MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	CAGTT	2	10	1303	1312	20 %	40 %	20 %	20 %	38505826
2	NC_005232	AAGGT	2	10	1462	1471	40 %	20 %	40 %	0 %	38505826
3	NC_005232	GCTGA	2	10	4167	4176	20 %	20 %	40 %	20 %	38505829
4	NC_005232	TGCCA	2	10	5502	5511	20 %	20 %	20 %	40 %	38505831
5	NC_005232	TCCAA	2	10	6406	6415	40 %	20 %	0 %	40 %	38505832
6	NC_005232	TGGGC	2	10	7230	7239	0 %	20 %	60 %	20 %	38505832
7	NC_005232	TCAAA	2	10	8485	8494	60 %	20 %	0 %	20 %	38505833
8	NC_005232	TCAAA	2	10	9128	9137	60 %	20 %	0 %	20 %	38505834
9	NC_005232	AGCTG	2	10	9161	9170	20 %	20 %	40 %	20 %	38505834
10	NC_005232	AAAGG	2	10	9875	9884	60 %	0 %	40 %	0 %	38505835
11	NC_005232	CAAAA	2	10	11530	11539	80 %	0 %	0 %	20 %	38505837
12	NC_005232	TTATT	2	10	15086	15095	20 %	80 %	0 %	0 %	38505839
13	NC_005232	AATGT	2	10	16252	16261	40 %	40 %	20 %	0 %	38505839
14	NC_005232	ATCTT	2	10	16654	16663	20 %	60 %	0 %	20 %	38505840
15	NC_005232	AGAAA	2	10	17204	17213	80 %	0 %	20 %	0 %	38505840
16	NC_005232	ACTTA	2	10	18015	18024	40 %	40 %	0 %	20 %	38505840
17	NC_005232	TATTC	2	10	18551	18560	20 %	60 %	0 %	20 %	38505841
18	NC_005232	CCATC	2	10	19203	19212	20 %	20 %	0 %	60 %	38505841
19	NC_005232	AAATT	2	10	19473	19482	60 %	40 %	0 %	0 %	38505841
20	NC_005232	AAATT	2	10	19800	19809	60 %	40 %	0 %	0 %	38505841
21	NC_005232	GGAAG	2	10	19858	19867	40 %	0 %	60 %	0 %	38505841
22	NC_005232	GAGAG	2	10	22379	22388	40 %	0 %	60 %	0 %	38505845
23	NC_005232	TGGTT	2	10	22605	22614	0 %	60 %	40 %	0 %	38505846
24	NC_005232	GAATT	2	10	22623	22632	40 %	40 %	20 %	0 %	38505846
25	NC_005232	AAAGA	2	10	22678	22687	80 %	0 %	20 %	0 %	38505846
26	NC_005232	TAAAT	2	10	22750	22759	60 %	40 %	0 %	0 %	38505846
27	NC_005232	CCTTG	2	10	23089	23098	0 %	40 %	20 %	40 %	38505847
28	NC_005232	CCTGC	2	10	23319	23328	0 %	20 %	20 %	60 %	38505847
29	NC_005232	GAATT	2	10	24822	24831	40 %	40 %	20 %	0 %	38505850
30	NC_005232	AAAAC	2	10	25271	25280	80 %	0 %	0 %	20 %	38505851
31	NC_005232	TGGGA	2	10	28536	28545	20 %	20 %	60 %	0 %	38505856
32	NC_005232	CGGAT	2	10	28743	28752	20 %	20 %	40 %	20 %	38505856
33	NC_005232	GGGGT	2	10	30422	30431	0 %	20 %	80 %	0 %	38505856
34	NC_005232	AACTG	2	10	31067	31076	40 %	20 %	20 %	20 %	38505856
35	NC_005232	GGCAA	2	10	31784	31793	40 %	0 %	40 %	20 %	38505858
36	NC_005232	TGGTT	2	10	32305	32314	0 %	60 %	40 %	0 %	38505859
37	NC_005232	CTGAA	2	10	34082	34091	40 %	20 %	20 %	20 %	38505862
38	NC_005232	GGGGA	2	10	34480	34489	20 %	0 %	80 %	0 %	38505863
39	NC_005232	GATTA	2	10	35784	35793	40 %	40 %	20 %	0 %	38505865
40	NC_005232	TGCCC	2	10	38051	38060	0 %	20 %	20 %	60 %	38505867
41	NC_005232	ATCGT	2	10	38545	38554	20 %	40 %	20 %	20 %	38505867
42	NC_005232	GGAAG	2	10	43674	43683	40 %	0 %	60 %	0 %	38505871
43	NC_005232	CTTAT	2	10	47054	47063	20 %	60 %	0 %	20 %	38505872
