MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	AG	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	38505826
2	NC_005232	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	38505826
3	NC_005232	AG	3	6	11719	11724	50 %	0 %	50 %	0 %	38505837
4	NC_005232	AG	3	6	12148	12153	50 %	0 %	50 %	0 %	38505837
5	NC_005232	AT	3	6	15002	15007	50 %	50 %	0 %	0 %	38505838
6	NC_005232	TA	3	6	15598	15603	50 %	50 %	0 %	0 %	38505839
7	NC_005232	AT	3	6	16123	16128	50 %	50 %	0 %	0 %	38505839
8	NC_005232	CT	3	6	16507	16512	0 %	50 %	0 %	50 %	38505840
9	NC_005232	AT	3	6	16975	16980	50 %	50 %	0 %	0 %	38505840
10	NC_005232	AT	3	6	17524	17529	50 %	50 %	0 %	0 %	38505840
11	NC_005232	CT	3	6	19065	19070	0 %	50 %	0 %	50 %	38505841
12	NC_005232	TG	3	6	20358	20363	0 %	50 %	50 %	0 %	38505841
13	NC_005232	GT	3	6	22534	22539	0 %	50 %	50 %	0 %	38505846
14	NC_005232	TG	3	6	22817	22822	0 %	50 %	50 %	0 %	38505846
15	NC_005232	CT	4	8	23350	23357	0 %	50 %	0 %	50 %	38505847
16	NC_005232	TC	3	6	23560	23565	0 %	50 %	0 %	50 %	38505847
17	NC_005232	TC	3	6	25582	25587	0 %	50 %	0 %	50 %	38505852
18	NC_005232	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	38505856
19	NC_005232	GA	3	6	33431	33436	50 %	0 %	50 %	0 %	38505861
20	NC_005232	AT	3	6	34802	34807	50 %	50 %	0 %	0 %	38505864
21	NC_005232	TC	3	6	41700	41705	0 %	50 %	0 %	50 %	38505868
22	NC_005232	CT	3	6	41950	41955	0 %	50 %	0 %	50 %	38505868
23	NC_005232	TC	3	6	44296	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	38505872
24	NC_005232	TG	4	8	44574	44581	0 %	50 %	50 %	0 %	38505872
25	NC_005232	AG	3	6	46094	46099	50 %	0 %	50 %	0 %	38505872
26	NC_005232	TG	4	8	47078	47085	0 %	50 %	50 %	0 %	38505872
27	NC_005232	AT	3	6	48360	48365	50 %	50 %	0 %	0 %	38505875
28	NC_005232	AT	3	6	48987	48992	50 %	50 %	0 %	0 %	38505875
29	NC_005232	TA	3	6	50588	50593	50 %	50 %	0 %	0 %	38505875
30	NC_005232	AT	3	6	50800	50805	50 %	50 %	0 %	0 %	38505875
31	NC_005232	CT	4	8	52876	52883	0 %	50 %	0 %	50 %	38505878
32	NC_005232	CA	4	8	52910	52917	50 %	0 %	0 %	50 %	38505878
33	NC_005232	TC	4	8	56076	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	38505883
34	NC_005232	TG	3	6	57559	57564	0 %	50 %	50 %	0 %	38505885
35	NC_005232	TC	3	6	57631	57636	0 %	50 %	0 %	50 %	38505885
36	NC_005232	AG	3	6	66437	66442	50 %	0 %	50 %	0 %	38505896
37	NC_005232	AG	3	6	66866	66871	50 %	0 %	50 %	0 %	38505896
38	NC_005232	AT	3	6	69720	69725	50 %	50 %	0 %	0 %	38505897
39	NC_005232	TA	3	6	70316	70321	50 %	50 %	0 %	0 %	38505898
40	NC_005232	AT	3	6	70841	70846	50 %	50 %	0 %	0 %	38505898
41	NC_005232	CT	3	6	71225	71230	0 %	50 %	0 %	50 %	38505899
42	NC_005232	AT	3	6	71693	71698	50 %	50 %	0 %	0 %	38505899
43	NC_005232	AT	3	6	72242	72247	50 %	50 %	0 %	0 %	38505899
44	NC_005232	CT	3	6	73783	73788	0 %	50 %	0 %	50 %	38505900
45	NC_005232	TG	3	6	75076	75081	0 %	50 %	50 %	0 %	38505900
46	NC_005232	GT	3	6	77252	77257	0 %	50 %	50 %	0 %	38505905
47	NC_005232	TG	3	6	77535	77540	0 %	50 %	50 %	0 %	38505905
48	NC_005232	CT	4	8	78068	78075	0 %	50 %	0 %	50 %	38505906
49	NC_005232	TC	3	6	78278	78283	0 %	50 %	0 %	50 %	38505906
50	NC_005232	TC	3	6	80300	80305	0 %	50 %	0 %	50 %	38505911
51	NC_005232	TG	3	6	89060	89065	0 %	50 %	50 %	0 %	304569843
52	NC_005232	AT	3	6	91112	91117	50 %	50 %	0 %	0 %	38505922
53	NC_005232	AG	3	6	93218	93223	50 %	0 %	50 %	0 %	38505923
54	NC_005232	GT	3	6	95394	95399	0 %	50 %	50 %	0 %	38505927
55	NC_005232	TA	3	6	95985	95990	50 %	50 %	0 %	0 %	38505927
56	NC_005232	TC	3	6	96504	96509	0 %	50 %	0 %	50 %	38505927
57	NC_005232	TA	3	6	98578	98583	50 %	50 %	0 %	0 %	38505928
58	NC_005232	AT	3	6	99713	99718	50 %	50 %	0 %	0 %	38505930
59	NC_005232	AG	3	6	100179	100184	50 %	0 %	50 %	0 %	38505930
60	NC_005232	TG	3	6	100499	100504	0 %	50 %	50 %	0 %	38505930
61	NC_005232	AG	3	6	100644	100649	50 %	0 %	50 %	0 %	38505931
62	NC_005232	TA	3	6	101105	101110	50 %	50 %	0 %	0 %	38505931
63	NC_005232	AT	3	6	102236	102241	50 %	50 %	0 %	0 %	38505932
64	NC_005232	TC	3	6	102514	102519	0 %	50 %	0 %	50 %	38505932
65	NC_005232	AT	3	6	102945	102950	50 %	50 %	0 %	0 %	38505933
66	NC_005232	AT	3	6	103369	103374	50 %	50 %	0 %	0 %	38505933

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.