MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 12344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	CGTC	2	8	994	1001	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
2	NC_005296	CTCG	2	8	1332	1339	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
3	NC_005296	GCCG	2	8	1453	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
4	NC_005296	CACC	2	8	1617	1624	25 %	0 %	0 %	75 %	39933081
5	NC_005296	CGAC	2	8	2468	2475	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
6	NC_005296	GCCG	2	8	2502	2509	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
7	NC_005296	GCCG	2	8	2635	2642	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
8	NC_005296	GATC	2	8	2748	2755	25 %	25 %	25 %	25 %	39933082
9	NC_005296	CGAC	2	8	2858	2865	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
10	NC_005296	TCCG	2	8	4362	4369	0 %	25 %	25 %	50 %	39933083
11	NC_005296	TGGA	2	8	4390	4397	25 %	25 %	50 %	0 %	39933083
12	NC_005296	GCCG	2	8	5097	5104	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
13	NC_005296	GGCC	2	8	5250	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
14	NC_005296	CTGG	2	8	6171	6178	0 %	25 %	50 %	25 %	39933084
15	NC_005296	TCCG	2	8	6186	6193	0 %	25 %	25 %	50 %	39933084
16	NC_005296	GGAA	2	8	7205	7212	50 %	0 %	50 %	0 %	39933084
17	NC_005296	GCCG	2	8	7264	7271	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
18	NC_005296	TCGA	2	8	7722	7729	25 %	25 %	25 %	25 %	39933085
19	NC_005296	GCCG	2	8	8450	8457	0 %	0 %	50 %	50 %	39933085
20	NC_005296	CGAG	2	8	8467	8474	25 %	0 %	50 %	25 %	39933085
21	NC_005296	CGGC	2	8	8970	8977	0 %	0 %	50 %	50 %	39933086
22	NC_005296	ACCA	2	8	8980	8987	50 %	0 %	0 %	50 %	39933086
23	NC_005296	CCGA	2	8	8996	9003	25 %	0 %	25 %	50 %	39933086
24	NC_005296	CGGA	2	8	9183	9190	25 %	0 %	50 %	25 %	39933086
25	NC_005296	CCGG	2	8	9880	9887	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
26	NC_005296	GGTG	2	8	10302	10309	0 %	25 %	75 %	0 %	39933087
27	NC_005296	CGGC	2	8	10313	10320	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
28	NC_005296	GAGC	2	8	10615	10622	25 %	0 %	50 %	25 %	39933087
29	NC_005296	CATC	2	8	10704	10711	25 %	25 %	0 %	50 %	39933087
30	NC_005296	GATC	2	8	11045	11052	25 %	25 %	25 %	25 %	39933088
31	NC_005296	CGCT	2	8	11245	11252	0 %	25 %	25 %	50 %	39933089
32	NC_005296	CAGC	2	8	11901	11908	25 %	0 %	25 %	50 %	39933089
33	NC_005296	ACCG	2	8	11922	11929	25 %	0 %	25 %	50 %	39933089
34	NC_005296	CCTG	2	8	12338	12345	0 %	25 %	25 %	50 %	39933089
35	NC_005296	TCGG	2	8	12574	12581	0 %	25 %	50 %	25 %	39933089
36	NC_005296	CGAG	2	8	12644	12651	25 %	0 %	50 %	25 %	39933089
37	NC_005296	TCGA	2	8	13528	13535	25 %	25 %	25 %	25 %	39933090
38	NC_005296	TCGG	2	8	14390	14397	0 %	25 %	50 %	25 %	39933091
39	NC_005296	GCGA	2	8	15002	15009	25 %	0 %	50 %	25 %	39933093
40	NC_005296	CGGC	2	8	15090	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
41	NC_005296	TACA	2	8	16003	16010	50 %	25 %	0 %	25 %	39933093
42	NC_005296	TGAT	2	8	16307	16314	25 %	50 %	25 %	0 %	39933093
43	NC_005296	GCCG	2	8	17101	17108	0 %	0 %	50 %	50 %	39933094
44	NC_005296	GGCT	2	8	17263	17270	0 %	25 %	50 %	25 %	39933094
45	NC_005296	GATG	2	8	17915	17922	25 %	25 %	50 %	0 %	39933095
46	NC_005296	GCCG	2	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
47	NC_005296	CGAA	3	12	19304	19315	50 %	0 %	25 %	25 %	39933096