44	NC_005232	TTATT	2	10	47491	47500	20 %	80 %	0 %	0 %	38505874
45	NC_005232	AGGTT	2	10	48032	48041	20 %	40 %	40 %	0 %	38505875
46	NC_005232	ACAGG	2	10	48109	48118	40 %	0 %	40 %	20 %	38505875
47	NC_005232	GCTGA	2	10	58885	58894	20 %	20 %	40 %	20 %	38505888
48	NC_005232	TGCCA	2	10	60220	60229	20 %	20 %	20 %	40 %	38505890
49	NC_005232	TCCAA	2	10	61124	61133	40 %	20 %	0 %	40 %	38505891
50	NC_005232	TGGGC	2	10	61948	61957	0 %	20 %	60 %	20 %	38505891
51	NC_005232	TCAAA	2	10	63203	63212	60 %	20 %	0 %	20 %	38505892
52	NC_005232	TCAAA	2	10	63846	63855	60 %	20 %	0 %	20 %	38505893
53	NC_005232	AGCTG	2	10	63879	63888	20 %	20 %	40 %	20 %	38505893
54	NC_005232	AAAGG	2	10	64593	64602	60 %	0 %	40 %	0 %	38505894
55	NC_005232	CAAAA	2	10	66248	66257	80 %	0 %	0 %	20 %	38505896
56	NC_005232	TTATT	2	10	69804	69813	20 %	80 %	0 %	0 %	38505898
57	NC_005232	AATGT	2	10	70970	70979	40 %	40 %	20 %	0 %	38505898
58	NC_005232	ATCTT	2	10	71372	71381	20 %	60 %	0 %	20 %	38505899
59	NC_005232	AGAAA	2	10	71922	71931	80 %	0 %	20 %	0 %	38505899
60	NC_005232	ACTTA	2	10	72733	72742	40 %	40 %	0 %	20 %	38505899
61	NC_005232	TATTC	2	10	73269	73278	20 %	60 %	0 %	20 %	38505900
62	NC_005232	CCATC	2	10	73921	73930	20 %	20 %	0 %	60 %	38505900
63	NC_005232	AAATT	2	10	74191	74200	60 %	40 %	0 %	0 %	38505900
64	NC_005232	AAATT	2	10	74518	74527	60 %	40 %	0 %	0 %	38505900
65	NC_005232	GGAAG	2	10	74576	74585	40 %	0 %	60 %	0 %	38505900
66	NC_005232	GAGAG	2	10	77097	77106	40 %	0 %	60 %	0 %	38505904
67	NC_005232	TGGTT	2	10	77323	77332	0 %	60 %	40 %	0 %	38505905
68	NC_005232	GAATT	2	10	77341	77350	40 %	40 %	20 %	0 %	38505905
69	NC_005232	AAAGA	2	10	77396	77405	80 %	0 %	20 %	0 %	38505905
70	NC_005232	TAAAT	2	10	77468	77477	60 %	40 %	0 %	0 %	38505905
71	NC_005232	CCTTG	2	10	77807	77816	0 %	40 %	20 %	40 %	38505906
72	NC_005232	CCTGC	2	10	78037	78046	0 %	20 %	20 %	60 %	38505906
73	NC_005232	GAATT	2	10	79540	79549	40 %	40 %	20 %	0 %	38505909
74	NC_005232	AAAAC	2	10	79989	79998	80 %	0 %	0 %	20 %	38505910
75	NC_005232	GGAGT	2	10	83835	83844	20 %	20 %	60 %	0 %	38505915
76	NC_005232	GGGGT	2	10	85485	85494	0 %	20 %	80 %	0 %	38505915
77	NC_005232	AACTG	2	10	86130	86139	40 %	20 %	20 %	20 %	38505915
78	NC_005232	TTTTG	2	10	87182	87191	0 %	80 %	20 %	0 %	38505917
79	NC_005232	TTTCA	2	10	88862	88871	20 %	60 %	0 %	20 %	304569843
80	NC_005232	TTTGA	2	10	91390	91399	20 %	60 %	20 %	0 %	38505922
81	NC_005232	AGCCA	2	10	92798	92807	40 %	0 %	20 %	40 %	38505923
82	NC_005232	CCAAT	2	10	92862	92871	40 %	20 %	0 %	40 %	38505923
83	NC_005232	TAAAT	2	10	94698	94707	60 %	40 %	0 %	0 %	38505926
84	NC_005232	GTTCA	2	10	95082	95091	20 %	40 %	20 %	20 %	38505927
85	NC_005232	AGAAA	2	10	98081	98090	80 %	0 %	20 %	0 %	38505928
86	NC_005232	TCAGA	2	10	98356	98365	40 %	20 %	20 %	20 %	38505928

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.