MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	GTTTT	2	10	327	336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005296	GCTGA	2	10	510	519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005296	AACTC	2	10	590	599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_005296	GCCCT	2	10	14008	14017	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_005296	AGCAA	2	10	24552	24561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_005296	GCTTC	2	10	26192	26201	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_005296	ACCGG	2	10	27135	27144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_005296	CGGCG	2	10	27289	27298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_005296	TTTTA	2	10	30701	30710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005296	CACCC	2	10	43390	43399	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_005296	TTTGG	2	10	45807	45816	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005296	CCGGG	2	10	59106	59115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_005296	CGCGT	2	10	59660	59669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_005296	GTCCA	2	10	60503	60512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_005296	ACGCA	2	10	65038	65047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_005296	CATGC	2	10	66547	66556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_005296	AGCAA	2	10	79348	79357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005296	AATGC	2	10	94092	94101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005296	GCCTG	2	10	99946	99955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_005296	ACTAA	2	10	104474	104483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_005296	TCGGA	2	10	106149	106158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_005296	TCCGG	2	10	126301	126310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_005296	CGAAC	2	10	132625	132634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_005296	ACAGA	2	10	135735	135744	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_005296	GTTGG	2	10	143655	143664	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005296	CCGGC	2	10	154019	154028	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_005296	CGGCT	2	10	165902	165911	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_005296	GTTGG	2	10	175609	175618	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005296	CGCGA	2	10	175659	175668	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_005296	GAACA	2	10	175696	175705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005296	CGGCG	2	10	177245	177254	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_005296	GCCGG	2	10	181759	181768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_005296	CGGCG	2	10	185190	185199	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_005296	CGGCG	2	10	185232	185241	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_005296	GAAAG	2	10	185339	185348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005296	GCGCC	2	10	192365	192374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_005296	AGGAT	2	10	200081	200090	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005296	CTTTT	2	10	200685	200694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005296	AGCCG	2	10	200702	200711	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_005296	GGAAA	2	10	202965	202974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005296	ACGAT	2	10	217827	217836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_005296	GCGCG	2	10	221969	221978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_005296	CGTCA	2	10	229762	229771	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_005296	GCTTC	2	10	241066	241075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_005296	CAAAA	2	10	241105	241114	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_005296	TGCGA	3	15	244938	244952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_005296	ACGAA	2	10	247867	247876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_005296	CGGCG	2	10	248642	248651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_005296	CACGC	2	10	261247	261256	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_005296	ATCCG	2	10	274244	274253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_005296	CGTTG	2	10	287217	287226	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005296	CCCGC	2	10	299149	299158	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
53	NC_005296	CCGCC	2	10	309816	309825	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_005296	CTGCG	2	10	346710	346719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_005296	TCCGA	2	10	350094	350103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_005296	TTCCC	2	10	354544	354553	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_005296	TCGGT	2	10	354814	354823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_005296	AGCTC	2	10	356664	356673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_005296	GCCGC	2	10	360537	360546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_005296	GACCC	2	10	360624	360633	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_005296	CGGCG	2	10	377503	377512	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_005296	AAGGC	2	10	385482	385491	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_005296	GAACT	2	10	388851	388860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_005296	ATACG	2	10	398227	398236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_005296	TGCCA	2	10	400040	400049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_005296	TATAT	2	10	402982	402991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005296	AGCCG	2	10	409150	409159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_005296	CTTCG	2	10	411470	411479	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_005296	GCCAC	2	10	412939	412948	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_005296	GTTAT	2	10	449991	450000	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005296	AAATC	2	10	454252	454261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_005296	CACCG	2	10	456348	456357	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_005296	CGCGT	2	10	456370	456379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_005296	GCCGC	2	10	465380	465389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_005296	AGCCG	2	10	467334	467343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_005296	TGTGT	2	10	472874	472883	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005296	TAGCC	2	10	475718	475727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_005296	TCCGC	2	10	507394	507403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_005296	GTGGC	2	10	507477	507486	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005296	TCGCG	2	10	525517	525526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_005296	GAATG	2	10	536666	536675	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005296	