MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	G	12	12	48193	48204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005296	G	6	6	92009	92014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005296	C	6	6	119622	119627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_005296	T	6	6	131492	131497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005296	A	6	6	177853	177858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005296	C	6	6	180660	180665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_005296	T	6	6	194080	194085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005296	A	6	6	199421	199426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005296	C	6	6	224418	224423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_005296	T	6	6	224491	224496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005296	T	6	6	237837	237842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005296	A	6	6	247894	247899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005296	A	6	6	266677	266682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005296	A	6	6	295199	295204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005296	G	6	6	300095	300100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005296	G	6	6	300629	300634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005296	G	6	6	313674	313679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005296	C	6	6	332524	332529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_005296	C	6	6	335694	335699	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_005296	G	6	6	357435	357440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005296	C	7	7	360631	360637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_005296	G	6	6	368969	368974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005296	C	6	6	377471	377476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_005296	C	6	6	410430	410435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_005296	T	6	6	427429	427434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005296	A	6	6	449925	449930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005296	T	6	6	450179	450184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005296	A	6	6	465981	465986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005296	A	6	6	486374	486379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005296	T	6	6	486450	486455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005296	A	6	6	495960	495965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005296	A	6	6	592226	592231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005296	T	6	6	613247	613252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005296	G	6	6	630741	630746	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005296	T	6	6	642305	642310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005296	T	6	6	665297	665302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005296	A	6	6	676384	676389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005296	A	6	6	707712	707717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005296	G	6	6	755048	755053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005296	G	6	6	780628	780633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005296	T	6	6	804535	804540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005296	T	6	6	826035	826040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005296	G	6	6	826617	826622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005296	T	6	6	845542	845547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005296	C	6	6	868987	868992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_005296	C	6	6	913075	913080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_005296	G	6	6	915600	915605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005296	C	7	7	953572	953578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_005296	T	6	6	954621	954626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005296	A	6	6	966318	966323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005296	T	8	8	966606	966613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005296	A	6	6	967174	967179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005296	A	6	6	1001551	1001556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005296	G	6	6	1003462	1003467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005296	T	6	6	1007257	1007262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005296	T	6	6	1007404	1007409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005296	T	7	7	1007614	1007620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005296	T	6	6	1019396	1019401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005296	T	6	6	1036607	1036612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005296	G	6	6	1041669	1041674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005296	A	6	6	1139056	1139061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005296	G	6	6	1142811	1142816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005296	G	7	7	1166805	1166811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005296	T	6	6	1217411	1217416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005296	T	6	6	1231565	1231570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005296	T	6	6	1232780	1232785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005296	C	6	6	1238987	1238992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_005296	T	6	6	1239219	1239224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005296	A	6	6	1242569	1242574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005296	T	6	6	1283977	1283982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005296	T	6	6	1305156	1305161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005296	A	6	6	1308412	1308417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005296	G	6	6	1340569	1340574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005296	C	7	7	1361305	1361311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_005296	G	7	7	1411603	1411609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005296	G	17	17	1429040	1429056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005296	C	6	6	1429376	1429381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_005296	C	6	6	1439120	1439125	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_005296	G	6	6	1471858	1471863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005296	G	6	6	1494186	1494191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005296	G	6	6	1561395	1561400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005296	A	6	6	1565310	1565315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005296	G	6	6	1586472	1586477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005296	A	6	6	1638124	1638129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005296	A	7	7	1658488	1658494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005296	C	6	6	1671021	1671026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_005296	G	6	6	1675885	1675890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005296	T	6	6	1679136	1679141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005296	G	6	6	1726703	1726708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005296	C	6	6	1726748	1726753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_005296	T	6	6	1756019	1756024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005296	T	6	6	1773451	1773456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005296	G	6	6	1774691	1774696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005296	C	6	6	1779770	1779775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_005296	G	6	6	1785950	1785955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005296	G	6	6	1793573	1793578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005296	G	7	7	1816483	1816489	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005296	G	6	6	1818180	1818185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005296	C	6	6	1824739	1824744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_005296	G	6	6	1839066	1839071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005296	C	6	6	1843241	1843246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_005296	T	6	6	1971489	1971494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005296	G	7	7	1975023	1975029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005296	C	6	6	1981164	1981169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_005296	G	6	6	1991066	1991071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_005296	C	6	6	2048269	2048274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_005296	T	6	6	2048460	2048465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005296	G	6	6	2049331	2049336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005296	G	7	7	2051725	2051731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005296	A	7	7	2059873	2059879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005296	G	6	6	2082229	2082234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005296	A	7	7	2084605	2084611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005296	G	6	6	2106982	2106987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005296	T	7	7	2134827	2134833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_005296	T	6	6	2173606	2173611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005296	T	6	6	2181367	2181372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005296	T	7	7	2224427	2224433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005296	T	6	6	2225625	2225630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_005296	A	6	6	2309089	2309094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005296	G	6	6	2404251	2404256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_005296	A	6	6	2466283	2466288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005296	G	7	7	2473099	2473105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005296	A	6	6	2477358	2477363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005296	T	6	6	2482004	2482009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005296	C	6	6	2495866	2495871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_005296	T	6	6	2541219	2541224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005296	T	6	6	2560451	2560456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005296	A	6	6	2560487	2560492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005296	G	7	7	2560556	2560562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_005296	A	6	6	2592083	2592088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_005296	G	6	6	2817308	2817313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_005296	T	6	6	2862682	2862687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005296	A	7	7	2864280	2864286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.