MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	AAT	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005230	ATC	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005230	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005230	CCA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_005230	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005230	TCC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_005230	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005230	CAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005230	CAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005230	TGG	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005230	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005230	AAT	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005230	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005230	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005230	CCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_005230	CCA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005230	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005230	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005230	AAC	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005230	ATC	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005230	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005230	AAT	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005230	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005230	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005230	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005230	ATT	2	6	11501	11506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005230	GTT	2	6	12514	12519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005230	TCA	2	6	12563	12568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005230	ATT	2	6	12569	12574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005230	CTA	2	6	12630	12635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005230	GAC	2	6	15801	15806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005230	TTC	2	6	16105	16110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005230	TCC	2	6	16273	16278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_005230	CTA	2	6	16318	16323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_005230	TTG	2	6	16349	16354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005230	CTA	2	6	16390	16395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005230	CTA	2	6	16464	16469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005230	CTA	2	6	16534	16539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005230	CTA	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005230	GAA	2	6	16648	16653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005230	CTA	2	6	16682	16687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005230	AAC	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005230	CTA	2	6	16758	16763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005230	TAA	2	6	16787	16792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005230	GTG	5	15	16806	16820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005230	CTA	2	6	16830	16835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005230	CTA	2	6	16903	16908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_005230	CTA	2	6	16975	16980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005230	CTA	2	6	17047	17052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005230	CTA	2	6	17119	17124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005230	CTA	2	6	17192	17197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005230	TGG	2	6	17237	17242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005230	CTA	2	6	17265	17270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005230	CAA	2	6	17317	17322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005230	CTA	2	6	17337	17342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005230	TTG	2	6	17375	17380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005230	AAG	2	6	17388	17393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005230	CTA	2	6	17408	17413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005230	CTA	2	6	17481	17486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005230	CTT	2	6	17509	17514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005230	TTC	2	6	17528	17533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005230	CTA	2	6	17553	17558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005230	CTG	2	6	17581	17586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005230	AAG	2	6	17587	17592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005230	CTA	2	6	17625	17630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005230	TGG	2	6	17664	17669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005230	CTA	2	6	17697	17702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005230	CTA	2	6	17766	17771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005230	TCC	2	6	18331	18336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_005230	CTA	2	6	18344	18349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005230	CCA	3	9	18385	18393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_005230	CTA	2	6	18418	18423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005230	CTA	2	6	18492	18497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005230	TTG	2	6	18523	18528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005230	CTA	2	6	18570	18575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005230	CTA	2	6	18644	18649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005230	TTG	2	6	18675	18680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005230	CTA	2	6	18722	18727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005230	CGC	2	6	18765	18770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_005230	CTA	2	6	18794	18799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005230	ACT	2	6	18852	18857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005230	CTA	2	6	18864	18869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_005230	TCG	2	6	18901	18906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005230	CTA	2	6	18939	18944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005230	TGG	2	6	18987	18992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005230	CTA	2	6	19013	19018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005230	TCG	2	6	19066	19071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005230	CTA	2	6	19301	19306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005230	CTA	2	6	19374	19379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_005230	TTC	2	6	19415	19420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005230	CTA	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005230	CTT	2	6	19506	19511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005230	CTA	2	6	19517	19522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005230	TTC	2	6	19789	19794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005230	CAG	2	6	20221	20226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005230	GGT	2	6	22268	22273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005230	ATC	2	6	22284	22289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005230	TCA	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005230	CAT	2	6	25829	25834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005230	AAT	2	6	25872	25877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005230	TGT	2	6	25920	25925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005230	ATT	2	6	25929	25934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005230	TTG	2	6	25972	25977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005230	AGT	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005230	CCA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_005230	AAC	2	6	26314	26319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005230	ATT	2	6	28761	28766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005230	GCC	2	6	29962	29967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_005230	CAT	2	6	30003	30008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005230	TTC	2	6	30012	30017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005230	CTG	2	6	30065	30070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005230	TCT	2	6	30288	30293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005230	AGG	2	6	30294	30299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005230	ATG	2	6	30303	30308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005230	AAT	2	6	30309	30314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005230	CAA	2	6	31497	31502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_005230	AGA	2	6	31571	31576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005230	CCA	2	6	31727	31732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_005230	CGG	2	6	31745	31750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005230	TTC	2	6	31779	31784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_005230	ACG	2	6	31806	31811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_005230	TAA	2	6	31816	31821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005230	ATT	2	6	32272	32277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005230	ACA	2	6	32609	32614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005230	ATG	2	6	32625	32630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005230	CCG	2	6	35685	35690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_005230	ACC	2	6	35708	35713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_005230	GGA	2	6	35722	35727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005230	ATT	2	6	35752	35757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005230	AGG	2	6	36586	36591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005230	TTC	2	6	37221	37226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005230	TCC	2	6	38718	38723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_005230	CGC	2	6	39081	39086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_005230	AGT	2	6	39104	39109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005230	GGA	2	6	39413	39418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005230	GAA	2	6	39488	39493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005230	TCC	2	6	39545	39550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_005230	CAA	2	6	39584	39589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005230	GTA	2	6	39739	39744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005230	AGA	2	6	39833	39838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_005230	CCA	2	6	93071	93076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_005230	GCG	2	6	93144	93149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_005230	TTC	2	6	93189	93194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_005230	ATA	2	6	93213	93218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_005230	CGA	2	6	94700	94705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_005230	GGT	2	6	96319	96324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_005230	AAT	2	6	97006	97011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_005230	TAT	2	6	97014	97019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_005230	ATT	2	6	101690	101695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.