MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	ATAAAT	2	12	2698	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005295	ACCTAT	2	12	4440	4451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005295	ATCAAA	2	12	8462	8473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_005295	AATATA	2	12	13537	13548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005295	TGTTTT	2	12	39152	39163	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005295	ATAAAT	2	12	57871	57882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005295	ATTAAT	2	12	65522	65533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005295	AAGTGT	2	12	76703	76714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005295	TTAAAT	2	12	86467	86478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005295	TATAAA	2	12	89668	89679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005295	GTTTTG	2	12	95536	95547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005295	TTTATA	2	12	111216	111227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005295	TGTTTT	2	12	114265	114276	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005295	AATATA	2	12	115236	115247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005295	CAATAT	2	12	116912	116923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_005295	TATTAA	2	12	120451	120462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005295	TTAATG	2	12	131342	131353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005295	TTTATA	2	12	138681	138692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005295	TAGTAT	2	12	139736	139747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005295	TATAAA	2	12	157460	157471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005295	TTCTGA	2	12	162749	162760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005295	TAACAA	2	12	165916	165927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_005295	ATATTT	2	12	173217	173228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005295	ACTAAT	2	12	173369	173380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005295	ATTTTT	2	12	173604	173615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005295	ATTGTA	2	12	189421	189432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005295	TGGATA	2	12	218127	218138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005295	AATACT	2	12	231896	231907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005295	AATTAA	2	12	270155	270166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005295	ATAATT	2	12	277680	277691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005295	TATGAA	2	12	311598	311609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005295	AAATAT	2	12	312360	312371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005295	TATAAT	2	12	315457	315468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005295	TTAGTA	2	12	318655	318666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005295	ATTAGT	2	12	324950	324961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005295	TTGTAT	2	12	335431	335442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005295	GTTAAT	2	12	371593	371604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005295	AATTAA	2	12	385142	385153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005295	TAAGTA	2	12	402766	402777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005295	GTTGAA	2	12	403434	403445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005295	AGATGA	2	12	403553	403564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005295	TATAAT	2	12	434221	434232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005295	TATGTT	2	12	439414	439425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005295	ATTTTT	2	12	492226	492237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005295	TAGAAT	2	12	501371	501382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005295	CAAAAA	2	12	509025	509036	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005295	TTGTAT	2	12	511245	511256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005295	AATGTA	2	12	515856	515867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005295	ATTAGT	2	12	516155	516166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005295	TCATTT	2	12	520876	520887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005295	TTTATA	2	12	528385	528396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005295	ATGAAA	2	12	534201	534212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005295	TTATAT	2	12	534395	534406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005295	ATTAAA	2	12	539788	539799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005295	TTATAT	2	12	552676	552687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005295	TTATAA	2	12	568905	568916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005295	GTTTTT	2	12	570217	570228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005295	TGGTTT	2	12	571098	571109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005295	GTTTTA	2	12	571234	571245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005295	TGGTTT	2	12	571366	571377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005295	TGGTTT	2	12	571634	571645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005295	TGGTTT	2	12	571768	571779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005295	TGTATT	2	12	577742	577753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005295	ATATAA	2	12	578045	578056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005295	TTAACT	2	12	582600	582611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_005295	ATATTT	2	12	590788	590799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005295	TATATT	2	12	600725	600736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005295	AAATAA	2	12	607121	607132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005295	TTAATA	2	12	620803	620814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005295	ATTTTA	2	12	620831	620842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005295	ATTTTT	2	12	621758	621769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005295	TTTATT	2	12	624094	624105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005295	TATTAA	2	12	626351	626362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005295	ATATTG	2	12	626683	626694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005295	ATTGAT	2	12	626865	626876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005295	TTAATT	2	12	632375	632386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005295	ATTTTT	2	12	637046	637057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005295	TATATT	2	12	638079	638090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005295	AATAAA	2	12	639368	639379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005295	TTGTAT	2	12	647046	647057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005295	TTATGT	2	12	649918	649929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005295	TATTTT	2	12	650149	650160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005295	AGTATA	2	12	679538	679549	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005295	AATATA	2	12	680123	680134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005295	TTGTAG	2	12	682654	682665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005295	ATTATC	2	12	685649	685660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005295	ATTTTT	2	12	710501	710512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005295	TCTATA	2	12	711737	711748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_005295	TATTTT	2	12	713084	713095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005295	CATTAT	2	12	718831	718842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_005295	AATACA	2	12	728255	728266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_005295	AAAATA	2	12	735170	735181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005295	TTAAAA	2	12	745562	745573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005295	AAAACA	3	18	745887	745904	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005295	AAATTA	2	12	751998	752009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005295	TAATAT	2	12	753813	753824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005295	AGTATT	2	12	767596	767607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005295	AAGTAT	2	12	774307	774318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005295	GTTATT	2	12	781275	781286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005295	TAAAAA	2	12	782039	782050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005295	TAATAT	2	12	796135	796146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005295	TAAAAT	2	12	799811	799822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005295	TATTTA	2	12	830406	830417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005295	ATATTT	2	12	839096	839107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005295	AATAGA	2	12	841647	841658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005295	ATAATT	2	12	849541	849552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005295	ATATAA	2	12	854258	854269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005295	TTAAAA	2	12	873578	873589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005295	ATAAAT	2	12	875767	875778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005295	TAAATA	2	12	880253	880264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005295	TAAAAA	2	12	880640	880651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005295	AAAATA	2	12	901034	901045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005295	TAACAA	2	12	901131	901142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_005295	TTAACA	2	12	906119	906130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_005295	TAGCTA	2	12	916190	916201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_005295	TAGACT	2	12	918872	918883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_005295	AAAAAT	2	12	925949	925960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005295	ATACAA	2	12	928315	928326	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_005295	AAAACC	2	12	932047	932058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005295	TATAAA	2	12	933302	933313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005295	ATGCTT	2	12	937470	937481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_005295	ATACTA	2	12	940711	940722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_005295	AAAAAT	2	12	953610	953621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005295	CAATTT	2	12	961661	961672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_005295	AATATA	2	12	972355	972366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005295	AAATAT	2	12	975191	975202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005295	TAAATT	2	12	987728	987739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005295	ATACAT	2	12	1006447	1006458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_005295	TTATAA	2	12	1006678	1006689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005295	AAATAA	2	12	1006962	1006973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005295	CAAAAT	2	12	1031355	1031366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_005295	CAATAA	2	12	1034632	1034643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_005295	CATATA	2	12	1037656	1037667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_005295	AATACT	2	12	1047113	1047124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_005295	AATATT	2	12	1047208	1047219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005295	TATCAA	2	12	1047446	1047457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_005295	CATATA	2	12	1072672	1072683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_005295	TAAATT	2	12	1085323	1085334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005295	TTAATA	2	12	1085418	1085429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_005295	TAACAA	2	12	1138688	1138699	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_005295	AATTAA	2	12	1232436	1232447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005295	ATATAA	2	12	1235555	1235566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.