MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	GACG	2	8	1410	1417	25 %	0 %	50 %	25 %	38505826
2	NC_005232	GATG	2	8	4462	4469	25 %	25 %	50 %	0 %	38505830
3	NC_005232	TCGG	2	8	4495	4502	0 %	25 %	50 %	25 %	38505830
4	NC_005232	CAAT	2	8	5146	5153	50 %	25 %	0 %	25 %	38505830
5	NC_005232	TGGC	2	8	5166	5173	0 %	25 %	50 %	25 %	38505830
6	NC_005232	TACC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	38505830
7	NC_005232	GGTT	2	8	5560	5567	0 %	50 %	50 %	0 %	38505831
8	NC_005232	GGGA	2	8	6482	6489	25 %	0 %	75 %	0 %	38505832
9	NC_005232	GTTG	2	8	6884	6891	0 %	50 %	50 %	0 %	38505832
10	NC_005232	GCTC	2	8	9616	9623	0 %	25 %	25 %	50 %	38505835
11	NC_005232	CTTT	2	8	9700	9707	0 %	75 %	0 %	25 %	38505835
12	NC_005232	GATT	2	8	9770	9777	25 %	50 %	25 %	0 %	38505835
13	NC_005232	CATT	2	8	9974	9981	25 %	50 %	0 %	25 %	38505835
14	NC_005232	AAGC	2	8	10563	10570	50 %	0 %	25 %	25 %	38505836
15	NC_005232	TGAC	2	8	10687	10694	25 %	25 %	25 %	25 %	38505836
16	NC_005232	GGCA	2	8	11655	11662	25 %	0 %	50 %	25 %	38505837
17	NC_005232	AGAA	2	8	11781	11788	75 %	0 %	25 %	0 %	38505837
18	NC_005232	AGAA	2	8	12057	12064	75 %	0 %	25 %	0 %	38505837
19	NC_005232	GTAG	2	8	12905	12912	25 %	25 %	50 %	0 %	38505837
20	NC_005232	ATGA	2	8	12977	12984	50 %	25 %	25 %	0 %	38505837
21	NC_005232	GAAT	2	8	13117	13124	50 %	25 %	25 %	0 %	38505837
22	NC_005232	TATT	2	8	13901	13908	25 %	75 %	0 %	0 %	38505838
23	NC_005232	ATTA	2	8	14350	14357	50 %	50 %	0 %	0 %	38505838
24	NC_005232	ACAG	2	8	14379	14386	50 %	0 %	25 %	25 %	38505838
25	NC_005232	ATTG	2	8	15053	15060	25 %	50 %	25 %	0 %	38505839
26	NC_005232	AGAA	2	8	15154	15161	75 %	0 %	25 %	0 %	38505839
27	NC_005232	GATT	2	8	15494	15501	25 %	50 %	25 %	0 %	38505839
28	NC_005232	AGGA	2	8	15664	15671	50 %	0 %	50 %	0 %	38505839
29	NC_005232	TCAA	2	8	16207	16214	50 %	25 %	0 %	25 %	38505839
30	NC_005232	AATT	2	8	17289	17296	50 %	50 %	0 %	0 %	38505840
31	NC_005232	TAGA	2	8	17361	17368	50 %	25 %	25 %	0 %	38505840
32	NC_005232	GGAA	2	8	17383	17390	50 %	0 %	50 %	0 %	38505840
33	NC_005232	AAAG	2	8	17431	17438	75 %	0 %	25 %	0 %	38505840
34	NC_005232	TTAT	2	8	18477	18484	25 %	75 %	0 %	0 %	38505841
35	NC_005232	TCTT	2	8	18976	18983	0 %	75 %	0 %	25 %	38505841
36	NC_005232	TCAA	2	8	19118	19125	50 %	25 %	0 %	25 %	38505841
37	NC_005232	AGCG	2	8	19139	19146	25 %	0 %	50 %	25 %	38505841
38	NC_005232	ACAA	2	8	19778	19785	75 %	0 %	0 %	25 %	38505841
39	NC_005232	TTAT	2	8	20277	20284	25 %	75 %	0 %	0 %	38505841
40	NC_005232	AATA	2	8	22031	22038	75 %	25 %	0 %	0 %	38505844
41	NC_005232	GAAA	2	8	22838	22845	75 %	0 %	25 %	0 %	38505846
42	NC_005232	GGTG	2	8	23179	23186	0 %	25 %	75 %	0 %	38505847
43	NC_005232	GTCG	2	8	23532	23539	0 %	25 %	50 %	25 %	38505847
44	NC_005232	CCGG	2	8	23576	23583	0 %	0 %	50 %	50 %	38505847
45	NC_005232	CGGC	2	8	23604	23611	0 %	0 %	50 %	50 %	38505847
46	NC_005232	CTTG	2	8	23716	23723	0 %	50 %	25 %	25 %	38505847
47	NC_005232	TGGT	2	8	23782	23789	0 %	50 %	50 %	0 %	38505847
48	NC_005232	AGAT	2	8	24016	24023	50 %	25 %	25 %	0 %	38505848