48	NC_005296	CGAG	2	8	19600	19607	25 %	0 %	50 %	25 %	39933096
49	NC_005296	TCGG	2	8	20167	20174	0 %	25 %	50 %	25 %	39933098
50	NC_005296	CGGA	2	8	20583	20590	25 %	0 %	50 %	25 %	39933098
51	NC_005296	CGAC	2	8	20981	20988	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
52	NC_005296	CGAG	2	8	21014	21021	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
53	NC_005296	CGAC	2	8	21320	21327	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
54	NC_005296	CGGA	2	8	22095	22102	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
55	NC_005296	GCCG	2	8	22103	22110	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
56	NC_005296	GGCC	2	8	22169	22176	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
57	NC_005296	ACCG	2	8	23092	23099	25 %	0 %	25 %	50 %	39933100
58	NC_005296	GAGC	2	8	23283	23290	25 %	0 %	50 %	25 %	39933100
59	NC_005296	GCCG	2	8	23652	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	39933100
60	NC_005296	GCCC	2	8	24169	24176	0 %	0 %	25 %	75 %	39933101
61	NC_005296	CGAG	3	12	24333	24344	25 %	0 %	50 %	25 %	39933101
62	NC_005296	CGGC	2	8	24410	24417	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
63	NC_005296	CCAC	2	8	24870	24877	25 %	0 %	0 %	75 %	39933102
64	NC_005296	GACA	2	8	25430	25437	50 %	0 %	25 %	25 %	39933103
65	NC_005296	CGGC	2	8	25688	25695	0 %	0 %	50 %	50 %	39933103
66	NC_005296	CGCC	2	8	26060	26067	0 %	0 %	25 %	75 %	39933103
67	NC_005296	GTCG	2	8	26781	26788	0 %	25 %	50 %	25 %	39933104
68	NC_005296	ATCG	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	39933105
69	NC_005296	CAGC	2	8	28947	28954	25 %	0 %	25 %	50 %	39933105
70	NC_005296	GGGC	2	8	31478	31485	0 %	0 %	75 %	25 %	39933107
71	NC_005296	GCCA	2	8	31632	31639	25 %	0 %	25 %	50 %	39933107
72	NC_005296	GCGG	2	8	32223	32230	0 %	0 %	75 %	25 %	39933108
73	NC_005296	GCGG	2	8	32235	32242	0 %	0 %	75 %	25 %	39933108
74	NC_005296	TCGG	2	8	32368	32375	0 %	25 %	50 %	25 %	39933108
75	NC_005296	CCAT	2	8	33382	33389	25 %	25 %	0 %	50 %	39933108
76	NC_005296	GGCC	2	8	33434	33441	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
77	NC_005296	GGCG	2	8	33790	33797	0 %	0 %	75 %	25 %	39933109
78	NC_005296	TCGA	2	8	33867	33874	25 %	25 %	25 %	25 %	39933109
79	NC_005296	GCCA	2	8	33920	33927	25 %	0 %	25 %	50 %	39933109
80	NC_005296	GGCG	2	8	34499	34506	0 %	0 %	75 %	25 %	39933109
81	NC_005296	CAGC	2	8	35222	35229	25 %	0 %	25 %	50 %	39933109
82	NC_005296	CGGC	2	8	35328	35335	0 %	0 %	50 %	50 %	39933109
83	NC_005296	ACGG	2	8	35570	35577	25 %	0 %	50 %	25 %	39933109
84	NC_005296	GATC	2	8	35960	35967	25 %	25 %	25 %	25 %	39933110
85	NC_005296	AGCG	2	8	36117	36124	25 %	0 %	50 %	25 %	39933110
86	NC_005296	TCCA	2	8	36853	36860	25 %	25 %	0 %	50 %	39933110
87	NC_005296	TCGG	2	8	36910	36917	0 %	25 %	50 %	25 %	39933110
88	NC_005296	GAAC	2	8	37645	37652	50 %	0 %	25 %	25 %	39933112
89	NC_005296	CGGC	2	8	37720	37727	0 %	0 %	50 %	50 %	39933112
90	NC_005296	CTTC	2	8	39035	39042	0 %	50 %	0 %	50 %	39933113
91	NC_005296	GGGC	3	12	39514	39525	0 %	0 %	75 %	25 %	39933114
92	NC_005296	GCCG	2	8	40175	40182	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
93	NC_005296	GCCC	2	8	40854	40861	0 %	0 %	25 %	75 %	39933114
94	NC_005296	CAGC	2	8	41437	41444	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
