MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	C	6	6	994	999	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
2	NC_005232	C	6	6	1269	1274	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
3	NC_005232	C	8	8	1282	1289	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
4	NC_005232	A	6	6	1909	1914	100 %	0 %	0 %	0 %	38505826
5	NC_005232	T	6	6	2463	2468	0 %	100 %	0 %	0 %	38505826
6	NC_005232	A	7	7	3847	3853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505828
7	NC_005232	A	6	6	4790	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	38505830
8	NC_005232	C	7	7	4838	4844	0 %	0 %	0 %	100 %	38505830
9	NC_005232	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	38505830
10	NC_005232	G	6	6	5808	5813	0 %	0 %	100 %	0 %	38505831
11	NC_005232	C	6	6	6875	6880	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
12	NC_005232	C	6	6	7021	7026	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
13	NC_005232	C	7	7	7063	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
14	NC_005232	C	6	6	7892	7897	0 %	0 %	0 %	100 %	38505833
15	NC_005232	G	6	6	8271	8276	0 %	0 %	100 %	0 %	38505833
16	NC_005232	A	6	6	8848	8853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505834
17	NC_005232	T	6	6	9991	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	38505835
18	NC_005232	A	7	7	11485	11491	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
19	NC_005232	A	7	7	11573	11579	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
20	NC_005232	A	6	6	11628	11633	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
21	NC_005232	A	8	8	11868	11875	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
22	NC_005232	A	7	7	12717	12723	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
23	NC_005232	T	6	6	13641	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
24	NC_005232	A	7	7	13754	13760	100 %	0 %	0 %	0 %	38505838
25	NC_005232	T	6	6	14565	14570	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
26	NC_005232	T	6	6	14676	14681	0 %	100 %	0 %	0 %	38505838
27	NC_005232	A	6	6	14762	14767	100 %	0 %	0 %	0 %	38505838
28	NC_005232	A	8	8	15519	15526	100 %	0 %	0 %	0 %	38505839
29	NC_005232	T	6	6	15799	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
30	NC_005232	T	7	7	15881	15887	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
31	NC_005232	T	6	6	15973	15978	0 %	100 %	0 %	0 %	38505839
32	NC_005232	T	6	6	16600	16605	0 %	100 %	0 %	0 %	38505840
33	NC_005232	A	6	6	17105	17110	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
34	NC_005232	T	6	6	17242	17247	0 %	100 %	0 %	0 %	38505840
35	NC_005232	A	6	6	17300	17305	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
36	NC_005232	A	6	6	17514	17519	100 %	0 %	0 %	0 %	38505840
37	NC_005232	T	6	6	18208	18213	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
38	NC_005232	A	8	8	18721	18728	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
39	NC_005232	A	6	6	18748	18753	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
40	NC_005232	A	6	6	19291	19296	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
41	NC_005232	A	6	6	19639	19644	100 %	0 %	0 %	0 %	38505841
42	NC_005232	T	6	6	19711	19716	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
