MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	38505669
2	NC_005230	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	38505670
3	NC_005230	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	38505674
4	NC_005230	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	38505676
5	NC_005230	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
6	NC_005230	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	38505676
7	NC_005230	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	38505677
8	NC_005230	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	38505678
9	NC_005230	AG	3	6	7092	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	38505678
10	NC_005230	AT	3	6	8946	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	38505679
11	NC_005230	GA	3	6	12732	12737	50 %	0 %	50 %	0 %	38505681
12	NC_005230	TG	3	6	14535	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	38505683
13	NC_005230	GT	3	6	15919	15924	0 %	50 %	50 %	0 %	38505685
14	NC_005230	CT	3	6	17969	17974	0 %	50 %	0 %	50 %	38505686
15	NC_005230	AT	4	8	22737	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
16	NC_005230	GA	3	6	22813	22818	50 %	0 %	50 %	0 %	38505692
17	NC_005230	AT	3	6	22911	22916	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
18	NC_005230	AT	3	6	23140	23145	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
19	NC_005230	CT	3	6	23855	23860	0 %	50 %	0 %	50 %	38505692
20	NC_005230	GA	3	6	24273	24278	50 %	0 %	50 %	0 %	38505693
21	NC_005230	AT	3	6	24437	24442	50 %	50 %	0 %	0 %	38505693
22	NC_005230	TG	3	6	33800	33805	0 %	50 %	50 %	0 %	38505705
23	NC_005230	TC	3	6	34764	34769	0 %	50 %	0 %	50 %	38505705
24	NC_005230	AT	3	6	37819	37824	50 %	50 %	0 %	0 %	38505711
25	NC_005230	GC	3	6	38371	38376	0 %	0 %	50 %	50 %	38505712
26	NC_005230	AG	3	6	40217	40222	50 %	0 %	50 %	0 %	38505713
27	NC_005230	GA	3	6	40714	40719	50 %	0 %	50 %	0 %	38505715
28	NC_005230	TA	3	6	45061	45066	50 %	50 %	0 %	0 %	38505722
29	NC_005230	CT	4	8	46015	46022	0 %	50 %	0 %	50 %	38505723
30	NC_005230	CT	3	6	46024	46029	0 %	50 %	0 %	50 %	38505723
31	NC_005230	TA	3	6	47006	47011	50 %	50 %	0 %	0 %	38505724
32	NC_005230	AG	3	6	48002	48007	50 %	0 %	50 %	0 %	38505725
33	NC_005230	AG	3	6	53622	53627	50 %	0 %	50 %	0 %	38505730
34	NC_005230	CA	3	6	58054	58059	50 %	0 %	0 %	50 %	38505733
35	NC_005230	TC	3	6	60342	60347	0 %	50 %	0 %	50 %	38505734
36	NC_005230	TC	3	6	61015	61020	0 %	50 %	0 %	50 %	38505735
37	NC_005230	AT	3	6	61818	61823	50 %	50 %	0 %	0 %	38505735
38	NC_005230	CT	3	6	63816	63821	0 %	50 %	0 %	50 %	38505736
39	NC_005230	AG	3	6	63854	63859	50 %	0 %	50 %	0 %	38505736
40	NC_005230	CA	3	6	66902	66907	50 %	0 %	0 %	50 %	38505742
41	NC_005230	TC	3	6	73139	73144	0 %	50 %	0 %	50 %	38505745
42	NC_005230	GT	3	6	75517	75522	0 %	50 %	50 %	0 %	38505748
43	NC_005230	GA	3	6	77106	77111	50 %	0 %	50 %	0 %	38505749
44	NC_005230	CT	3	6	77676	77681	0 %	50 %	0 %	50 %	38505750
45	NC_005230	GA	3	6	80236	80241	50 %	0 %	50 %	0 %	38505753
46	NC_005230	TC	3	6	80341	80346	0 %	50 %	0 %	50 %	38505753
47	NC_005230	GA	3	6	82541	82546	50 %	0 %	50 %	0 %	38505754
48	NC_005230	GA	3	6	83379	83384	50 %	0 %	50 %	0 %	38505755
49	NC_005230	GA	3	6	83822	83827	50 %	0 %	50 %	0 %	38505756
50	NC_005230	CT	3	6	87630	87635	0 %	50 %	0 %	50 %	38505758
51	NC_005230	CT	3	6	88634	88639	0 %	50 %	0 %	50 %	38505760
52	NC_005230	TA	3	6	100820	100825	50 %	50 %	0 %	0 %	38505772
53	NC_005230	AT	3	6	100859	100864	50 %	50 %	0 %	0 %	38505772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.