MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	AAAAT	2	10	2145	2154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005230	TTTGC	2	10	5262	5271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005230	TTTAG	2	10	20020	20029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005230	ATTAG	2	10	20238	20247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005230	CAAGC	2	10	25653	25662	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_005230	CAAGC	2	10	25683	25692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_005230	TTTGT	2	10	26295	26304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005230	CTGCA	2	10	29882	29891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_005230	ACAAT	2	10	31599	31608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005230	CCCAG	2	10	39615	39624	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_005230	CCTGC	2	10	39632	39641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_005230	CTCTG	2	10	42550	42559	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_005230	TCTCT	2	10	44422	44431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_005230	TGAGT	2	10	69858	69867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005230	GGATC	2	10	70531	70540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_005230	ACTCT	2	10	90717	90726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_005230	ATTAA	2	10	91154	91163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005230	GTCTC	2	10	91481	91490	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_005230	CGCTT	2	10	91597	91606	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_005230	TGAAT	2	10	92991	93000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005230	AGGGG	2	10	96249	96258	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005230	CACCG	2	10	97119	97128	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_005230	TAACT	2	10	97153	97162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_005230	CCAAA	2	10	103059	103068	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.