MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005229	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	38505537
2	NC_005229	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	38505538
3	NC_005229	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
4	NC_005229	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	38505540
5	NC_005229	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
6	NC_005229	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	38505540
7	NC_005229	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	38505540
8	NC_005229	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
9	NC_005229	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
10	NC_005229	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
11	NC_005229	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	38505540
12	NC_005229	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
13	NC_005229	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
14	NC_005229	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
15	NC_005229	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
16	NC_005229	AAGT	2	8	8287	8294	50 %	25 %	25 %	0 %	38505540
17	NC_005229	CAAT	2	8	8317	8324	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
18	NC_005229	GTCC	2	8	8357	8364	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
19	NC_005229	GAAG	2	8	9314	9321	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
20	NC_005229	TGGA	2	8	9951	9958	25 %	25 %	50 %	0 %	38505540
21	NC_005229	TGTT	2	8	10491	10498	0 %	75 %	25 %	0 %	38505540
22	NC_005229	TACA	2	8	10807	10814	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
23	NC_005229	TCAA	2	8	10960	10967	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
24	NC_005229	GGCG	2	8	11083	11090	0 %	0 %	75 %	25 %	38505540
25	NC_005229	CAGG	2	8	11606	11613	25 %	0 %	50 %	25 %	38505540
26	NC_005229	AGCA	2	8	12223	12230	50 %	0 %	25 %	25 %	38505540
27	NC_005229	CCAA	2	8	12235	12242	50 %	0 %	0 %	50 %	38505540
28	NC_005229	AGCG	2	8	12685	12692	25 %	0 %	50 %	25 %	38505540
29	NC_005229	ACCA	2	8	13007	13014	50 %	0 %	0 %	50 %	38505540
30	NC_005229	CCGG	2	8	13555	13562	0 %	0 %	50 %	50 %	38505540
31	NC_005229	GAGC	2	8	13617	13624	25 %	0 %	50 %	25 %	38505540
32	NC_005229	GTAT	2	8	13686	13693	25 %	50 %	25 %	0 %	38505540
33	NC_005229	TCAA	2	8	16069	16076	50 %	25 %	0 %	25 %	38505544
34	NC_005229	GGCA	2	8	16622	16629	25 %	0 %	50 %	25 %	38505545
35	NC_005229	TCAT	2	8	17291	17298	25 %	50 %	0 %	25 %	38505546
36	NC_005229	TTAA	2	8	17338	17345	50 %	50 %	0 %	0 %	38505546
37	NC_005229	TATT	2	8	18489	18496	25 %	75 %	0 %	0 %	38505547
38	NC_005229	CCAA	2	8	18763	18770	50 %	0 %	0 %	50 %	38505547
39	NC_005229	GATC	2	8	19857	19864	25 %	25 %	25 %	25 %	38505548
40	NC_005229	ATTT	2	8	20498	20505	25 %	75 %	0 %	0 %	38505548
41	NC_005229	TAAT	2	8	20672	20679	50 %	50 %	0 %	0 %	38505549
42	NC_005229	CTTT	2	8	22302	22309	0 %	75 %	0 %	25 %	38505551
43	NC_005229	CAAA	2	8	22788	22795	75 %	0 %	0 %	25 %	38505551
44	NC_005229	TATT	2	8	22835	22842	25 %	75 %	0 %	0 %	38505551
45	NC_005229	CTAT	2	8	23556	23563	25 %	50 %	0 %	25 %	38505552
