MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 plasmid pRPA

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005297	TAAG	2	8	144	151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005297	AATT	2	8	408	415	50 %	50 %	0 %	0 %	39840938
3	NC_005297	CCCT	2	8	482	489	0 %	25 %	0 %	75 %	39840938
4	NC_005297	TGCG	2	8	534	541	0 %	25 %	50 %	25 %	39840938
5	NC_005297	GATA	2	8	664	671	50 %	25 %	25 %	0 %	39840938
6	NC_005297	CCGC	2	8	870	877	0 %	0 %	25 %	75 %	39840938
7	NC_005297	CATC	2	8	1219	1226	25 %	25 %	0 %	50 %	39840938
8	NC_005297	TGGA	2	8	2123	2130	25 %	25 %	50 %	0 %	39840939
9	NC_005297	GCGA	2	8	2246	2253	25 %	0 %	50 %	25 %	39840939
10	NC_005297	GTCG	2	8	2399	2406	0 %	25 %	50 %	25 %	39840939
11	NC_005297	TCGC	2	8	3130	3137	0 %	25 %	25 %	50 %	39840940
12	NC_005297	CGGT	2	8	3412	3419	0 %	25 %	50 %	25 %	39840940
13	NC_005297	TGGC	2	8	3478	3485	0 %	25 %	50 %	25 %	39840940
14	NC_005297	ATGG	2	8	4007	4014	25 %	25 %	50 %	0 %	39840941
15	NC_005297	TTGA	2	8	4682	4689	25 %	50 %	25 %	0 %	39840941
16	NC_005297	TGCA	2	8	5482	5489	25 %	25 %	25 %	25 %	39840941
17	NC_005297	GTAA	2	8	5537	5544	50 %	25 %	25 %	0 %	39840941
18	NC_005297	CGCC	2	8	5590	5597	0 %	0 %	25 %	75 %	39840941

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.