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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 2228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	TTCG	2	8	246	253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005296	ATCC	2	8	3522	3529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005296	GCCG	2	8	4852	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005296	TCTA	2	8	4925	4932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005296	CCAT	2	8	7567	7574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005296	GCCG	2	8	8865	8872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005296	ATCA	2	8	13078	13085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005296	GAAA	2	8	13827	13834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005296	GGAC	2	8	22682	22689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005296	GCGA	2	8	24544	24551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005296	CATC	2	8	27309	27316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005296	CCGG	2	8	29203	29210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005296	GGAA	2	8	29212	29219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005296	GGAA	2	8	33600	33607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005296	GCCG	2	8	39222	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005296	GCCG	2	8	39375	39382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005296	TCAA	2	8	44051	44058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005296	CATC	2	8	45328	45335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005296	TGGC	2	8	46357	46364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005296	GTTC	2	8	46372	46379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_005296	GGCC	2	8	47150	47157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005296	AACC	2	8	47234	47241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005296	GGCG	2	8	48105	48112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005296	GATT	2	8	48185	48192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005296	TTGG	2	8	52186	52193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005296	GACA	2	8	64961	64968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_005296	CAGG	2	8	69215	69222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005296	GGCT	2	8	69257	69264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_005296	CGCC	2	8	69330	69337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_005296	GGCA	2	8	72120	72127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_005296	GAAC	2	8	72131	72138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005296	CGCA	2	8	73365	73372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005296	GCGA	2	8	73727	73734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_005296	CGGC	2	8	79435	79442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005296	GCCG	2	8	79448	79455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005296	CTGC	2	8	103278	103285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005296	CGAC	2	8	103839	103846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005296	CCGT	2	8	106245	106252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005296	GGGC	2	8	116912	116919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005296	GTCA	2	8	119697	119704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005296	AGCG	2	8	126339	126346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005296	CCGG	2	8	132009	132016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005296	CCGA	2	8	133110	133117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005296	CGAT	2	8	133140	133147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_005296	CCGG	2	8	135911	135918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005296	CGAG	2	8	136720	136727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_005296	CTCG	2	8	171293	171300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005296	GAGG	2	8	175728	175735	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005296	GGTT	2	8	177172	177179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005296	GAAG	2	8	177434	177441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005296	ACCG	2	8	179027	179034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_005296	TCGG	2	8	179067	179074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_005296	ACGT	2	8	179494	179501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_005296	GAGC	2	8	179588	179595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_005296	AGCA	2	8	183051	183058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_005296	GCCG	2	8	192419	192426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005296	CCGT	2	8	192526	192533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005296	CATC	2	8	194120	194127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005296	GGAT	2	8	194141	194148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005296	GATG	2	8	194730	194737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005296	CGGT	2	8	196240	196247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005296	ATCA	2	8	199592	199599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_005296	GGCC	2	8	205450	205457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005296	GCCC	2	8	209417	209424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_005296	GTGG	2	8	215798	215805	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005296	TCGG	2	8	217151	217158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005296	CCGT	2	8	222101	222108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_005296	GCAC	2	8	223782	223789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005296	AAAT	2	8	231361	231368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005296	CATC	2	8	231929	231936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005296	CGAG	2	8	237053	237060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005296	GGTT	2	8	237176	237183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005296	CGGA	2	8	237821	237828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_005296	TCAT	2	8	240090	240097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005296	CTTC	2	8	241045	241052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_005296	GATG	2	8	242012	242019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005296	ATTG	2	8	244763	244770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005296	CCTC	2	8	244845	244852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_005296	AGCG	2	8	246115	246122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_005296	GAAC	2	8	247858	247865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005296	CGAT	2	8	248751	248758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005296	GCTC	2	8	250467	250474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_005296	TCGC	2	8	251255	251262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005296	CATC	2	8	252639	252646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_005296	CAAA	2	8	253905	253912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_005296	CGCC	2	8	253915	253922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_005296	TTCG	2	8	256534	256541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_005296	CATC	2	8	257225	257232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005296	TAGT	2	8	261109	261116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005296	GCAT	2	8	261181	261188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005296	GCGG	2	8	263396	263403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_005296	GCCG	2	8	266525	266532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_005296	