2	10	1812774	1812783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005363	CTTGA	2	10	1822559	1822568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_005363	TGAGA	2	10	1826555	1826564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005363	CAAAG	2	10	1859377	1859386	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_005363	AATTC	2	10	1860138	1860147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_005363	AGCCC	2	10	1886041	1886050	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_005363	GGGCT	2	10	1886155	1886164	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_005363	TTTTC	2	10	1915525	1915534	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_005363	GGGGT	2	10	1917273	1917282	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005363	TCAAA	2	10	1918485	1918494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_005363	TTTGC	2	10	1918539	1918548	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005363	GAAAA	2	10	1918685	1918694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005363	GTTTT	2	10	1919831	1919840	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005363	AGTCT	2	10	1923945	1923954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_005363	TGATT	2	10	1955674	1955683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005363	GACTA	2	10	1970842	1970851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_005363	CCTGT	2	10	1976814	1976823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_005363	TAAGT	2	10	2022436	2022445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005363	GCCCA	2	10	2045173	2045182	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_005363	AGAGC	2	10	2055417	2055426	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005363	TTTCA	2	10	2071859	2071868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_005363	TAAAA	2	10	2071962	2071971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_005363	CTTGG	2	10	2095870	2095879	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_005363	CGGCA	2	10	2138269	2138278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_005363	AAAAT	2	10	2343153	2343162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005363	TTTTG	2	10	2343270	2343279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_005363	CGCAG	2	10	2356338	2356347	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_005363	GTTTT	2	10	2483465	2483474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_005363	TAAAA	2	10	2503370	2503379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_005363	TGTGA	2	10	2511196	2511205	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005363	CTGTG	2	10	2521187	2521196	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_005363	ATGCC	2	10	2620078	2620087	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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178	NC_005363	TCTCA	2	10	2661628	2661637	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_005363	TTGGA	2	10	2675010	2675019	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_005363	TTTGA	2	10	2820244	2820253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_005363	CTTTT	2	10	2828562	2828571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_005363	CTTTT	2	10	2867808	2867817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_005363	CTCTT	2	10	2873695	2873704	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_005363	CGCAG	2	10	2895952	2895961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_005363	AGGCA	2	10	2897197	2897206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
188	NC_005363	CTTTT	2	10	2918329	2918338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_005363	CATTT	2	10	2944480	2944489	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_005363	GCCCC	2	10	2981291	2981300	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
193	NC_005363	AGGCA	2	10	3006047	3006056	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_005363	TTTTC	2	10	3046850	3046859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
195	NC_005363	CGCAG	2	10	3072648	3072657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_005363	AAATC	2	10	3143891	3143900	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_005363	TTAAC	2	10	3145177	3145186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_005363	TGACT	2	10	3203361	3203370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_005363	GCTTT	2	10	3223729	3223738	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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201	NC_005363	TTTGA	2	10	3353031	3353040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
202	NC_005363	GAAAA	2	10	3356376	3356385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
203	NC_005363	ATTGA	2	10	3374487	3374496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
204	NC_005363	TCCGC	2	10	3382476	3382485	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
205	NC_005363	CGCAG	2	10	3390520	3390529	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
206	NC_005363	GCTTT	2	10	3390638	3390647	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
207	NC_005363	CCGCG	2	10	3414535	3414544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
208	NC_005363	CAACG	2	10	3422419	3422428	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_005363	GAACA	2	10	3444714	3444723	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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224	NC_005363	GTCCA	2	10	3721763	3721772	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
225	NC_005363	TTAAT	2	10	3738117	3738126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_005363	TTCTT	2	10	3752223	3752232	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.