MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	TGGCAT	2	12	2417	2428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	38505826
2	NC_005232	CGAAGG	2	12	4354	4365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505829
3	NC_005232	GACATC	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505831
4	NC_005232	GTAATC	2	12	5636	5647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505831
5	NC_005232	GCCTTT	2	12	6142	6153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	38505831
6	NC_005232	AAACCC	2	12	6575	6586	50 %	0 %	0 %	50 %	38505832
7	NC_005232	GCCAAG	2	12	8003	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505833
8	NC_005232	CCATTG	2	12	8905	8916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505834
9	NC_005232	GAAATA	2	12	11915	11926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	38505837
10	NC_005232	TTTTAG	2	12	13598	13609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38505838
11	NC_005232	AAATTT	2	12	15104	15115	50 %	50 %	0 %	0 %	38505839
12	NC_005232	TTTAAA	2	12	19555	19566	50 %	50 %	0 %	0 %	38505841
13	NC_005232	GATTTT	2	12	19946	19957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38505841
14	NC_005232	TGTTTT	2	12	22193	22204	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	38505845
15	NC_005232	AAGATG	2	12	24720	24731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	38505850
16	NC_005232	CAAAAA	2	12	26819	26830	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	38505854
17	NC_005232	AACGGC	2	12	28303	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505856
18	NC_005232	AACGGG	2	12	29965	29976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505856
19	NC_005232	TCTTCA	2	12	33248	33259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	38505861
20	NC_005232	CATGCA	2	12	34900	34911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505864
21	NC_005232	AGCCCA	2	12	38093	38104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	38505867
22	NC_005232	CAAGTT	2	12	38400	38411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505867
23	NC_005232	GATGCC	2	12	41007	41018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	38505868
24	NC_005232	TTGGCT	2	12	41871	41882	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	38505868
25	NC_005232	TGGATT	2	12	43198	43209	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	38505870
26	NC_005232	TGATCT	2	12	47791	47802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505874
27	NC_005232	ATTTTG	2	12	47867	47878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38505875
28	NC_005232	ATTGCC	2	12	47965	47976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505875
29	NC_005232	GAAAAT	2	12	50970	50981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	38505875
30	NC_005232	CAATCA	2	12	51734	51745	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	38505877
31	NC_005232	AAAGCC	2	12	52830	52841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	38505878
32	NC_005232	GGAATG	2	12	53217	53228	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	38505878
33	NC_005232	CGTTAT	2	12	55652	55663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505883
34	NC_005232	CAACGG	2	12	55753	55764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505883
35	NC_005232	CGAAGG	2	12	59072	59083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505888
36	NC_005232	GACATC	2	12	60077	60088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505890
37	NC_005232	GTAATC	2	12	60354	60365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505890
38	NC_005232	GCCTTT	2	12	60860	60871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	38505890
39	NC_005232	AAACCC	2	12	61293	61304	50 %	0 %	0 %	50 %	38505891
40	NC_005232	GCCAAG	2	12	62721	62732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505892
41	NC_005232	CCATTG	2	12	63623	63634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505893
42	NC_005232	GAAATA	2	12	66633	66644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	38505896
43	NC_005232	TTTTAG	2	12	68316	68327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38505897
44	NC_005232	AAATTT	2	12	69822	69833	50 %	50 %	0 %	0 %	38505898
45	NC_005232	TTTAAA	2	12	74273	74284	50 %	50 %	0 %	0 %	38505900
46	NC_005232	GATTTT	2	12	74664	74675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38505900
47	NC_005232	TGTTTT	2	12	76911	76922	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	38505904
48	NC_005232	AAGATG	2	12	79438	79449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	38505909
49	NC_005232	CAAAAA	2	12	81537	81548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	38505913
50	NC_005232	TTGACT	2	12	83092	83103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505915
51	NC_005232	GGGCCA	2	12	84054	84065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	38505915
52	NC_005232	ATGCGG	2	12	89649	89660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	304569843
53	NC_005232	TACGAA	2	12	94443	94454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	38505926
54	NC_005232	TGAAGA	2	12	95954	95965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	38505927
55	NC_005232	GAAAAA	2	12	96137	96148	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	38505927
56	NC_005232	GGCAAA	2	12	96389	96400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	38505927
57	NC_005232	CAACGG	2	12	102189	102200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505932

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.