MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005231	TTCC	2	8	630	637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005231	GCCT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005231	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	38505776
4	NC_005231	CTGC	2	8	3129	3136	0 %	25 %	25 %	50 %	38505777
5	NC_005231	TTGC	2	8	4885	4892	0 %	50 %	25 %	25 %	38505781
6	NC_005231	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	38505781
7	NC_005231	TTCC	2	8	5933	5940	0 %	50 %	0 %	50 %	38505781
8	NC_005231	AGTC	2	8	7662	7669	25 %	25 %	25 %	25 %	38505784
9	NC_005231	CTAA	2	8	8736	8743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005231	CCCT	2	8	9088	9095	0 %	25 %	0 %	75 %	38505786
11	NC_005231	TCGT	2	8	9574	9581	0 %	50 %	25 %	25 %	38505787
12	NC_005231	TATT	2	8	9676	9683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005231	GAAG	2	8	9760	9767	50 %	0 %	50 %	0 %	38505788
14	NC_005231	ACTT	2	8	9982	9989	25 %	50 %	0 %	25 %	38505789
15	NC_005231	TGTT	2	8	10868	10875	0 %	75 %	25 %	0 %	38505790
16	NC_005231	GAAG	2	8	11090	11097	50 %	0 %	50 %	0 %	38505791
17	NC_005231	GACA	2	8	11223	11230	50 %	0 %	25 %	25 %	38505791
18	NC_005231	CCAT	2	8	11814	11821	25 %	25 %	0 %	50 %	38505791
19	NC_005231	ACAG	2	8	12163	12170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005231	GGAA	2	8	12281	12288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005231	AAAG	2	8	12688	12695	75 %	0 %	25 %	0 %	38505792
22	NC_005231	AGGT	2	8	13796	13803	25 %	25 %	50 %	0 %	38505793
23	NC_005231	TGGT	2	8	14103	14110	0 %	50 %	50 %	0 %	38505793
24	NC_005231	TAGC	2	8	14161	14168	25 %	25 %	25 %	25 %	38505793
25	NC_005231	AACC	2	8	14255	14262	50 %	0 %	0 %	50 %	38505793
26	NC_005231	TTCT	2	8	14398	14405	0 %	75 %	0 %	25 %	38505793
27	NC_005231	TGAG	2	8	15240	15247	25 %	25 %	50 %	0 %	38505793
28	NC_005231	CCTC	2	8	15401	15408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_005231	ACAA	2	8	15529	15536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_005231	TAAG	2	8	15680	15687	50 %	25 %	25 %	0 %	38505794
31	NC_005231	TCTT	2	8	15888	15895	0 %	75 %	0 %	25 %	38505794
32	NC_005231	GTTG	2	8	17719	17726	0 %	50 %	50 %	0 %	38505795
33	NC_005231	CTAG	2	8	19304	19311	25 %	25 %	25 %	25 %	38505796
34	NC_005231	AAGC	2	8	19942	19949	50 %	0 %	25 %	25 %	38505798
35	NC_005231	GCTG	2	8	20405	20412	0 %	25 %	50 %	25 %	38505798
36	NC_005231	GGTT	2	8	20817	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	38505798
37	NC_005231	CCAA	2	8	22007	22014	50 %	0 %	0 %	50 %	38505800
38	NC_005231	CAGC	2	8	22293	22300	25 %	0 %	25 %	50 %	38505800
39	NC_005231	TAGT	2	8	22353	22360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005231	CTAA	2	8	22442	22449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005231	GTTG	2	8	22748	22755	0 %	50 %	50 %	0 %	38505801
42	NC_005231	GTTG	2	8	22820	22827	0 %	50 %	50 %	0 %	38505801
43	NC_005231	CATT	2	8	22900	22907	25 %	50 %	0 %	25 %	38505801
44	NC_005231	ACCC	2	8	23106	23113	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_005231	GGAA	2	8	23481	23488	50 %	0 %	50 %	0 %	38505802
46	NC_005231	GTAA	2	8	23643	23650	50 %	25 %	25 %	0 %	38505802
47	NC_005231	AAGC	2	8	23700	23707	50 %	0 %	25 %	25 %	38505802
48	NC_005231	TGAC	2	8	23859	23866	25 %	25 %	25 %	25 %	38505802
49	NC_005231	CTTA	2	8	24119	24126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005231	ATGG	2	8	24661	24668	25 %	25 %	50 %	0 %	38505804
51	NC_005231	GGAT	2	8	25311	25318	25 %	25 %	50 %	0 %	38505805
52	NC_005231	AATA	2	8	26083	26090	75 %	25 %	0 %	0 %	38505805
53	NC_005231	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	38505805
54	NC_005231	CGAT	2	8	26799	26806	25 %	25 %	25 %	25 %	38505805
55	NC_005231	TTGG	2	8	26822	26829	0 %	50 %	50 %	0 %	38505805
56	NC_005231	CGAT	2	8	26897	26904	25 %	25 %	25 %	25 %	38505805
57	NC_005231	TCAG	2	8	27113	27120	25 %	25 %	25 %	25 %	38505805
58	NC_005231	GCAT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	38505808
59	NC_005231	CCTA	2	8	32000	32007	25 %	25 %	0 %	50 %	38505812
60	NC_005231	TAAT	2	8	32021	32028	50 %	50 %	0 %	0 %	38505812
61	NC_005231	ACGG	2	8	33062	33069	25 %	0 %	50 %	25 %	38505813
62	NC_005231	GATC	2	8	33387	33394	25 %	25 %	25 %	25 %	38505813
63	NC_005231	ATTT	2	8	33809	33816	25 %	75 %	0 %	0 %	38505813
64	NC_005231	CTGG	2	8	33930	33937	0 %	25 %	50 %	25 %	38505813
65	NC_005231	GGTA	2	8	34341	34348	25 %	25 %	50 %	0 %	38505813
66	NC_005231	CTGG	2	8	35166	35173	0 %	25 %	50 %	25 %	38505813
67	NC_005231	ACCA	2	8	35285	35292	50 %	0 %	0 %	50 %	38505813
68	NC_005231	GAAT	2	8	36272	36279	50 %	25 %	25 %	0 %	38505813
69	NC_005231	AATT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	38505814
70	NC_005231	CTAC	2	8	37089	37096	25 %	25 %	0 %	50 %	38505814
71	NC_005231	GATA	2	8	37709	37716	50 %	25 %	25 %	0 %	38505815
72	NC_005231	TGAT	2	8	38176	38183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005231	ATTT	2	8	38309	38316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005231	ACAG	2	8	38369	38376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005231	CAAG	2	8	38381	38388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005231	GAGG	2	8	38790	38797	25 %	0 %	75 %	0 %	38505817
77	NC_005231	TTTC	2	8	39091	39098	0 %	75 %	0 %	25 %	38505818
78	NC_005231	GACA	2	8	39727	39734	50 %	0 %	25 %	25 %	38505819
79	NC_005231	GAAA	2	8	41373	41380	75 %	0 %	25 %	0 %	38505820
80	NC_005231	CCCT	2	8	41673	41680	0 %	25 %	0 %	75 %	38505821
81	NC_005231	AAAC	2	8	41948	41955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005231	CTAT	2	8	42261	42268	25 %	50 %	0 %	25 %	38505823
83	NC_005231	AGGC	2	8	42339	42346	25 %	0 %	50 %	25 %	38505823
84	NC_005231	CAAG	2	8	42735	42742	50 %	0 %	25 %	25 %	38505823
85	NC_005231	GGTC	2	8	44079	44086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.