MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	ATATC	2	10	2183	2192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_005295	CTATA	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005295	AACAT	2	10	8179	8188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_005295	TAATT	2	10	8362	8371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005295	GTAAT	2	10	8550	8559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005295	TACAT	2	10	11437	11446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_005295	ACTAA	2	10	12982	12991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_005295	TTTTA	2	10	13276	13285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005295	TCTAT	2	10	14400	14409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005295	TAATT	2	10	24882	24891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005295	TAAAA	2	10	24979	24988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005295	TTGAT	2	10	25054	25063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005295	TTTAT	2	10	26552	26561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005295	CTTAT	2	10	28491	28500	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_005295	TATAA	2	10	31034	31043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005295	TTAAT	2	10	38926	38935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005295	TTTAA	2	10	41624	41633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005295	AATCA	2	10	43722	43731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005295	TAAAT	2	10	44357	44366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005295	TAGTT	2	10	46111	46120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005295	GATAC	2	10	46209	46218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_005295	ATCAA	2	10	47492	47501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_005295	TTTAT	2	10	52833	52842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005295	TATGA	2	10	53750	53759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005295	TAATA	2	10	57736	57745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005295	TGTAA	2	10	58011	58020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005295	TGTAA	2	10	58265	58274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005295	TGTAA	2	10	58520	58529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005295	ATTTT	2	10	58745	58754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005295	ATGGT	2	10	59844	59853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005295	ATTTC	2	10	60985	60994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005295	TAACG	2	10	65386	65395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_005295	TTGTT	2	10	67631	67640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005295	TTTAT	2	10	68096	68105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005295	ATGTA	2	10	71928	71937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005295	TGTAT	2	10	72354	72363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005295	AAAAG	2	10	74865	74874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005295	TTATA	2	10	79247	79256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005295	GTATG	2	10	80727	80736	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005295	AAGAT	2	10	81176	81185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005295	ATATT	2	10	81859	81868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005295	AATTT	2	10	83767	83776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005295	AAGTG	2	10	84039	84048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005295	TTAAT	2	10	86250	86259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005295	GTAAT	2	10	94803	94812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005295	GTTTT	2	10	95365	95374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005295	TATGT	2	10	95706	95715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005295	ATATA	2	10	95872	95881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005295	AAAAT	2	10	108917	108926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005295	AATCA	2	10	110543	110552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_005295	TTATA	2	10	111278	111287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005295	TGTAA	2	10	111979	111988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005295	TAATG	2	10	114512	114521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005295	TAATT	2	10	114781	114790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005295	AGATT	2	10	114890	114899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005295	GGAAA	2	10	115387	115396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005295	TTATT	2	10	118201	118210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005295	AGACT	2	10	120463	120472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_005295	GTTAT	2	10	123514	123523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005295	AATAA	2	10	124093	124102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005295	AGTTA	2	10	124244	124253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005295	TGCTA	2	10	130285	130294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_005295	ATTAT	2	10	131361	131370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005295	TATAT	2	10	131402	131411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005295	CATAT	2	10	134674	134683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_005295	TGTTA	2	10	134712	134721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005295	CATAT	2	10	134812	134821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_005295	CATAT	2	10	134949	134958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_005295	TGTTA	2	10	134987	134996	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005295	TATAT	2	10	139257	139266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005295	TTATA	2	10	144774	144783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005295	TGTAT	2	10	149386	149395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005295	AAATA	2	10	151271	151280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005295	TTATG	2	10	155842	155851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005295	AATGT	2	10	156132	156141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005295	TATTT	2	10	156885	156894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005295	AATTT	2	10	157071	157080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005295	TTAAT	2	10	159041	159050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005295	AGATT	2	10	160915	160924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005295	AGATA	2	10	161277	161286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005295	AGATA	2	10	161433	161442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005295	AATAT	2	10	164880	164889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005295	TGTTT	2	10	165155	165164	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005295	TTGAT	2	10	166212	166221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005295	TATTT	2	10	169881	169890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005295	TGTAA	2	10	170067	170076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005295	GTAAT	2	10	170414	170423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005295	TTAAT	2	10	170824	170833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005295	TAGTC	2	10	172680	172689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_005295	TTCAT	2	10	177690	177699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_005295	GAATA	2	10	179094	179103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005295	GAATA	2	10	179556	179565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005295	GAATA	2	10	179710	179719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005295	TATTT	2	10	181205	