MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	C	6	6	994	999	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
2	NC_005232	C	6	6	1269	1274	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
3	NC_005232	C	8	8	1282	1289	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
4	NC_005232	A	6	6	1909	1914	100 %	0 %	0 %	0 %	38505826
5	NC_005232	T	6	6	2463	2468	0 %	100 %	0 %	0 %	38505826
6	NC_005232	A	7	7	3785	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005232	A	7	7	3827	3833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005232	A	7	7	3847	3853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505828
9	NC_005232	A	6	6	4790	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	38505830
10	NC_005232	C	7	7	4838	4844	0 %	0 %	0 %	100 %	38505830
11	NC_005232	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	38505830
12	NC_005232	G	6	6	5808	5813	0 %	0 %	100 %	0 %	38505831
13	NC_005232	C	6	6	6875	6880	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
14	NC_005232	C	6	6	7021	7026	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
15	NC_005232	C	7	7	7063	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
16	NC_005232	T	6	6	7535	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005232	C	6	6	7892	7897	0 %	0 %	0 %	100 %	38505833
18	NC_005232	G	6	6	8271	8276	0 %	0 %	100 %	0 %	38505833
19	NC_005232	A	6	6	8848	8853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505834
20	NC_005232	T	6	6	9991	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	38505835
21	NC_005232	T	6	6	10267	10272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005232	T	7	7	11133	11139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005232	A	6	6	11169	11174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005232	T	6	6	11264	11269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005232	T	6	6	11304	11309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005232	A	7	7	11485	11491	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
27	NC_005232	A	7	7	11573	11579	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
28	NC_005232	A	6	6	11628	11633	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
29	NC_005232	A	8	8	11868	11875	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
30	NC_005232	A	7	7	12717	12723	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
31	NC_005232	T	6	6	13641	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
32	NC_005232	A	7	7	13754	13760	100 %	0 %	0 %	0 %	38505838
33	NC_005232	T	6	6	14565	14570	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
34	NC_005232	T	6	6	14676	14681	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
35	NC_005232	A	6	6	14762	14767	100 %	0 %	0 %	0 %	38505838
36	NC_005232	A	8	8	15519	15526	100 %	0 %	0 %	0 %	38505839
37	NC_005232	T	6	6	15799	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
38	NC_005232	T	7	7	15881	15887	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
39	NC_005232	T	6	6	15973	15978	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
40	NC_005232	T	6	6	16600	16605	0 %	100 %	0 %	0 %	38505840
41	NC_005232	A	6	6	17105	17110	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
42	NC_005232	T	6	6	17242	17247	0 %	100 %	0 %	0 %	38505840
43	NC_005232	A	6	6	17300	17305	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
44	NC_005232	A	6	6	17514	17519	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
45	NC_005232	T	6	6	18208	18213	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
46	NC_005232	A	8	8	18721	18728	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
47	NC_005232	A	6	6	18748	18753	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
48	NC_005232	A	6	6	19291	19296	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
49	NC_005232	A	6	6	19639	19644	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
50	NC_005232	T	6	6	19711	19716	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
51	NC_005232	T	6	6	19954	19959	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
52	NC_005232	T	6	6	20427	20432	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
53	NC_005232	T	6	6	21517	21522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005232	T	6	6	21530	21535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005232	A	6	6	21795	21800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005232	T	7	7	21873	21879	0 %	100 %	0 %	0 %	38505844
57	NC_005232	C	6	6	21893	21898	0 %	0 %	0 %	100 %	38505844
58	NC_005232	C	6	6	21945	21950	0 %	0 %	0 %	100 %	38505844
59	NC_005232	G	9	9	22071	22079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005232	T	6	6	22158	22163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005232	T	9	9	22238	22246	0 %	100 %	0 %	0 %	38505845
62	NC_005232	T	6	6	22278	22283	0 %	100 %	0 %	0 %	38505845
63	NC_005232	A	6	6	22303	22308	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
64	NC_005232	A	9	9	22344	22352	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
65	NC_005232	A	6	6	22373	22378	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
66	NC_005232	A	6	6	22415	22420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005232	A	6	6	22480	22485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005232	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
69	NC_005232	A	6	6	22512	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
70	NC_005232	A	6	6	22636	22641	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
71	NC_005232	A	6	6	22787	22792	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
72	NC_005232	A	7	7	22883	22889	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
73	NC_005232	A	6	6	22950	22955	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
74	NC_005232	T	6	6	22962	22967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005232	C	6	6	22978	22983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_005232	T	6	6	23068	23073	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
77	NC_005232	G	8	8	23147	23154	0 %	0 %	100 %	0 %	38505847
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80	NC_005232	T	6	6	23593	23598	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
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82	NC_005232	G	6	6	23776	23781	0 %	0 %	100 %	0 %	38505847
83	NC_005232	T	6	6	23980	23985	0 %	100 %	0 %	0 %	38505848
84	NC_005232	T	6	6	24629	24634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005232	T	6	6	25207	25212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005232	C	6	6	25494	25499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_005232	C	6	6	26052	26057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_005232	A	8	8	26686	26693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005232	C	6	6	26788	26793	0 %	0 %	0 %	100 %	38505854
90	NC_005232	A	7	7	26808	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	38505854
91	NC_005232	G	6	6	26900	26905	0 %	0 %	100 %	0 %	38505854
92	NC_005232	T	6	6	27392	27397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005232	T	6	6	27490	27495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005232	A	6	6	27551	27556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005232	A	6	6	27650	27655	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
96	NC_005232	A	6	6	27666	27671	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
97	NC_005232	A	7	7	27689	27695	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
98	NC_005232	C	6	6	28003	28008	0 %	0 %	0 %	100 %	38505856
99	NC_005232	A	6	6	28261	28266	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
100	NC_005232	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	38505856
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102	NC_005232	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
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108	NC_005232	T	6	6	33664	33669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005232	A	6	6	33693	33698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005232	A	6	6	33834	33839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005232	G	6	6	37127	37132	0 %	0 %	100 %	0 %	38505866
112	NC_005232	G	6	6	37763	37768	0 %	0 %	100 %	0 %	38505867
113	NC_005232	A	6	6	38866	38871	100 %	0 %	0 %	0 %	38505867
114	NC_005232	G	6	6	38951	38956	0 %	0 %	100 %	0 %	38505867
115	NC_005232	C	6	6	39288	39293	0 %	0 %	0 %	100 %	38505868
116	NC_005232	G	7	7	39839	39845	0 %	0 %	100 %	0 %	38505868
117	NC_005232	T	6	6	40516	40521	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
118	NC_005232	T	6	6	40800	40805	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
119	NC_005232	T	7	7	40843	40849	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
120	NC_005232	A	6	6	41692	41697	100 %	0 %	0 %	0 %	38505868
121	NC_005232	G	6	6	41909	41914	0 %	0 %	100 %	0 %	38505868
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126	NC_005232	A	6	6	46810	46815	100 %	0 %	0 %	0 %	38505872
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131	NC_005232	A	6	6	49984	49989	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
132	NC_005232	A	6	6	50540	50545	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
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134	NC_005232	A	6	6	50572	50577	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
135	NC_005232	T	6	6	50618	50623	0 %	100 %	0 %	0 %	38505875
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145	NC_005232	A	6	6	54346	54351	100 %	0 %	0 %	0 %	38505881
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.