MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	38505670
2	NC_005230	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	38505670
3	NC_005230	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	38505671
4	NC_005230	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	38505671
5	NC_005230	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	38505672
6	NC_005230	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	38505673
7	NC_005230	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	38505673
8	NC_005230	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	38505676
9	NC_005230	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	38505676
10	NC_005230	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
11	NC_005230	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	38505677
12	NC_005230	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	38505677
13	NC_005230	CTGC	2	8	6613	6620	0 %	25 %	25 %	50 %	38505678
14	NC_005230	CAAT	2	8	8312	8319	50 %	25 %	0 %	25 %	38505678
15	NC_005230	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	38505679
16	NC_005230	TACT	2	8	9144	9151	25 %	50 %	0 %	25 %	38505679
17	NC_005230	ATTT	2	8	9377	9384	25 %	75 %	0 %	0 %	38505679
18	NC_005230	TTCC	2	8	10287	10294	0 %	50 %	0 %	50 %	38505679
19	NC_005230	TATC	2	8	10324	10331	25 %	50 %	0 %	25 %	38505679
20	NC_005230	AATT	2	8	11178	11185	50 %	50 %	0 %	0 %	38505679
21	NC_005230	AACT	2	8	11453	11460	50 %	25 %	0 %	25 %	38505679
22	NC_005230	AAAC	2	8	11722	11729	75 %	0 %	0 %	25 %	38505680
23	NC_005230	TTGG	2	8	12178	12185	0 %	50 %	50 %	0 %	38505680
24	NC_005230	TAAA	2	8	12320	12327	75 %	25 %	0 %	0 %	38505680
25	NC_005230	GTAG	2	8	13067	13074	25 %	25 %	50 %	0 %	38505681
26	NC_005230	TTTA	2	8	13300	13307	25 %	75 %	0 %	0 %	38505681
27	NC_005230	TAAT	2	8	13432	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	38505681
28	NC_005230	GGGT	2	8	14092	14099	0 %	25 %	75 %	0 %	38505682
29	NC_005230	ACTT	2	8	14101	14108	25 %	50 %	0 %	25 %	38505682
30	NC_005230	CTTA	2	8	14244	14251	25 %	50 %	0 %	25 %	38505683
31	NC_005230	CAAT	2	8	15154	15161	50 %	25 %	0 %	25 %	38505684
32	NC_005230	GAGT	2	8	15655	15662	25 %	25 %	50 %	0 %	38505684
33	NC_005230	TACC	2	8	15691	15698	25 %	25 %	0 %	50 %	38505684
34	NC_005230	GTTT	2	8	15874	15881	0 %	75 %	25 %	0 %	38505685
35	NC_005230	GTCA	2	8	15938	15945	25 %	25 %	25 %	25 %	38505685
36	NC_005230	CTTC	2	8	17948	17955	0 %	50 %	0 %	50 %	38505686
37	NC_005230	TCCC	2	8	19768	19775	0 %	25 %	0 %	75 %	38505689
38	NC_005230	GAAA	2	8	20832	20839	75 %	0 %	25 %	0 %	38505691