43	NC_005232	T	6	6	19954	19959	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
44	NC_005232	T	6	6	20427	20432	0 %	100 %	0 %	0 %	38505841
45	NC_005232	T	7	7	21873	21879	0 %	100 %	0 %	0 %	38505844
46	NC_005232	C	6	6	21893	21898	0 %	0 %	0 %	100 %	38505844
47	NC_005232	C	6	6	21945	21950	0 %	0 %	0 %	100 %	38505844
48	NC_005232	T	9	9	22238	22246	0 %	100 %	0 %	0 %	38505845
49	NC_005232	T	6	6	22278	22283	0 %	100 %	0 %	0 %	38505845
50	NC_005232	A	6	6	22303	22308	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
51	NC_005232	A	9	9	22344	22352	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
52	NC_005232	A	6	6	22373	22378	100 %	0 %	0 %	0 %	38505845
53	NC_005232	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
54	NC_005232	A	6	6	22512	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
55	NC_005232	A	6	6	22636	22641	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
56	NC_005232	A	6	6	22787	22792	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
57	NC_005232	A	7	7	22883	22889	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
58	NC_005232	A	6	6	22950	22955	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
59	NC_005232	T	6	6	23068	23073	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
60	NC_005232	G	8	8	23147	23154	0 %	0 %	100 %	0 %	38505847
61	NC_005232	T	6	6	23481	23486	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
62	NC_005232	G	6	6	23505	23510	0 %	0 %	100 %	0 %	38505847
63	NC_005232	T	6	6	23593	23598	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
64	NC_005232	C	6	6	23732	23737	0 %	0 %	0 %	100 %	38505847
65	NC_005232	G	6	6	23776	23781	0 %	0 %	100 %	0 %	38505847
66	NC_005232	T	6	6	23980	23985	0 %	100 %	0 %	0 %	38505848
67	NC_005232	C	6	6	26788	26793	0 %	0 %	0 %	100 %	38505854
68	NC_005232	A	7	7	26808	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	38505854
69	NC_005232	G	6	6	26900	26905	0 %	0 %	100 %	0 %	38505854
70	NC_005232	A	6	6	27650	27655	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
71	NC_005232	A	6	6	27666	27671	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
72	NC_005232	A	7	7	27689	27695	100 %	0 %	0 %	0 %	38505855
73	NC_005232	C	6	6	28003	28008	0 %	0 %	0 %	100 %	38505856
74	NC_005232	A	6	6	28261	28266	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
75	NC_005232	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	38505856
76	NC_005232	A	7	7	29239	29245	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
77	NC_005232	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
78	NC_005232	C	6	6	30886	30891	0 %	0 %	0 %	100 %	38505856
79	NC_005232	T	6	6	32206	32211	0 %	100 %	0 %	0 %	38505859
80	NC_005232	T	6	6	32716	32721	0 %	100 %	0 %	0 %	38505860
81	NC_005232	G	6	6	37127	37132	0 %	0 %	100 %	0 %	38505866
82	NC_005232	G	6	6	37763	37768	0 %	0 %	100 %	0 %	38505867
83	NC_005232	A	6	6	38866	38871	100 %	0 %	0 %	0 %	38505867
84	NC_005232	G	6	6	38951	38956	0 %	0 %	100 %	0 %	38505867
85	NC_005232	C	6	6	39288	39293	0 %	0 %	0 %	100 %	38505868
86	NC_005232	G	7	7	39839	39845	0 %	0 %	100 %	0 %	38505868
87	NC_005232	T	6	6	40516	40521	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