TCCA	2	8	266604	266611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005296	CATC	2	8	268028	268035	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_005296	GGCG	2	8	277277	277284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_005296	CACG	2	8	284490	284497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005296	CCTG	2	8	284513	284520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005296	ATCC	2	8	289806	289813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_005296	CGGA	2	8	295468	295475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_005296	CGGC	2	8	295515	295522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_005296	ACCG	2	8	295654	295661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_005296	GCCC	2	8	300083	300090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_005296	CCCG	2	8	302178	302185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_005296	TCGG	2	8	302278	302285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_005296	CTTT	2	8	304235	304242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005296	GATG	2	8	309770	309777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005296	GGAT	2	8	309963	309970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005296	CCGG	2	8	315534	315541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_005296	TCGT	2	8	319903	319910	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_005296	ACGA	2	8	320052	320059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005296	GCAA	2	8	321321	321328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_005296	CCGC	2	8	321363	321370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_005296	CAAA	2	8	326525	326532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_005296	GGAA	2	8	327886	327893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005296	AAGG	2	8	327949	327956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005296	CCGG	2	8	332676	332683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_005296	GGAT	2	8	335897	335904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005296	GGTC	2	8	337310	337317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_005296	TGCC	2	8	344701	344708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_005296	CGCC	2	8	348370	348377	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_005296	CAAC	2	8	354086	354093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005296	CGGC	2	8	360493	360500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005296	GCCG	2	8	362768	362775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005296	GGGC	2	8	367384	367391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005296	GCCC	2	8	367398	367405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_005296	GCCG	2	8	374108	374115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_005296	AACT	2	8	374418	374425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005296	GCCG	2	8	377389	377396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_005296	CCGA	2	8	377397	377404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_005296	GGCC	2	8	388787	388794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_005296	GCCG	2	8	389655	389662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005296	CGAT	2	8	391425	391432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_005296	CAAA	2	8	397146	397153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_005296	GCGG	2	8	398141	398148	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_005296	CGTT	2	8	399722	399729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005296	TCCG	2	8	399734	399741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005296	GGAT	2	8	399849	399856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005296	TCGA	2	8	407977	407984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_005296	CCCT	2	8	409388	409395	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_005296	CGGC	2	8	409527	409534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005296	ACTG	2	8	412949	412956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_005296	CCCG	2	8	412957	412964	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_005296	TGGC	2	8	414035	414042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005296	GCGG	2	8	421835	421842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_005296	GCCG	2	8	424204	424211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_005296	GCCG	2	8	424220	424227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_005296	CGGG	2	8	427170	427177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_005296	TTCG	2	8	427194	427201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_005296	TGCC	2	8	427358	427365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_005296	GCCC	2	8	427387	427394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_005296	CAAC	2	8	431589	431596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_005296	CGGC	2	8	436392	436399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_005296	GGGC	2	8	436420	436427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_005296	CATC	2	8	438079	438086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_005296	GGAT	2	8	438100	438107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005296	GGCA	2	8	439457	439464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_005296	ACCG	2	8	449916	449923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_005296	CAGT	2	8	449933	449940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_005296	GGCT	2	8	450225	450232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_005296	CCGC	2	8	459503	459510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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169	NC_005296	AAGC	2	8	461894	461901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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180	NC_005296	GGAG	2	8	499302	499309	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
181	NC_005296	TCCA	2	8	500007	500014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_005296	CCAT	2	8	502889	502896	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_005296	GAAC	2	8	507466	507473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_005296	GCAC	2	8	507837	507844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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192	NC_005296	TGGC	2	8	524392	524399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_005296	GGCT	2	8	1239310	1239317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_005296	GATC	2	8	1247824	1247831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_005296	TCCG	2	8	1250023	1250030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_005296	TTGT	2	8	1256814	1256821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_005296	CGTG	2	8	1277382	1277389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_005296	CCGG	2	8	1281545	1281552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_005296	CCGG	2	8	1281557	1281564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_005296	ACTG	2	8	1282193	1282200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_005296	GCCG	2	8	1283464	1283471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_005296	CCGA	2	8	1283915	1283922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_005296	CGAC	2	8	1306221	1306228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_005296	CCCG	2	8	1309519	1309526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_005296	CGAT	2	8	1309731	1309738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_005296	CATC	2	8	1310717	1310724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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