MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 14425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	CG	3	6	350	355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005296	TC	3	6	530	535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005296	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
4	NC_005296	CG	3	6	1598	1603	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
5	NC_005296	CG	3	6	2350	2355	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
6	NC_005296	GC	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
7	NC_005296	GC	3	6	3416	3421	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
8	NC_005296	GC	3	6	3932	3937	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
9	NC_005296	GC	3	6	4552	4557	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
10	NC_005296	GC	3	6	4727	4732	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
11	NC_005296	CG	3	6	4823	4828	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
12	NC_005296	GT	3	6	5354	5359	0 %	50 %	50 %	0 %	39933084
13	NC_005296	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
14	NC_005296	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
15	NC_005296	GC	5	10	6456	6465	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
16	NC_005296	CA	3	6	6605	6610	50 %	0 %	0 %	50 %	39933084
17	NC_005296	CG	3	6	6742	6747	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
18	NC_005296	GC	4	8	6850	6857	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
19	NC_005296	CG	3	6	6990	6995	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
20	NC_005296	CG	3	6	7353	7358	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
21	NC_005296	GC	4	8	8149	8156	0 %	0 %	50 %	50 %	39933085
22	NC_005296	CG	3	6	8477	8482	0 %	0 %	50 %	50 %	39933085
23	NC_005296	GC	3	6	8527	8532	0 %	0 %	50 %	50 %	39933085
24	NC_005296	GC	3	6	8954	8959	0 %	0 %	50 %	50 %	39933086
25	NC_005296	CG	4	8	10363	10370	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
26	NC_005296	GC	3	6	10641	10646	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
27	NC_005296	GC	3	6	11255	11260	0 %	0 %	50 %	50 %	39933089
28	NC_005296	GC	3	6	11442	11447	0 %	0 %	50 %	50 %	39933089
29	NC_005296	GC	3	6	11459	11464	0 %	0 %	50 %	50 %	39933089
30	NC_005296	GC	3	6	12430	12435	0 %	0 %	50 %	50 %	39933089
31	NC_005296	GC	3	6	12720	12725	0 %	0 %	50 %	50 %	39933089
32	NC_005296	GC	3	6	13393	13398	0 %	0 %	50 %	50 %	39933090
33	NC_005296	AT	3	6	13820	13825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005296	GC	3	6	14725	14730	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
35	NC_005296	GC	3	6	15107	15112	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
36	NC_005296	GC	3	6	15702	15707	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
37	NC_005296	GC	3	6	16115	16120	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
38	NC_005296	CG	3	6	16210	16215	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
39	NC_005296	GC	3	6	16395	16400	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
40	NC_005296	GA	3	6	16866	16871	50 %	0 %	50 %	0 %	39933093
41	NC_005296	CG	3	6	17232	17237	0 %	0 %	50 %	50 %	39933094
42	NC_005296	GC	3	6	18439	18444	0 %	0 %	50 %	50 %	39933095
43	NC_005296	GC	3	6	18713	18718	0 %	0 %	50 %	50 %	39933095
44	NC_005296	CG	3	6	18882	18887	0 %	0 %	50 %	50 %	39933095
45	NC_005296	GC	3	6	18955	18960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005296	AC	3	6	18986	18991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005296	GC	3	6	19000	19005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005296	GC	3	6	19406	19411	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
49	NC_005296	GC	3	6	19677	19682	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
50	NC_005296	AG	3	6	20545	20550	50 %	0 %	50 %	0 %	39933098
51	NC_005296	GC	3	6	20918	20923	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
52	NC_005296	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
53	NC_005296	CG	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005296	CG	3	6	23586	23591	0 %	0 %	50 %	50 %	39933100
55	NC_005296	CG	3	6	24009	24014	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
56	NC_005296	CG	3	6	24031	24036	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
57	NC_005296	GC	3	6	24941	24946	0 %	0 %	50 %	50 %	39933102
58	NC_005296	CA	3	6	24983	24988	50 %	0 %	0 %	50 %	39933102
59	NC_005296	GC	3	6	25583	25588	0 %	0 %	50 %	50 %	39933103
60	NC_005296	GC	3	6	25858	25863	0 %	0 %	50 %	50 %	39933103
61	NC_005296	CG	3	6	26079	26084	0 %	0 %	50 %	50 %	39933103
62	NC_005296	CA	3	6	26178	26183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005296	CG	3	6	26466	26471	0 %	0 %	50 %	50 %	39933104
64	NC_005296	GA	3	6	26575	26580	50 %	0 %	50 %	0 %	39933104
65	NC_005296	CG	3	6	27508	27513	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
66	NC_005296	CG	3	6	27966	27971	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
67	NC_005296	GC	3	6	28001	28006	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
68	NC_005296	GC	3	6	28118	28123	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
69	NC_005296	CG	3	6	28356	28361	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
70	NC_005296	GC	3	6	28853	28858	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
71	NC_005296	CG	3	6	29007	29012	0 %	0 %	50 %	50 %	39933105
72	NC_005296	GC	4	8	31324	31331	0 %	0 %	50 %	50 %	39933107
73	NC_005296	GC	3	6	32479	32484	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
74	NC_005296	GC	3	6	32495	32500	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
