MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 16107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	TAA	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
2	NC_005295	ATG	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
3	NC_005295	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
4	NC_005295	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
5	NC_005295	AAG	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
6	NC_005295	GGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238732
7	NC_005295	CTG	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238732
8	NC_005295	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
9	NC_005295	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
10	NC_005295	ACA	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
11	NC_005295	AAG	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
12	NC_005295	CAA	3	9	714	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
13	NC_005295	AAT	2	6	748	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
14	NC_005295	ACA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
15	NC_005295	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
16	NC_005295	TAG	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
17	NC_005295	GAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
18	NC_005295	ATA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
19	NC_005295	TTA	2	6	1073	1078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238732
20	NC_005295	GAT	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
21	NC_005295	TTA	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
22	NC_005295	TCC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238733
23	NC_005295	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
24	NC_005295	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
25	NC_005295	TCA	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238733
26	NC_005295	ACC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238733
27	NC_005295	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238733
28	NC_005295	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
29	NC_005295	TAG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
30	NC_005295	TAA	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238734
31	NC_005295	GAA	3	9	3896	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
32	NC_005295	AGA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
33	NC_005295	GAA	2	6	4040	4045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
34	NC_005295	AGA	3	9	4078	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
35	NC_005295	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238734
36	NC_005295	GTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238734
37	NC_005295	GCA	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238734
38	NC_005295	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
39	NC_005295	AGC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238735
40	NC_005295	ACT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
41	NC_005295	AAT	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
42	NC_005295	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
43	NC_005295	ATC	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
44	NC_005295	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238735
45	NC_005295	AGA	2	6	5436	5441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
46	NC_005295	AGA	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
47	NC_005295	AAT	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
48	NC_005295	AGA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
49	NC_005295	TGA	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238735
50	NC_005295	TTA	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238735
51	NC_005295	TAA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
52	NC_005295	AGA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
53	NC_005295	ATA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
54	NC_005295	GAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
55	NC_005295	GAT	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238735
56	NC_005295	ATA	2	6	6074	6079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
57	NC_005295	TCT	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238735
58	NC_005295	AAG	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
59	NC_005295	ATC	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
60	NC_005295	ATA	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
61	NC_005295	AAT	2	6	6247	6252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
62	NC_005295	ATT	2	6	6303	6308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238735
63	NC_005295	TAA	2	6	6315	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
64	NC_005295	ATA	2	6	6394	6399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
65	NC_005295	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
66	NC_005295	CTA	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
67	NC_005295	TAC	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
68	NC_005295	AAC	2	6	6596	6601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238735
69	NC_005295	ATA	2	6	6687	6692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238736
70	NC_005295	TCA	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
71	NC_005295	TGG	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238736
72	NC_005295	CAT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
73	NC_005295	AGA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238736
74	NC_005295	TAA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238736
75	NC_005295	AGC	2	6	6841	6846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238736
76	NC_005295	ATG	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238736
77	NC_005295	CTA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
78	NC_005295	AGT	2	6	6946	6951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238737
79	NC_005295	TGT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238737
80	NC_005295	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238737
81	NC_005295	ATA	2	6	7209	7214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238737
82	NC_005295	CTT	2	6	7215	7220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238737
83	NC_005295	AGA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238737
84	NC_005295	CAA	2	6	7323	7328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238737
85	NC_005295	CAA	2	6	7554	7559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238737
86	NC_005295	AAG	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238737
87	NC_005295	GAA	2	6	7697	7702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238737
88	NC_005295	AGA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238737
89	NC_005295	ATA	2	6	7830	7835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238737
90	NC_005295	ATT	2	6	7918	7923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238737
91	NC_005295	TTA	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238738
92	NC_005295	TCT	2	6	9739	9744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238738
93	NC_005295	AAG	2	6	9797	9802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238738
94	NC_005295	ATA	3	9	9827	9835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238738
95	NC_005295	ATC	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238738
96	NC_005295	AAG	2	6	9938	9943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238738
97	NC_005295	TAG	2	6	9989	9994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238738
98	NC_005295	AGC	2	6	10041	10046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238738
99	NC_005295	CCA	2	6	10090	10095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238738
100	NC_005295	CCA	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238738
101	NC_005295	ACC	2	6	10164	10169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238738
102	NC_005295	TGT	2	6	10185	10190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238738
103	NC_005295	TAT	2	6	10337	10342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238738
104	NC_005295	ATA	2	6	10417	10422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238738
105	NC_005295	CAA	2	6	10544	10549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238738
106	NC_005295	AAT	2	6	10659	10664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238738
107	NC_005295	AAT	2	6	10769	10774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238738
108	NC_005295	TAA	2	6	10870	10875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238738
109	NC_005295	ATG	2	6	11680	11685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238739
110	NC_005295	TAT	2	6	11782	11787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238739
111	NC_005295	ATA	2	6	11860	11865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238739
112	NC_005295	TAA	2	6	12088	12093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238739
113	NC_005295	CTC	2	6	12112	12117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238739
114	NC_005295	GGA	2	6	12267	12272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238739
115	NC_005295	TCT	2	6	12309	12314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238739
116	NC_005295	TAA	2	6	12326	12331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238739
117	NC_005295	TGC	2	6	12509	12514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238739
118	NC_005295	ATT	2	6	12683	12688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238739
119	NC_005295	ACA	2	6	12690	12695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238739
120	NC_005295	CAA	2	6	12715	12720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238739
121	NC_005295	ATG	2	6	12792	12797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238739
122	NC_005295	TTC	3	9	13754	13762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238740
123	NC_005295	ATC	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238740
124	NC_005295	CAT	2	6	13888	13893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238740
125	NC_005295	ACA	2	6	14023	14028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238740
126	NC_005295	ACA	2	6	14127	14132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238740
127	NC_005295	TAA	2	6	14185	14190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238740
128	NC_005295	TAA	2	6	14676	14681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238741
129	NC_005295	GCA	2	6	14750	14755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238741
130	NC_005295	TAA	2	6	14826	14831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238741
131	NC_005295	GAT	2	6	14996	15001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238741
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133	NC_005295	AGG	2	6	15094	15099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238741
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