MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 5079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	ATTA	3	12	42	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005295	ATGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
3	NC_005295	AATG	2	8	1031	1038	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
4	NC_005295	ATTA	2	8	1088	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
5	NC_005295	TTTA	2	8	1394	1401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005295	TAAC	2	8	1483	1490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005295	TTAT	2	8	1737	1744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005295	TAAT	2	8	2017	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005295	TAAA	2	8	2278	2285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005295	ATCT	2	8	2404	2411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005295	AATT	2	8	2615	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005295	CAAT	2	8	2856	2863	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
13	NC_005295	AAAT	2	8	3062	3069	75 %	25 %	0 %	0 %	57238733
14	NC_005295	ATTT	2	8	3131	3138	25 %	75 %	0 %	0 %	57238733
15	NC_005295	TAAC	2	8	3301	3308	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
16	NC_005295	CCAT	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	57238733
17	NC_005295	TAAT	2	8	3423	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005295	ATAA	2	8	3632	3639	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
19	NC_005295	AAAT	2	8	3666	3673	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
20	NC_005295	TACA	2	8	3927	3934	50 %	25 %	0 %	25 %	57238734
21	NC_005295	AAAG	2	8	4581	4588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005295	AAAG	2	8	4784	4791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005295	TAAA	2	8	5927	5934	75 %	25 %	0 %	0 %	57238735
24	NC_005295	CAAG	2	8	6162	6169	50 %	0 %	25 %	25 %	57238735
25	NC_005295	TACA	2	8	6366	6373	50 %	25 %	0 %	25 %	57238735
26	NC_005295	GAAA	2	8	7056	7063	75 %	0 %	25 %	0 %	57238737
27	NC_005295	AACA	2	8	7289	7296	75 %	0 %	0 %	25 %	57238737
28	NC_005295	ATCA	2	8	7398	7405	50 %	25 %	0 %	25 %	57238737
29	NC_005295	GTTA	2	8	7861	7868	25 %	50 %	25 %	0 %	57238737
30	NC_005295	TTTA	2	8	8143	8150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005295	CTAA	2	8	8478	8485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005295	TAAA	2	8	8567	8574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005295	TAAA	2	8	8592	8599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005295	ATTA	2	8	8639	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005295	ATTC	2	8	8649	8656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005295	ATAA	2	8	8665	8672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005295	CTTA	2	8	8787	8794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005295	AAAT	2	8	9024	9031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005295	TACA	3	12	9222	9233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005295	TTAA	2	8	9326	9333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005295	TAAT	2	8	9475	9482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005295	CAAC	2	8	9574	9581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005295	ATTT	2	8	9720	9727	25 %	75 %	0 %	0 %	57238738
44	NC_005295	ATCT	2	8	10049	10056	25 %	50 %	0 %	25 %	57238738
45	NC_005295	TATC	2	8	10118	10125	25 %	50 %	0 %	25 %	57238738
46	NC_005295	CATC	2	8	10218	10225	25 %	25 %	0 %	50 %	57238738
47	NC_005295	AATC	2	8	10942	10949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005295	ATAA	2	8	11011	11018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005295	AATA	2	8	11053	11060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005295	CTAA	2	8	11337	11344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_005295	ATTA	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005295	TACA	2	8	12041	12048	50 %	25 %	0 %	25 %	57238739
53	NC_005295	TTGT	2	8	12205	12212	0 %	75 %	25 %	0 %	57238739
54	NC_005295	ACAA	2	8	12225	12232	75 %	0 %	0 %	25 %	57238739
55	NC_005295	TATG	2	8	12290	12297	25 %	50 %	25 %	0 %	57238739
56	NC_005295	CTTA	2	8	12406	12413	25 %	50 %	0 %	25 %	57238739
57	NC_005295	GATA	2	8	12654	12661	50 %	25 %	25 %	0 %	57238739
58	NC_005295	CTAT	2	8	12837	12844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005295	CTAT	2	8	12995	13002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_005295	CTAT	2	8	13153	13160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005295	TCAT	2	8	13336	13343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005295	TTAA	2	8	13487	13494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005295	ACTT	2	8	13503	13510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005295	ATAA	2	8	13570	13577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005295	TTTA	2	8	13642	13649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005295	ATTA	2	8	13727	13734	50 %	50 %	0 %	0 %	57238740
67	NC_005295	CTTT	2	8	13834	13841	0 %	75 %	0 %	25 %	57238740
68	NC_005295	CAAT	2	8	14038	14045	50 %	25 %	0 %	25 %	57238740
69	NC_005295	TAAA	2	8	14222	14229	75 %	25 %	0 %	0 %	57238740
70	NC_005295	ATTA	2	8	14536	14543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005295	AGAA	2	8	15142	15149	75 %	0 %	25 %	0 %	57238741
72	NC_005295	TAAG	2	8	15500	15507	50 %	25 %	25 %	0 %	57238741
73	NC_005295	AAGA	2	8	17043	17050	75 %	0 %	25 %	0 %	57238742