181214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005295	GTAGT	2	10	186012	186021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005295	ATTGT	2	10	187902	187911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005295	TGATA	2	10	190575	190584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005295	GGTTA	2	10	190731	190740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005295	GTAAA	2	10	194175	194184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005295	GTATA	2	10	194249	194258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005295	TTATT	2	10	194618	194627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005295	TTTCT	2	10	195232	195241	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_005295	TTATT	2	10	202039	202048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005295	TGAAT	2	10	202127	202136	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005295	ATATA	2	10	204769	204778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005295	TATAT	2	10	204839	204848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005295	TTAGT	2	10	208911	208920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005295	TAATT	2	10	209185	209194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005295	GTATT	2	10	209253	209262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005295	TATAT	2	10	209325	209334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005295	TATAA	2	10	214988	214997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005295	GTTGT	2	10	217787	217796	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005295	TTTAA	2	10	217979	217988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005295	TTAAA	2	10	218600	218609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005295	TGAGT	2	10	219486	219495	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005295	AATTA	2	10	219677	219686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005295	AAGTT	2	10	222198	222207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005295	TAATA	2	10	223484	223493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005295	GTTAT	2	10	225283	225292	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005295	CTATT	2	10	225328	225337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_005295	TAATA	2	10	231778	231787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005295	AGTTG	2	10	233352	233361	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005295	ATTAA	2	10	233774	233783	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005295	ATATT	3	15	235911	235925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005295	TGTGT	2	10	236406	236415	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005295	TTTTA	2	10	236759	236768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005295	AATTA	2	10	237208	237217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005295	ATTAT	2	10	237507	237516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005295	ATTAA	2	10	237769	237778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005295	TAATG	2	10	241305	241314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005295	AAGTT	2	10	241340	241349	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005295	AATTA	2	10	243043	243052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005295	ACTTA	2	10	243472	243481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_005295	TATAA	2	10	244253	244262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005295	AGAAC	2	10	246142	246151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005295	GATTA	2	10	249246	249255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005295	ATTAT	2	10	254028	254037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005295	TTAAT	2	10	254946	254955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005295	TTATT	2	10	260142	260151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005295	AATTA	2	10	260592	260601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005295	AAATT	2	10	261601	261610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005295	TTAGT	2	10	261645	261654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005295	ATAAG	2	10	262123	262132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005295	CTATT	2	10	265852	265861	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005295	TAATT	2	10	267416	267425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005295	TTACT	2	10	267522	267531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_005295	TATAT	2	10	267538	267547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005295	ATATA	2	10	270007	270016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005295	TGTAT	2	10	272253	272262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005295	TGTAT	2	10	272550	272559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005295	GTATT	2	10	275286	275295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005295	GTTAA	2	10	275397	275406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005295	GTTTA	2	10	277866	277875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005295	GGTGT	2	10	277927	277936	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_005295	ATATT	2	10	296127	296136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_005295	ATATT	2	10	296379	296388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_005295	CTTAT	2	10	297977	297986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_005295	ATATT	2	10	299172	299181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_005295	TAAAT	2	10	301464	301473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_005295	ATGTA	2	10	308392	308401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_005295	TAGAT	2	10	311350	311359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_005295	TATGA	2	10	311398	311407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_005295	TTGTA	2	10	312392	312401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_005295	AAAAT	2	10	314933	314942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_005295	TTTAT	2	10	315143	315152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005295	TTTAG	2	10	315301	315310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_005295	TGTTA	2	10	318034	318043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_005295	ATTGT	2	10	318493	318502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_005295	TCTGT	2	10	319637	319646	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_005295	CTAGA	2	10	327547	327556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_005295	TCGTG	2	10	327970	327979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_005295	ATGTA	2	10	337928	337937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_005295	TGTAT	2	10	341061	341070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_005295	TATAG	2	10	458607	458616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_005295	ATGTA	2	10	473068	473077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_005295	TATTT	2	10	495229	495238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_005295	ATATT	2	10	497654	497663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_005295	TTATT	2	10	500034	500043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_005295	TTTGT	2	10	500132	500141	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_005295	TTGTT	2	10	500146	500155	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_005295	GTCTC	2	10	505386	505395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_005295	TATTG	2	10	517281	517290	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_005295	AAAAT	2	10	517554	517563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_005295	AGTTA	2	10	518440	518449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_005295	TACTT	2	10	518530	518539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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