39	NC_005230	GTTT	2	8	20893	20900	0 %	75 %	25 %	0 %	38505691
40	NC_005230	AAAC	2	8	22534	22541	75 %	0 %	0 %	25 %	38505692
41	NC_005230	ATTT	2	8	22653	22660	25 %	75 %	0 %	0 %	38505692
42	NC_005230	ACAA	2	8	22836	22843	75 %	0 %	0 %	25 %	38505692
43	NC_005230	GGAG	2	8	23098	23105	25 %	0 %	75 %	0 %	38505692
44	NC_005230	CTTC	2	8	23273	23280	0 %	50 %	0 %	50 %	38505692
45	NC_005230	TTGG	2	8	23361	23368	0 %	50 %	50 %	0 %	38505692
46	NC_005230	AAAG	2	8	23923	23930	75 %	0 %	25 %	0 %	38505692
47	NC_005230	CTTT	2	8	25355	25362	0 %	75 %	0 %	25 %	38505695
48	NC_005230	CTCA	2	8	26676	26683	25 %	25 %	0 %	50 %	38505696
49	NC_005230	GGTA	2	8	27489	27496	25 %	25 %	50 %	0 %	38505696
50	NC_005230	CACT	2	8	27741	27748	25 %	25 %	0 %	50 %	38505697
51	NC_005230	GGAA	2	8	28072	28079	50 %	0 %	50 %	0 %	38505697
52	NC_005230	ACCC	2	8	28268	28275	25 %	0 %	0 %	75 %	38505697
53	NC_005230	AATT	2	8	28985	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	38505698
54	NC_005230	TAAG	2	8	29141	29148	50 %	25 %	25 %	0 %	38505698
55	NC_005230	CAAA	2	8	30641	30648	75 %	0 %	0 %	25 %	38505700
56	NC_005230	ACAA	2	8	30807	30814	75 %	0 %	0 %	25 %	38505701
57	NC_005230	CATT	2	8	30829	30836	25 %	50 %	0 %	25 %	38505701
58	NC_005230	CCAC	2	8	31288	31295	25 %	0 %	0 %	75 %	38505702
59	NC_005230	ACCA	2	8	32398	32405	50 %	0 %	0 %	50 %	38505704
60	NC_005230	CACC	2	8	33699	33706	25 %	0 %	0 %	75 %	38505705
61	NC_005230	CTGT	2	8	34463	34470	0 %	50 %	25 %	25 %	38505705
62	NC_005230	CTCC	2	8	34605	34612	0 %	25 %	0 %	75 %	38505705
63	NC_005230	CAAA	2	8	35106	35113	75 %	0 %	0 %	25 %	38505705
64	NC_005230	TCAA	2	8	35285	35292	50 %	25 %	0 %	25 %	38505705
65	NC_005230	CCCA	2	8	36905	36912	25 %	0 %	0 %	75 %	38505709
66	NC_005230	GTTG	2	8	37039	37046	0 %	50 %	50 %	0 %	38505709
67	NC_005230	TCCT	2	8	37047	37054	0 %	50 %	0 %	50 %	38505709
68	NC_005230	GTAA	2	8	37893	37900	50 %	25 %	25 %	0 %	38505711
69	NC_005230	TTTC	2	8	38039	38046	0 %	75 %	0 %	25 %	38505711
70	NC_005230	TGGC	2	8	38388	38395	0 %	25 %	50 %	25 %	38505712
71	NC_005230	CATT	2	8	40242	40249	25 %	50 %	0 %	25 %	38505714
72	NC_005230	CCAA	2	8	40345	40352	50 %	0 %	0 %	50 %	38505714
73	NC_005230	AGGT	2	8	40495	40502	25 %	25 %	50 %	0 %	38505714
74	NC_005230	TGAT	2	8	41251	41258	25 %	50 %	25 %	0 %	38505715
75	NC_005230	TGAC	2	8	41422	41429	25 %	25 %	25 %	25 %	38505716
76	NC_005230	AGCA	2	8	41632	41639	50 %	0 %	25 %	25 %	38505716
77	NC_005230	GATA	2	8	43988	43995	50 %	25 %	25 %	0 %	38505719
78	NC_005230	TCCC	2	8	44240	44247	0 %	25 %	0 %	75 %	38505720
