MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	TCTT	2	8	91	98	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005213	TCCA	2	8	363	370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005213	CTTT	2	8	420	427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005213	TCTT	2	8	746	753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005213	TATT	2	8	5673	5680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005213	TTTC	2	8	5681	5688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005213	CATT	2	8	10835	10842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005213	TAGT	2	8	11000	11007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005213	ATTT	2	8	12010	12017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005213	AAAG	2	8	13253	13260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005213	ATTT	2	8	13266	13273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005213	TGGT	2	8	13297	13304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005213	TTTC	2	8	13369	13376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005213	CCTT	2	8	13984	13991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005213	TCCG	2	8	14112	14119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005213	TTTC	2	8	14189	14196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005213	GTTT	2	8	16214	16221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	TTAG	2	8	39300	39307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	ATTA	2	8	48326	48333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005213	TAAA	2	8	55595	55602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005213	CTTC	2	8	55647	55654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005213	TTAA	2	8	55734	55741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005213	ATAA	2	8	55796	55803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005213	ATTT	2	8	60345	60352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005213	TCAT	2	8	66863	66870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_005213	CCCG	2	8	72035	72042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_005213	TTAC	2	8	73864	73871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005213	GAAA	2	8	87629	87636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005213	TAGA	2	8	91784	91791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005213	TAAA	2	8	91850	91857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005213	ATTA	2	8	98536	98543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005213	CTAT	2	8	111133	111140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005213	CGGG	2	8	118816	118823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_005213	ATAA	3	12	127268	127279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005213	GTTA	2	8	145936	145943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005213	TTGC	2	8	146643	146650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005213	GATA	2	8	150630	150637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005213	CTAT	2	8	150758	150765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_005213	ATCT	2	8	151973	151980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005213	CGGC	2	8	164019	164026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005213	TTTA	2	8	166224	166231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005213	TTTA	2	8	173167	173174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005213	TTGG	2	8	179439	179446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005213	TATT	2	8	192023	192030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005213	CAAA	2	8	225736	225743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005213	TAAT	2	8	229539	229546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005213	TTAT	2	8	234179	234186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005213	ACAA	2	8	234429	234436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_005213	GATA	2	8	241077	241084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005213	CTAT	2	8	249291	249298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_005213	TATT	2	8	250646	250653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005213	CCGG	2	8	259186	259193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005213	ATTA	2	8	259310	259317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005213	TTTC	2	8	259447	259454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_005213	ATAA	2	8	259559	259566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005213	AAGA	2	8	260010	260017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005213	TTCT	2	8	266968	266975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_005213	TAAT	2	8	267076	267083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005213	TAAA	2	8	269125	269132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005213	AATC	2	8	287590	287597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005213	ATTA	2	8	302030	302037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005213	AATA	2	8	304174	304181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005213	ATTA	2	8	304416	304423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005213	TTCC	2	8	304472	304479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_005213	AGAT	2	8	304485	304492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005213	ATTA	2	8	317561	317568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005213	ATAA	2	8	317636	317643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005213	TAAA	2	8	320383	320390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005213	CTTC	2	8	325019	325026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005213	TTTA	2	8	325090	325097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005213	ATTA	2	8	327826	327833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005213	CAAT	2	8	328164	328171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_005213	TCTT	2	8	339581	339588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_005213	TTTA	2	8	343158	343165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005213	AATA	2	8	348932	348939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005213	CGGG	2	8	356587	356594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_005213	TATT	2	8	358879	358886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005213	CTAT	2	8	359071	359078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_005213	TCCA	2	8	365696	365703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_005213	TAAA	2	8	369989	369996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005213	ACCA	2	8	370079	370086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005213	AGAA	2	8	377700	377707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005213	TTAA	2	8	378468	378475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005213	TGGA	2	8	379873	379880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005213	TGTA	2	8	380478	380485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005213	GTTT	2	8	382438	382445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005213	CGAG	2	8	393942	393949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_005213	CCCG	2	8	393995	394002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_005213	AAAG	2	8	394183	394190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005213	TCCC	2	8	394295	394302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_005213	GGAG	2	8	394369	394376	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005213	CGGG	2	8	394535	394542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_005213	GCCG	2	8	395245	395252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005213	GGCG	2	8	395295	395302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_005213	GGGC	2	8	395872	395879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_005213	TCTA	2	8	396690	396697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_005213	TAAA	2	8	398685	398692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005213	TAAA	2	8	399304	399311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005213	GCCG	2	8	417066	417073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_005213	TAAT	2	8	419314	419321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005213	AATA	3	12	429117	429128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005213	TAAA	2	8	429129	429136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005213	TCCG	2	8	432360	432367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005213	GCCC	2	8	432546	432553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_005213	GCCC	2	8	433142	433149	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_005213	ATGC	2	8	433491	433498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_005213	TTGT	2	8	437402	437409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005213	TAAA	2	8	440931	440938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005213	ATAA	2	8	445896	445903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005213	TATT	2	8	449797	449804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005213	TTAA	2	8	455077	455084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005213	GCCT	2	8	471230	471237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_005213	ACAT	2	8	472184	472191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_005213	TATG	2	8	472401	472408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005213	TAGA	2	8	472951	472958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005213	CTTT	2	8	483400	483407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_005213	GTTT	2	8	487334	487341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005213	GTTT	2	8	487357	487364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005213	CCTA	2	8	487375	487382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_005213	TAAA	2	8	487422	487429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005213	GGTG	2	8	487462	487469	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005213	TAAA	2	8	487772	487779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005213	GCTT	2	8	488122	488129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_005213	TGAT	2	8	488178	488185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005213	GGGA	2	8	489015	489022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005213	TTCG	2	8	489329	489336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_005213	TTTC	2	8	489615	489622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005213	AGAT	2	8	489941	489948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005213	CTTT	2	8	490506	490513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_005213	TAAA	2	8	490749	490756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.