88	NC_005232	T	6	6	40800	40805	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
89	NC_005232	T	7	7	40843	40849	0 %	100 %	0 %	0 %	38505868
90	NC_005232	A	6	6	41692	41697	100 %	0 %	0 %	0 %	38505868
91	NC_005232	G	6	6	41909	41914	0 %	0 %	100 %	0 %	38505868
92	NC_005232	G	6	6	42173	42178	0 %	0 %	100 %	0 %	38505868
93	NC_005232	A	6	6	42805	42810	100 %	0 %	0 %	0 %	38505869
94	NC_005232	A	6	6	45319	45324	100 %	0 %	0 %	0 %	38505872
95	NC_005232	T	6	6	46384	46389	0 %	100 %	0 %	0 %	38505872
96	NC_005232	A	6	6	46810	46815	100 %	0 %	0 %	0 %	38505872
97	NC_005232	A	6	6	48283	48288	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
98	NC_005232	T	7	7	48645	48651	0 %	100 %	0 %	0 %	38505875
99	NC_005232	T	6	6	48724	48729	0 %	100 %	0 %	0 %	38505875
100	NC_005232	A	6	6	49984	49989	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
101	NC_005232	A	6	6	50540	50545	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
102	NC_005232	A	7	7	50553	50559	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
103	NC_005232	A	6	6	50572	50577	100 %	0 %	0 %	0 %	38505875
104	NC_005232	T	6	6	50618	50623	0 %	100 %	0 %	0 %	38505875
105	NC_005232	A	7	7	51182	51188	100 %	0 %	0 %	0 %	38505876
106	NC_005232	T	6	6	51829	51834	0 %	100 %	0 %	0 %	38505877
107	NC_005232	T	6	6	52103	52108	0 %	100 %	0 %	0 %	38505878
108	NC_005232	T	7	7	53246	53252	0 %	100 %	0 %	0 %	38505878
109	NC_005232	C	6	6	53457	53462	0 %	0 %	0 %	100 %	38505879
110	NC_005232	A	6	6	53682	53687	100 %	0 %	0 %	0 %	38505879
111	NC_005232	A	6	6	53768	53773	100 %	0 %	0 %	0 %	38505879
112	NC_005232	A	6	6	53813	53818	100 %	0 %	0 %	0 %	38505880
113	NC_005232	T	6	6	54135	54140	0 %	100 %	0 %	0 %	38505880
114	NC_005232	A	6	6	54346	54351	100 %	0 %	0 %	0 %	38505881
115	NC_005232	G	6	6	56029	56034	0 %	0 %	100 %	0 %	38505883
116	NC_005232	C	6	6	56435	56440	0 %	0 %	0 %	100 %	38505884
117	NC_005232	T	6	6	56633	56638	0 %	100 %	0 %	0 %	38505884
118	NC_005232	A	6	6	57223	57228	100 %	0 %	0 %	0 %	38505885
119	NC_005232	T	6	6	57283	57288	0 %	100 %	0 %	0 %	38505885
120	NC_005232	T	6	6	57431	57436	0 %	100 %	0 %	0 %	38505885
121	NC_005232	A	6	6	59508	59513	100 %	0 %	0 %	0 %	38505889
122	NC_005232	C	7	7	59556	59562	0 %	0 %	0 %	100 %	38505889
123	NC_005232	T	6	6	59747	59752	0 %	100 %	0 %	0 %	38505889
124	NC_005232	G	6	6	60526	60531	0 %	0 %	100 %	0 %	38505890
125	NC_005232	C	6	6	61593	61598	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
126	NC_005232	C	6	6	61739	61744	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
127	NC_005232	C	7	7	61781	61787	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
128	NC_005232	C	6	6	62610	62615	0 %	0 %	0 %	100 %	38505892
129	NC_005232	G	6	6	62989	62994	0 %	0 %	100 %	0 %	38505892
130	NC_005232	A	6	6	63566	63571	100 %	0 %	0 %	0 %	38505893
131	NC_005232	T	6	6	64709	64714	0 %	100 %	0 %	0 %	38505894
132	NC_005232	A	7	7	66203	66209	100 %	0 %	0 %	0 %	38505896
133	NC_005232	A	7	7	66291	66297	100 %	0 %	0 %	0 %	38505896
134	NC_005232	A	6	6	66346	66351	100 %	0 %	0 %	0 %	38505896
135	NC_005232	A	8	8	66586	66593	100 %	0 %	0 %	0 %	38505896
136	NC_005232	A	7	7	67435	67441	100 %	0 %	0 %	0 %	38505896
137	NC_005232	T	6	6	68359	68364	0 %	100 %	0 %	0 %	38505897
