MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	G	6	6	35506	35511	0 %	0 %	100 %	0 %	39933109
2	NC_005296	G	6	6	39653	39658	0 %	0 %	100 %	0 %	39933114
3	NC_005296	G	6	6	46913	46918	0 %	0 %	100 %	0 %	39933120
4	NC_005296	G	6	6	60333	60338	0 %	0 %	100 %	0 %	39933134
5	NC_005296	C	7	7	60709	60715	0 %	0 %	0 %	100 %	39933135
6	NC_005296	C	6	6	92741	92746	0 %	0 %	0 %	100 %	229220836
7	NC_005296	C	6	6	113110	113115	0 %	0 %	0 %	100 %	39933179
8	NC_005296	C	6	6	165328	165333	0 %	0 %	0 %	100 %	39933222
9	NC_005296	C	7	7	167796	167802	0 %	0 %	0 %	100 %	39933226
10	NC_005296	T	6	6	175990	175995	0 %	100 %	0 %	0 %	39933234
11	NC_005296	G	7	7	186306	186312	0 %	0 %	100 %	0 %	39933244
12	NC_005296	A	7	7	203506	203512	100 %	0 %	0 %	0 %	39933259
13	NC_005296	C	6	6	206915	206920	0 %	0 %	0 %	100 %	39933263
14	NC_005296	C	6	6	233780	233785	0 %	0 %	0 %	100 %	39933287
15	NC_005296	T	6	6	267251	267256	0 %	100 %	0 %	0 %	39933319
16	NC_005296	T	6	6	267261	267266	0 %	100 %	0 %	0 %	39933319
17	NC_005296	T	6	6	286347	286352	0 %	100 %	0 %	0 %	39933337
18	NC_005296	G	6	6	337278	337283	0 %	0 %	100 %	0 %	39933383
19	NC_005296	G	6	6	338478	338483	0 %	0 %	100 %	0 %	39933385
20	NC_005296	T	6	6	340471	340476	0 %	100 %	0 %	0 %	39933388
21	NC_005296	A	9	9	352174	352182	100 %	0 %	0 %	0 %	39933401
22	NC_005296	C	6	6	383111	383116	0 %	0 %	0 %	100 %	39933430
23	NC_005296	G	6	6	383615	383620	0 %	0 %	100 %	0 %	39933430
24	NC_005296	C	6	6	398771	398776	0 %	0 %	0 %	100 %	39933445
25	NC_005296	G	6	6	416705	416710	0 %	0 %	100 %	0 %	39933458
26	NC_005296	A	6	6	419607	419612	100 %	0 %	0 %	0 %	39933460
27	NC_005296	C	6	6	422062	422067	0 %	0 %	0 %	100 %	39933463
28	NC_005296	G	7	7	436764	436770	0 %	0 %	100 %	0 %	39933474
29	NC_005296	C	6	6	439034	439039	0 %	0 %	0 %	100 %	39933476
30	NC_005296	G	6	6	493807	493812	0 %	0 %	100 %	0 %	39933524
31	NC_005296	T	6	6	504753	504758	0 %	100 %	0 %	0 %	39933535
32	NC_005296	A	6	6	537401	537406	100 %	0 %	0 %	0 %	39933563
33	NC_005296	G	7	7	569335	569341	0 %	0 %	100 %	0 %	39933589
34	NC_005296	G	6	6	581148	581153	0 %	0 %	100 %	0 %	39933597
35	NC_005296	T	6	6	590577	590582	0 %	100 %	0 %	0 %	39933607
36	NC_005296	G	6	6	592279	592284	0 %	0 %	100 %	0 %	39933609
37	NC_005296	G	6	6	596970	596975	0 %	0 %	100 %	0 %	39933612
38	NC_005296	T	6	6	631451	631456	0 %	100 %	0 %	0 %	39933645
39	NC_005296	C	6	6	693895	693900	0 %	0 %	0 %	100 %	39933703
40	NC_005296	A	7	7	706180	706186	100 %	0 %	0 %	0 %	39933715
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42	NC_005296	C	6	6	711320	711325	0 %	0 %	0 %	100 %	39933719
43	NC_005296	C	6	6	735125	735130	0 %	0 %	0 %	100 %	39933743
44	NC_005296	A	6	6	759943	759948	100 %	0 %	0 %	0 %	39933760
45	NC_005296	C	6	6	784668	784673	0 %	0 %	0 %	100 %	39933790
46	NC_005296	G	6	6	788144	788149	0 %	0 %	100 %	0 %	39933793
47	NC_005296	G	6	6	802501	802506	0 %	0 %	100 %	0 %	39933805
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49	NC_005296	C	6	6	825994	825999	0 %	0 %	0 %	100 %	39933823
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66	NC_005296	C	6	6	923231	923236	0 %	0 %	0 %	100 %	39933902
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101	NC_005296	G	6	6	1667561	1667566	0 %	0 %	100 %	0 %	39934574
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108	NC_005296	T	7	7	1773479	1773485	0 %	100 %	0 %	0 %	39934665
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136	NC_005296	T	6	6	2242961	2242966	0 %	100 %	0 %	0 %	39935060
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.