MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bdellovibrio bacteriovorus HD100

Total Repeats: 437

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005363	TA	5	10	1602	1611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005363	AC	3	6	21723	21728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005363	GA	3	6	25353	25358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005363	CA	3	6	29308	29313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005363	TA	4	8	59484	59491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005363	AT	3	6	61979	61984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005363	TG	3	6	62000	62005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005363	GC	3	6	86343	86348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005363	GC	3	6	90675	90680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005363	AC	3	6	96703	96708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005363	TC	3	6	105657	105662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005363	TA	3	6	108413	108418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005363	CT	3	6	108481	108486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005363	TG	3	6	108547	108552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005363	AT	3	6	120723	120728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005363	AG	3	6	121849	121854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005363	CT	4	8	160080	160087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005363	TA	3	6	160183	160188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005363	GC	3	6	183264	183269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005363	GT	3	6	183333	183338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005363	AG	3	6	202722	202727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005363	GT	3	6	214140	214145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005363	GA	3	6	214162	214167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005363	TC	3	6	225330	225335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005363	CT	3	6	225640	225645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_005363	CT	3	6	229963	229968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005363	AT	3	6	270115	270120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005363	GA	3	6	297365	297370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005363	GT	3	6	301252	301257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005363	TG	3	6	310623	310628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005363	GA	4	8	313479	313486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005363	CG	3	6	313572	313577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005363	GA	6	12	313681	313692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005363	AC	3	6	313720	313725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005363	CT	3	6	332376	332381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005363	GT	4	8	353505	353512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005363	CG	3	6	364726	364731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005363	GC	3	6	369314	369319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005363	GT	3	6	372369	372374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005363	TG	3	6	372447	372452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005363	TG	3	6	379808	379813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005363	TG	3	6	398564	398569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005363	TA	4	8	404853	404860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005363	GC	5	10	407772	407781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005363	CT	4	8	409214	409221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005363	AG	3	6	439246	439251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005363	CT	3	6	457251	457256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005363	TC	3	6	471615	471620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005363	GA	4	8	479452	479459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005363	AG	3	6	480668	480673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005363	TA	3	6	487321	487326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005363	AT	3	6	488062	488067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005363	GT	3	6	500395	500400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005363	GC	3	6	500786	500791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005363	GC	3	6	500795	500800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005363	GT	3	6	504610	504615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005363	GC	3	6	514963	514968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005363	TA	3	6	548236	548241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005363	AT	3	6	548356	548361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005363	CA	3	6	562085	562090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005363	TC	3	6	562107	562112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005363	TC	3	6	563032	563037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005363	GA	3	6	564124	564129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005363	CG	3	6	599602	599607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_005363	TC	3	6	601576	601581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_005363	GT	3	6	602156	602161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005363	CT	3	6	602727	602732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_005363	AT	3	6	605564	605569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005363	GT	3	6	620121	620126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005363	TG	3	6	628993	628998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005363	TG	3	6	638644	638649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005363	CT	3	6	638659	638664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_005363	AG	3	6	693703	693708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005363	CA	3	6	693806	693811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005363	TA	4	8	706189	706196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005363	TG	3	6	706269	706274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005363	AT	3	6	706308	706313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005363	AC	3	6	717198	717203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005363	GT	3	6	717207	717212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005363	GC	4	8	727454	727461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005363	CG	3	6	727518	727523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005363	CG	3	6	730406	730411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_005363	CT	3	6	747116	747121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005363	TC	3	6	747125	747130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_005363	GA	3	6	747160	747165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005363	GA	3	6	747270	747275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005363	CT	3	6	749651	749656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005363	TA	3	6	749780	749785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005363	TC	3	6	753820	753825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005363	GT	3	6	776517	776522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005363	CA	3	6	776524	776529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005363	GA	3	6	784534	784539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005363	TA	4	8	817902	817909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005363	GT	3	6	818334	818339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005363	GC	3	6	818386	818391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005363	AC	3	6	820772	820777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005363	AC	3	6	820941	820946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005363	GA	3	6	821214	821219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005363	CA	4	8	821511	821518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_005363	AT	3	6	822280	822285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005363	GC	3	6	823739	823744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_005363	GA	3	6	824425	824430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005363	CT	3	6	824435	824440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005363	AG	3	6	824450	824455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005363	AT	3	6	826861	826866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005363	GA	3	6	826915	826920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005363	TA	4	8	856521	856528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005363	TC	3	6	867705	867710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_005363	GA	3	6	888300	888305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005363	AG	3	6	890391	890396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005363	GC	3	6	892473	892478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_005363	GA	3	6	892805	892810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005363	TA	3	6	898113	898118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005363	GT	3	6	912540	912545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005363	TG	3	6	920118	920123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005363	CT	3	6	920198	920203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_005363	CG	3	6	930324	930329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_005363	AG	3	6	954897	954902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005363	GT	3	6	964504	964509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005363	GA	3	6	968669	968674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005363	CG	3	6	976236	976241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005363	GC	3	6	976245	976250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005363	GT	3	6	999205	999210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005363	CG	3	6	1000837	1000842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_005363	AC	3	6	1001060	1001065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005363	CT	3	6	1006811	1006816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_005363	TC	3	6	1006873	1006878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_005363	TG	3	6	1008859	1008864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005363	AT	3	6	1011719	1011724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005363	GC	3	6	1015276	1015281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_005363	GC	3	6	1033045	1033050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005363	CG	3	6	1033054	1033059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005363	TC	3	6	1051371	1051376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_005363	AG	3	6	1074035	1074040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005363	AG	3	6	1081622	1081627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005363	TC	3	6	1089426	1089431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005363	TG	3	6	1089478	1089483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005363	TG	3	6	1093121	1093126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005363	AT	3	6	1096633	1096638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005363	CG	3	6	1097414	1097419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005363	CT	3	6	1120703	1120708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_005363	AT	3	6	1123646	1123651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005363	AT	3	6	1127059	1127064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005363	CT	3	6	1138455	1138460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_005363	GT	3	6	1139829	1139834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005363	GT	3	6	1148171	1148176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005363	AT	3	6	1153036	1153041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005363	GA	3	6	1156948	1156953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005363	AG	3	6	1176264	1176269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005363	TA	3	6	1179131	1179136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005363	CT	3	6	1190841	1190846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_005363	CG	3	6	1192077	1192082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_005363	CG	5	10	1199751	1199760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.