MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005231	CA	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	38505776
2	NC_005231	CA	3	6	3412	3417	50 %	0 %	0 %	50 %	38505777
3	NC_005231	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	38505777
4	NC_005231	AG	3	6	3919	3924	50 %	0 %	50 %	0 %	38505779
5	NC_005231	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	38505779
6	NC_005231	TC	3	6	4377	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	38505779
7	NC_005231	CA	3	6	6928	6933	50 %	0 %	0 %	50 %	38505784
8	NC_005231	AG	3	6	7696	7701	50 %	0 %	50 %	0 %	38505784
9	NC_005231	GA	3	6	8720	8725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005231	AT	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	38505786
11	NC_005231	AG	4	8	9992	9999	50 %	0 %	50 %	0 %	38505789
12	NC_005231	AT	3	6	11549	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	38505791
13	NC_005231	AG	3	6	11883	11888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005231	GA	3	6	12930	12935	50 %	0 %	50 %	0 %	38505792
15	NC_005231	CA	3	6	13270	13275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005231	AG	3	6	13280	13285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005231	GA	4	8	15544	15551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005231	CT	3	6	16662	16667	0 %	50 %	0 %	50 %	38505794
19	NC_005231	CT	3	6	17509	17514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005231	AT	3	6	17600	17605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005231	AC	3	6	17788	17793	50 %	0 %	0 %	50 %	38505795
22	NC_005231	CT	4	8	17938	17945	0 %	50 %	0 %	50 %	38505795
23	NC_005231	TC	3	6	18454	18459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_005231	GA	3	6	19959	19964	50 %	0 %	50 %	0 %	38505798
25	NC_005231	TC	3	6	20390	20395	0 %	50 %	0 %	50 %	38505798
26	NC_005231	GT	3	6	20516	20521	0 %	50 %	50 %	0 %	38505798
27	NC_005231	AT	3	6	21657	21662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005231	AT	4	8	21666	21673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005231	AG	4	8	21975	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	38505800
30	NC_005231	AG	3	6	22828	22833	50 %	0 %	50 %	0 %	38505801
31	NC_005231	CT	3	6	23665	23670	0 %	50 %	0 %	50 %	38505802
32	NC_005231	AT	3	6	24814	24819	50 %	50 %	0 %	0 %	38505804
33	NC_005231	AT	3	6	25515	25520	50 %	50 %	0 %	0 %	38505805
34	NC_005231	CT	3	6	25670	25675	0 %	50 %	0 %	50 %	38505805
35	NC_005231	GC	3	6	29880	29885	0 %	0 %	50 %	50 %	38505809
36	NC_005231	AC	3	6	30511	30516	50 %	0 %	0 %	50 %	38505810
37	NC_005231	GT	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	38505813
38	NC_005231	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	38505818
39	NC_005231	TC	3	6	39462	39467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005231	TA	3	6	39486	39491	50 %	50 %	0 %	0 %	38505819
41	NC_005231	TA	3	6	39836	39841	50 %	50 %	0 %	0 %	38505819
42	NC_005231	CT	3	6	39892	39897	0 %	50 %	0 %	50 %	38505819
43	NC_005231	AC	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	38505819
44	NC_005231	AG	3	6	40818	40823	50 %	0 %	50 %	0 %	38505819
45	NC_005231	GA	3	6	41004	41009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005231	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	38505820
47	NC_005231	TG	3	6	43387	43392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005231	GA	3	6	44205	44210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005231	GT	3	6	44258	44263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.