49	NC_005232	GGAA	2	8	24370	24377	50 %	0 %	50 %	0 %	38505849
50	NC_005232	TGCC	2	8	24661	24668	0 %	25 %	25 %	50 %	38505850
51	NC_005232	TTTA	2	8	25574	25581	25 %	75 %	0 %	0 %	38505852
52	NC_005232	TGAA	2	8	25683	25690	50 %	25 %	25 %	0 %	38505852
53	NC_005232	AATC	2	8	26384	26391	50 %	25 %	0 %	25 %	38505853
54	NC_005232	AAAG	2	8	26440	26447	75 %	0 %	25 %	0 %	38505853
55	NC_005232	CAGG	2	8	26999	27006	25 %	0 %	50 %	25 %	38505854
56	NC_005232	ATTG	2	8	27024	27031	25 %	50 %	25 %	0 %	38505854
57	NC_005232	AAAC	2	8	27125	27132	75 %	0 %	0 %	25 %	38505854
58	NC_005232	ACAG	2	8	27173	27180	50 %	0 %	25 %	25 %	38505854
59	NC_005232	TAAA	2	8	27240	27247	75 %	25 %	0 %	0 %	38505854
60	NC_005232	AACC	2	8	28970	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	38505856
61	NC_005232	ATCG	2	8	30240	30247	25 %	25 %	25 %	25 %	38505856
62	NC_005232	CCAT	2	8	30817	30824	25 %	25 %	0 %	50 %	38505856
63	NC_005232	ACAA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	0 %	25 %	38505857
64	NC_005232	AGAA	2	8	31745	31752	75 %	0 %	25 %	0 %	38505858
65	NC_005232	GTTT	2	8	32853	32860	0 %	75 %	25 %	0 %	38505860
66	NC_005232	TCAC	2	8	32963	32970	25 %	25 %	0 %	50 %	38505861
67	NC_005232	CATC	2	8	33224	33231	25 %	25 %	0 %	50 %	38505861
68	NC_005232	CCCA	2	8	33360	33367	25 %	0 %	0 %	75 %	38505861
69	NC_005232	TTGA	2	8	33943	33950	25 %	50 %	25 %	0 %	38505862
70	NC_005232	GAAG	2	8	33987	33994	50 %	0 %	50 %	0 %	38505862
71	NC_005232	CAAT	2	8	34864	34871	50 %	25 %	0 %	25 %	38505864
72	NC_005232	GATG	2	8	35296	35303	25 %	25 %	50 %	0 %	38505864
73	NC_005232	GCTA	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	38505865
74	NC_005232	TTAA	2	8	35681	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	38505865
75	NC_005232	AGCT	2	8	37927	37934	25 %	25 %	25 %	25 %	38505867
76	NC_005232	GCCC	2	8	38256	38263	0 %	0 %	25 %	75 %	38505867
77	NC_005232	TAAT	2	8	38386	38393	50 %	50 %	0 %	0 %	38505867
78	NC_005232	GTTT	2	8	38788	38795	0 %	75 %	25 %	0 %	38505867
79	NC_005232	GGTT	2	8	40323	40330	0 %	50 %	50 %	0 %	38505868
80	NC_005232	TATT	2	8	40608	40615	25 %	75 %	0 %	0 %	38505868
81	NC_005232	CACC	2	8	40760	40767	25 %	0 %	0 %	75 %	38505868
82	NC_005232	GGTT	2	8	40925	40932	0 %	50 %	50 %	0 %	38505868
83	NC_005232	GGAA	2	8	42136	42143	50 %	0 %	50 %	0 %	38505868
84	NC_005232	TATT	2	8	43328	43335	25 %	75 %	0 %	0 %	38505870
85	NC_005232	TATC	2	8	43502	43509	25 %	50 %	0 %	25 %	38505871
86	NC_005232	AAGG	2	8	43756	43763	50 %	0 %	50 %	0 %	38505872
87	NC_005232	CGAA	2	8	43949	43956	50 %	0 %	25 %	25 %	38505872
88	NC_005232	TGAT	2	8	44327	44334	25 %	50 %	25 %	0 %	38505872
89	NC_005232	TGGT	2	8	44531	44538	0 %	50 %	50 %	0 %	38505872
90	NC_005232	ATTA	2	8	44604	44611	50 %	50 %	0 %	0 %	38505872
91	NC_005232	TGCC	2	8	44717	44724	0 %	25 %	25 %	50 %	38505872
92	NC_005232	TGAT	2	8	44741	44748	25 %	50 %	25 %	0 %	38505872
93	NC_005232	CGAG	2	8	45111	45118	25 %	0 %	50 %	25 %	38505872
94	NC_005232	ATTT	2	8	45455	45462	25 %	75 %	0 %	0 %	38505872
95	NC_005232	ATCG	2	8	45502	45509	25 %	25 %	25 %	25 %	38505872
96	NC_005232	ATTT	2	8	45779	45786	25 %	75 %	0 %	0 %	38505872