138	NC_005232	A	7	7	68472	68478	100 %	0 %	0 %	0 %	38505897
139	NC_005232	T	6	6	69283	69288	0 %	100 %	0 %	0 %	38505897
140	NC_005232	T	6	6	69394	69399	0 %	100 %	0 %	0 %	38505897
141	NC_005232	A	6	6	69480	69485	100 %	0 %	0 %	0 %	38505897
142	NC_005232	A	8	8	70237	70244	100 %	0 %	0 %	0 %	38505898
143	NC_005232	T	6	6	70517	70522	0 %	100 %	0 %	0 %	38505898
144	NC_005232	T	7	7	70599	70605	0 %	100 %	0 %	0 %	38505898
145	NC_005232	T	6	6	70691	70696	0 %	100 %	0 %	0 %	38505898
146	NC_005232	T	6	6	71318	71323	0 %	100 %	0 %	0 %	38505899
147	NC_005232	A	6	6	71823	71828	100 %	0 %	0 %	0 %	38505899
148	NC_005232	T	6	6	71960	71965	0 %	100 %	0 %	0 %	38505899
149	NC_005232	A	6	6	72018	72023	100 %	0 %	0 %	0 %	38505899
150	NC_005232	A	6	6	72232	72237	100 %	0 %	0 %	0 %	38505899
151	NC_005232	T	6	6	72926	72931	0 %	100 %	0 %	0 %	38505900
152	NC_005232	A	8	8	73439	73446	100 %	0 %	0 %	0 %	38505900
153	NC_005232	A	6	6	73466	73471	100 %	0 %	0 %	0 %	38505900
154	NC_005232	A	6	6	74009	74014	100 %	0 %	0 %	0 %	38505900
155	NC_005232	A	6	6	74357	74362	100 %	0 %	0 %	0 %	38505900
156	NC_005232	T	6	6	74429	74434	0 %	100 %	0 %	0 %	38505900
157	NC_005232	T	6	6	74672	74677	0 %	100 %	0 %	0 %	38505900
158	NC_005232	T	6	6	75145	75150	0 %	100 %	0 %	0 %	38505900
159	NC_005232	T	7	7	76591	76597	0 %	100 %	0 %	0 %	38505903
160	NC_005232	C	6	6	76611	76616	0 %	0 %	0 %	100 %	38505903
161	NC_005232	C	6	6	76663	76668	0 %	0 %	0 %	100 %	38505903
162	NC_005232	T	9	9	76956	76964	0 %	100 %	0 %	0 %	38505904
163	NC_005232	T	6	6	76996	77001	0 %	100 %	0 %	0 %	38505904
164	NC_005232	A	6	6	77021	77026	100 %	0 %	0 %	0 %	38505904
165	NC_005232	A	9	9	77062	77070	100 %	0 %	0 %	0 %	38505904
166	NC_005232	A	6	6	77091	77096	100 %	0 %	0 %	0 %	38505904
167	NC_005232	A	6	6	77211	77216	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
168	NC_005232	A	6	6	77230	77235	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
169	NC_005232	A	6	6	77354	77359	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
170	NC_005232	A	6	6	77505	77510	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
171	NC_005232	A	7	7	77601	77607	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
172	NC_005232	A	6	6	77668	77673	100 %	0 %	0 %	0 %	38505905
173	NC_005232	T	6	6	77786	77791	0 %	100 %	0 %	0 %	38505906
174	NC_005232	G	8	8	77865	77872	0 %	0 %	100 %	0 %	38505906
175	NC_005232	T	6	6	78199	78204	0 %	100 %	0 %	0 %	38505906
176	NC_005232	G	6	6	78223	78228	0 %	0 %	100 %	0 %	38505906
177	NC_005232	T	6	6	78311	78316	0 %	100 %	0 %	0 %	38505906
178	NC_005232	C	6	6	78450	78455	0 %	0 %	0 %	100 %	38505906
179	NC_005232	G	6	6	78494	78499	0 %	0 %	100 %	0 %	38505906
180	NC_005232	T	6	6	78698	78703	0 %	100 %	0 %	0 %	38505907
181	NC_005232	C	6	6	81506	81511	0 %	0 %	0 %	100 %	38505913
182	NC_005232	A	7	7	81526	81532	100 %	0 %	0 %	0 %	38505913
183	NC_005232	G	6	6	81618	81623	0 %	0 %	100 %	0 %	38505913
184	NC_005232	A	6	6	82368	82373	100 %	0 %	0 %	0 %	38505914
185	NC_005232	A	6	6	82384	82389	100 %	0 %	0 %	0 %	38505914
186	NC_005232	A	7	7	82407	82413	100 %	0 %	0 %	0 %	38505914
187	NC_005232	C	6	6	82721	82726	0 %	0 %	0 %	100 %	38505915
188	NC_005232	A	6	6	82979	82984	100 %	0 %	0 %	0 %	38505915
