MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 2533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	ATGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
2	NC_005295	AATG	2	8	1031	1038	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
3	NC_005295	ATTA	2	8	1088	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
4	NC_005295	CAAT	2	8	2856	2863	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
5	NC_005295	AAAT	2	8	3062	3069	75 %	25 %	0 %	0 %	57238733
6	NC_005295	ATTT	2	8	3131	3138	25 %	75 %	0 %	0 %	57238733
7	NC_005295	TAAC	2	8	3301	3308	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
8	NC_005295	CCAT	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	57238733
9	NC_005295	ATAA	2	8	3632	3639	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
10	NC_005295	AAAT	2	8	3666	3673	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
11	NC_005295	TACA	2	8	3927	3934	50 %	25 %	0 %	25 %	57238734
12	NC_005295	TAAA	2	8	5927	5934	75 %	25 %	0 %	0 %	57238735
13	NC_005295	CAAG	2	8	6162	6169	50 %	0 %	25 %	25 %	57238735
14	NC_005295	TACA	2	8	6366	6373	50 %	25 %	0 %	25 %	57238735
15	NC_005295	GAAA	2	8	7056	7063	75 %	0 %	25 %	0 %	57238737
16	NC_005295	AACA	2	8	7289	7296	75 %	0 %	0 %	25 %	57238737
17	NC_005295	ATCA	2	8	7398	7405	50 %	25 %	0 %	25 %	57238737
18	NC_005295	GTTA	2	8	7861	7868	25 %	50 %	25 %	0 %	57238737
19	NC_005295	ATTT	2	8	9720	9727	25 %	75 %	0 %	0 %	57238738
20	NC_005295	ATCT	2	8	10049	10056	25 %	50 %	0 %	25 %	57238738
21	NC_005295	TATC	2	8	10118	10125	25 %	50 %	0 %	25 %	57238738
22	NC_005295	CATC	2	8	10218	10225	25 %	25 %	0 %	50 %	57238738
23	NC_005295	TACA	2	8	12041	12048	50 %	25 %	0 %	25 %	57238739
24	NC_005295	TTGT	2	8	12205	12212	0 %	75 %	25 %	0 %	57238739
25	NC_005295	ACAA	2	8	12225	12232	75 %	0 %	0 %	25 %	57238739
26	NC_005295	TATG	2	8	12290	12297	25 %	50 %	25 %	0 %	57238739
27	NC_005295	CTTA	2	8	12406	12413	25 %	50 %	0 %	25 %	57238739
28	NC_005295	GATA	2	8	12654	12661	50 %	25 %	25 %	0 %	57238739
29	NC_005295	ATTA	2	8	13727	13734	50 %	50 %	0 %	0 %	57238740
30	NC_005295	CTTT	2	8	13834	13841	0 %	75 %	0 %	25 %	57238740
31	NC_005295	CAAT	2	8	14038	14045	50 %	25 %	0 %	25 %	57238740
32	NC_005295	TAAA	2	8	14222	14229	75 %	25 %	0 %	0 %	57238740
33	NC_005295	AGAA	2	8	15142	15149	75 %	0 %	25 %	0 %	57238741
34	NC_005295	TAAG	2	8	15500	15507	50 %	25 %	25 %	0 %	57238741
35	NC_005295	AAGA	2	8	17043	17050	75 %	0 %	25 %	0 %	57238742
36	NC_005295	TAAG	2	8	17619	17626	50 %	25 %	25 %	0 %	57238742
37	NC_005295	GATA	2	8	17860	17867	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
38	NC_005295	GATA	2	8	17888	17895	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
39	NC_005295	ATGT	2	8	18261	18268	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
40	NC_005295	TGTA	2	8	18441	18448	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
41	NC_005295	AATG	2	8	18912	18919	50 %	25 %	25 %	0 %	57238744
42	NC_005295	GATT	2	8	19007	19014	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
43	NC_005295	ACTA	2	8	19454	19461	50 %	25 %	0 %	25 %	57238744
44	NC_005295	TTAG	2	8	19611	19618	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
