MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	TGCC	2	8	2109	2116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005230	CAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005230	TGTT	2	8	12523	12530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005230	AGAA	2	8	16658	16665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005230	AGCA	2	8	17023	17030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005230	AGCA	2	8	17095	17102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005230	TTGA	2	8	19047	19054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005230	AAAG	2	8	28665	28672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005230	AATG	2	8	29734	29741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005230	TAGA	2	8	32198	32205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005230	ATTC	2	8	32227	32234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005230	ATCT	2	8	32485	32492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_005230	CTCC	2	8	32556	32563	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_005230	GAAG	2	8	35825	35832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005230	GATG	2	8	37212	37219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005230	TTCT	2	8	37530	37537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005230	AGAA	2	8	41662	41669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005230	GCTA	2	8	43731	43738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_005230	GGAG	2	8	44360	44367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005230	TAAG	2	8	44480	44487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005230	ATTG	2	8	45047	45054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005230	TAAT	2	8	51470	51477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005230	ATTT	2	8	51524	51531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005230	TTTA	2	8	68042	68049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005230	TGCT	2	8	68335	68342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_005230	CTAG	2	8	70681	70688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_005230	GCCA	2	8	71346	71353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005230	GCCA	2	8	71496	71503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005230	TTGT	2	8	71860	71867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005230	AACC	2	8	74952	74959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005230	CTTT	2	8	82056	82063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005230	ATTG	2	8	90128	90135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005230	ATTG	2	8	90200	90207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005230	GAAG	2	8	90237	90244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005230	ATTG	2	8	90272	90279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005230	ATTG	2	8	90343	90350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005230	ATTG	2	8	90415	90422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005230	ATTG	2	8	90490	90497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005230	TCTT	2	8	90531	90538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005230	ATTG	2	8	90562	90569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005230	ATTG	2	8	90633	90640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005230	ATTG	2	8	90706	90713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005230	ATTG	2	8	90779	90786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005230	ATTG	2	8	90851	90858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005230	ATTG	2	8	90924	90931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005230	ATTG	2	8	90995	91002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005230	GTTA	2	8	91018	91025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005230	ATTG	2	8	91067	91074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005230	ATTG	2	8	91139	91146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005230	ATTG	2	8	91216	91223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005230	ATTG	2	8	91287	91294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005230	ATTG	2	8	91362	91369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005230	ATTG	2	8	91435	91442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005230	ATTG	2	8	91509	91516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005230	ATTG	2	8	91585	91592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005230	ATTG	2	8	91660	91667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005230	ATTG	2	8	91731	91738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005230	ATTG	2	8	91804	91811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005230	ATTG	2	8	91880	91887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005230	ATTG	2	8	91955	91962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005230	ATTG	2	8	92030	92037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005230	ATTG	2	8	92112	92119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005230	ATTG	2	8	92187	92194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005230	TAAT	2	8	92224	92231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005230	ATTG	2	8	92259	92266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005230	ATTG	2	8	92334	92341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005230	ATTG	2	8	92412	92419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005230	ATTG	2	8	92489	92496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005230	ATTG	2	8	92560	92567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005230	ATTG	2	8	92643	92650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005230	CAGC	2	8	92666	92673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005230	ATTG	2	8	92716	92723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005230	ATTG	2	8	92791	92798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005230	ATTG	2	8	92870	92877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005230	ATTG	2	8	92946	92953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005230	AAAT	2	8	95361	95368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005230	TCTT	2	8	96961	96968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_005230	AGAA	2	8	100179	100186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005230	AATT	2	8	101779	101786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005230	CTAT	2	8	102449	102456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005230	TAAC	2	8	102474	102481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.