79	NC_005230	ACTA	2	8	44248	44255	50 %	25 %	0 %	25 %	38505720
80	NC_005230	TAGG	2	8	44981	44988	25 %	25 %	50 %	0 %	38505721
81	NC_005230	AGGG	2	8	45602	45609	25 %	0 %	75 %	0 %	38505722
82	NC_005230	AATT	2	8	45877	45884	50 %	50 %	0 %	0 %	38505723
83	NC_005230	ATGT	2	8	46007	46014	25 %	50 %	25 %	0 %	38505723
84	NC_005230	GGGA	2	8	46701	46708	25 %	0 %	75 %	0 %	38505724
85	NC_005230	CTCC	2	8	46773	46780	0 %	25 %	0 %	75 %	38505724
86	NC_005230	GGCG	2	8	46898	46905	0 %	0 %	75 %	25 %	38505724
87	NC_005230	ATTT	2	8	46945	46952	25 %	75 %	0 %	0 %	38505724
88	NC_005230	TCTT	2	8	48719	48726	0 %	75 %	0 %	25 %	38505726
89	NC_005230	AGTT	2	8	49445	49452	25 %	50 %	25 %	0 %	38505728
90	NC_005230	TGAT	2	8	49576	49583	25 %	50 %	25 %	0 %	38505728
91	NC_005230	GTTG	2	8	50296	50303	0 %	50 %	50 %	0 %	38505728
92	NC_005230	CCAA	2	8	50386	50393	50 %	0 %	0 %	50 %	38505728
93	NC_005230	ACTG	2	8	51840	51847	25 %	25 %	25 %	25 %	38505729
94	NC_005230	CCTA	2	8	52011	52018	25 %	25 %	0 %	50 %	38505729
95	NC_005230	AGAA	2	8	52133	52140	75 %	0 %	25 %	0 %	38505729
96	NC_005230	AGTG	2	8	52476	52483	25 %	25 %	50 %	0 %	38505729
97	NC_005230	CAAA	2	8	52750	52757	75 %	0 %	0 %	25 %	38505729
98	NC_005230	GTGG	2	8	52977	52984	0 %	25 %	75 %	0 %	38505730
99	NC_005230	CATT	2	8	53302	53309	25 %	50 %	0 %	25 %	38505730
100	NC_005230	ATTG	2	8	53546	53553	25 %	50 %	25 %	0 %	38505730
101	NC_005230	GATT	2	8	53915	53922	25 %	50 %	25 %	0 %	38505730
102	NC_005230	GTCT	2	8	54344	54351	0 %	50 %	25 %	25 %	38505731
103	NC_005230	TTGA	2	8	54920	54927	25 %	50 %	25 %	0 %	38505731
104	NC_005230	TAAT	2	8	55231	55238	50 %	50 %	0 %	0 %	38505731
105	NC_005230	TCGT	2	8	55307	55314	0 %	50 %	25 %	25 %	38505731
106	NC_005230	CATA	2	8	55591	55598	50 %	25 %	0 %	25 %	38505731
107	NC_005230	GAAG	2	8	56097	56104	50 %	0 %	50 %	0 %	38505731
108	NC_005230	TTAA	2	8	56410	56417	50 %	50 %	0 %	0 %	38505732
109	NC_005230	GCCA	2	8	56561	56568	25 %	0 %	25 %	50 %	38505732
110	NC_005230	AACT	2	8	56805	56812	50 %	25 %	0 %	25 %	38505732
111	NC_005230	TGAC	2	8	57123	57130	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
112	NC_005230	GATT	2	8	57625	57632	25 %	50 %	25 %	0 %	38505733
113	NC_005230	ATCG	2	8	57785	57792	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
114	NC_005230	GGTA	2	8	57874	57881	25 %	25 %	50 %	0 %	38505733
115	NC_005230	CGAT	2	8	58188	58195	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
116	NC_005230	CCCT	2	8	58203	58210	0 %	25 %	0 %	75 %	38505733