GCTGC	2	10	536967	536976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_005296	CTGCG	2	10	546042	546051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_005296	GCCCC	2	10	562861	562870	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_005296	CCGCC	2	10	562994	563003	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_005296	CCCGA	2	10	567889	567898	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_005296	ATAAG	2	10	576608	576617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005296	CCGGT	2	10	576745	576754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_005296	GGCCA	2	10	585625	585634	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_005296	GCTTC	2	10	598371	598380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_005296	GCAGG	2	10	600236	600245	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_005296	CCGTT	2	10	617641	617650	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_005296	GACAC	2	10	637407	637416	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_005296	GGGGT	2	10	640040	640049	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005296	CATCG	2	10	642323	642332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_005296	CGGCG	2	10	663996	664005	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_005296	CCGGC	2	10	665303	665312	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_005296	GCGTT	2	10	671795	671804	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_005296	GTTGC	2	10	671901	671910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_005296	TGAGC	2	10	676617	676626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_005296	CCGGT	2	10	682538	682547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_005296	CTCGT	2	10	684893	684902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_005296	CCACC	2	10	690414	690423	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
104	NC_005296	GGCGC	2	10	694316	694325	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_005296	TAGCG	2	10	702918	702927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_005296	TCGTC	2	10	712243	712252	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_005296	GGGCA	2	10	736302	736311	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_005296	ACCGG	2	10	749873	749882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_005296	TCGCC	2	10	781362	781371	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_005296	GCAGC	2	10	813886	813895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_005296	CGCGG	2	10	816087	816096	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_005296	GCGCC	2	10	826443	826452	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_005296	GGTCG	2	10	826525	826534	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_005296	GCTTC	2	10	829682	829691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_005296	CCGGC	2	10	831972	831981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_005296	CAATG	2	10	843743	843752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_005296	CGGAA	2	10	880646	880655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_005296	GTTCG	2	10	880669	880678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005296	GGCGT	2	10	901307	901316	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_005296	AATGA	2	10	915389	915398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005296	AGGCA	2	10	915747	915756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005296	GGCGC	2	10	923398	923407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_005296	TTGCT	2	10	936533	936542	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_005296	AAACA	2	10	937309	937318	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_005296	TCGCT	2	10	942092	942101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_005296	TCACC	2	10	961061	961070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_005296	CACCC	2	10	961234	961243	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_005296	CGGCG	2	10	966740	966749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_005296	GGGGT	2	10	981319	981328	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005296	GGGGA	2	10	981388	981397	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005296	GGCCC	2	10	986662	986671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_005296	CCCGG	2	10	995152	995161	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_005296	GGCGC	2	10	1001972	1001981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_005296	CGCGG	2	10	1007229	1007238	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_005296	TCTTT	2	10	1007422	1007431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005296	TGGCC	2	10	1007555	1007564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_005296	CGGCC	2	10	1007958	1007967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_005296	CCTGT	2	10	1010105	1010114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_005296	GCAGC	2	10	1010410	1010419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_005296	TCTGT	2	10	1025441	1025450	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_005296	TCGAA	2	10	1025549	1025558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_005296	TGGTC	2	10	1038047	1038056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_005296	GAACA	2	10	1046394	1046403	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_005296	GCGAT	2	10	1049142	1049151	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005296	GGGGT	2	10	1052040	1052049	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005296	CACCC	2	10	1052081	1052090	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
147	NC_005296	GAGCG	2	10	1059125	1059134	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_005296	GCGTC	2	10	3176786	3176795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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459	NC_005296	GCCCC	2	10	3410623	3410632	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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461	NC_005296	TGGCG	2	10	3418323	3418332	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_005296	CCGGC	2	10	3418890	3418899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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474	NC_005296	TCGCT	2	10	3491373	3491382	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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479	NC_005296	CTCCG	2	10	3510782	3510791	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
480	NC_005296	CCGCG	2	10	3522092	3522101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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489	NC_005296	GTTTG	2	10	3591259	3591268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_005296	CGCGG	2	10	3636643	3636652	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
500	NC_005296	GACCA	2	10	3664206	3664215	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

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