MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 92951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	ACG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
2	NC_005296	ACT	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933081
3	NC_005296	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
4	NC_005296	CGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
5	NC_005296	GCA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
6	NC_005296	CGG	2	6	1053	1058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
7	NC_005296	CGC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
8	NC_005296	CGC	3	9	1125	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
9	NC_005296	GCC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
10	NC_005296	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
11	NC_005296	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
12	NC_005296	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
13	NC_005296	TCG	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
14	NC_005296	CGA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
15	NC_005296	ACC	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933081
16	NC_005296	GTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
17	NC_005296	CGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
18	NC_005296	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
19	NC_005296	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
20	NC_005296	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
21	NC_005296	CTG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
22	NC_005296	CTG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
23	NC_005296	TCG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
24	NC_005296	GCC	2	6	1970	1975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
25	NC_005296	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
26	NC_005296	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
27	NC_005296	CGC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
28	NC_005296	CTA	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933082
29	NC_005296	CCG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
30	NC_005296	GCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933082
31	NC_005296	CGT	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
32	NC_005296	AAC	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933082
33	NC_005296	CTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
34	NC_005296	AAG	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
35	NC_005296	CGA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
36	NC_005296	CCG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
37	NC_005296	GAA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
38	NC_005296	CGT	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
39	NC_005296	CCG	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
40	NC_005296	CCG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
41	NC_005296	GGT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
42	NC_005296	GCG	2	6	3858	3863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
43	NC_005296	GCC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
44	NC_005296	GCG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
45	NC_005296	ACC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933083
46	NC_005296	ACG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
47	NC_005296	CGG	3	9	4031	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
48	NC_005296	CTG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
49	NC_005296	CGC	2	6	4323	4328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
50	NC_005296	CGC	3	9	4476	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
51	NC_005296	GCT	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
52	NC_005296	TCG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
53	NC_005296	CGC	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
54	NC_005296	TGC	3	9	4649	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
55	NC_005296	CGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
56	NC_005296	GTG	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
57	NC_005296	GTT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933083
58	NC_005296	CGA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
59	NC_005296	CAC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
60	NC_005296	GTC	2	6	5221	5226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
61	NC_005296	CGA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
62	NC_005296	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
63	NC_005296	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
64	NC_005296	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
65	NC_005296	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
66	NC_005296	GGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
67	NC_005296	GGT	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
68	NC_005296	TGC	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
69	NC_005296	CAC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
70	NC_005296	GTC	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
71	NC_005296	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
72	NC_005296	CAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
73	NC_005296	GGT	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
74	NC_005296	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
75	NC_005296	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
76	NC_005296	CGG	2	6	5931	5936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
77	NC_005296	AAG	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933084
78	NC_005296	CGA	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
79	NC_005296	CCG	2	6	6053	6058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
80	NC_005296	TCG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
81	NC_005296	GGT	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
82	NC_005296	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
83	NC_005296	GCC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
84	NC_005296	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
85	NC_005296	GGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
86	NC_005296	ATC	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
87	NC_005296	TGA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933084
88	NC_005296	GCT	3	9	6618	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
89	NC_005296	TTC	3	9	6631	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933084
90	NC_005296	GGC	2	6	6664	6669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
91	NC_005296	GCC	2	6	6687	6692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
92	NC_005296	CGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
93	NC_005296	GCG	2	6	6815	6820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
94	NC_005296	CTG	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
95	NC_005296	GCG	2	6	6916	6921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
96	NC_005296	CAC	2	6	6948	6953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
97	NC_005296	GCC	3	9	6976	6984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
98	NC_005296	GCG	2	6	7085	7090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
99	NC_005296	AGG	2	6	7094	7099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933084
100	NC_005296	CGA	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
101	NC_005296	TCC	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933084
102	NC_005296	TGC	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
103	NC_005296	GAC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
104	NC_005296	GCT	2	6	7362	7367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
105	NC_005296	CGA	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
106	NC_005296	CGT	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
107	NC_005296	CGC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933085
108	NC_005296	CGC	2	6	7699	7704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933085
109	NC_005296	TCT	2	6	7716	7721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933085
110	NC_005296	CGT	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933085
111	NC_005296	GAA	2	6	7793	7798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933085
112	NC_005296	CCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933085
113	NC_005296	CGA	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933085
114	NC_005296	CGG	2	6	7961	7966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933085
115	NC_005296	CGG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933085
116	NC_005296	GAA	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933085
117	NC_005296	CGG	2	6	8302	8307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933085
118	NC_005296	CGA	2	6	8377	8382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933085
119	NC_005296	CAG	2	6	8387	8392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933085
120	NC_005296	GCC	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933085
121	NC_005296	GCT	2	6	8575	8580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933085
122	NC_005296	ATG	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933086
123	NC_005296	ACA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933086
124	NC_005296	TCA	2	6	9062	9067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933086
125	NC_005296	CGA	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933086
126	NC_005296	TGC	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933086
127	NC_005296	AAC	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933086
128	NC_005296	TCG	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933086
129	NC_005296	GCT	2	6	9378	9383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933086
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131	NC_005296	CGG	2	6	9477	9482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933087
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258	NC_005296	GCG	2	6	16280	16285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933093
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