75	NC_005296	GC	4	8	32602	32609	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
76	NC_005296	GC	3	6	32850	32855	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
77	NC_005296	CG	3	6	32955	32960	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
78	NC_005296	GC	3	6	33030	33035	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
79	NC_005296	GT	3	6	33313	33318	0 %	50 %	50 %	0 %	39933108
80	NC_005296	GC	3	6	33620	33625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005296	CG	3	6	33677	33682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005296	GC	3	6	34282	34287	0 %	0 %	50 %	50 %	39933109
83	NC_005296	GC	4	8	35448	35455	0 %	0 %	50 %	50 %	39933109
84	NC_005296	CG	3	6	35466	35471	0 %	0 %	50 %	50 %	39933109
85	NC_005296	GC	3	6	35654	35659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005296	CA	3	6	35746	35751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_005296	CG	3	6	36310	36315	0 %	0 %	50 %	50 %	39933110
88	NC_005296	CG	3	6	36743	36748	0 %	0 %	50 %	50 %	39933110
89	NC_005296	GC	3	6	36898	36903	0 %	0 %	50 %	50 %	39933110
90	NC_005296	GC	3	6	37001	37006	0 %	0 %	50 %	50 %	39933110
91	NC_005296	CG	3	6	37216	37221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005296	CG	3	6	37299	37304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_005296	GC	3	6	37399	37404	0 %	0 %	50 %	50 %	39933111
94	NC_005296	GC	4	8	37454	37461	0 %	0 %	50 %	50 %	39933111
95	NC_005296	GC	3	6	37823	37828	0 %	0 %	50 %	50 %	39933112
96	NC_005296	AC	3	6	38757	38762	50 %	0 %	0 %	50 %	39933113
97	NC_005296	CG	3	6	39540	39545	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
98	NC_005296	CG	3	6	39592	39597	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
99	NC_005296	GC	4	8	39705	39712	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
100	NC_005296	GC	3	6	39752	39757	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
101	NC_005296	CG	3	6	39828	39833	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
102	NC_005296	GC	4	8	40000	40007	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
103	NC_005296	GC	4	8	40190	40197	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
104	NC_005296	CG	3	6	40353	40358	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
105	NC_005296	GC	3	6	40741	40746	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
106	NC_005296	CG	3	6	40996	41001	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
107	NC_005296	CG	3	6	41167	41172	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
108	NC_005296	CG	3	6	41797	41802	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
109	NC_005296	GC	4	8	41809	41816	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
110	NC_005296	GC	3	6	42242	42247	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
111	NC_005296	CG	4	8	42778	42785	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
112	NC_005296	AT	3	6	43017	43022	50 %	50 %	0 %	0 %	39933115
113	NC_005296	GC	4	8	43056	43063	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
114	NC_005296	GC	3	6	43069	43074	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
115	NC_005296	AG	3	6	43298	43303	50 %	0 %	50 %	0 %	39933115
116	NC_005296	GA	3	6	43343	43348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005296	GC	3	6	43512	43517	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
118	NC_005296	GC	3	6	43521	43526	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
119	NC_005296	GC	3	6	43676	43681	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
120	NC_005296	CG	3	6	43879	43884	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
121	NC_005296	GC	3	6	44167	44172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005296	GC	4	8	44187	44194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005296	GC	3	6	45608	45613	0 %	0 %	50 %	50 %	39933118
124	NC_005296	CG	3	6	45923	45928	0 %	0 %	50 %	50 %	39933119
125	NC_005296	CG	3	6	46087	46092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005296	GC	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	39933120
127	NC_005296	CG	3	6	47058	47063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_005296	CG	3	6	47093	47098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_005296	GC	3	6	47437	47442	0 %	0 %	50 %	50 %	39933121
130	NC_005296	AG	3	6	47529	47534	50 %	0 %	50 %	0 %	39933121
131	NC_005296	AG	3	6	48125	48130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005296	CG	4	8	48543	48550	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
133	NC_005296	GC	4	8	48640	48647	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
134	NC_005296	GC	3	6	48982	48987	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
135	NC_005296	GC	3	6	49079	49084	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
136	NC_005296	CG	3	6	49222	49227	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
137	NC_005296	CG	3	6	49459	49464	0 %	0 %	50 %	50 %	39933123
138	NC_005296	GC	3	6	49590	49595	0 %	0 %	50 %	50 %	39933123
139	NC_005296	GC	3	6	50720	50725	0 %	0 %	50 %	50 %	39933124
140	NC_005296	TC	3	6	51072	51077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005296	GC	3	6	51128	51133	0 %	0 %	50 %	50 %	39933125
142	NC_005296	GC	3	6	51811	51816	0 %	0 %	50 %	50 %	39933125
143	NC_005296	GC	3	6	52006	52011	0 %	0 %	50 %	50 %	39933125
144	NC_005296	CG	3	6	52415	52420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_005296	GC	3	6	53381	53386	0 %	0 %	50 %	50 %	39933127
146	NC_005296	GC	3	6	53677	53682	0 %	0 %	50 %	50 %	39933127
147	NC_005296	CG	3	6	53724	53729	0 %	0 %	50 %	50 %	39933127
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