45	NC_005295	TATT	2	8	20150	20157	25 %	75 %	0 %	0 %	57238745
46	NC_005295	TTTA	2	8	20660	20667	25 %	75 %	0 %	0 %	57238746
47	NC_005295	ACAG	2	8	20829	20836	50 %	0 %	25 %	25 %	57238746
48	NC_005295	AGTA	2	8	22152	22159	50 %	25 %	25 %	0 %	57238748
49	NC_005295	GGTA	2	8	22923	22930	25 %	25 %	50 %	0 %	57238748
50	NC_005295	ATTA	2	8	23703	23710	50 %	50 %	0 %	0 %	57238749
51	NC_005295	ATTT	2	8	23870	23877	25 %	75 %	0 %	0 %	57238749
52	NC_005295	GATT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	25 %	0 %	57238749
53	NC_005295	CTCA	2	8	24606	24613	25 %	25 %	0 %	50 %	57238750
54	NC_005295	TGTT	2	8	25438	25445	0 %	75 %	25 %	0 %	57238751
55	NC_005295	ATGG	2	8	25866	25873	25 %	25 %	50 %	0 %	57238751
56	NC_005295	ATTT	2	8	27948	27955	25 %	75 %	0 %	0 %	57238753
57	NC_005295	ATAA	2	8	28576	28583	75 %	25 %	0 %	0 %	57238754
58	NC_005295	ATTT	2	8	28672	28679	25 %	75 %	0 %	0 %	57238754
59	NC_005295	TACA	2	8	28791	28798	50 %	25 %	0 %	25 %	57238754
60	NC_005295	ATCT	2	8	29291	29298	25 %	50 %	0 %	25 %	57238755
61	NC_005295	AGAA	2	8	30200	30207	75 %	0 %	25 %	0 %	57238755
62	NC_005295	TATT	2	8	31162	31169	25 %	75 %	0 %	0 %	57238756
63	NC_005295	TGTA	2	8	31599	31606	25 %	50 %	25 %	0 %	57238756
64	NC_005295	CATA	2	8	31749	31756	50 %	25 %	0 %	25 %	57238756
65	NC_005295	GAAT	2	8	32191	32198	50 %	25 %	25 %	0 %	57238756
66	NC_005295	GTAC	2	8	32708	32715	25 %	25 %	25 %	25 %	57238756
67	NC_005295	TTTC	2	8	32953	32960	0 %	75 %	0 %	25 %	57238756
68	NC_005295	AATA	2	8	33466	33473	75 %	25 %	0 %	0 %	57238756
69	NC_005295	TACT	2	8	33940	33947	25 %	50 %	0 %	25 %	57238757
70	NC_005295	AACA	2	8	34690	34697	75 %	0 %	0 %	25 %	57238758
71	NC_005295	TAGA	2	8	34797	34804	50 %	25 %	25 %	0 %	57238758
72	NC_005295	ATTT	2	8	34915	34922	25 %	75 %	0 %	0 %	57238758
73	NC_005295	AATT	2	8	35250	35257	50 %	50 %	0 %	0 %	57238758
74	NC_005295	GTAG	2	8	35540	35547	25 %	25 %	50 %	0 %	57238758
75	NC_005295	ATTC	2	8	36029	36036	25 %	50 %	0 %	25 %	57238759
76	NC_005295	TGTT	2	8	36503	36510	0 %	75 %	25 %	0 %	57238759
77	NC_005295	TTAC	2	8	36748	36755	25 %	50 %	0 %	25 %	57238759
78	NC_005295	TCAT	2	8	36857	36864	25 %	50 %	0 %	25 %	57238760
79	NC_005295	CTTA	2	8	37450	37457	25 %	50 %	0 %	25 %	57238760
80	NC_005295	TAAT	2	8	37681	37688	50 %	50 %	0 %	0 %	57238761
81	NC_005295	GTTA	2	8	37776	37783	25 %	50 %	25 %	0 %	57238761
82	NC_005295	AATG	2	8	37833	37840	50 %	25 %	25 %	0 %	57238761
83	NC_005295	GAAT	2	8	38074	38081	50 %	25 %	25 %	0 %	57238761
84	NC_005295	TATC	2	8	38618	38625	25 %	50 %	0 %	25 %	57238761
85	NC_005295	GTGG	2	8	40606	40613	0 %	25 %	75 %	0 %	57238762
86	NC_005295	GTTT	2	8	41457	41464	0 %	75 %	25 %	0 %	57238762
87	NC_005295	TAAA	2	8	42342	42349	75 %	25 %	0 %	0 %	57238764
88	NC_005295	ATTT	2	8	43710	43717	25 %	75 %	0 %	0 %	57238765
89	NC_005295	GTGG	2	8	45862	45869	0 %	25 %	75 %	0 %	57238766
90	NC_005295	CAGT	2	8	48160	48167	25 %	25 %	25 %	25 %	57238767
91	NC_005295	CCTT	2	8	48379	48386	0 %	50 %	0 %	50 %	57238767
92	NC_005295	TCTT	2	8	49323	49330	0 %	75 %	0 %	25 %	57238768
93	NC_005295	TGCT	2	8	49586	49593	0 %	50 %	25 %	25 %	57238768
