MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	CCATC	2	10	761	770	20 %	20 %	0 %	60 %	38505670
2	NC_005230	TTTTA	2	10	937	946	20 %	80 %	0 %	0 %	38505670
3	NC_005230	AATTA	2	10	2018	2027	60 %	40 %	0 %	0 %	38505672
4	NC_005230	CCTGG	2	10	2545	2554	0 %	20 %	40 %	40 %	38505673
5	NC_005230	AATTT	2	10	9062	9071	40 %	60 %	0 %	0 %	38505679
6	NC_005230	GAAAT	2	10	9414	9423	60 %	20 %	20 %	0 %	38505679
7	NC_005230	CAAAA	2	10	10090	10099	80 %	0 %	0 %	20 %	38505679
8	NC_005230	GATCA	2	10	13184	13193	40 %	20 %	20 %	20 %	38505681
9	NC_005230	TCCTT	2	10	17899	17908	0 %	60 %	0 %	40 %	38505686
10	NC_005230	GCATC	2	10	20926	20935	20 %	20 %	20 %	40 %	38505691
11	NC_005230	TGATT	2	10	22453	22462	20 %	60 %	20 %	0 %	38505692
12	NC_005230	TGGAA	2	10	23781	23790	40 %	20 %	40 %	0 %	38505692
13	NC_005230	CAATC	2	10	31829	31838	40 %	20 %	0 %	40 %	38505703
14	NC_005230	GAATT	2	10	33224	33233	40 %	40 %	20 %	0 %	38505705
15	NC_005230	TTACC	2	10	33745	33754	20 %	40 %	0 %	40 %	38505705
16	NC_005230	CAAGC	2	10	33823	33832	40 %	0 %	20 %	40 %	38505705
17	NC_005230	ATTGA	2	10	36177	36186	40 %	40 %	20 %	0 %	38505706
18	NC_005230	ATTGG	2	10	36228	36237	20 %	40 %	40 %	0 %	38505707
19	NC_005230	ACCCC	2	10	36337	36346	20 %	0 %	0 %	80 %	38505707
20	NC_005230	CAAGC	2	10	43143	43152	40 %	0 %	20 %	40 %	38505718
21	NC_005230	GGGGC	2	10	45403	45412	0 %	0 %	80 %	20 %	38505722
22	NC_005230	GCATT	2	10	45987	45996	20 %	40 %	20 %	20 %	38505723
23	NC_005230	AGAGG	2	10	46734	46743	40 %	0 %	60 %	0 %	38505724
24	NC_005230	GAAGG	2	10	48539	48548	40 %	0 %	60 %	0 %	38505726
25	NC_005230	TAATT	2	10	50204	50213	40 %	60 %	0 %	0 %	38505728
26	NC_005230	TCTCC	2	10	51095	51104	0 %	40 %	0 %	60 %	38505728
27	NC_005230	TTGCC	2	10	52360	52369	0 %	40 %	20 %	40 %	38505729
28	NC_005230	AGCAA	2	10	52514	52523	60 %	0 %	20 %	20 %	38505729
29	NC_005230	TTGTT	2	10	57067	57076	0 %	80 %	20 %	0 %	38505733
30	NC_005230	TTTTC	2	10	58777	58786	0 %	80 %	0 %	20 %	38505734
31	NC_005230	AAAAT	2	10	60676	60685	80 %	20 %	0 %	0 %	38505734
32	NC_005230	AAAAT	2	10	62535	62544	80 %	20 %	0 %	0 %	38505735
33	NC_005230	TTTGG	2	10	63703	63712	0 %	60 %	40 %	0 %	38505736
34	NC_005230	GGGCT	2	10	63726	63735	0 %	20 %	60 %	20 %	38505736
35	NC_005230	TGGCG	2	10	67475	67484	0 %	20 %	60 %	20 %	38505743
36	NC_005230	TCGTA	2	10	67957	67966	20 %	40 %	20 %	20 %	38505743
37	NC_005230	GCCAT	2	10	76226	76235	20 %	20 %	20 %	40 %	38505749
38	NC_005230	ATGGA	2	10	76509	76518	40 %	20 %	40 %	0 %	38505749
39	NC_005230	TCAGC	2	10	76567	76576	20 %	20 %	20 %	40 %	38505749
40	NC_005230	CCCAA	2	10	83176	83185	40 %	0 %	0 %	60 %	38505755
41	NC_005230	TCTTG	2	10	88375	88384	0 %	60 %	20 %	20 %	38505759
42	NC_005230	CACCC	2	10	88996	89005	20 %	0 %	0 %	80 %	38505760
43	NC_005230	CGGAG	2	10	94941	94950	20 %	0 %	60 %	20 %	38505765

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.