46	NC_005229	AGCT	2	8	24558	24565	25 %	25 %	25 %	25 %	38505556
47	NC_005229	CTTT	2	8	25318	25325	0 %	75 %	0 %	25 %	38505557
48	NC_005229	AATT	2	8	25358	25365	50 %	50 %	0 %	0 %	38505557
49	NC_005229	ATGA	2	8	25572	25579	50 %	25 %	25 %	0 %	38505557
50	NC_005229	CAAT	2	8	25661	25668	50 %	25 %	0 %	25 %	38505557
51	NC_005229	AATT	2	8	27272	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	38505559
52	NC_005229	AAAC	2	8	27550	27557	75 %	0 %	0 %	25 %	38505559
53	NC_005229	CTTT	2	8	28620	28627	0 %	75 %	0 %	25 %	38505561
54	NC_005229	TAAA	2	8	28813	28820	75 %	25 %	0 %	0 %	38505561
55	NC_005229	TCAA	2	8	29633	29640	50 %	25 %	0 %	25 %	38505561
56	NC_005229	ATTT	2	8	30167	30174	25 %	75 %	0 %	0 %	38505561
57	NC_005229	CTGC	2	8	30326	30333	0 %	25 %	25 %	50 %	38505562
58	NC_005229	TAAA	2	8	30760	30767	75 %	25 %	0 %	0 %	38505563
59	NC_005229	AACC	2	8	30840	30847	50 %	0 %	0 %	50 %	38505563
60	NC_005229	AAAG	2	8	31533	31540	75 %	0 %	25 %	0 %	38505564
61	NC_005229	GAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	50 %	0 %	38505564
62	NC_005229	AAAG	2	8	31856	31863	75 %	0 %	25 %	0 %	38505564
63	NC_005229	GTCA	2	8	32633	32640	25 %	25 %	25 %	25 %	38505565
64	NC_005229	CAGG	2	8	32804	32811	25 %	0 %	50 %	25 %	38505565
65	NC_005229	CCAA	2	8	32934	32941	50 %	0 %	0 %	50 %	38505566
66	NC_005229	GTAA	2	8	33099	33106	50 %	25 %	25 %	0 %	38505567
67	NC_005229	CTCC	2	8	33212	33219	0 %	25 %	0 %	75 %	38505567
68	NC_005229	TAGA	2	8	33713	33720	50 %	25 %	25 %	0 %	38505568
69	NC_005229	ATTA	2	8	33890	33897	50 %	50 %	0 %	0 %	38505568
70	NC_005229	GGCA	2	8	34150	34157	25 %	0 %	50 %	25 %	38505569
71	NC_005229	GTTT	2	8	34203	34210	0 %	75 %	25 %	0 %	38505569
72	NC_005229	TAGA	2	8	34765	34772	50 %	25 %	25 %	0 %	38505570
73	NC_005229	CAAC	2	8	34860	34867	50 %	0 %	0 %	50 %	38505570
74	NC_005229	TCCC	2	8	34870	34877	0 %	25 %	0 %	75 %	38505570
75	NC_005229	TGGT	2	8	35549	35556	0 %	50 %	50 %	0 %	38505571
76	NC_005229	GGCC	2	8	35889	35896	0 %	0 %	50 %	50 %	38505571
77	NC_005229	ATTC	2	8	36792	36799	25 %	50 %	0 %	25 %	38505572
78	NC_005229	GAAA	2	8	36908	36915	75 %	0 %	25 %	0 %	38505573
79	NC_005229	GGGA	2	8	37007	37014	25 %	0 %	75 %	0 %	38505573
80	NC_005229	TCAA	2	8	37249	37256	50 %	25 %	0 %	25 %	38505573
81	NC_005229	TACT	2	8	37600	37607	25 %	50 %	0 %	25 %	38505573
82	NC_005229	TGTT	2	8	37861	37868	0 %	75 %	25 %	0 %	38505573
83	NC_005229	GAGT	2	8	37997	38004	25 %	25 %	50 %	0 %	38505573
84	NC_005229	AGTT	2	8	38117	38124	25 %	50 %	25 %	0 %	38505573
85	NC_005229	AATA	2	8	38476	38483	75 %	25 %	0 %	0 %	38505574
86	NC_005229	TTGG	2	8	39439	39446	0 %	50 %	50 %	0 %	38505575
87	NC_005229	TACC	2	8	39574	39581	25 %	25 %	0 %	50 %	38505575
88	NC_005229	GCTT	2	8	39632	39639	0 %	50 %	25 %	25 %	38505575
89	NC_005229	CGTT	2	8	40550	40557	0 %	50 %	25 %	25 %	38505577
90	NC_005229	TTGC	2	8	40861	40868	0 %	50 %	25 %	25 %	38505577
91	NC_005229	GATC	2	8	40902	40909	25 %	25 %	25 %	25 %	38505577
92	NC_005229	CGAT	2	8	40973	40980	25 %	25 %	25 %	25 %	38505577
93	NC_005229	ATAA	2	8	40996	41003	75 %	25 %	0 %	0 %	38505577
94	NC_005229	TTCT	2	8	41489	41496	0 %	75 %	0 %	25 %	38505578
95	NC_005229	AACC	2	8	41538	41545	50 %	0 %	0 %	50 %	38505578