74	NC_005295	TAAG	2	8	17619	17626	50 %	25 %	25 %	0 %	57238742
75	NC_005295	GATA	2	8	17860	17867	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
76	NC_005295	GATA	2	8	17888	17895	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
77	NC_005295	ATGT	2	8	18261	18268	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
78	NC_005295	TGTA	2	8	18441	18448	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
79	NC_005295	AATG	2	8	18912	18919	50 %	25 %	25 %	0 %	57238744
80	NC_005295	GATT	2	8	19007	19014	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
81	NC_005295	ACTA	2	8	19454	19461	50 %	25 %	0 %	25 %	57238744
82	NC_005295	TTAG	2	8	19611	19618	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
83	NC_005295	ATTT	2	8	19790	19797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005295	TATT	2	8	20150	20157	25 %	75 %	0 %	0 %	57238745
85	NC_005295	TTTA	2	8	20660	20667	25 %	75 %	0 %	0 %	57238746
86	NC_005295	ACAG	2	8	20829	20836	50 %	0 %	25 %	25 %	57238746
87	NC_005295	AGTA	2	8	22152	22159	50 %	25 %	25 %	0 %	57238748
88	NC_005295	GGTA	2	8	22923	22930	25 %	25 %	50 %	0 %	57238748
89	NC_005295	GTAT	2	8	23152	23159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005295	TTAC	2	8	23313	23320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005295	ATTA	2	8	23703	23710	50 %	50 %	0 %	0 %	57238749
92	NC_005295	ATTT	2	8	23870	23877	25 %	75 %	0 %	0 %	57238749
93	NC_005295	GATT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	25 %	0 %	57238749
94	NC_005295	CTCA	2	8	24606	24613	25 %	25 %	0 %	50 %	57238750
95	NC_005295	GTAT	2	8	25192	25199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005295	TGTT	2	8	25438	25445	0 %	75 %	25 %	0 %	57238751
97	NC_005295	ATGG	2	8	25866	25873	25 %	25 %	50 %	0 %	57238751
98	NC_005295	GTTA	2	8	26617	26624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005295	ATTT	2	8	27948	27955	25 %	75 %	0 %	0 %	57238753
100	NC_005295	ATAA	2	8	28576	28583	75 %	25 %	0 %	0 %	57238754
101	NC_005295	ATTT	2	8	28672	28679	25 %	75 %	0 %	0 %	57238754
102	NC_005295	TACA	2	8	28791	28798	50 %	25 %	0 %	25 %	57238754
103	NC_005295	ATCT	2	8	29291	29298	25 %	50 %	0 %	25 %	57238755
104	NC_005295	AGAA	2	8	30200	30207	75 %	0 %	25 %	0 %	57238755
105	NC_005295	AAAT	2	8	30631	30638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005295	TTTA	2	8	30717	30724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005295	TAAA	2	8	30849	30856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005295	AAAT	2	8	30958	30965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005295	AAGT	2	8	31104	31111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005295	TTAC	2	8	31133	31140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005295	TATT	2	8	31162	31169	25 %	75 %	0 %	0 %	57238756
112	NC_005295	TGTA	2	8	31599	31606	25 %	50 %	25 %	0 %	57238756
113	NC_005295	CATA	2	8	31749	31756	50 %	25 %	0 %	25 %	57238756
114	NC_005295	GAAT	2	8	32191	32198	50 %	25 %	25 %	0 %	57238756
115	NC_005295	GTAC	2	8	32708	32715	25 %	25 %	25 %	25 %	57238756
116	NC_005295	TTTC	2	8	32953	32960	0 %	75 %	0 %	25 %	57238756
117	NC_005295	AATA	2	8	33466	33473	75 %	25 %	0 %	0 %	57238756
118	NC_005295	TTTA	2	8	33601	33608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005295	TACT	2	8	33940	33947	25 %	50 %	0 %	25 %	57238757
120	NC_005295	AACA	2	8	34690	34697	75 %	0 %	0 %	25 %	57238758
121	NC_005295	TAGA	2	8	34797	34804	50 %	25 %	25 %	0 %	57238758
122	NC_005295	ATTT	2	8	34915	34922	25 %	75 %	0 %	0 %	57238758
123	NC_005295	AATT	2	8	35250	35257	50 %	50 %	0 %	0 %	57238758
124	NC_005295	GTAG	2	8	35540	35547	25 %	25 %	50 %	0 %	57238758
125	NC_005295	ATTC	2	8	36029	36036	25 %	50 %	0 %	25 %	57238759
126	NC_005295	TGTT	2	8	36503	36510	0 %	75 %	25 %	0 %	57238759
127	NC_005295	TTAC	2	8	36748	36755	25 %	50 %	0 %	25 %	57238759
128	NC_005295	TCAT	2	8	36857	36864	25 %	50 %	0 %	25 %	57238760
129	NC_005295	CTTA	2	8	37450	37457	25 %	50 %	0 %	25 %	57238760
130	NC_005295	TATT	2	8	37584	37591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005295	TAAT	2	8	37681	37688	50 %	50 %	0 %	0 %	57238761
132	NC_005295	GTTA	2	8	37776	37783	25 %	50 %	25 %	0 %	57238761
133	NC_005295	AATG	2	8	37833	37840	50 %	25 %	25 %	0 %	57238761
134	NC_005295	GAAT	2	8	38074	38081	50 %	25 %	25 %	0 %	57238761
135	NC_005295	TATC	2	8	38618	38625	25 %	50 %	0 %	25 %	57238761
136	NC_005295	TAAA	2	8	38892	38899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005295	GATT	2	8	39395	39402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005295	TATT	2	8	39860	39867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005295	TAAT	2	8	39901	39908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005295	TAAA	2	8	40027	40034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005295	TTAT	2	8	40157	40164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005295	ATTT	2	8	40392	40399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005295	TTTC	2	8	40461	40468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005295	GTGG	2	8	40606	40613	0 %	25 %	75 %	0 %	57238762
145	NC_005295	GTTT	2	8	41457	41464	0 %	75 %	25 %	0 %	57238762
146	NC_005295	TAAA	2	8	42342	42349	75 %	25 %	0 %	0 %	57238764
147	NC_005295	ATTT	2	8	43710	43717	25 %	75 %	0 %	0 %	57238765
148	NC_005295	TAAA	2	8	43884	43891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005295	TAAA	2	8	43916	43923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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