117	NC_005230	AGCT	2	8	58267	58274	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
118	NC_005230	CCAC	2	8	58440	58447	25 %	0 %	0 %	75 %	38505733
119	NC_005230	AATT	2	8	59768	59775	50 %	50 %	0 %	0 %	38505734
120	NC_005230	CAAA	3	12	59927	59938	75 %	0 %	0 %	25 %	38505734
121	NC_005230	ATTT	2	8	60209	60216	25 %	75 %	0 %	0 %	38505734
122	NC_005230	TCTT	2	8	60484	60491	0 %	75 %	0 %	25 %	38505734
123	NC_005230	TTCC	2	8	61150	61157	0 %	50 %	0 %	50 %	38505735
124	NC_005230	TAAC	2	8	61176	61183	50 %	25 %	0 %	25 %	38505735
125	NC_005230	TAAT	2	8	61444	61451	50 %	50 %	0 %	0 %	38505735
126	NC_005230	GCAG	2	8	61514	61521	25 %	0 %	50 %	25 %	38505735
127	NC_005230	TCTG	2	8	61578	61585	0 %	50 %	25 %	25 %	38505735
128	NC_005230	AAAG	2	8	61767	61774	75 %	0 %	25 %	0 %	38505735
129	NC_005230	GTTT	2	8	61802	61809	0 %	75 %	25 %	0 %	38505735
130	NC_005230	ACTG	2	8	61994	62001	25 %	25 %	25 %	25 %	38505735
131	NC_005230	AGGC	2	8	62047	62054	25 %	0 %	50 %	25 %	38505735
132	NC_005230	TAAT	2	8	62263	62270	50 %	50 %	0 %	0 %	38505735
133	NC_005230	AAAT	2	8	63152	63159	75 %	25 %	0 %	0 %	38505736
134	NC_005230	CAAA	2	8	63236	63243	75 %	0 %	0 %	25 %	38505736
135	NC_005230	GATC	2	8	63516	63523	25 %	25 %	25 %	25 %	38505736
136	NC_005230	TTGG	2	8	63528	63535	0 %	50 %	50 %	0 %	38505736
137	NC_005230	CAAA	2	8	64887	64894	75 %	0 %	0 %	25 %	38505739
138	NC_005230	CAGG	2	8	65464	65471	25 %	0 %	50 %	25 %	38505739
139	NC_005230	CTTT	2	8	65709	65716	0 %	75 %	0 %	25 %	38505739
140	NC_005230	TGCT	2	8	66695	66702	0 %	50 %	25 %	25 %	38505742
141	NC_005230	TCAA	2	8	72909	72916	50 %	25 %	0 %	25 %	38505745
142	NC_005230	GGTT	2	8	73639	73646	0 %	50 %	50 %	0 %	304569842
143	NC_005230	GGTA	2	8	74748	74755	25 %	25 %	50 %	0 %	304569842
144	NC_005230	GTTA	2	8	75160	75167	25 %	50 %	25 %	0 %	38505748
145	NC_005230	GCCA	2	8	75253	75260	25 %	0 %	25 %	50 %	38505748
146	NC_005230	TTGA	2	8	75472	75479	25 %	50 %	25 %	0 %	38505748
147	NC_005230	AGCC	2	8	75825	75832	25 %	0 %	25 %	50 %	38505748
148	NC_005230	TTAC	2	8	77006	77013	25 %	50 %	0 %	25 %	38505749
149	NC_005230	CAAG	2	8	77482	77489	50 %	0 %	25 %	25 %	38505749
150	NC_005230	TTTA	2	8	78234	78241	25 %	75 %	0 %	0 %	38505750
151	NC_005230	GCTC	2	8	78838	78845	0 %	25 %	25 %	50 %	38505751
152	NC_005230	ACAG	2	8	78876	78883	50 %	0 %	25 %	25 %	38505751
153	NC_005230	GGGC	2	8	78926	78933	0 %	0 %	75 %	25 %	38505751
154	NC_005230	TAGC	2	8	79279	79286	25 %	25 %	25 %	25 %	38505751
155	NC_005230	TTAG	2	8	79515	79522	25 %	50 %	25 %	0 %	38505751
156	NC_005230	AATT	2	8	79942	79949	50 %	50 %	0 %	0 %	38505752