94	NC_005295	AAAT	2	8	50215	50222	75 %	25 %	0 %	0 %	57238769
95	NC_005295	AATG	2	8	50238	50245	50 %	25 %	25 %	0 %	57238769
96	NC_005295	TTGA	2	8	51865	51872	25 %	50 %	25 %	0 %	57238770
97	NC_005295	TGAG	2	8	55180	55187	25 %	25 %	50 %	0 %	57238771
98	NC_005295	AAAT	2	8	55719	55726	75 %	25 %	0 %	0 %	57238772
99	NC_005295	GTAA	2	8	56050	56057	50 %	25 %	25 %	0 %	57238772
100	NC_005295	AAAG	2	8	56074	56081	75 %	0 %	25 %	0 %	57238772
101	NC_005295	AAGG	2	8	56203	56210	50 %	0 %	50 %	0 %	57238772
102	NC_005295	ACAA	2	8	56823	56830	75 %	0 %	0 %	25 %	57238772
103	NC_005295	TAAG	2	8	57248	57255	50 %	25 %	25 %	0 %	57238772
104	NC_005295	TTAC	2	8	57484	57491	25 %	50 %	0 %	25 %	57238772
105	NC_005295	TTAG	2	8	59946	59953	25 %	50 %	25 %	0 %	57238773
106	NC_005295	AAGT	2	8	60284	60291	50 %	25 %	25 %	0 %	57238773
107	NC_005295	TTAT	2	8	63196	63203	25 %	75 %	0 %	0 %	57238774
108	NC_005295	TTGT	2	8	63387	63394	0 %	75 %	25 %	0 %	57238774
109	NC_005295	AAAT	2	8	64418	64425	75 %	25 %	0 %	0 %	57238776
110	NC_005295	TAAT	2	8	66390	66397	50 %	50 %	0 %	0 %	57238777
111	NC_005295	AATT	2	8	69563	69570	50 %	50 %	0 %	0 %	57238779
112	NC_005295	AATT	2	8	69735	69742	50 %	50 %	0 %	0 %	57238779
113	NC_005295	ATCA	2	8	70200	70207	50 %	25 %	0 %	25 %	57238779
114	NC_005295	ATTA	2	8	70239	70246	50 %	50 %	0 %	0 %	57238779
115	NC_005295	TAAA	2	8	70289	70296	75 %	25 %	0 %	0 %	57238779
116	NC_005295	TTAA	2	8	70546	70553	50 %	50 %	0 %	0 %	57238779
117	NC_005295	CCTT	2	8	70600	70607	0 %	50 %	0 %	50 %	57238779
118	NC_005295	ATTG	2	8	70626	70633	25 %	50 %	25 %	0 %	57238779
119	NC_005295	ATTA	2	8	70812	70819	50 %	50 %	0 %	0 %	57238779
120	NC_005295	TATT	2	8	71185	71192	25 %	75 %	0 %	0 %	57238779
121	NC_005295	AATA	2	8	71662	71669	75 %	25 %	0 %	0 %	57238779
122	NC_005295	CAAG	2	8	76236	76243	50 %	0 %	25 %	25 %	57238782
123	NC_005295	AGTA	2	8	76329	76336	50 %	25 %	25 %	0 %	57238782
124	NC_005295	ACCT	2	8	77167	77174	25 %	25 %	0 %	50 %	57238783
125	NC_005295	TAAT	5	20	77829	77848	50 %	50 %	0 %	0 %	57238784
126	NC_005295	TAGA	2	8	77896	77903	50 %	25 %	25 %	0 %	57238784
127	NC_005295	AGCC	2	8	77961	77968	25 %	0 %	25 %	50 %	57238784
128	NC_005295	TATT	2	8	78779	78786	25 %	75 %	0 %	0 %	57238785
129	NC_005295	GAAG	2	8	79160	79167	50 %	0 %	50 %	0 %	57238785
130	NC_005295	ATGG	2	8	80126	80133	25 %	25 %	50 %	0 %	57238786
131	NC_005295	GTTT	2	8	82317	82324	0 %	75 %	25 %	0 %	57238787
132	NC_005295	TTGT	2	8	82329	82336	0 %	75 %	25 %	0 %	57238787
133	NC_005295	ATTA	2	8	82833	82840	50 %	50 %	0 %	0 %	57238787
134	NC_005295	TAAG	2	8	83231	83238	50 %	25 %	25 %	0 %	57238788
135	NC_005295	GATA	2	8	83401	83408	50 %	25 %	25 %	0 %	57238788
136	NC_005295	AAGT	2	8	85582	85589	50 %	25 %	25 %	0 %	57238789
137	NC_005295	GATT	2	8	85616	85623	25 %	50 %	25 %	0 %	57238789
138	NC_005295	GTAA	2	8	85677	85684	50 %	25 %	25 %	0 %	57238789
139	NC_005295	AAGA	2	8	85770	85777	75 %	0 %	25 %	0 %	57238789
140	NC_005295	AACA	2	8	85803	85810	75 %	0 %	0 %	25 %	57238789
141	NC_005295	TGAA	2	8	85867	85874	50 %	25 %	25 %	0 %	57238789
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