MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 megaplasmid pHG1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005241	CGCCT	2	10	22548	22557	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_005241	ACGCG	2	10	22999	23008	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_005241	GGCGC	2	10	57655	57664	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_005241	TGCCT	2	10	74174	74183	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_005241	CTTGG	2	10	100581	100590	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_005241	GGCTG	2	10	108921	108930	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_005241	CCGTT	2	10	109025	109034	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_005241	GGGCG	2	10	133266	133275	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005241	CATGA	2	10	133409	133418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005241	AAGCG	2	10	147267	147276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_005241	GCGGT	2	10	151047	151056	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_005241	GGCTC	2	10	153042	153051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_005241	TCGGC	2	10	157043	157052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_005241	GCGCC	2	10	162574	162583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_005241	AGCGC	2	10	162751	162760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_005241	TGCGC	2	10	163975	163984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_005241	AAGCG	2	10	164400	164409	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005241	GGCAA	2	10	164955	164964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005241	CTGGC	2	10	166834	166843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_005241	GACTC	2	10	176684	176693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_005241	TGCTC	2	10	181617	181626	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_005241	CCCAA	2	10	185912	185921	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_005241	CGCCT	2	10	194489	194498	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_005241	GGAAA	2	10	196948	196957	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005241	CGGGC	2	10	201107	201116	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_005241	CGGCT	2	10	209947	209956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_005241	CTTCC	2	10	211661	211670	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_005241	CAACG	2	10	214965	214974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_005241	CAACG	2	10	215083	215092	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_005241	TTTCG	2	10	216167	216176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005241	CTGAG	2	10	216261	216270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005241	TCGCC	2	10	218020	218029	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_005241	GGTCG	2	10	222974	222983	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_005241	GGCTC	2	10	224660	224669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_005241	TGAAT	2	10	239173	239182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005241	CTTCC	2	10	239303	239312	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_005241	AGGCA	2	10	243747	243756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_005241	CGGTT	2	10	279582	279591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005241	TCGCC	2	10	295937	295946	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_005241	CGCGC	2	10	295953	295962	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_005241	TGCGA	2	10	296967	296976	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_005241	TCCCT	2	10	297532	297541	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_005241	CGCTC	2	10	299926	299935	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_005241	GCCTG	2	10	300595	300604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_005241	AGAAA	2	10	305931	305940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005241	GCGTC	2	10	316356	316365	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_005241	GTGTG	2	10	327429	327438	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005241	CAATC	2	10	327546	327555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_005241	AGAAA	2	10	331100	331109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005241	CGGCG	2	10	340948	340957	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_005241	TTGAT	2	10	345147	345156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005241	CATGC	2	10	351336	351345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_005241	ATCGA	2	10	351533	351542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005241	TGATC	2	10	370914	370923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_005241	GGCTT	2	10	372712	372721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_005241	GCTTT	2	10	388346	388355	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005241	CCGAT	2	10	393776	393785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_005241	CCGCT	2	10	393831	393840	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_005241	TCGTC	2	10	394362	394371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_005241	GAACA	2	10	394556	394565	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_005241	CGCAT	2	10	396675	396684	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_005241	CGGCG	2	10	400646	400655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_005241	CAACA	2	10	402105	402114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_005241	GGTGT	2	10	403980	403989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005241	TCCGG	2	10	404785	404794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_005241	AGGGA	2	10	408222	408231	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005241	GCCGT	2	10	409224	409233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_005241	TTCCG	2	10	423081	423090	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_005241	TGACC	2	10	423316	423325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_005241	TGGGC	2	10	431610	431619	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005241	TCACG	2	10	431892	431901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_005241	GGCAT	2	10	433720	433729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_005241	GCAAG	2	10	434133	434142	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_005241	CATGA	2	10	437387	437396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_005241	GGGCG	2	10	451828	451837	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.