MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	CTT	2	6	222	227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005213	TTC	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005213	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005213	TTC	2	6	403	408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005213	TTC	2	6	451	456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005213	TTA	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005213	ATA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005213	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005213	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005213	GCG	2	6	3236	3241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005213	TTC	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_005213	CGG	2	6	7007	7012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005213	CAA	2	6	7089	7094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005213	TAA	2	6	10992	10997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005213	AAT	2	6	11031	11036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005213	TAT	2	6	13125	13130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005213	AAT	2	6	13133	13138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	GTA	2	6	13203	13208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	TAA	2	6	13525	13530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005213	CAA	2	6	13682	13687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005213	GAA	3	9	13696	13704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005213	TAT	4	12	13769	13780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005213	CTT	2	6	13814	13819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005213	CAG	2	6	13955	13960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005213	ATG	2	6	13978	13983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005213	TAG	2	6	14034	14039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005213	AGA	2	6	14048	14053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005213	CTT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005213	TTA	2	6	14240	14245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005213	TAA	2	6	14313	14318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005213	CTA	2	6	14328	14333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005213	TCC	2	6	14336	14341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_005213	TGT	2	6	14382	14387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005213	TGT	2	6	14413	14418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005213	TTA	2	6	14633	14638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005213	ATA	2	6	14760	14765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005213	AAT	2	6	14814	14819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005213	TTA	2	6	14841	14846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005213	ATT	2	6	14856	14861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005213	TTA	2	6	16166	16171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005213	TAA	2	6	16258	16263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005213	TAA	2	6	22084	22089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005213	TTG	2	6	22220	22225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005213	ATA	2	6	22256	22261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005213	ATT	2	6	23205	23210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005213	TAG	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005213	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005213	TAT	2	6	29245	29250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005213	ACC	2	6	29382	29387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005213	ATT	2	6	34428	34433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005213	TAT	2	6	34736	34741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005213	TAC	2	6	35244	35249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005213	GCC	2	6	35296	35301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_005213	CCG	2	6	35323	35328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_005213	GCG	2	6	35361	35366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005213	AGT	2	6	35436	35441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005213	TAA	2	6	45776	45781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005213	TGA	2	6	45782	45787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005213	AAT	2	6	45803	45808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005213	GAC	2	6	45812	45817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005213	AGA	2	6	46935	46940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005213	TCA	2	6	46942	46947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005213	GAT	2	6	48353	48358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005213	TCA	2	6	54074	54079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005213	CCG	2	6	54085	54090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_005213	GCC	2	6	54744	54749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_005213	GGC	2	6	54811	54816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005213	TAA	2	6	54829	54834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005213	TAA	2	6	54886	54891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005213	TAA	2	6	54929	54934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005213	TAC	2	6	55007	55012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005213	TAT	2	6	55073	55078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005213	CAA	2	6	55127	55132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005213	ACT	2	6	55200	55205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_005213	GAA	2	6	55206	55211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005213	CGC	2	6	55235	55240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_005213	AAT	2	6	55260	55265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005213	CAT	2	6	55295	55300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005213	TAT	2	6	55310	55315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005213	CAA	2	6	55351	55356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005213	ATA	2	6	55361	55366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005213	TAT	2	6	55621	55626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005213	AGG	2	6	55721	55726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005213	TAA	3	9	55739	55747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005213	TAA	2	6	55763	55768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005213	ACC	2	6	56722	56727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_005213	AGA	2	6	60320	60325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005213	AGA	2	6	60424	60429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005213	TAA	2	6	64167	64172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005213	AAT	2	6	64185	64190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005213	TTA	2	6	66728	66733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005213	ATA	2	6	66753	66758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005213	CAT	2	6	66795	66800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005213	TGA	2	6	66814	66819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005213	TTA	2	6	73676	73681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005213	TGG	2	6	73876	73881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005213	AGC	2	6	74887	74892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005213	TAC	2	6	74935	74940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005213	ATA	2	6	76162	76167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005213	ATT	2	6	76169	76174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005213	AAT	2	6	76795	76800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005213	TAT	2	6	87549	87554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005213	AAC	2	6	87658	87663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_005213	GAT	2	6	87696	87701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005213	GTT	2	6	87716	87721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005213	GAA	2	6	88865	88870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005213	AGT	2	6	91829	91834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005213	TAT	2	6	91863	91868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005213	TGA	2	6	93665	93670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005213	TTC	2	6	98580	98585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005213	TTA	2	6	98617	98622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005213	AAT	2	6	103681	103686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005213	CGG	2	6	111119	111124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_005213	AAG	2	6	111385	111390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005213	AAG	2	6	111405	111410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005213	AGA	2	6	111416	111421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005213	AGA	2	6	111431	111436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005213	ATA	2	6	111484	111489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005213	AGA	2	6	111512	111517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005213	AGA	2	6	111533	111538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005213	TTC	2	6	113595	113600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_005213	GCC	2	6	118853	118858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_005213	AAT	2	6	118889	118894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005213	AAT	2	6	120139	120144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005213	CCG	2	6	120724	120729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_005213	GCG	2	6	120762	120767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005213	TAA	2	6	131514	131519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005213	TAA	3	9	131638	131646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005213	AAT	2	6	131647	131652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005213	TAC	2	6	135253	135258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_005213	GCC	2	6	135284	135289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_005213	ATA	2	6	135358	135363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005213	CGG	2	6	138230	138235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005213	AAT	2	6	139777	139782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005213	ATT	2	6	140182	140187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005213	TTC	3	9	145978	145986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005213	AGT	2	6	145996	146001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005213	TCA	2	6	146008	146013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005213	AGT	2	6	146663	146668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005213	ATG	2	6	149380	149385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005213	TAT	2	6	151947	151952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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