96	NC_005229	ATAG	2	8	41611	41618	50 %	25 %	25 %	0 %	38505578
97	NC_005229	ATCA	2	8	41924	41931	50 %	25 %	0 %	25 %	38505578
98	NC_005229	TCCA	2	8	42631	42638	25 %	25 %	0 %	50 %	38505579
99	NC_005229	CATG	2	8	42639	42646	25 %	25 %	25 %	25 %	38505579
100	NC_005229	ATGG	2	8	42724	42731	25 %	25 %	50 %	0 %	38505579
101	NC_005229	ATTG	2	8	43633	43640	25 %	50 %	25 %	0 %	38505581
102	NC_005229	CCAG	2	8	43837	43844	25 %	0 %	25 %	50 %	38505581
103	NC_005229	TGCC	2	8	44367	44374	0 %	25 %	25 %	50 %	38505582
104	NC_005229	GCCC	2	8	44854	44861	0 %	0 %	25 %	75 %	38505582
105	NC_005229	TAAT	2	8	45225	45232	50 %	50 %	0 %	0 %	38505582
106	NC_005229	GAAA	2	8	45795	45802	75 %	0 %	25 %	0 %	38505582
107	NC_005229	CTCG	2	8	46544	46551	0 %	25 %	25 %	50 %	38505583
108	NC_005229	GTTT	2	8	48075	48082	0 %	75 %	25 %	0 %	38505584
109	NC_005229	AAAT	2	8	48115	48122	75 %	25 %	0 %	0 %	38505584
110	NC_005229	AGCC	2	8	48472	48479	25 %	0 %	25 %	50 %	38505585
111	NC_005229	AATT	2	8	48690	48697	50 %	50 %	0 %	0 %	38505585
112	NC_005229	CGGT	2	8	49020	49027	0 %	25 %	50 %	25 %	38505585
113	NC_005229	ATTG	2	8	49532	49539	25 %	50 %	25 %	0 %	38505585
114	NC_005229	AGAC	2	8	50214	50221	50 %	0 %	25 %	25 %	38505587
115	NC_005229	AAAG	2	8	50239	50246	75 %	0 %	25 %	0 %	38505587
116	NC_005229	CAGC	2	8	50336	50343	25 %	0 %	25 %	50 %	38505587
117	NC_005229	TATC	2	8	50530	50537	25 %	50 %	0 %	25 %	38505587
118	NC_005229	ATCG	2	8	50612	50619	25 %	25 %	25 %	25 %	38505587
119	NC_005229	CTTT	2	8	51073	51080	0 %	75 %	0 %	25 %	38505587
120	NC_005229	TGGG	2	8	52011	52018	0 %	25 %	75 %	0 %	38505587
121	NC_005229	AGCC	2	8	52180	52187	25 %	0 %	25 %	50 %	38505587
122	NC_005229	AATA	2	8	52801	52808	75 %	25 %	0 %	0 %	38505588
123	NC_005229	TTAT	2	8	53125	53132	25 %	75 %	0 %	0 %	38505589
124	NC_005229	CAAT	2	8	53409	53416	50 %	25 %	0 %	25 %	38505589
125	NC_005229	AAAG	2	8	53736	53743	75 %	0 %	25 %	0 %	38505589
126	NC_005229	CAAA	2	8	53984	53991	75 %	0 %	0 %	25 %	38505589
127	NC_005229	CAAG	2	8	54613	54620	50 %	0 %	25 %	25 %	38505590
128	NC_005229	TCTG	2	8	54856	54863	0 %	50 %	25 %	25 %	38505590
129	NC_005229	ACCT	2	8	56848	56855	25 %	25 %	0 %	50 %	38505592
130	NC_005229	AAAG	2	8	57208	57215	75 %	0 %	25 %	0 %	38505592
131	NC_005229	TTCC	2	8	58345	58352	0 %	50 %	0 %	50 %	38505593
132	NC_005229	CAGT	2	8	58518	58525	25 %	25 %	25 %	25 %	38505593
133	NC_005229	GTTT	2	8	59812	59819	0 %	75 %	25 %	0 %	38505593
134	NC_005229	GCTC	2	8	60025	60032	0 %	25 %	25 %	50 %	38505593
135	NC_005229	TGGT	2	8	60110	60117	0 %	50 %	50 %	0 %	38505593
136	NC_005229	CCAT	2	8	60985	60992	25 %	25 %	0 %	50 %	38505594
137	NC_005229	TCAT	2	8	61728	61735	25 %	50 %	0 %	25 %	38505595
138	NC_005229	CCAT	2	8	61851	61858	25 %	25 %	0 %	50 %	38505595
139	NC_005229	TTGA	2	8	61988	61995	25 %	50 %	25 %	0 %	38505595
140	NC_005229	TGTC	2	8	62128	62135	0 %	50 %	25 %	25 %	38505595
141	NC_005229	CAAC	2	8	62387	62394	50 %	0 %	0 %	50 %	38505595
142	NC_005229	CGAT	2	8	62755	62762	25 %	25 %	25 %	25 %	38505595
143	NC_005229	TATT	2	8	62853	62860	25 %	75 %	0 %	0 %	38505595
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.