189	NC_005232	T	6	6	83673	83678	0 %	100 %	0 %	0 %	38505915
190	NC_005232	A	7	7	84302	84308	100 %	0 %	0 %	0 %	38505915
191	NC_005232	A	6	6	86691	86696	100 %	0 %	0 %	0 %	38505916
192	NC_005232	T	7	7	87136	87142	0 %	100 %	0 %	0 %	38505917
193	NC_005232	T	7	7	87249	87255	0 %	100 %	0 %	0 %	38505917
194	NC_005232	A	7	7	88140	88146	100 %	0 %	0 %	0 %	38505919
195	NC_005232	T	6	6	88667	88672	0 %	100 %	0 %	0 %	304569843
196	NC_005232	G	8	8	88972	88979	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
197	NC_005232	G	7	7	89071	89077	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
198	NC_005232	A	6	6	89709	89714	100 %	0 %	0 %	0 %	304569843
199	NC_005232	G	7	7	89875	89881	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
200	NC_005232	T	6	6	89996	90001	0 %	100 %	0 %	0 %	38505921
201	NC_005232	T	6	6	90171	90176	0 %	100 %	0 %	0 %	38505921
202	NC_005232	A	7	7	92075	92081	100 %	0 %	0 %	0 %	38505922
203	NC_005232	A	7	7	92184	92190	100 %	0 %	0 %	0 %	38505922
204	NC_005232	A	6	6	92224	92229	100 %	0 %	0 %	0 %	38505922
205	NC_005232	A	6	6	92588	92593	100 %	0 %	0 %	0 %	38505923
206	NC_005232	A	6	6	92724	92729	100 %	0 %	0 %	0 %	38505923
207	NC_005232	C	7	7	94317	94323	0 %	0 %	0 %	100 %	38505926
208	NC_005232	T	6	6	94659	94664	0 %	100 %	0 %	0 %	38505926
209	NC_005232	A	7	7	94775	94781	100 %	0 %	0 %	0 %	38505927
210	NC_005232	C	6	6	95151	95156	0 %	0 %	0 %	100 %	38505927
211	NC_005232	A	6	6	96747	96752	100 %	0 %	0 %	0 %	38505927
212	NC_005232	A	6	6	97221	97226	100 %	0 %	0 %	0 %	38505927
213	NC_005232	C	7	7	97354	97360	0 %	0 %	0 %	100 %	38505927
214	NC_005232	T	6	6	97644	97649	0 %	100 %	0 %	0 %	38505927
215	NC_005232	A	6	6	99290	99295	100 %	0 %	0 %	0 %	38505929
216	NC_005232	T	6	6	99296	99301	0 %	100 %	0 %	0 %	38505929
217	NC_005232	A	7	7	99360	99366	100 %	0 %	0 %	0 %	38505929
218	NC_005232	A	7	7	99477	99483	100 %	0 %	0 %	0 %	38505929
219	NC_005232	A	7	7	99739	99745	100 %	0 %	0 %	0 %	38505930
220	NC_005232	A	6	6	99783	99788	100 %	0 %	0 %	0 %	38505930
221	NC_005232	G	6	6	99942	99947	0 %	0 %	100 %	0 %	38505930
222	NC_005232	A	6	6	100277	100282	100 %	0 %	0 %	0 %	38505930
223	NC_005232	A	7	7	100297	100303	100 %	0 %	0 %	0 %	38505930
224	NC_005232	A	6	6	100505	100510	100 %	0 %	0 %	0 %	38505930
225	NC_005232	A	6	6	100736	100741	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
226	NC_005232	A	6	6	100784	100789	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
227	NC_005232	A	7	7	101223	101229	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
228	NC_005232	A	6	6	101492	101497	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
229	NC_005232	A	6	6	101566	101571	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
230	NC_005232	A	7	7	101629	101635	100 %	0 %	0 %	0 %	38505931
231	NC_005232	A	7	7	103012	103018	100 %	0 %	0 %	0 %	38505933
232	NC_005232	T	6	6	103305	103310	0 %	100 %	0 %	0 %	38505933
233	NC_005232	A	6	6	103552	103557	100 %	0 %	0 %	0 %	38505933
234	NC_005232	T	6	6	103713	103718	0 %	100 %	0 %	0 %	38505933
235	NC_005232	C	6	6	103934	103939	0 %	0 %	0 %	100 %	38505934
236	NC_005232	T	6	6	104129	104134	0 %	100 %	0 %	0 %	38505934

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.