97	NC_005232	GCGG	2	8	46227	46234	0 %	0 %	75 %	25 %	38505872
98	NC_005232	AATT	2	8	46310	46317	50 %	50 %	0 %	0 %	38505872
99	NC_005232	TGAG	2	8	47309	47316	25 %	25 %	50 %	0 %	38505873
100	NC_005232	TTAT	2	8	47538	47545	25 %	75 %	0 %	0 %	38505874
101	NC_005232	TGTT	2	8	48428	48435	0 %	75 %	25 %	0 %	38505875
102	NC_005232	TTCA	2	8	48439	48446	25 %	50 %	0 %	25 %	38505875
103	NC_005232	ATTC	2	8	48533	48540	25 %	50 %	0 %	25 %	38505875
104	NC_005232	GAAG	2	8	48852	48859	50 %	0 %	50 %	0 %	38505875
105	NC_005232	GAAA	2	8	48969	48976	75 %	0 %	25 %	0 %	38505875
106	NC_005232	AATC	2	8	49081	49088	50 %	25 %	0 %	25 %	38505875
107	NC_005232	GTTG	2	8	49611	49618	0 %	50 %	50 %	0 %	38505875
108	NC_005232	CGGG	2	8	49690	49697	0 %	0 %	75 %	25 %	38505875
109	NC_005232	GAAA	2	8	50010	50017	75 %	0 %	25 %	0 %	38505875
110	NC_005232	ACTT	2	8	50397	50404	25 %	50 %	0 %	25 %	38505875
111	NC_005232	TACA	2	8	50475	50482	50 %	25 %	0 %	25 %	38505875
112	NC_005232	AAAC	2	8	50823	50830	75 %	0 %	0 %	25 %	38505875
113	NC_005232	TGCT	2	8	51167	51174	0 %	50 %	25 %	25 %	38505876
114	NC_005232	AGTT	2	8	51248	51255	25 %	50 %	25 %	0 %	38505876
115	NC_005232	AACT	2	8	52160	52167	50 %	25 %	0 %	25 %	38505878
116	NC_005232	TCAG	2	8	52599	52606	25 %	25 %	25 %	25 %	38505878
117	NC_005232	TTCC	2	8	53318	53325	0 %	50 %	0 %	50 %	38505878
118	NC_005232	ATCA	2	8	53986	53993	50 %	25 %	0 %	25 %	38505880
119	NC_005232	ATAG	2	8	54102	54109	50 %	25 %	25 %	0 %	38505880
120	NC_005232	CTTC	2	8	54368	54375	0 %	50 %	0 %	50 %	38505881
121	NC_005232	AGGC	2	8	54665	54672	25 %	0 %	50 %	25 %	38505881
122	NC_005232	TAAT	2	8	54696	54703	50 %	50 %	0 %	0 %	38505881
123	NC_005232	ACCG	2	8	56000	56007	25 %	0 %	25 %	50 %	38505883
124	NC_005232	TGCC	2	8	56805	56812	0 %	25 %	25 %	50 %	38505884
125	NC_005232	TTCA	2	8	56827	56834	25 %	50 %	0 %	25 %	38505884
126	NC_005232	TCCT	2	8	57352	57359	0 %	50 %	0 %	50 %	38505885
127	NC_005232	GGAG	2	8	57745	57752	25 %	0 %	75 %	0 %	38505886
128	NC_005232	GATG	2	8	59180	59187	25 %	25 %	50 %	0 %	38505889
129	NC_005232	TCGG	2	8	59213	59220	0 %	25 %	50 %	25 %	38505889
130	NC_005232	CAAT	2	8	59864	59871	50 %	25 %	0 %	25 %	38505889
131	NC_005232	TGGC	2	8	59884	59891	0 %	25 %	50 %	25 %	38505889
132	NC_005232	TACC	2	8	59934	59941	25 %	25 %	0 %	50 %	38505889
133	NC_005232	GGTT	2	8	60278	60285	0 %	50 %	50 %	0 %	38505890
134	NC_005232	GGGA	2	8	61200	61207	25 %	0 %	75 %	0 %	38505891
135	NC_005232	GTTG	2	8	61602	61609	0 %	50 %	50 %	0 %	38505891
136	NC_005232	GCTC	2	8	64334	64341	0 %	25 %	25 %	50 %	38505894
137	NC_005232	CTTT	2	8	64418	64425	0 %	75 %	0 %	25 %	38505894
138	NC_005232	GATT	2	8	64488	64495	25 %	50 %	25 %	0 %	38505894
139	NC_005232	CATT	2	8	64692	64699	25 %	50 %	0 %	25 %	38505894
140	NC_005232	AAGC	2	8	65281	65288	50 %	0 %	25 %	25 %	38505895
141	NC_005232	TGAC	2	8	65405	65412	25 %	25 %	25 %	25 %	38505895
142	NC_005232	GGCA	2	8	66373	66380	25 %	0 %	50 %	25 %	38505896
143	NC_005232	AGAA	2	8	66499	66506	75 %	0 %	25 %	0 %	38505896
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.