95	NC_005296	GCCG	2	8	41503	41510	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
96	NC_005296	GCGA	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
97	NC_005296	GCGA	2	8	42529	42536	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
98	NC_005296	ACCG	2	8	42878	42885	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
99	NC_005296	CGGC	2	8	42892	42899	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
100	NC_005296	CCGC	2	8	44213	44220	0 %	0 %	25 %	75 %	39933117
101	NC_005296	CGAT	2	8	44327	44334	25 %	25 %	25 %	25 %	39933117
102	NC_005296	CCAG	2	8	44427	44434	25 %	0 %	25 %	50 %	39933117
103	NC_005296	CTTC	2	8	44784	44791	0 %	50 %	0 %	50 %	39933117
104	NC_005296	GGCC	2	8	45656	45663	0 %	0 %	50 %	50 %	39933118
105	NC_005296	GCTG	2	8	47519	47526	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
106	NC_005296	GCTG	2	8	47928	47935	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
107	NC_005296	CCGA	2	8	47944	47951	25 %	0 %	25 %	50 %	39933121
108	NC_005296	CCGC	2	8	48237	48244	0 %	0 %	25 %	75 %	39933122
109	NC_005296	AGGC	2	8	48755	48762	25 %	0 %	50 %	25 %	39933122
110	NC_005296	CGGA	2	8	49431	49438	25 %	0 %	50 %	25 %	39933123
111	NC_005296	CAGC	2	8	49596	49603	25 %	0 %	25 %	50 %	39933123
112	NC_005296	CATC	2	8	49652	49659	25 %	25 %	0 %	50 %	39933123
113	NC_005296	CGCC	2	8	50496	50503	0 %	0 %	25 %	75 %	39933124
114	NC_005296	GTGG	2	8	50595	50602	0 %	25 %	75 %	0 %	39933124
115	NC_005296	GCCG	2	8	52021	52028	0 %	0 %	50 %	50 %	39933125
116	NC_005296	ACCG	2	8	52825	52832	25 %	0 %	25 %	50 %	39933126
117	NC_005296	CCGT	2	8	53048	53055	0 %	25 %	25 %	50 %	39933126
118	NC_005296	CCAG	2	8	53646	53653	25 %	0 %	25 %	50 %	39933127
119	NC_005296	CTCG	2	8	53977	53984	0 %	25 %	25 %	50 %	39933127
120	NC_005296	AGCC	2	8	56439	56446	25 %	0 %	25 %	50 %	39933130
121	NC_005296	GCCG	2	8	56668	56675	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
122	NC_005296	CGTC	2	8	57016	57023	0 %	25 %	25 %	50 %	39933130
123	NC_005296	CTGG	2	8	57040	57047	0 %	25 %	50 %	25 %	39933130
124	NC_005296	CTGC	2	8	57154	57161	0 %	25 %	25 %	50 %	39933130
125	NC_005296	CTGG	2	8	57172	57179	0 %	25 %	50 %	25 %	39933130
126	NC_005296	CGAT	2	8	58880	58887	25 %	25 %	25 %	25 %	39933132
127	NC_005296	CGCC	2	8	58983	58990	0 %	0 %	25 %	75 %	39933132
128	NC_005296	TCGA	2	8	60069	60076	25 %	25 %	25 %	25 %	39933134
129	NC_005296	CGGC	2	8	61456	61463	0 %	0 %	50 %	50 %	39933135
130	NC_005296	ACGA	2	8	62282	62289	50 %	0 %	25 %	25 %	39933136
131	NC_005296	CCAG	2	8	62875	62882	25 %	0 %	25 %	50 %	39933137
132	NC_005296	CGGC	2	8	63314	63321	0 %	0 %	50 %	50 %	39933137
133	NC_005296	TCGG	2	8	63744	63751	0 %	25 %	50 %	25 %	39933138
134	NC_005296	GCTG	2	8	65224	65231	0 %	25 %	50 %	25 %	39933139
135	NC_005296	GCCG	2	8	65378	65385	0 %	0 %	50 %	50 %	39933139
136	NC_005296	GCTG	2	8	65431	65438	0 %	25 %	50 %	25 %	39933139
137	NC_005296	CGCC	2	8	66081	66088	0 %	0 %	25 %	75 %	39933139
138	NC_005296	AGGG	2	8	66166	66173	25 %	0 %	75 %	0 %	39933139
139	NC_005296	CCGG	2	8	66195	66202	0 %	0 %	50 %	50 %	39933139
140	NC_005296	GATC	2	8	66280	66287	25 %	25 %	25 %	25 %	39933139
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142	NC_005296	GCCG	2	8	67926	67933	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
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