157	NC_005230	TCTT	2	8	80444	80451	0 %	75 %	0 %	25 %	38505753
158	NC_005230	AATT	2	8	80659	80666	50 %	50 %	0 %	0 %	38505753
159	NC_005230	AAAG	2	8	80746	80753	75 %	0 %	25 %	0 %	38505753
160	NC_005230	TAAA	2	8	80824	80831	75 %	25 %	0 %	0 %	38505753
161	NC_005230	CATT	2	8	81137	81144	25 %	50 %	0 %	25 %	38505753
162	NC_005230	TATT	2	8	81279	81286	25 %	75 %	0 %	0 %	38505753
163	NC_005230	TTCC	2	8	81447	81454	0 %	50 %	0 %	50 %	38505753
164	NC_005230	ATTA	2	8	82191	82198	50 %	50 %	0 %	0 %	38505754
165	NC_005230	CGCC	2	8	82719	82726	0 %	0 %	25 %	75 %	38505755
166	NC_005230	GATT	2	8	82931	82938	25 %	50 %	25 %	0 %	38505755
167	NC_005230	GAAT	2	8	82941	82948	50 %	25 %	25 %	0 %	38505755
168	NC_005230	TAAA	2	8	83008	83015	75 %	25 %	0 %	0 %	38505755
169	NC_005230	GGTT	2	8	84014	84021	0 %	50 %	50 %	0 %	38505757
170	NC_005230	CTGC	2	8	85908	85915	0 %	25 %	25 %	50 %	38505758
171	NC_005230	TTGG	2	8	85946	85953	0 %	50 %	50 %	0 %	38505758
172	NC_005230	ACCA	2	8	86256	86263	50 %	0 %	0 %	50 %	38505758
173	NC_005230	CCTG	2	8	86580	86587	0 %	25 %	25 %	50 %	38505758
174	NC_005230	TGGG	2	8	86946	86953	0 %	25 %	75 %	0 %	38505758
175	NC_005230	CTGG	2	8	87235	87242	0 %	25 %	50 %	25 %	38505758
176	NC_005230	GGCT	2	8	87427	87434	0 %	25 %	50 %	25 %	38505758
177	NC_005230	TTGC	2	8	88114	88121	0 %	50 %	25 %	25 %	38505758
178	NC_005230	TGGC	2	8	88905	88912	0 %	25 %	50 %	25 %	38505760
179	NC_005230	CGAT	2	8	89021	89028	25 %	25 %	25 %	25 %	38505760
180	NC_005230	TTGA	2	8	89248	89255	25 %	50 %	25 %	0 %	38505760
181	NC_005230	TATT	2	8	89571	89578	25 %	75 %	0 %	0 %	38505760
182	NC_005230	ATCA	2	8	89783	89790	50 %	25 %	0 %	25 %	38505761
183	NC_005230	GGTT	2	8	93568	93575	0 %	50 %	50 %	0 %	38505762
184	NC_005230	CCAG	2	8	93706	93713	25 %	0 %	25 %	50 %	38505763
185	NC_005230	ATTT	2	8	93794	93801	25 %	75 %	0 %	0 %	38505763
186	NC_005230	TTAC	2	8	95814	95821	25 %	50 %	0 %	25 %	38505766
187	NC_005230	TGCT	2	8	96224	96231	0 %	50 %	25 %	25 %	38505766
188	NC_005230	ATTG	2	8	96365	96372	25 %	50 %	25 %	0 %	38505767
189	NC_005230	CGGA	2	8	96869	96876	25 %	0 %	50 %	25 %	38505767
190	NC_005230	CGTT	2	8	97910	97917	0 %	50 %	25 %	25 %	38505768
191	NC_005230	CAAC	2	8	98995	99002	50 %	0 %	0 %	50 %	38505769
192	NC_005230	AGCA	2	8	99930	99937	50 %	0 %	25 %	25 %	38505770
193	NC_005230	TAAT	2	8	100113	100120	50 %	50 %	0 %	0 %	38505770
194	NC_005230	GAAA	2	8	101098	101105	75 %	0 %	25 %	0 %	38505772
195	NC_005230	CCCT	2	8	101398	101405	0 %	25 %	0 %	75 %	38505773

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.